week 6 Flashcards
donner la définition d’un virus
un parasite obligatoire qui dépend de la cellule hôte pour se répliquer
donner la définition structurale d’un virus
un virus c’est un agent infectieux constitué d’un seul acide nucléique = génome, entouré d’un coque protéique = capside, l’ensemble pouvant être (ou non) entouré d’une membrane lipidique = enveloppe.
qu’est ce que c’est un nucléocapside?
acide nucléique + capside
est-ce que la présence d’une enveloppe est obligatoire?
La présence d’une enveloppe est caractéristique de certaines familles virales. Certaines ont, certaines non. La présence ou pas est très important, parce ça fait différence: sensible ou pas à l’environnement.
quelles sont les différences entre microorganismes unicellulaires et virus?
- les virus ne possèdent pas les organelles
- chez les organismes unicellulaires le matériel génétique c’est le ADN, chez les virus c’est ADN ou ARN
- les virus dépendent obligatoirement de la cellule “hôte” pour se reproduire, tandis que les cellules unicellulaires possèdent leur propre appareillage pour synthétiser les macromolécules nécessaires à leur reproduction
- les virus sont résistants aux antibiotiques, cellules unicellulaires sont sensibles
qu’est ce que c’est un capside?
un coque protéique
l’enveloppe des virus c’est …
une membrane lipidique
à partir de quels ribosomes un virus fait ces protéines?
à partir de ribosome d’une cellule qu’il a envahi
pourquoi des virus ne sont pas considérés comme des cellules?
à cause d’absence des organelles
le virus ne va pas se répliquer tant que…
il y aura une cellule
qu’est ce que ça veut dire que l’acide nucléique viral est souvent infectieux?
si on isole l’acide nucléique de virus et l’injecte dans une cellule, cela va pousser la cellule de produire les clones du même virus. Pas tout les virus ont cette propriété! Chez ceux ça prend toute la particule virale (pas juste l’acide nucléique).
qui est filtrable: batteries ou virus?
virus sont filtrables, les bactéries non (pour un grandeur spécifique des pores).
la grandeur de virus le plus petit est … le plus grandes ….
1 nm et 400 nm
un microscope ordinaire peut nous permettre de voir les virus…
les plus gros, comme meganovirus (?)
le plus complexe virus …
poxviridae
spécificité des adenoviridae
projections qui sortent de leur capside
décrire la forme de la capside hélicoïdale
acide nucléique au centre, et autour unité de la capside , attachés à l’acide nucléique. Au microscope ça l’air de battonnet.
nucléocapside hélicoïdale donne une forme …
forme ronde. On ne voie pas la capside hélicoïdale, elle est à l’intérieur de l’enveloppe virale.
les peplomères sont
des protéines (virale et parfois de la cellule hôte) qui sortent de l’enveloppe virale. L’enveloppe n’est pas faite parfaitement 100% des protéines virales, mais aussi les protéines de la cellule.
où se situe la matrice?
la matrice se situe entre l’enveloppe et l’acide nucléique. Contient les protéines virales.
définir la forme de capside icosaédrique
capside à 20 phases triangulaires!
si il y a une enveloppe autour de la capside icosaédrique
la forme ronde de l’enveloppe autour de la forme icosaédrique de la capside
est-ce que la présence de l’enveloppe est obligatoire pour les virus?
non, mais ceux qui n’ont pas l’enveloppe sont plus fragiles
il existe combien de forme des capsides?
les deux mentionnés (icosaédrique et hélicoïdale)et aussi la forme complexe
qui sont les exceptions par rapport à la grandeur?
les virus géants! Les virus >1 µm;
est-ce que les virus géants sont filtrables?
Non!
le type de matériel génétique des virus géants?
obligatoirement ADN
le type de matériels génétique chez virus
- DNA ou RNA
- Bicaténaire ou monocaténaire
- Segmenté ou non segmenté (en morceaux) chaque gène a son propre morceau. 8 morceau chez influenza.
- Linéaire ou circulaire (dans le virus c’est linéaire, mais une fois il infecte la cellule hôte ça devient circulaire)
- Poids moléculaire très variable (1.5 x 106 à 160 x 106 daltons)
On peut avoir un génome constitué de double brun ARN! ou ADN simple brun (c’est pas ordinaire de voir ces forme de ADN et ARN).
quels sont les 4 types de génome viraux?
- ADN bicaténaire
- ADN monocaténaire
- ARN monocaténaire
- ARN bicaténaire
Donc il y a une variabilité dans le génome viral
quels sont les méthodes de diagnostic viral
- Microscopie électronique (d’habitude n’est pas suffisante)
- Culture cellulaire + immunofluorescence (IF) avec un anticorps spécifique (c’est la méthode préférée des laboratoires)
- PCR (très utilisé aujourd’hui; réaction de polymérisation en chaîne; très vite comme méthode - on a besoin juste d’un morceau du virus)
- Séroconversion (recherche des anticorps par IF ou ELISA). Personne qui a été infecté par un virus, présenté ou pas les anticorps
comment on classifie les virus?
par:
- ordre
- famille (ADN ou ARN; double brun ou simple brun, forme de capside, présence d’enveloppe ou non)
- sous-famille (poids moléculaire de l’acide nucléique, diamètre des particules virales, nombre de capsomères (= unités de capside), hôtes infectés, etc)
- genre
- espèce
viridae signifie:
veut dire qu’on parle d’une famille virale
virinae signifie:
on parle de sous famille
virale signifie:
ordre
quels sont les étapes de la réplication virale?
- en général
- Attachement – à l’aide d’un récepteur spécifique sur la cellule cible qui reconnaît une protéine à la surface du virus
- Pénétration
- Décapsidation (‘uncoating’)
- Transcription (précoce)
- Traduction (précoce)
- Synthèse des enzymes de réplication
- Réplication de l’acide nucléique
- Transcription (tardive)
- Traduction (tardive)
- Synthèse des protéines structurales
- Assemblage des nucléocapsides
- Bourgeonnement
est-ce que tous les virus ont la même réplication?
pas du tout! chaque type de virus a ces spécialités.
pourquoi l’humain n’est pas infecté par des virus des plantes par exemple?
parce que on n’est pas capable de s’attacher, et donc pas d’infection! étape d’attachement est très spécifique, si le récepteur n’est pas là, donc on ne peut pas infecter.
quant à la pénétration, est-ce que tous les virus le font à la même manière?
la capside doit entrer (par pinocytose).
comment on divise les étapes de la réplication virale?
tous ce qui est fait avant l’étape de réplication de virus - précoce. Si après - tardive, donc arrive après la réplication virale.
cycle réplicatif:
- l’attachement se fait via les recteurs et ligands qui sont spécifiques;
- fusion de l’enveloppe de virus et membrane cellulaire;
- décapsidation - il enlève sa capside. Avant cela, la bactérie n’est pas infectée!
- réplication du génome virale à l’aide d la cellule cible
- production de protéines virales
- assemblage des particules virale (génome+ capside)
- relâchement
qu’est ce qui se passe avec la cellule après ?
elle est détruite
pour les virus comme herpès, qui contiennent l’ADN, le processus de réplication …
les virus avec enveloppe - fusion avec la membrane, les trois étapes (transcription/réplication/assemblage) se passent dans le noyau, les protéines sont synthétisé dans la cytoplasme. Les ARN retournent dans le noyau pour assemblage!
les virus qui contiennent ARN le processus de réplication se passe dans …
le cytoplasme!
Gastroentérites virales
Inflammation du système digestif (nausées, maux de ventre, vomissement, diarrhée, perte d’appétit, maux de tête, etc)
Affecte l’estomac et intestin
quels virus causes gastroentérites?
- Virus de l’hépatite A (anciennement entérovirus 72)
- Norovirus
- Virus de l’hépatite E
- Rotavirus
- Enterovirus
- Adénovirus (types 40 et 41)
- Astrovirus, sapovirus, adénovirus, parvovirus, coronavirus, aichavirus
quelles sont les caractéristiques des virus causant la gastroentérite?
- Non-enveloppés. L’enveloppe ne donne pas une protection, parce que elle est fait des lipides, qui sont fragiles (au chaleur p.e.) Les protéines sont plus résistants que les lipides, c’est pourquoi ceux qui n’ont pas l’enveloppe sont plus résistants.
- Résistants au chlore, solvants organiques et pH acide
- Résistants à la congélation
- Sensibles à l’ébullition
Où sont les ligands des virus qui n’ont pas l’enveloppe?
ceux qui n’ont pas l’enveloppe, leur ligands est sur la capside. Cela les rend très résistant à l’environnement.
quelles sont les modes de transmission des Gastroentérites virales?
- Par des aliments contaminés: mollusques, fruits et légumes.
- Par des selles et vomissures de personnes infectées (>1 million de particules virales / gram de selles).
- Transmission peut se faire par contact direct avec la personne infectée ou par contact indirect (si on touche des surfaces contaminées par le virus, e.g. poignées de portes, aliments et boissons contaminés).
- Transmission facile dans les milieux où les gens sont en contact étroit: écoles, garderies, établissements de soins de longue durée et de soins de santé, navires de croisière.
- Résistants à des taux relativement élevés de chlore et à des températures diverses. Beaucoup de ces virus survivent jusqu’à 12 heures sur des surfaces dures et jusqu’à 12 jours sur de la moquette contaminée.
quels sont les préventions contre la contamination virale?
- Se laver les mains fréquemment au savon et à l’eau tiède (pendant au moins 20 secondes), notamment après avoir utilisé les toilettes, après avoir changé des couches et avant de manger et de préparer les aliments. Une telle pratique s’impose notamment si vous avez été malade récemment ou été en contact avec une personne malade.
- Manger des aliments cuits à point (minimum 2 minutes à 70°C, idéalement 1½ minutes à 85°C), et encore chauds.
Bien laver fruits et légumes avant de les manger. - Nettoyer soigneusement les surfaces contaminées immédiatement après un épisode de maladie en utilisant de l’eau chaude et du savon. Désinfecter ensuite les surfaces en utilisant un désinfectant à base de chlore d’une concentration de 500 ppm. Retirer et laver immédiatement vêtement, literie et autre linge susceptibles d’être contaminés par des selles ou des vomissures. Utiliser la laveuse au cycle chaud (85°C).
Jeter selles et vomissures dans les toilettes et s’assurer que les surfaces environnantes soient propres. - Ne pas secouer le linge contaminé et porter des gants domestiques pour manipuler les objets contaminés.
les règles pour les manipulateurs d’aliments:
- Tout employé souffrant de vomissement et diarrhée doit être libéré immédiatement, et ne pas retourner au travail avant une période asymptomatique d’aux moins 48 heures.
- Pour le virus de l’hépatite A, la période d’exclusion recommandée est de 1 semaine suite à l’apparition de jaunisse*.
- L’honnêteté est essentielle: faut encourager les employés à déclarer leurs symptômes dès que possible.
polio
- virus non enveloppé, résistant dans l’environnement
- transmission par l’eau (fécale-orale)
- prévention facile par la vaccination
il y a d’autres membres de la famille polio pour qui il n’y a pas des vaccins.
quels sont les caractéristiques des entérovirus?
▪ petits virus à RNA
▪ stables à pH acide (pH 3 à 5)
▪ multiplication dans le tube digestif
▪ très large prédominance des infections inapparentes
▪ diversité clinique des infections apparentes
quels sont deux genres de poliomyélite existes?
entérovirus et rhinovirus
physiopathologie
Virus ↓ voie digestive ↓ période d’incubation (amygdales, adénoides, tissu lymphoide du tube digestif), durée: 1-2 semaines ↓ phase d’invasion = virémie, durée: 4 - 5 jours (fièvre, douleurs musculaires, malaises digestives, parfois avec maux de tête, vomissements = atteinte méningée) maladie bénigne, >90% des cas ↓ paralysies = poliomyélite = infection des neurones moteurs de la corne antérieure de la moelle épinière ↓ excrétion dans selles
est-ce que chaque fois qu’on est infecté avec poliomyélite on est paralysé?
non, pas du tout. La maladie peut s’arrêter à l’étape d’incubation, ou à l’étape d’invasion, avant d’arriver au paralysie.
est-ce varicelle est enveloppé ?
oui! Dans l’eau, sur une surface il est détruit très rapidement.
pourquoi le zona est plus … chez les adultes?
car leur système immunitaire est moins forte, et donc le virus qui était dormant peut se réactiver.