Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

mikrobna izpit > 6- translacija > Flashcards

6- translacija Flashcards

1
Q

kaj potrebujemo za translacijo

A

mRNA
tRNA
ribosomi (rRNA, ribosomski proteini): evolucijo močno ohranjena struktura -> velik del bakterijske biosinteze je za ribosome

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

ribosomi

A

encim, ki izvaja polimerizacijo AK v polipeptid. zgrajen je iz velike in male podenote in treh značilnih mest:
A: mesto kamor se veže naslednja tRNA (aminoacilno mesto)
P: mesto kjer nastane peptidna vez
E: mesto od koder se sprosti nenabita tRNA

mala podenota: P in A
velika podenota: E, P, A

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

razlika med P in E ribosomi

A

P: 70S
velika podenota 50S: 23S rRNA, proteini, 5SrRNA
mala podenota 30S: 16S rRNA, proteini

E: 80S
velika podenota 60S: 28S rRNA, proteini, 5S rRNA, 5,8S rRNA
mala podenota 40: 18S rRNA, proteini

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

vloga ribosomskih podenot

A

velika podenota: bolj rigidna zato daje stabilnost ribosomu. z njeno vezavo nastane funkcionalen protein, tvori peptidno vez, prestavlja tRNA iz enega mesta na drugo

mala podenota: bolj gibljiva. naloge: začetek translacije, pomaga pri izbiri pravilne AK-tRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

vloga rRNA molekul

A
  • strukturna vloga (kako ribosom izgleda)
  • 23S rRNA: peptidiltransferaza… ribocim, ki tvori kanal skozi katerega izhaja rastoč peptid
  • 16S rRNA: iniciacija in terminacija translacije, dekodiranje zaporedja mRNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

kako so ugotovili strukturo podenot

A

s kristalografijo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

vloga ribosomskih proteinov

A
  • trdnost
  • fiksacija molekul rRNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

kaj so ribocimi, kako delujejo

A

so encimi, ki so molekule RNA in ne proteini
delujejo sami ali pa v kompleksu s proteini - NUKLEOPROTEINI

  • intorni, ki se sami izrežejo
  • imajo aktivno mesto
  • režejo RNA na sredini
  • katalizirajo reakcijo enkrat .. večkrat samo 23S rRNA in RNaza P
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

v katerih organizmih najdemo ribocime

A

prokarionti
evkarionti (skriti v intronih)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

RNaza P

A
  • ribocim, ki katalizira večkrat
  • ribonukleoprotein
  • drži RNA v aktivni sekundarni strukturi
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

zgradba tRNA

A

akceptorski 3’ konec: CCA zaporedje, ki sprejme AK (esterska vez)
antikodonska zanka: prevajanje
D zanka in Tpsi(T) zanka: premikanje tRNA, vstavitev tRNA na pravilno mesto v ribosomu

v naravi v sekundarni in terciarni strukturi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

opiši tRNA

A
  • prenašalna RNA
  • tretji nukleotid je ohlapen “wooble” zato pride do neobičajnih parjenj
  • vsak kodon specifična tRNA
  • ena AK več tRNA
  • 60 tRNA molekul
  • CCA se lahko doda posttranskripcijsko
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

stopnje translacije

A

iniciacija
elongacija (podaljševanje)
terminacija

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

dejavniki - faktorji iniciacije

A

IF1: stabilizacija 30S podenote
IF2: omogoča vezavo iniciatorske tRNA na iniciacijski kodon
IF3: veže 30S podenoto na mRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

dejavniki-faktorji elongacije

A

EF-Tu: dostavi aa-tRNA na A mesto ribosoma
EF-Ts: aktivira EF-Tu
EF-G: stimulira translokacijo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

dejavniki-faktorji terminacije

A

RF1: katalizira sprostitev verige in disociacijo pri UAA in UAG
RF2: … pri UGA in UAA
RF3: stimulira RF1 in RF2
IF3: disociacija

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

kaj je peptidna vez

A

je povezava med AK.
20-25AK- oligopeptid
polipeptid
protein=polipeptid z maso 10kDa
sinteza poteka od N proti C koncu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

koliko možnih bralnih okvirjev ima DNA

A

6

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

če se translacija dogaja v pravilnem okvirju rečemo, da je _______

A

zero frame

20
Q

če se translacija ne dogaja v pravilnem okvirju rečemo, da je _________

A

-1 frame: če je bralni okvir pomaknjen za enega nazaj
+1 frame: če je pomaknjen za enega naprej

21
Q

vezava AK na tRNA

A

aatRNA - aminoacilna tRNA povezuje ustrezno AK in tRNA s pomočjo prepoznavnih mest

  1. aktivacija AK: AK + ATP –> aminoacil-AMP + P-P
  2. nabitje tRNA: aminoacil-AMP + tRNA –> aminoacil-tRNA + AMP
22
Q

opiši aminoacilacijo tRNA

A

to je aktivacija in nabitje
AK + ATP + tRNA (aminoacil tRNA sinteteza)–> aminoacil-tRNA + AMP + P-P

23
Q

translacijsko-iniciacijska regija (TIR)

A

oz. ribosomsko vezavno mesto
RRS (AGGAGG) + AUG = RDS (ribosome docking site)

24
Q

iniciacijski kodon

A

AUG
lahko tudi GUG, UUG in CUG

25
Q

iniciatorska tRNA

A

je ena sama, tista ki veže metionin
je edina, ki vstopi direktno na P mesto. to je omogočeno zaradi f-Met (formilmetionin)

26
Q

kaj vse je potrebno za iniciacijo translacije

A

IF1, IF2, IF3, mRNA, iniciatorska tRNA in mala ribosomska podenota.
mala podenota (30S) se poveže z veliko (50S) v iniciacijski kompleks (70S).

poteka v mali podenoti (P in A mesti)
- IF1 se veže na A mesto in prepreči da bi se gor kaj vezalo
- IF2-GTP veže iniciacijsko tRNA na P mesto.
- IF2 in IF3 zagotovita ustrezno pozicioniranje mRNA in iniciatorske tRNA
- odcepijo se IF1, IF2 in IF3. ko se odcepi IF2 to omogoči povezavo s 50S podenoto in inicacija se zaključi z nastankom iniciacijskega kompleksa (70S)

27
Q

kako poteka iniciacija translacije če ni TlR

A

iniciacijski kodon je na ali v bližini 5’ konca mRNA
2 načina iniciacije translacije:
1. iniciacijski kompleks nima mRNA ampak iniciatorsko tRNA, IF2 in 30S in potem tak kompleks prepozna iniciacijski kodon na mRNA in se veže nanj

  1. kompleks 70S prepozna ustrezni inicacijski kodon in se veže nanj

–> mehanizem je podoben E

28
Q

opiši elongacijo translacije

A

na mesto A prihajajo novi kodoni in nove tRNA. na A mestu se dogaja vezava med tRNA in kodonom - decoding tRNA mora imeti na sebi EF (da se lahko veže na A mesto)

peptidna veriga se iz prejšnjega tRNA na P mestu prestavi na novo AK, ki je prišla na A mesto. potem se veže EF-G in prestavi vse skupaj iz A mesta na P mesto
premik ribosoma gre v smeri 5-3. peptidna veriga se vedno daje iz P mesta na A mesto. to poteka dokler ne pride mRNA do stop kodona.

29
Q

opiši terminacijo translacije

A

za stop kodon ni nobene nabite tRNA

terminacija se ustavi ko se na stop kodon veže release faktor (sprostitveni faktor). polipeptid se sprosti in ribosom razpade. RF3 pomaga sprostiti RF1 in RF2.
+ ribosomski sprostitveni faktor (RRF) pomaga pri disociaciji - IF3

30
Q

terminacija translacije s tmRNA (transfer-messenger RNA)

A
  • ko na mRNA ni stop kodona
  • mRNA je lahko tako majhna da je na P mestu vezana tRNA na A mestu pa ni. ribosom se ustavi in je STOLED. ker ni nove tRNA, ne release faktorja se nič ne zgodi. pride tmRNA, ki se pretvarja da je tRNA (ima kratek ORF, ki se zaključi s stop kodonom). ribosom disocira

prekratke proteine celica razgradi s proteinazami

31
Q

ali imajo peptidi formilno skupino (fMet)

A

ne. fMet se mora odstraniti

32
Q

kaj je poliribosom oz. polisom

A

je ribosom povezan z molekulo mRNA, ki deluje kot enota pri prevajanju dedne informacije v beljakovino

33
Q

geni se lahko med sabo tako ujemajo da nastanejo sekundarne strukture z ______

A

vezano translacijo

34
Q

primerjava translacije pri A, P in E

A

A in E imajo neke dodatne faktorje

35
Q

hitrost translacije

A

pri P potekata transkripcija in translacija sočasno
60 nt/sekundo

36
Q

ali lahko genski kod odstopa od svojih univerzalnih oznak

A

da
npr. UGA je po univerzalnem kodu stop kodon, po specifičnem pa Trp

37
Q

značilnosti genetskega koda

A

podan je kot RNA
UNIVERZALEN: pomeni da je AUG pri vseh organizmih start kodon. isti kodon kodira isto AK pri vseh organizmih

REDUDANTEN: ena AK je zapisana z več različnimi kodoni

DEGENERIRAN: več stvari se isto bere

38
Q

VEZI V PROTEINIH

A

H vezi (največ)
SS - mostički
hidrofobne interakcije

39
Q

strukture proteinov

A

primarna: zaporedje AK
sekundarna: alfa vijačnica
terciarna: beta strukture + alfa vijačnica
kvartarna dva proteina prepletena

40
Q

koliko rRNA sintetizirajo celice

A

celice sintetizirajo toliko rRNA in tRNA molekul koliko jih rabijo, kar pa je odvisno od hitrosti rasti

41
Q

kako so razporejeni geni za sintezo ribosomov

A

v večjih skupkih okoli oriC
– niso naključno razporejeni

42
Q

regulacija sinteze rRNA

A
  • celice, ki rastejo hitreje rabijo več ribosomov – usklajenost s hitrostjo rasti
  • preko koncentracije ATP oz. GTP
43
Q

odziv na neugodne razmere

A

ko ni hranil (ni aa-tRNA) se translacija ustavi, saj tak odziv celici prihrani energijo in vire
STRINGENT RESPONSE
vezan je na nastanek ppGpp

44
Q

opiši nastanek ppGpp

A

GTP (RelA) –> pppGpp + AMP
RelA - relaxed control gen A
spoT

45
Q

vloga ppGpp

A

nastane ob pomanjkanju hranil, pri prehodu v stacionarno fazo, v stresnih pogojih
= splošni alarmon, ki se veže na RNAP

46
Q

DksA

A

protein pri E. coli, ki poveča delovanje ppGpp na RNAP

mikrobna izpit (17 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions