7- mutacije Flashcards

1
Q

kaj je mutacija

A

je vsaka sprememba v zaporedju nukleotidov v DNA, ki se deduje. to je lahko sprememba v enem baznem paru/ v velikem številu baznih parov/ regiji kromosoma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

kaj sproži enojno mutacijo

A

ena napaka v replikaciji/rekombinaciji/popravljanju (ni vezana na število spremenjenih baz)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

ali so mutacije naključne

A

ne popolnoma, saj obstajajo vroče točke kjer se mutacije pogosteje dogajajo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

ali obstajajo letalne mutacije

A

ne ker to bi pomenilo da se ne deduje. mutacije pa se dedujejo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

vrste mutacij

A

substitucija: zamenjava nukleotidov- tranzicija in transverzija
delecija: izbris nukleotida
insercija: doda se nukleotid
premik bralnega okvirja: pomeni da se je zgodila delecija ali insercija
duplikacija: del genoma se podvoji
inverzija: del genoma se obrne naokoli
loss of function (null)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

loss of function (null)

A

ko nek genski zapis, ki je imel produkt mutiramo tako da ta produkt ne proizvede

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

leaky

A

če smo nekaj mutirali se na fenotipu pozna v tolikšni meri koliko je produkta

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

gain of function

A

pojavi se nov produkt z novimi lastnostmi
tip R: reverzna mutacija pri kateri se organizem povrne v prvotno stanje

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

revertanta

A

po neki mutaciji se je zgodila druga mutacija za tisti kodon, ki je bil revertiran
npr. it Trp nastane stop kodon (to je mutanta) potem pa iz stop kodona ponovno nastane Trp (to je revertanta)

da se nastane revertanta je zelo nizka verjetnost

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

supresorske mutacije

A

se zgodijo izven kodona
so bolj pogoste kot nastanek revertant

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

substitucije baznih parov

A

tranzicija: purin s prinom
transverzija: pirimidin in purin

do substitucije pride zaradi:
- napačnega parjenja baz (DNA polimeraza, imino/enolne oblike)
- spontanih deaminacij (frekvenca se poviša pri višji T)
- oksidacij baz (superoksidni radikal, vodikov peroksid, hidroksilni ion+hidroksilni radikal)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

posledice substitucij

A

drugačnosmiselne mutacije: ak iz druge skupine
nesmiselne mutacije: uvedba stop kodona (izguba funkcionalnosti proteina)
polarni efekt: mutacija ne vpliva samo na ta gen ampak tudi na naslednji strukturni gen - te mutacije se porušijo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

značilnosti substitucije

A
  • točkovne mutacije
  • leaky ker so vezane na eno mesto
  • se hitro popravijo
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

vzrok za premike bralnega okvirja

A

zdrs DNAP - za premikom bralnega okvirja sledijo popolnoma druge AK
zdrsi so pogosti na zaporedju kjer so kratke ponovitve - polimeraza doda ali odstrani Nu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

značilnosti premika bralnega okvirja

A
  • niso leaky
  • nastanejo nefunkcionalni proteini (na 20 kodonov je stop)
  • se hitro popravijo
  • patogene bakterije premike bralnega okvirja koristijo kot mehanizem izogiba IS
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

zakaj pride do delecij

A

zaradi rekombinacije med dvema neposrednima ponovitvama, ki sta na dveh lokacijah (med dvema različnima DNA ali pa na isti DNA)
ponovitve morajo biti dolge vsaj 50 bp

17
Q

značilnosti delecij

A
  • niso leaky
  • nastanejo nefunkcionalni proteini
  • pogosto vzrok genskih fuzij
  • dolge delecije ne morejo revertirati
  • označimo jih z grško črko delta
17
Q

duplikacije -nastanek

A

do duplikacij pride zardi rekombinacij. če do tega pride v enem genu to inaktivira protein če pa v več ni posledic

17
Q

duplikacije - značilnosti

A
  • v enem genu niso leaky
  • hitro se popravijo in niso stabilne
  • tako je nastal genom kvasovk
18
Q
A
19
Q

inverzije - nastanek

A

zaradi rekombinacij med dvema obrnjenima ponovitvama

20
Q

inverzije - značilnosti

A
  • hitro revertirajo, niso stabilne
  • ne vodijo v spremembo fenotipa - izjema regulacija
  • dolge inverzije so problematične - usmerjensot zaporedij KOPS
21
Q

insercija - nastanek

A

kratke: zdrs
dolge: transpozicija

22
Q

insercija - značilnosti

A
  • inaktivirajo gen
  • niso leaky
  • transkripcijsko terminacjiska mesta lahko motijo izražanje genov
  • redko revertirajo
23
Q

supresija mutacij

A

INTRAGENETSKI SUPRESORJI: mutacija je spremenila protein da je posatl neaktiven, druga mutacija v istem genu pa je povzročila da spet postane aktiven.
premik bralnega okvira izniči predhoden premik

INTERGENSKI SUPRESOR: mutacija je spremenila protein da je postal neaktiven, druga mutacija v DRUGEM GENU pa prinese spremembo da protein postane aktiven ali pa se pojavi produkt ki ga je nadomestil

24
Q

nonsense supresorji

A

mutacija ki tRNA spremni tako, da antikodon prebere stop kodon
supD, supE, supF, supB in supL