13- Interaction Proteine Proteine

Question 1

nommer trois mechanismes de proteines et ses partenaires

Answer 1

1- interaction avec partenaires differents dans compartiments differents
2- partenaire diff apres modif post trad
3- competition entre concentration 2 prot
4- partenaire different pr chq domaine proteique

Question 2

3 forces determinant les interactions

Answer 2

forces electrostatiques (ionique typique ou modification post trad)
forces ioniques
forces hydrophobes

Question 3

Interactions ioniques typiques et modif post trad

Answer 3

typiques: Lys Glu
Lys Asp
Arg Glu
Arg Asp
His Glu
His Asp

Autres exemples (MPT): pSer Lys, pSer Arg
pTyr Lys pTyr Arg

Question 4

phosphorylation vs serylation

Answer 4

phospho ajout phosphate
seryl ajout serine

Question 5

pourquoi interaction dipole dipole important

Answer 5

sont sur la surf entre domaines proteiques pr favoriser contact avec molecule liee

Question 6

interactions cation pi, anion pi, soufre pi et amine pi

Answer 6

combinaison entre d-d et interactions ioniques
cation pi: noyau aromatique + lys ou arg
anion-pi: noyau aromatique + asp ou alu
soufre-pi: noyau aromatique + cys ou met
amine-pi: noyau aromatique + gln asn

Question 7

cest quoi les double interactions sur un noyau aromatique?

Answer 7

sur les deux cotes du noyau aromatique il peut faire deux types differents dinteractions cation pi, anion pi amine pi

Question 8

role de leau dans les forces hydrophobes

Answer 8

les aa non polaires ou hydrophobes veulent minimiser leur contact avec leau. eau = endothermique, aa non polaires = athermiques delta H = 0

Question 9

effet forces hydrophobes sur lentropie

Answer 9

qd aa hydrophobes se rassemblent lentropie autout augmente

Question 10

2 types dinteraction proteine ADN

Answer 10

seq ADN specif: p53
seq ADN non specif : histone

Question 11

quel type de proteine interagit avec des seq specif d adn, structure, ou sur l helice adn

Answer 11

regulateurs transcription
dimeres ayant helice a
sur le sillon maj

Question 12

pq dimerisation? (3)

Answer 12

1- augmente affinite de liaison
2- augmente diversite sites liaisons
3- augmente diversite regulation transcriptionnelle

Question 13

exemple homodimere
exemple heterodimere

Answer 13

ADN palyndromique
recepteurs dhormones steroides

Question 14

pk helice a cm ligand a lADN

Answer 14

entre bien ds sillon majeur presque mm diametre

Question 15

v ou f plus de 2/3 des interactions sont electrostatiques

Answer 15

v et se font avec le squelette de lADN (sucres et phosphates)

Question 16

but des interactions electrostatiques

Answer 16

stabilisent liaison proteine ADN (+affinite)
mais n augmentent pas specificite

Question 17

trois types de liaisons hydrogenes entre les prot et adn

Answer 17

bidente (+frequent)
simple
complexe

Question 18

v ou f les liaisons hydrogenes simples augmentent specificite

Answer 18

f elles augmente affinite de liaison et stabilite

Question 19

donneur et receveur de LH

Answer 19

donneur donne proton
receveur recoit proton (N,O)

Question 20

cest quoi une liaison hydrogene bidentee

Answer 20

chaine lat aa (Arg, Lys, Asn, Gln) + base ADN (2 LH ou +)

Question 21

cest quoi une liaison hydrogene complexe

Answer 21

chaine lat aa + 2 bases ADN (2 LH ou +)

Question 22

exemple de LH complexe

Answer 22

Arg avec deux G et un C ou Arg avec TG en diagonale

Question 23

resume des types de liaisons H

Answer 23

Liaisons hydrogène simples: pas specificite

*Liaisons hydrogène bidentées: Cruciales pour la reconnaissance de bases simples à des positions spécifiques.

Souvent effectuées par arginine

• Liaisons hydrogène complexes: Ne reconnaissent pas de simples bases, mais de petites séquences d’ADN.

Ce sont elles qui confèrent une spécificité universelle

Question 24

pourquoi arginine frequent en LH bident

Answer 24

geometrie structure geometrie longueur

Question 25

quels aa nont pas de modif post trad

Answer 25

G, P, A, V, L, I, F, W, H

Question 26

quels aa sont oxydes (sulfoxyde)

Answer 26

C, M

Question 27

quels aa sont phospho

Answer 27

S, T, Y

Question 28

quels aa sont methyles ou acetyles

Answer 28

K, R