14 Flashcards
Classe 1
Bénin
probablement présent chez tout le monde
pas de conséquences
Classe deux
probablement bénin
aucune conséquence = hérité d’un parent en bonne santé
Classe trois
Variations de signification indéterminée
Benin égal pathogènes
Classe quatre
Probablement pathogènes
variant du site catalytique forte suspicion protéine pas fonctionné
Classe cinq
Pathogènes
variations déjà rapporté chez d’autres patients
Classe six ( hors classification)
Variation un pénétrons incomplète expressivité variable
facteurs de susceptibilité troubles du Neuro développement
PNMR 3
2018 2022 Re labellisation : Cinq objectifs : diagnostic rapide pour chacun : diminuer errance et impasse diagnostique Augmenter les moyens thérapeutiques Améliorer qualité de vie et autonomie Communiquer et former Moderniser
Sitôt génétique
Analyse au niveau chromosomique :
caryotype/FISH/CG H array: puces à ADN
Biologie moléculaire
Moléculaire/chromosomique
qPCR
N GS : technique de séquençage haut débit :
Panel : séquençage groupe de jeunes connu
Exo me : séquençage tous exon gêne organise
Génome : séquençage de l’ensemble de l’ADN
Panel :
NGS
séquençage groupe de GENE connu
Exo me :
NGS
séquençage tous exon gêne organise
Génome :
NGS séquençage de l’ensemble de l’ADN
Différence entre de génétique
Diagnostique natal
Génétique de l’enfant
Génétique de l’adulte
Onco génétique
Caryotype : détection
Aneuploïdie
Variations de structure
Sitôt génétique
Caryotype anténatal dépistage combiné trisomie 21>1\50
Biopsie de trophoblaste : recherche d’un après-midi j’ai fœtus aneuploïdie chez le fœtus/anomalie viable : 13 18 et 21 plus chromosomes sexuels
Anomalie viable
Trisomie 13/18/21
Anomalies des chromosomes sexuels : moins de conséquences dans la majorité des cas
Caryotype anténatal
Confirmation d’un DPNI : diagnostic prénatal non invasif positif pour trisomie
Échographie : malformation visible
Antécédents familiale d’anomalies équilibré : translocation/inversion
Caryotype postnatal :
Fausse couche à répétition : supérieur à 3/infertilité
Retard de croissance puberté chez les filles : syndrome de Turner :
Suspicion de syndrome génétique chromosomique : trisomie 21
Syndrome de Turner :
Monosomie X/1 seul chromosome X
Phénotype féminin
Particularité du visage : cou palme /oreilles un peu basse
Petite taille
Absence de puberté : infertilité
Pas de déficience intellectuelle : difficultés d’apprentissages : troubles du raisonnement
Malformation cardiaque grave : coarctation de Lahorte
FISH
Cytogénétique
Examen ciblé : coloration d’une partie de chromosomes : Locus spécifique
Détection : délétion en duplication d’une partie d’un chromosome
Syndrome de micro délétion/duplication est diagnostiquée cliniquement
Vérification d’un CN V de grande taille : CGA Charré
Ségrégation familial : CN V grandes tailles
Complément : détection/caractérisation d’une anomalie structure
Différents types de FISH
Sonde centromerique : plus rapide dès que le caryotype : présence de deux ou trois chromosomes 21
Sont spécifiques de locus : micro délétion sur un chromosome : le sept : syndrome de Williams Beuren
Peinture chromosomique spécifique : pour la recherche : pas d’intérêt pratique
Sonde centromerique
Plus rapide que le caryotype
Présence de 2/3 chromosomes 21
ACPA
Cytogénétique
ADN du patient comparer ADN témoin : fragmentation plus fluo
Hybridation compétitive
Mesure d’intensité de fluorescence : scanner
Traitement informatique :
déviation à gauche égal délétion par rapport aux témoins
Déviation à droite égal duplication par rapport aux témoins
ACPAAnténatal
Anomalie morphologique fœtal à l’échographie
hyper clarté nucal : supérieur à 3,5 mm
Retard de croissance en train utérin
ACPA Post natale
Syndrome informatif
Troubles du développement intellectuel
Troubles des apprentissages
ACPA détection
CN V : maladie de 10 Georges
qPCR
Examen ciblé sur un blocus précis : syndrome de Lix fragile : maladie à expansion de triplés : CGG
Indications : confirmation de la présence par un CN V de petite taille
Étude de la ségrégation dans V NV de petite taille d’une famille
Étude de maladie à expansion triplé
Sequencage d.exome / génome
Diagnostic de milliers de maladie : variation ponctuelle de l’ADN/variation du nombre de copies : SNV et CN V sur le même examen
Indications : troubles développement intellectuel : déficience intellectuelle : plein de gêne/syndrome
Anomalies du développement
Épilepsie
Cancer
Maladie rare : 51 pris indications
Maladie rare séquençage
Exo m’/génome : 51 pris indications
Diagnostic prénatal : en clinique
Conseil génétique : antécédents de la famille : génétique/héréditaire
Anomalie à l’écho :
Bilan suite à une IMG plus examen Phyto pathologique : accidentel : risque de récidive très drame
Non accidentel : recherche d’une maladie à transmission excessive : risque de récidive
Diagnostic prénatal vérification
Diagnostique chez l’enfant/adultes
Pour maladie d’origine génétique : malformation/troubles du développement intellectuel/épilepsie/maladie neurologique grave ou précoce/maladie familial
Par un médecin aspects : pédiatre/neurologue/cardiologue
Consultation génétique : avant
Courrier du médecin à dresseur/Histoire de la maladie/clinique/examens complémentaires déjà réalisé/questionnaire adressé en amont ou parents/passion
Consultation génétique pendant
Recueil des antécédents familiaux : arbre généalogique : suspecté si mode de transmission
Plusieurs personnes atteintes : transmission dominante
Uniquement les garçons : transmission X
Si passe uniquement par femme : mitochondrial
Anamnèse lâche examen clinique/prescription éventuelle d’examens complémentaires : I.R.M. si déficience intellectuelle
Prescription de bilan génétique
Consultation génétique après
Réunion de la concertation avec les biologistes : parallèle entre mutation trouver une clinique
Bibliographie
Rendu du résultat aux patients avec explication
Plus ou moins suivi
Patient attends d’une déficience intellectuelle
Évaluation clinique : Neuro pédiatre/généticien clinicien
Anomalie avec gêne connu : phénotype typique : analyse ciblée/phénotype spécifique :ACPA et X fragile
Si résultat négatif : RCP PFMG : plan France médecine génomique puis séquençage très haut débit du génome
Malformation cérébrale
Holoprosencéphalies plus malformation corticale : panel ciblé
Si résultat négatif : RCP PFMG d’amont: séquençage très haut débit
Conseiller en génétique formation
Master professionnel : deux ans : médecine prédictive et conseil génétique
Personne : infirmier sache femme ou titulaire de licence en biologie
Lieu de formation en France : Lyon et Marseille
Conseillère génétique : rôle
Et qui pluridisciplinaire : responsabilité du médecin qualifiant génétique
Interaction avec les familles les labos et les Centre pluridisciplinaire de diagnostic prénatal
Rôle : prescription des tests génétiques/le rendu des résultats/rédaction d’un compte rendu/participation au CP des PN
Assistant de prescription :
Collecte des données par la clinique des patients : dans les plates-formes de e-prescription
Aide à la prescription informatique
Consultation autonome : prescription des examens génétiques/signature des consentement sous la délégation de la généticien
Pluridisciplinaire
Suivi des analyses prescrit : différentes étapes d’analyses jusqu’au rendu du résultat
Lien entre laboratoire et clinicien
Trisomie 21
Incidence 1/1600 naissance : Cause la plus fréquente de déficience intellectuelle d’origine génétique
Dépistage prénatal : combiné au séquentiel : échographie au premier trimestre de grossesse
Risques : >1/50 caryotype
>1/1000 DPNI : Prise de sang fœtale/maternelle

Trisomie 21 : mécanisme de transmission
95 % libre et homogène : risque de récidive 1 %
5 % de mon livre : translocation Robert : risque de récidive cinq à 15 %
Trisomie 21 particularité morphologique
Profile plat Feinte palpébral oblique en eau et en dehors Petites oreilles rondes Clino dactylie du cinquième doigt Tache de brushfiel PPTu Sandales gap
Prise en charge trisomie 21
Kiné Psycho motte Orthophonie Psychologique Accompagnement éducatif MDPH
Syndrome de 10 Georges
Syndrome vélo cardio faciale : des lésions sur le chromosome 22
Incidence : 1/2000 -1/4000
Plus deux cents 80 anomalie associés : expressivité variable tout le monde n’a pas les mêmes
Dis Georges incidence
1/2000 -1/4000
Prise en charge 10 Georges
Adapter aux manifestations cliniques
Médical
Paramédical
X fragile
Répétition de triplet CCG
Liste d’instabilité : transmission maternelle
Cause la plus fréquente de déficients intellectuels familial
Prévalence : garçons1/5000
Fille1/8000
Première cause de déficience intellectuelle chez les garçons
Syndrome de Guy Georges
Cause la plus fréquente de déficience intellectuelle familial
Prévalence : 1/5000 naissances
Nombre de répétitions des triplés et gravité
5-54 CCG Allèles normaux/stable
55-200 Allèles prématuré, instable pendant la méiose féminine
>200 Mutation complète : syndrome de Lix fragile
Pré maturation syndrome X fragile :
FXTAS : Garçons : tremblements/a taxi/troubles cognitif et psychiatrie/neuropathie sensitive/hypersignal signaux
FXPOI: Fille inférieur à 40 ans
Autres : troubles duNeuro développement to
FXTAS
Garçon
Fragile X associed tremor Ataxia syndrome
FXPOI
Fragile X prématuré ovarienne failur
Syndrome de Lix fragile présentation variable chez les filles
Pas ou peu de particularité morphologique
QI normal basse ou déficience intellectuelle légère
Biais d’une activation de x : même manifestation que chez les garçons
Manifestation X chez les garçons
Clinique : retard langage/déficience intellectuelle/troubles de l’attention/hyper activité/intolérance à la frustration/troubles du spectre de l’autisme / épilepsie 20 % des garçons
Morphologique : visage allongé étroit /macrocéphalie/front ou élargi/oreilles décollées/lèvres épaisses et et versez/mal position dentaire/prognathisme : menton pointu/macro Orchies dit poste puberté
La mucoviscidose def
Gène CFTR : chromosomes 7
Code pour un canal chlore de points réguliers par la AMPc : au niveau des poumons : rôle dans la situation de mucus
Mucoviscidose maladie mono génique
Mutation du gène CFDR : sécrétion pâteuse à l’origine d’un encombrement : destruction progressive des poumons
Variations pathogènes :
Canal absent : un mot fonctionnel : formes les plus graves
Canal présent mais moins fonctionnel : forme moins grave de la maladie
Environ 2000 variations rapporter : deux tiers des variations de la population européenne :p.PHE508del
Transmission mucoviscidose
Autosomique récessive
25 % enfants de mon porteur
50 % enfants porteurs seins
25 % enfants atteints
Prévalence Mucoviscidose
Maladie grave chez l’enfant : la plus fréquentes dans la population caucasienne : 1/4500 naissance
Fréquence des hétérozygotes : 1/ 32
Diagnostique je mucoviscidose
Dépistage néonatal : teste de Guthrie Clinique Test à la sueur Étude de 30 mutation les plus fréquents : kit Séquençage complet du gène par N GS
Mucoviscidose principales manifestations
Attends pulmonaire/digestive
Corrélation génotype/du phénotype :
Mutation sévère : insuffisance pancréatique/attendre pulmonaire/agénésie bilatérale des canaux différents : infertilité chez les garçons/espérance de vie à 30 ans
Mutation peu sévère : en fonction pancréatique exocrine conserver : agénésie bilatérale des canaux différents : espérance de vie 50 ans
Variabilité interne individuelle : paramètre important à prendre en compte : facteurs environnementaux / gène modificateur
Mutation sévère :
insuffisance pancréatique/attendre pulmonaire/agénésie bilatérale des canaux différents : infertilité chez les garçons/espérance de vie à 30 ans
Mutation peu sévère :
en fonction pancréatique exocrine conserver : agénésie bilatérale des canaux différents : espérance de vie 50 ans
