week 3

Question 1

verschillende manieren van genexpressie controle

Answer 1

1. transcriptional control
2. RNA processing control
3. RNA transport and localization control
4. Translational control
5. mRNA degradation control
6. protein activity control door eiwitten te (in)activeren, af te breken, transport of compartimentalisatie

Question 2

cis-regulatoire sequenties

Answer 2

sequenties die op hetzelfde chromosoom liggen waar transcriptieregulatoren aan kunnen binden

Question 3

major groove

Answer 3

meer moleculaire contactpunten zodat transcriptieregulatoren hier beter kunnen binden

Question 4

coöperatieve binding

Answer 4

wanneer er een monomeer gebonden is, bindt de volgende monomeer gemakkelijker (geeft sigmoidale curve)

Question 5

operon

Answer 5

cluster aan genen onder één operon

Question 6

allosterisch eiwit

Answer 6

wordt geactiveerd door het ondergaan van een conformatieverandering door binding van een ander molecuul (bijv tryptofaan bij de tryptofaan-repressor)

Question 7

regulators van het Lac operon

Answer 7

Lac repressor (is repressed door allolactose bij aanwezigheid van lactose) en CAP activator (is geactiveerd door binding cyclisch amp bij absentie van glucose)

Question 8

promotor

Answer 8

hier binden de GTF’s en RNA pol

Question 9

cis-regulatory sequences

Answer 9

hier binden transcriptieregulators

Question 10

gene control region

Answer 10

bij eukaryoten de combinatie van cis-regulatoire sequenties en de promotor

Question 11

spacer DNA sequences

Answer 11

dna tussen cis-regulatoire sequenties

Question 12

mediator

Answer 12

protein complex dat ervoor zorgt dat eiwitten met RNA pol kunnen communiceren en het positioneert TFIIH op de staart van RNA pol

Question 13

coactivators en co-repressors

Answer 13

eiwitten die niet direct aan het DNA binden maar aan andere gebonden transcriptieregulatoren

Question 14

enhancer

Answer 14

cis-regulatory sequence waar transcriptie activatoren binden

Question 15

synergie

Answer 15

transcriptieregulatoren hebben samen hun effecten met elkaar vermenigvuldigd

Question 16

insulator

Answer 16

twee eiwitten binden aan twee insulator sequenties en binden aan elkaar (vormt een loop) hierdoor wordt de cis-regulagtoire sequentie dichter bij het te transcriberen gen gebracht

Question 17

krüppel en giant

Answer 17

repressor Eve

Question 18

hunchbac en bicoid

Answer 18

activator van Eve

Question 19

combinatorial control

Answer 19

de combinatie van verschillende transcriptieregulatoren bepaalt welk celtype ontstaat

Question 20

iPS

Answer 20

induced pluripotent stem cells door inbrengen 3 master transcription regulators

Question 21

glucocorticoid receptor

Answer 21

geactiveerd door het ligand glucocorticoid

Question 22

feed forward loop

Answer 22

alleen langere signalen geven een effect omdat een tweede signaalmolecuul op moet hopen

Question 23

flipflop device

Answer 23

om en om activatie, dubbele repressie van twee regulatoren leidt indirect tot een positive feedback loop

Question 24

DNA methylering

Answer 24

op cytosine in CG rijke gebieden. Transcriptie onderdrukken op meerdere manieren: interfereren met eiwitten voor transcriptie-initiatie, histon modifying enzymes aantrekken,

Question 25

genomic imprinting

Answer 25

alleen paternaal of maternaal allel komt tot expressie, andere gemethyleerd

Question 26

X-inactivation

Answer 26

synthese van Xist RNA dat blijft zitten op het chromosoom en het bedekt. vormt bindingsplaatsen voor allerlei eiwitten die zorgen voor condensatie en inactivatie.