1 COURS_Voies de Signalisation

Question 1

donner les 3 différentes méthodes de communication moléculaire entre cellules

Answer 1

• contact
• jonctions gap
• diffusion

Question 2

de quoi a-t-on besoin pour chaque système de communication ? (2)

Answer 2

• générateur du signal
• R du signal

Question 3

donner le groupe pour qui la voie de signalisation est la plus simple et décrire le type de molécule

Answer 3

molécules hydrophobes : pas solubles dans l’eau donc besoin d’un transporteur dans le sang et le cytoplasme mais passent facilement les membranes

Question 4

donner un exemple de système de communication par contact

Answer 4

système delta-notch

Question 5

décrire le système delta-notch

Answer 5

molécule de signalisation delta dans la membrane d’une cellule : R spécifique notch dans la membrane d’une autre cellule donc les 2 cellules doivent se toucher pour qu’il y ait communication

Question 6

que crée le système de communication par contact ? pourquoi ?

Answer 6

patrons : une cellule produit la molécule signal et inhibe la formation de molécules signal chez les cellules voisines qui produisent donc des molécules R

Question 7

nommer les structures qui permettent aux molécules de diffuser d’un cytoplasme à un autre chez les animaux vs les plantes

Answer 7

animaux : jonctions gap
plantes : plasmodesmes

Question 8

décrire les jonctions gap (2)

Answer 8

• 6 connexines forment un canal et s’alignent avec le canal d’une autre cellule donc contact des cytoplasmes
• diffusion libre pour des molécules plus petites que 1000 Da

Question 9

décrire les plasmodesmes (2)

Answer 9

• formés lors de la division cellulaire : fragment de RE prit dans l’espace entre les 2 nouvelles cellules donc connection cytoplasmique
• diamètre qui peut augmenter si une molécule possède la ‘clé’

Question 10

décrire la communication par diffusion

Answer 10

molécule sécrétée par une cellule puis relâchée à l’extérieur : atteint le tissu cible et se lie au R pour produire la réponse dans la cellules cible

Question 11

donner les différences entre les molécules dans les 3 types de communication

Answer 11

• contact : molécules fixes
• jonctions : molécules diffusibles mais restent dans les cytoplasmes
• diffusion : molécules diffusibles relâchées à l’extérieur de la cellule (pas besoin de contact)

Question 12

tant qu’une molécule diffusible (= signal) est à l’extérieur de la cellule, elle y répond or il faut parfois des réponses ponctuelles, comment résoudre ce problème ? (3)

Answer 12

• molécules instables qui se dégradent rapidement
• produit des enzymes qui dégradent les molécules
• utilise de mécanismes pour ignorer la présence du signal

Question 13

donner un exemple de réponse ponctuelle à la molécule diffusible NO

Answer 13

molécule instable qui permet de relâcher les vaisseaux sanguins : NO active des protéines enzymatiques cytoplasmiques qui transforment le GTP en GMPc qui active une pompe Ca2+ donc plus de Ca2+ dans la cellule musculaire donc se décontracte

Question 14

pour augmenter le flux sanguin on peut ajouter du GMPc mais il y a une autre manière, décrire cette manière avec l’exemple du viagra

Answer 14

viagra bloque la dégradation de la GMPc par la GMPc phosphodiestérase

Question 15

l’acétylcholine a une durée de vie moyenne hors de la cellule, comment l’organisme arrête-t-il la réponse au signal ?

Answer 15

sécrète l’enzyme acétyl CoA qui dégrade l’acétylcholine

Question 16

par quoi peut être expliqué les différents types de réponses cellulaire pour une même molécule ? (2)

Answer 16

• R différent
• voie de signalisation différente

Question 17

PROBLÈME :
Succinylcholine est un analogue de l’acétylcholine utilisé par des chirurgiens pour provoquer un relâchement des muscles squelettiques (striés). Sachant que l’acétylcholine est normalement dégradée par l’acétylcholinestérase et que ses R ont 3 conformations (fermé, ouvert, inactivé), pourquoi l’analogue provoque un relâchement des muscles alors que l’acétylcholine provoque normalement la contraction ?

Answer 17

l’acétylcholinestérase ne peut pas dégrader la succinylcholine donc elle reste liée au R qui devient inactif

Question 18

décrire les molécules informatives hydrophobes (4)

Answer 18

• longue durée de vie
• change la conformation pendant longtemps
• pas soluble dans l’eau donc besoin d’un transporteur dans le sang et le cytoplasme
• passe les membranes plasmiques facilement

Question 19

décrire un domaine protéique

Answer 19

séquence de protéine qui se replie toujours de la même façon indépendamment de où elle est or la conformation donne la fonction donc le domaine a toujours la même fonction

Question 20

décrire la technique d’empreinte

Answer 20

permet de déterminer la position de gènes avec la DNase : DNase produit des fragments d’ADN (‘témoin’), mélange un autre ADN avec la protéine qui s’y lie donc rend une partie de l’ADN inaccessible à la DNase donc sait où se lie la protéine

Question 21

décrire une séquence régulatrice

Answer 21

domaine de liaison de l’ADN où peut s’insérer une protéine de liaison de l’ADN

Question 22

décrire le chemine d’un glucocorticoïde de son entrée dans la cellule à sa liaison à l’ADN

Answer 22

petite molécule transportée dans le sang puis passe la membrane puis se lie à son FT-R qui s’active et entre dans le noyau pour se lier à l’ADN

Question 23

nommer le site de liaison du glucocorticoïde à l’ADN

Answer 23

GRE

Question 24

décrire le processus pour ID le FT activé par le glucocorticoïde

Answer 24

ID les protéines produites en réponse à la présence de glucocoritcoïde pour savoir de quel gène elle provient et donc trouver la séquence régulatrice à laquelle se lie le FT

Question 25

comment trouver la protéine produite en réponse à la présence de GC ?

Answer 25

comparaison des protéines trouvées chez des cellules qui répondent au GC traitées avec des GC et non traitées

Question 26

comment séquencer la protéine produite en présence de GC une fois trouvée ?

Answer 26

séquençage par spectroscopie de masse

Question 27

que permet l’ID de la protéine produite en présence de GC ?

Answer 27

peut trouver la séquence transcrite donc régulatrice (GRE)

Question 28

comment trouver GRE ?

Answer 28

extrait nucléaire des cellules traitées et non traitées au GC puis fait une empreinte

Question 29

une fois GRE trouvé, comment trouver le FT qui s’y lie ?

Answer 29

chromatographie par affinité : met la séquence GRE dans une bille puis met dans une colonne avec toutes les protéines de la cellule donc toutes les protéines qui lisent GRE s’y lient puis séquençage pour ID le FT

Question 30

donner les domaines de liaison du FT-R de GC (3)

Answer 30

• liaison à l’ADN (partie FT)
• liaison au GC (partie R)
• domaine de transactivation (active la transcription du gène)

Question 31

grâce à la technique d’empreinte, on observe différentes choses quand on ajoute le domaine 1, 2, 2 et 3 et 2, 3 et GC en plus du GRE, donner les observations, que peut-on en conclure ?

Answer 31

domaine 1 : GRE ne se lie pas à l’ADN (= ne lit pas l’ADN)
domaine 2 : GRE se lie à l’ADN
domaines 2 et 3 : GRE ne se lie pas à l’ADN donc 3 donne une dépendance de la protéine aux GC pour se lier à l’ADN
domaines 2, 3 et GC : GRE se lie à l’ADN

Question 32

réponse courte : comment est-ce que les molécules stéroïdiennes peuvent-elles avoir un effet à long terme (ex : caractères sexuels) ?

Answer 32

RA positive

Question 33

réponse longue : comment est-ce que les molécules stéroïdiennes peuvent-elles avoir un effet à long terme ?

Answer 33

molécule stéroïdienne se lie à son R et provoque une réponse primaire ce qui produit des protéines dont le FT qui a provoqué la réponse primaire (= réponse 2aire)

Question 34

définir une réponse primaire

Answer 34

molécule de signalisation provoque directement l’effet sans avoir besoin de synthétiser quelque chose préalablement donc l’ajout de cette molécule provoque tout le temps le même effet

Question 35

définir une réponse 2aire

Answer 35

réponse qui ne peut pas avoir lieu si la synthèse protéique est bloquée

Question 36

qu’observe-t-on comme patron quand il y a une RA négative ?

Answer 36

patron d’alternance entre activation et inactivation : oscillations