5) Génétique des populations Flashcards
Évolution
- transformation des espèces à partir des ancêtres
- changement aux cours des générations successives dans composition génétique des populations
- peut être au hasard
composition génétique
ensemble des génomes que portent les individus
Étude génétique des populations
étudie comment la composition génétique des populations naturelles a évolué au fil des générations
forces motrices évolution biologique
- mutation -> SNPs, translocation, recombinaison soit une nouvelle combinaison créée
- structure populationnelle
- dérive génétique
- sélection
- migration
- recombinaison
diversité génétique
modification subtile de la composition génétique de la population chez indivdu
ségrégation et recombinaison = ?
nouvelles combinaisons de génomes parentaux
source ULTIME de variation
mutation
définition facteurs stochastiques
aléatoires
- > mutation arrive à certain locus dans génome par hasard
- > génome passé génération à autre
définition facteurs déterministes
cause derrière
- > sélection naturelle
- >
- descendants, passe + de gènes
locus (pl. : loci)
endroit spécifique du génome
allèles
différents variants génétiques ségrégant dans population à chaque locus
locus monomorphe
tous les individus de la population portent le même allèle
locus polymorphe
plusieurs allèles (SNPs)
haplotype
combinaison allèles hérités ensemble à des loci sur même chromosome
population idéale
modèle nulle -> rien ne se passe => pas d’évolution
V/F: les fréquences génétiques = intrinsèquement stables dans une population idéale
VRAI
propriétés population idéale
- organismes = diploïdes
- reproduction = sexuelle et fréquences = égales entre femmes et hommes
- générations ne se chevauchent pas (discrète)
- accouplement aléatoire
- GRANDE population (infinie)
- pas migration
- pas mutation
- pas sélection naturelle (neutre)
reproduction sexuelle
processus où individus combinent leur ADN pour créer un nouvel individu
méiose
division cellulaire pour reproduction sexuelle
recombinaison méiotique
chaque enfant reçoit mosaïque unique des chromosomes des parents
génération discrète
cycle de naissance, maturation et mort
MORT DE TS LES INDIVUDS DE CHAQUE GÉNÉRATION AVANT MATURITÉ DE LA PROCHAINE
modèle de Wright-Fisher
chaque individu a une chance de transmettre ses gènes
- taille population = identique -> infinie
généalogie des populations
+ spécifique vs histoire
généalogie de l’échantillon
- pas échantillon de toute la population
- échantillon d’un sous-ensemble
V/F: le modèle Coalescent n’a pas permis d’avancer la génétique
FAUX -> il a permis de BCP avancer génétique
espérance de temps chez coalescent
temps moyen qu’il faut pour avoir coalescence
principe de Hardy-Weinberg
- population idéale où rien ne se passe
- modélisation de la fréquence des allèles et des génotypes
- modèle nulle du matériel génétique
V/F: plus la fréquence de génotype de l’allèle dominant (p^2) est grand, plus la fréquence de génotype de l’allèle récessif (q^2) est petit
VRAI
V/F: lorsque la valeur du test chi-carré > valeur critique (3,84), on rejette la valeur
VRAI -> signifique que l’hypothèse = nulle donc il n’y a PAS d’équilibre
Accouplement aléatoire
individus s’accouplent sans tenir compte de leur génotype
-> chance qu’un individu s’accouple avec un autre génotype donné = fréquence de ce génotype dans la population
accouplement assorti
accouplement non-aléatoire : préférence pour même génotype ou phénotype
accouplement désassorti
accouplement non-aléatoire : préférence pour différents génotypes ou phénotypes
type accouplement non-aléatoire
- accouplement assorti/désassorti
- subdivision de la population
- consanguinité -> reproduction avec individu ayant ancêtre commun
structure populationnelle
structure de la population ou subdivision de la population où accouplement a lieu dans sous-groupes de la population entière
- peut être hiérarchique
conséquences structure populationnelle
- différence fréquences alléliques parmi les sous-populations
- moins hétérozygotes vs attendu sous accouplement aléatoire => + homozygotes
- accouplement aléatoire observable dans chaque sous-population, mais ne tient pas dans population dans son ensemble
test statistique pour résumer structure proportionnelle selon équilibre attendue
statistique F de Wright
fonction indice de fixation chez statistique F de Wright
mesurer la réduction hétérozygote attendue vs accouplement aléatoire (FST)
