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BIO_2240 GDM > 1_COURS Concepts de base et méthodes > Flashcards

1_COURS Concepts de base et méthodes Flashcards

1
Q

donner la définition de développement

A

processus biologique qui détermine la forme de l’organisme et sa structure interne

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Q

donner la biologie du développement avant vs maintenant

A

avant : préformation (juste de la croissance)

maintenant : épigenèse (structures apparaissent progressivement)

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3
Q

donner la théorie des cellules

A

tous les organismes vivants sont constitués d’une ou plusieurs cellules qui dérivent d’une autre cellule par division cellulaire

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4
Q

quelles sont les 2 sortes de cellules ?

A
  • germinales

- somatiques

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5
Q

quelle était la théorie des cellules et leurs déterminants cellulaires et qu’elle XP l’a réfuté ?

A

noyau de l’oeuf fécondé possède autant de déterminants cellulaire qu’il y a de cellules différentes et que la division cellulaire sépare les déterminants nucléaires
XP : après 1ère division d’un oeuf fécondé on tue une des 2 cellules, l’oursin qui en résulte est juste plus petit

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6
Q

quelle XP montre que les cellules communiquent entre elles lors de la gastrulation ?

A

prend cellules de la bouche qu’on met au niveau des fesses : développement d’une bouche

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7
Q

que doit faire un groupe de cellules pour former un organe ? (5)

A
  • se diviser
  • se différencier
  • se déplacer
  • patronage des tissus (patterning)
  • apoptose
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8
Q

donner 3 caractéristiques de la croissance

A
  • multiplication cellulaire
  • augmentation de la taille des cellules
  • déposition de matériel extracellulaire (os)
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9
Q

quelles sont les différences entre la croissance animale et végétale ?

A

animaux : croissance généralement déterminée, division cellulaire possible sans croissance
végétaux : peuvent grandir toute leur vie, division cellulaire en même temps que la croissance

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10
Q

définir le patterning

A

processus par lequel l’activité cellulaire est organisée dans le temps et l’espace pour organiser les organes de l’organisme

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11
Q

quand se passe généralement le patterning chez les animaux ?

A

à l’embryogenèse : après la naissance ils ne font que grandir

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12
Q

donner le plan du corps (axes (6) et organes (5))

A

axes : postérieur, antérieur, dorsal, ventral, gauche, droite
organes : distal, proximal (animaux), adaxial, abaxial, latéral (plantes)

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13
Q

donner 2 polarités différentes

A
  • apico-basale

- planaire

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14
Q

où est vue la polarité apico-basale ?

A

visible au niveau des cellules par distribution de protéines différentielles

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15
Q

définir la polarité planaire

A

polarité dans le tissu en développement sur une surface

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16
Q

quelle est la différence entre les cellules animales et végétales en ce qui concerne le mouvement cellulaire ?

A

cellules animales peuvent se déplacer (ex : formation des intestins, cellules cancéreuses méristématiques)
cellules végétales ne peuvent pas à cause de leur paroi

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17
Q

dans quoi est impliquée la mort cellulaire chez les animaux ? chez les plantes ?

A

animaux : morphogenèse (membrane entre les doigts)

plantes : morphogenèse et différenciation (xylème)

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18
Q

définir la différenciation

A

processus par lequel les cellules se spécialisent en différents types

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19
Q

quelle est la grande différence entre la différenciation chez les plantes et les animaux ?

A

processus réversible chez les plantes mais pas les animaux (peut obtenir une plante à partir d’une feuille mais pas un animal à partir d’une patte)

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20
Q

qu’est-ce que le patterning des couches cellulaires ?

A

allocation de cellules dans les couches spécifiques de l’embryon (tôt chez les plantes et variable chez les animaux)

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21
Q

comment les gènes déterminent-ils le devenir des cellules ?

A

déterminent la production de protéines, leur localisation et le temps de synthèse

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22
Q

donner exemples de possibilités pour changer le nombre, localisation et la fonction des protéines dans la cellule (4)

A
  • FT (augmentent ou diminuent la production)
  • alternative splicing (découper ARNm différemment donc donne protéine différente)
  • ARNm séquestré dans le noyau
  • protéines modifiées une fois produites (ajout de glucide)
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23
Q

donner le rôle majeur des FT activateurs et répresseurs

A

activateurs : se lient à la séquence régulatrice pour activer la transcription
répresseurs : dissocient la polymérase

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24
Q

donner un exemple schématique d’une RA positive

A

gène produit une protéine qui se lie au promoteur d’un autre gène qui produit une protéine qui se lie au promoteur du premier gène

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25
Q

quel est le résultat d’une RA positive ? à quoi sert-elle ?

A

augmente la production des protéines des 2 gènes

bascule le développement cellulaire

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26
Q

donner un exemple schématique d’une RA négative

A

une gène produit une protéine qui stimule la production d’un autre gène qui inhibe la traduction du 1er gène

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27
Q

quel est le résultat d’une RA négative ? à quoi sert-elle ?

A

expression stable du gène

permet de maintenir des cellules similaires dans un tissu

28
Q

comment l’expression d’un gène dans une cellule peut déterminer le développement ?

A

gène dans la cellule peut inhiber la production de ce gène dans les cellules voisines

29
Q

que permet le comportement différentiel des cellules ?

A

fournit le lien entre l’action des gènes et le développement : permet d’avoir des changements structuraux

30
Q

à quoi servent les interactions inductives ?

A

permettent de rendre les cellules différentes les unes des autres

31
Q

comment peut être transmis un signal inducteur ? (3)

A
  • diffusion
  • contact direct
  • jonctions lacunaires (plasmodesme des plantes)
32
Q

décrire la transmission du signal inducteur par diffusion

A

cellule relâche des hormones / peptides / protéines et l’autre cellule a des récepteurs pour ces molécules

33
Q

décrire la transmission du signal inducteur par contact direct

A

protéine / peptide sur la membrane de 2 cellules, leur contact provoque un signal dans la cellule

34
Q

quel est le terme désignant la possibilité d’une cellule de percevoir un signal pour avoir une réponse ?

A

compétence

35
Q

comment créer un motif à partir d’un groupe de cellules identiques ? (2)

A
  • différentes caractéristiques selon les informations positionnelles par diffusion d’hormone (possible chez plantes et animaux)
  • attribution aléatoire de caractéristiques puis organisation des types de cellules pour former un motif (uniquement chez les animaux)
36
Q

définir une molécule morphogène

A

molécule de signalisation influençant le devenir des cellules en fonction de leur emplacement dans le réseau de cellules : peut être inhibiteur ou stimulateur (système peut être régénéré après perturbation)

37
Q

que permet le système de gradient de morphogène ?

A

permet de déterminer les seuils d’activation (système peut s’ajuster facilement à différentes longueurs)

38
Q

donner les 2 gradients de molécule morphogène possibles

A
  • linéaire

- planaire

39
Q

que peut générer une inhibition latérale (gradient sur un plan en 2D)

A

peut générer des motifs (produit + diffuse un morphogène qui inhibe la production du morphogène dans les autres cellules)

40
Q

comment spécifier le type de cellule selon le type de division ? (2)

A
  • division symétrique : 2 cellules identiques avec le même destin
  • division asymétrique : 2 cellules qui n’ont pas le même destin
41
Q

comment peut-on assurer le développement ? (3)

A
  • redondance
  • RA négative
  • réseau régulatoire
42
Q

définir le redondance

A

voies de signalisation dupliquées : légères différences entre elles donc si une est défectueuse les autres peuvent amener à la même réponse

43
Q

comment les RA négatives assurent-elles la fiabilité du développement ?

A

stabilisent les gènes pour qu’il n’y ai pas d’expression forte d’un gène

44
Q

définir le réseau régulatoire

A

signaux qui existent pour contourner des problèmes dans une voie

45
Q

pourquoi le développement est-il central pour l’évolution ?

A

évolution des organismes n’est possible que s’ils se développent d’une façon spécifique

46
Q

qu’est-ce qui est touché le plus par le développement / l’évolution ?

A

les séquences régulatrices

47
Q

que se passe-t-il s’il y a des changements dans la séquence régulatrice d’un gène ?

A

donne quelque chose de différent avec la même protéine car elle est exprimée à un moment différent, pendant un temps différent, à une concentration différente…

48
Q

définir un organisme modèle

A

espèce étudiée de manière approfondie pour comprendre un phénomène biologique particulier

49
Q

donner les avantages des organismes modèles (5)

A
  • facile à manipuler expérimentalement
  • modifications génétiques faciles
  • leur génome est séquencé : on connaît leurs gènes
  • proche des humains (intérêt médical)
  • proche des organismes importants économiquement
50
Q

définir une mutation

A

modification rare, accidentelle ou provoquée, de l’information génétique

51
Q

pourquoi veut-on obtenir des mutations dans les organismes modèles ?

A

elles perturbent le développement ce qui permet de découvrir à quoi servent certains gènes

52
Q

donner les 3 types de mutations

A
  • récessive (effets à l’état homozygote)
  • semi-dominante (effets à l’état hétérozygote et létal à l’état homozygote)
  • dominante (létal à l’état hétérozygote)
53
Q

comment se produisent les mutations au hasard ? (3)

A
  • spontanément dans les populations naturelles
  • via des mutagènes (substances chimiques, radiations…)
  • T-ADN (insertion aléatoire de mutants dans le génome provenant de bactéries)
54
Q

comment se produisent les mutations ciblées ? (3)

A
  • recombinaison homologue ciblée
  • extinction de gène
  • autres techniques (CRISPR-cas9, Zinc finger, TELEN…)
55
Q

décrire une recombinaison homologue ciblée (3)

A
  • gène de sélection (marqueur) synthétisé avec des bordures spécifiques à un gène dans le génome
  • introduit dans la cellule
  • partie homologue au gène ciblé va recombiner avec le marqueur (tue le gène spécifique)
56
Q

décrire une extinction de gène (3)

A
  • introduit un ARN interférent qui sera coupé par une protéine
  • génère des fragments spécifiques aux fragments à tuer
  • fragments se lient à un complexe de protéine qui va cliver la molécule d’ARN
57
Q

quelles sont les 2 approches génétiques pour déterminer la fonction d’un gène ?

A
  • classique

- inversée

58
Q

décrire la génétique classique

A

part du phénotype pour aller vers le gène : cherche à étudier un gène responsable d’un phénotype
==> doit identifier les mutations qui affectent le phénotype

59
Q

décrire la génétique inversée

A

part du gène pour comprendre sa fonction : cherche à comprendre la fonction des gènes donnés par l’observation des mutants

60
Q

pourquoi la microscopie est-elle la technique la plus importante pour comprendre le développement ?

A

permet de voir les changements spatio-temporels des cellules

61
Q

quel est le microscope le plus utilisé en développement et le décrire

A

microscope confocal : microscope à fluorescence avec une faible profondeur de champ, permet de faire des sections optiques et une reconstitution en 3D

62
Q

que sont les GFP et que permettent-elles

A

protéine de fluorescence

permettent une résolution spatiale et temporelle : visualiser les cellules en temps réel sans tuer l’organisme

63
Q

comment faire la localisation des protéines avec les GFP ?

A

doit fusionner la protéine ou le promoteur cible à la GFP

64
Q

donner 2 techniques pour regarder la croissance et le développement en temps réel

A
  • lineage tracing (traçage de lignée cellulaire)

- live-imaging

65
Q

définir le lineage tracing

A

déterminer l’origine de tissus en établissant la correspondance entre des cellules individuelles à un stade de développement et leur descendance à des stades ultérieurs (colorant ne se déplace pas entre cellules : retrouve un secteur marqué)

66
Q

définir le live-imaging

A

utilisation d’un microscope confocal pour suivre la croissance en temps réel (fait des images du tissu à des intervalles de temps spécifiques puis obtient une image 3D : peut trouver la cellule mère qui donne naissance aux cellules filles et calculer la croissance du tissu à partir de 2 images)
==> permet de regarder le comportement de cellules individuelles pour tout l’organe de façon quantitative

BIO_2240 GDM (8 decks)

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