Vorlesung 6. Flashcards
Typisierung und Einteilung von Mikroorganismen Klassisch, physiologisch Molekulare Marker (16S rRNA etc) Differenzierung zw. Bacteria/Archaea und Eukarya
Wer entwarf den Tree of life?
Carl R. Woese
Wer war der erste oxygene phototrophe Organismus?
Cyanobakterium
Was ist LUCA?
- Vorgänger der Archaea und Bakterien (universeller Vorfahre?)
- vermutlich Organismus methanogen, autotroph, thermophil
- benötigte H2 und CO2
- CO2-Fixierung mit Wood-Ljungdahl Pathway
- bei dieser Annahme Eukaryoten aus Bakterien und Archaea entstanden
Worauf deuten die phylogenetischen Analysen hin woraus die Eukaryoten entstanden sind?
-Eukaryoten aus den Archaea entstanden
-aus Superhylum
der Asgard Archaea
Welche rRNA-Sequenz ist Grundlage für die meisten Stammbäume und warum?
- 16S
- hochkonserviert
- manche Domänen gleich von Organismus zu Organismus
- altes Molekül, konstante Funktion
Wo kommt die 16S her?
- Teil des Ribosoms
- 1500 Basen
Definition Signatursequenz
-Charakteristisch und spezifisch für eine phylogenetische Gruppe
-Sequenzähnlichkeit weist auf phylogenetische Verwandtschaft hin
-Ausmaß der Ähnlichkeit in diesen Sequenzen zwischen 2 Organismen
zeigen die rel. evolutionäre Verwandtschaft auf
Welchen Ursprung haben Mitochondrien und Chloroplasten?
-Bakteriellen Ursprung
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus:
Was davon ist hierbei die Klasse (Phylum),
Ordnung, Familie, Gattung, Art (Unterart)
- Firmicutes –> Phylum
- Bacilli –> Klasse
- Lactobacillales (Milchsäurebakterien) –> Ordnung
- Lactobacillaceae –> Familie
- Lactobacillus –> Gattung
- Lactobacillus delbrueckii –> Art
- Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus –> Unterart
Gemeinsamkeiten und Unterschiede Archaea, Eukaryoten und Bakterien: (Tabelle)
Bakterien/ Archaea/ Eukaryoten/
Zellwand: + / + (-)
Zellkern: - / - +
Ribosom: 70S / 70S 80S
Lipide: Ester / Ether Ester
Introns: - / - +
Operon: + / + -
Promotoren: -10–35 / TATA-Box TATA-Box
RNA-Poly- eine / eine
merase: 5-6 UE / 12-14 UE drei 12-14 UE
Einige Phyla Archaea?
- Crenarchaeota
- Euryarchaeota
- Nanoarchaeota
- Korarchaeota
Einige Phyla Bakterien:
-Proteobacteria
-Chloroplast
-Mitochondrium
-Gram-positive Bakterien
-Cyanobakterien
-Thermotoga
Grüne nicht-Schwefelbakterien
-Grüne Schwefelbakterien
-Spirochaeten
Was heißt FISH?
-Fluorescence In Situ Hybridization
Anwendung von FISH?
- sichtbarmachen von bestimmten Bakterien z.B. nitrifizierender Bakterien in einer Klärschlammflocke
- bestimmte Signatursequenz der 16S rRNA spez. für ammoniakoxidienden Bakterien
