7) Sélection naturelle Flashcards
théorie de Jean-Baptiste Lamarck (girafe) sur sélection naturelle
les girafes ont étiré leur cou => descendants ont + long cou
ACTIONS INTRINSÈQUES
théorie Charles Darwin (becs oiseaux) sélection naturelle
- qnd environnement ont pas support -> ceux mieux adaptés à environnement peuvent survivre
- environnement change -> pression
sélection naturelle
les génotypes visant la survie et la reproduction vont être en plus grand nombre en âge et auront de la facilité à se reproduire pour des prochaines générations
Types de sélection
- sélection POSITIVE : favorise mutations avantageuses
- sélection bidirectionnelle : 1 allèle est avantageux et augmente temps en fréquence dans direction du phénotype avantagé
- sélection balancée : plusieurs allèles sont maintenus dans la population à de hautes fréquences
(hétérozygotes survivent + vs homozygotes)
- sélection purificatrice (NÉGATIVE) : éliminer mutations délétères
caractéristiques sélection positive
peu allèle rare, mais haute en fréquence
caractéristiques sélection négative
peu de fréquence => augmentation allèles rares
exemple sélection balancée (avantage de l’hétérozygote)
anémie falciforme : maladie héréditaire affectant les globules rouges
Notion Fitness (valeur adaptative)
survie différentielle des individus (W)
V/F: la fitness moyenne est toujours calculée à chaque génération
VRAI -> pcq évolution
V/F: plus la valeur adaptative est grande, plus la valeur est représentée aux prochaines générations
VRAI
type de sélection chez les gènes des maladies mendéliennes (dominante)
sélection purificatrice (négative)
valeur spécifique de la fitness relative chez une maladie létale récessive pour allèle récessif
0 (pas de progéniture à prochaine génération)
V/F: après la première génération, il y a augmentation de la fréquence de l’allèle létal pour maladie létale récessive
FAUX -> il y a DIMINUTION de la fréquence de cet allèle
plus la génération augmente -> moins il y a des individus malades
V/F: l’allèle délétère ne sera pas complètement perdu chez maladie létale récessive
VRAI (sauf potentiellement par dérive)
quelle type de personnes ont une présence d’allèles délétères RARES (porteur, homozygote ou hétérozygote) ?
porteurs => ces allèles échappent à la sélection
V/F: la sélection naturelle n’affecte pas la fréquence du nombre de variants délétères ou létaux
VRAI -> ils sont rares car ils sont de basse fréquence
V/F: un effet fondateur peut augmenter la fréquence des maladies létales récessives “par accident”
VRAI
sur quelle type de population la sélection est moins efficace (petite ou grande)
PETITE
V/F: l’excès de variants ayant des effets phénotypiques nocifs plus importants (sélection) peut expliquer les maladies héréditaires au Québec
VRAI
conséquence à petite valeur de coefficient de sélection (s)
petit impact sur fitness (sélection)
conséquence à grande valeur de coefficient de sélection (s)
effet important sur fitness
définition coefficient de sélection (s)
différence de fitness entre 2 homozygotes
comment détecter la sélection naturelle?
déterminer et analyser la diversité génétique dans un écosystème naturel dirigé par sélection naturelle
- comparer espèces naturelles
- comparer populations humaines saines issues de différentes zones géographiques et de différentes origines ethniques
inter-espèces
- impact sur diversité génétique
- étude divergence (changement adaptatif) = différences fixées entre espèces et les comparer
- étude conservation = positions identiques entre espèces (régions négatives [purificatrices])
intra-espèces
- impact sur diversité génétique
- étude polymorphismes -> les comparer
Tests intra-espèces
- différentiation entre populations (FST)
- tests de neutralité (D de Tajima)
- déséquilibre de liaison (haplotypes attendus)
fonction différentiation populationnelle
identifier les valeurs abberantes pour indices de sélection naturelle
fonction analyse génomique FST
identifier les allèles présentant des différences de fréquence alléliques ANORMALEMENT importantes entre 2 populations
qu’est ce que la statistique FST compare?
différentes paires des valeurs de FST
fonction test de neutralité
comparer données vs neutres (contraster les 2 statistiques)
signification D de Tajima négatif
𝞹 (nombre moyen de différences entre chaque paire de séquences) < S/a_n
- bcp de sites mutés mais basse fréquence
- excès allèles rares (variation réduite)
- indication sélection + ou - ou expansion populationnelle
signification D de Tajima positif
𝞹 (paires de séquences) > S/a_n
- bcp de différences de séquences, mais - SNP mutés
- excès allèles de fréquence intermédiaire (faible qntité allèles à haute et basse fréquence)
- indication sélection balancée ou bottleneck de la population
2e loi de Mendel (loci)
+ loci proches des chromosomes -> + ils sont transmis ensemble
déséquilibre de liaison
association non aléatoire d’allèles sur différents sites du génome d’une population
haplotypes
allèles hérités ensemble à des loci liés sur même chromosome
signification augmentation valeur de D
transmission des allèles ensemble
définition sélection positive chez déséquilibre de liaison (LD)
balayage sélectif (sweep)
définition sélection négative de LD
sélection de fond (background)
