2010

Question 1

Nennen Sie die 4 wichtigsten gentechnisch veränderten Pflanzen

Answer 1

Mais, Flar-Savr-Tomate, Glyphosat-resistente Pflanzen, Dürre-Resistenz ?

Question 2

a) Beschriften Sie Ordinate und Abszisse des Graphen (Gerade von -x-Achse schräge nach oben)
b) Wie heißt der Modus der Inhibition von Glyphosat?
c) Wie verändert sich die Steigung unter dem Einfluss von Glyhphosat? (gegenüber der Kurve in a)

Answer 2

a) Ordinate: Konzentration von 5-Enolpyruvyl-shikimat-3-phosphat (EPSP) oder Chorismat (Endprodukt)
Abzisse: Zeit
b) kompetitiver Inhibitor
c)flacher

Question 3

Geben Sie die Formel von Glyphosat an

Answer 3

N-Phosponomethyl-glycin (Glycin + CH2 am N + PO3H2)

Question 4

Nennen Sie drei molekulare Prozesse mit denen Herbizide in Pflanzen detoxifiziert werden können.

Answer 4

N-Acetylierung (Glyphosat)

Eventuell Ox/Red-Reaktionen, Hydrolyse, Konjugationsreaktionen. Aber keine Ahnung was er da hören will

Question 5

Die epigenetische Genexpression lässt sich messen an:

• Aktivität der Gene
• Mutationsrate der Gene

Answer 5

Aktivität der Gene

Question 6

Ordnen Sie die folgenden Mutationen den chemischen Modifikationen zu:

1) Desaminierung
2) Depurinierung
3) Oxidation durch ROS
4) Alkylierung

a) Transition C-G wird zu A-T
b) Rasterschubmutation
c) Replikationsstop

Answer 6

Desaminierung: C wird zu U –> Transition C-G wird zu A-T
Depurinierung/Depyrimidinierung: abasische Stelle –> Rasterschubmutation
Oxidation durch ROS: 8-Oxo-Guanin paart mit A –> Transition C-G zu A-T und Thyminglykol führt zum Replikationsstop
Alkylierung: O6-Methylguanin paart mit T –> Transition C-G zu A-T

1 a
2 b
3 a und c
4 a

Question 7

Warum sind freie Radikale für den Körper problematisch?

Answer 7

freie Radikale wandeln Zielmoleküle in neue Radikale um (z.B. Fettsäure-Seitenketten, DNA, Proteine) –> neue Radikale können miteinander reagieren –> schädigen die beteiligten Moleküle

Question 8

Benennen Sie die generellen Basenpaarungsmöglichkeiten in einer Triplex-DNA

Answer 8

Hogsteen Basenpaarung:
T-AT, C-GC+ (saures Milieu),
eher unstabil: TAG und CGG

Question 9

Warum werden CpG Oligos als Gefahrensignal von Säugerzellen erkannt. 2 Begründungen.

Answer 9

CpG Oligonukleotide werden von Toll-like Rezeptor 9 erkannt (war nicht Teil der Vorlesung)

Question 10

Aptamere binden über ihre 3D-Struktur an ihre Zielmoleküle. Nennen Sie 3 Möglichkeiten

Answer 10

Wasserstoffbrückenbindungen, elektrostatische Wechselwirkungen, adaptive Bindungen (herumfalten)

Oder: möchte hier nicht eher auf die Terminator Haarnadel oder Sequestor hinaus, die nach Liganden Bindungen zu einer Bp zwischen Aptamer Domäne und SS führen.

Oder: 3D Strukturen von RNA: pseudoknoten, kissing hairpin, koaxiale Basenpaarung

Question 11

Die RNAi-Maschinerie kann über siRNA und miRNA wirken. Wie wirken diese jeweils?

Answer 11

siRNA: führen zur Spaltung der RNA
miRNA: führen eher zur Inhibition der Expression

Question 12

Benennen Sie die zelluläre Komponente, in der die Target-mRNA durch siRNA beeinflusst wird

Answer 12

1. Dicer Prozessierung: Dicer (RNAse III) spaltet lange dsRNA in kurze siRNA von 20-25nt
2. Bildung des RISC:: Übergabe der siRNA mithilfe von Dicer und TRBP an Argonaut (benötigt Mg2+)
3. Guide Strang Selektion: Passsenger (sense) Strang wird gespalten und entfernt
4. Target mRNA Erkennung und Spaltungg: Bindung mRNA target und guide durch endnukleatische Spaltung
5. RISC_Recycling: gespaltene mRNA wird entfernt, wobei RISC weiterhin über den gguide strang binden kann