Acides aminés et protéines Flashcards
De quoi sont composés les chromosomes?
Les chromosomes sont composés d’ADN compacté
C’est quoi un gène?
C’est une séquence d’ADN situé sur un chromosome
C’est quoi de l’ADN?
Contient l’ensemble des gènes qui dicte notre phénotype
C’est quoi L’ARNm?
C’est une copie de l’ADN (transcription) qui voyage jusqu’au ribosome pour la synthèse des a.a/protéines (traduction)
ARN messager
Quelle est la différence entre l’ADN et l’ARNm?
ADN:
* Double brin
* Groupement phosphate + Désoxyribose + Bases azotées
* Bases azotées: Cytosine, Guanine, Adénine, Thymine
ARN:
* Simple brin
* Groupement phosphate + Ribose + Bases azotées
* Cytosine, Guanine, Adénine, Uracile
Qu’est-ce qu’un codon?
assemblage de 3 bases nucléiques
base azotée = base nucléique
Explique la synthèse des protéines?
- ARNm a fait la copie de l’ADN (transcription) et quitte le noyau pour s’attacher au ribosome et commencer la traduction
- Initiation de la traduction au codon initiateur AUG (méthionine)
- Association codon-anticodon (3 bases nucléiques)
- L’association de codon-anticodon dicte la formation d’un a.a
- Fin de la traduction aux codons STOP (il y en a 2)
Ainsi, c’est le code génétique qui dicte la formation des a.a
Pourquoi existe-t-il 64 codons et seulement 20 a.a?
Plusieurs codons dictent le même acide aminé
Comment les protéines/a.a sont liés au métabolisme?
- Ils peuvent des intermédiaires de cycle métabolique: citrulline et ornithine
- Ce sont des enzymes protéiques qui catalysent les différentes étapes des cycles
Génotype vs Phénotype?
- Génotype: ensemble des gènes d’un individu
- Phénotypes: caractéristiques visibles du résultat de l’intéraction entre le génotype et l’environnement
Classe en ordre:Transcriptome, Génome, Mébolome, Protéome
et sur quel étape l’environnement peut-il avoir un impact?
Génome → Transcriptome → Protéome → Métabolite
Les gènes donnent les arn messager (transcription), qui vont donner les protéines (traduction), qui eux vont donner des métabolites (ex: enzymes (prot) dans cycle de krebs)
LE TOUT PEUT ÊTRE INFLUENCÉ PAR L’ENVIRONNEMENT/À QUOI ON EST EXPOSÉ
Explique à quel étape une mutation d’un gène peut avoir un impact?
- Problème au niveau de la transcription de l’ARN
- Problème au niveau de la traduction en protéines
- Problème au niveau du métabolisme
V ou F
Une mutation n’est pas suffisante pour changer notre phénotype
La majorité du temps une mutation n’est pas suffisante, mais en intéraction avec l’environnement (ex: alimentation, climat,etc), les changements sont plus fréquents
Phénotype = intéraction entre génotype et environnement
Qu’est-ce qui peut faire en sorte qu’une simple mutation change notre phénotype?
Intéraction gène/environnement
C’est quoi un polymorphisme?
C’est une variation de gène plutôt fréquente ( + 1% de la population ) qui influence le phénotype
V ou F
les polymorphismes ne sont pas pathogènes et ne sont pas dangereux, c’est eux qui contribuent à la diversité dans une population
F
Bien qu’ils ne soient pas pathogènes, ils peuvent augmenter la sensibilité au développement de certaines maladies
Quelle est la différence entre une mutation et un polymorphisme?
Les 2 sont des variation de l’ADN / variation génétique
* Mutation: variation de l’ADN peu fréquente (-1%), peut avoir des conséquences graves sur la santé (ex: mutation d’une enzyme du cycle de Krebs)
* Polymorphisme: variation de l’ADN assez fréquente (+1%), pas pathologiques, peuvent augmenter risque de maladies
Quels sont les 2 types de mutations?
- Germinale: mutation dans une gamète/cellule reproductrice, donc héréditaire et se transmet
- Somatique: mutation dans une cellule somatique/ non reproductrice, ne se transmet pas
Quels sont les effets d’un polymorphisme/mutation sur une personne?
- Neutre
- Amélioration d’une fonction (évolution, diversité)
- Altération d’une fonction (pathogène)
Quand est-ce qu’une mutation peut altérer une fonction?
Si une protéine est altérée
Parce que si la mutation a provoqué un changement au niveau d’un codon, mais que ce codon code pour le même a.a initial => même protéine au final (la mutation n’aura aucun impact)
C’est quoi l’épigénétique?
Environnement influence les régulations épigénétiques
* Pas un problème de variation de gène/ADN (changement de séquence)
* Cause des problèmes au niveau de l’expression des gènes (transcription) et l’accessibilité de l’ADN (transcription)
EXEMPLES:
* Méthylation, acétylation, phosphorylation des histones (qui s’occupent de compacter l’ADN des chromosomes)
-↑ compaction de l’ADN = ↓expression/accessibilité
-↓ compaction de l’ADN = ↑expression/accessibilité
* Méthylation d’ADN ou d’ARN
* Dégradation de l’ARNm => ARN non codant
↓expression/accessibilité = difficulté à transcrire l’ADN en ARNm
Quelle est la différence entre l’épigénétique, les mutations et les polymorphisme?
- Épigénétique: modifie l’ADN, l’ARN ou les histones par méthylation, acétylation, phosphorylation, etc, pour affecter la transciption et l’accessibilité de l’ADN
- Mutation: variation des séquences de l’ADN/gènes peu fréquente
- Polymorphisme: variation des séquences de l’ADN/gènes assez fréquente
Quelle est la différence entre la nutrigénomique et la nutrigénétique?
Nutrigénomique: alimentation qui affecte nos gènes (ex: manger trop de méthyl = méthylation des histones)
Nutrigénétique: gènes qui affecte notre alimentation (ex: difficulter à assimiler un nutriment)
Quels sont les groupements d’un acide aminé?
Groupement amine
Groupement carboxyle/carboné
Groupement R = diversité/fonction de l’a.a pcq c lui qui change
C’est quoi des a.a essentiels, non-essentiels et conditionnellement essentiels?
- Essentiel: on ne le synthétise pas/pas assez, on doit le chercher dans notre alimentation
- Non-essentiel: on le synthétise suffisement
- Conditionnellement essentiel: devient essentiel suite à une condition pathologique
Donne moi un exemple d’a.a conditionnellement essentiel
Exemple lors de phénylcétonurie
1. Phénylalanine → Tyrosine (phénylalanine hydroxylase)
1. Mutation de la phénylalanie hydroxylase
2. Phénylalanine (↑↑) ❌→ Tyrosine (↓↓)
La tyrosine devient essentiel et on doit aller la chercher dans notre alimentation, tandis que l’on doit réduire la phénylalanine de notre alimentation.
C’est quoi des a.a branchés?
Des a.a qui peuvent être utilisés comme des marqueurs de diabète (s’accumule quand on a le Db)
* Valine
* Leucine
* Isoleucine
C’est quoi des a.a non protéinogènes et donne moi des exemples?
Ceux sont des intermédiaires du métabolisme ne formant pas de protéines
1. Citrulline, Ornithine: intermédiaires du cycle de l’urée
2. Homocystéine:Produit du catabolisme de l’acide aminé méthionine, taux élevée lors de déficience en B6, B9, B12
3. Hydroxyproline et Hydroxylysine: ajout de groupement OH à lysine et proline (composant du collagène, élévation= trop collagène)
4. 3-méthylhistidine: modification de l’histidine, composant des protéines des muscles (élévation= dégradation protéines musculaires)
Explique moi comment se forme une protéine (différentes phase/structure)
- Structure primaire: liaison peptidique entre acides aminés (perte de H20) et séquence d’acides aminés:dipeptide, tripeptide, oligopeptide, polypeptide
- Structure secondaire: Repliement et liaison OH entre les a.a
- Structure tertiaire: Intéractions entre groupes et fome 3D fonctionnelle
- Structure quaternaire: Forme finale et activité optimale pour les protéines composés de plusieurs polypeptides/sous-unités (ex:hémoglobine)
Quels sont les 3 facteurs qui influencent les besoins nutritionnels en protéines?
- Renouvellement des protéines/substances azotées: maintien de l’équilibre azoté
- Formation de nouveaux tissus: croissance, grossesse, allaitement
-
Qualité de la protéine:
1-Acide aminé essentiel
2-Assez d’a.a pour synthétiser les a.a non essentiels
3- Facile à digérer
C’est quoi un a.a limitant?
Un a.a essentiel en petite quantité dans un aliment
Les recommendations des ANREF sont basées sur quels critères?
maintien de l’équilibre azoté
ET
besoin de croissance
Les protéines complètes sont généralement animales, cependant il existe une exception
Gélatine
déficiente en tryptophane
Les protéines incomplètes sont généralement végétales, cependant il existe une exception
soja = assez complète (reste tout de même un peu faible en cystéine)
Quelles sont les méthodes d’évaluation chimique (+ explication)?
On évalue le score pour chaque a.a et le plus faible = acide aminé limitant
1. Score chimique d’acide aminé:
(1mg d’un a.a d’une protéine testée / 1mg du même a.a d’une protéine de référence)
1. Score chimique d’acide aminé corrigé pour la digestibilité:
(1mg d’un a.a d’une protéine testée / 1mg du même a.a d’une protéine de référence) x (% digestibilité)
Quelles sont les méthodes d’évaluation biologique (+ explication)?
- Coefficent d’efficacité protéique
gain de poids (g) / protéine ingéré (g) - Utilisation protéique nette:
azote retenue /azote ingéré
C’est quoi la digestibilité et c’est quoi les facteurs qui l’influence?
C’est la capacité de notre tube digestif à absorber les acides aminés:
* Taille: entier (↓) vs moulu (↑)
* Cuisson: dénature les protéines donc digestion/absorption + facile (augmente)
* Réaction de Maillard: diminue la digestibilité
* Type de protéines: végétale (↓) vs animale
* Fibres: leur présence diminue la digestibilité des a.a
* Composition en acide aminé essentiel: augmente la digestibitlité
Puisque plusieurs aliments (surtout origine végétale) ont des a.a limitants, comment fait-on pour avoir tout nos a.a essentiels?
Il faut faire des combinaisons (ex: légumineuse + grains) et favoriser la diversité alimentaire