Virus - Jorma Hinkkula Flashcards
Nämn ett par dsDNA-virus
Poxvirus: orthopoxvirus
Herpesvirus: HSV (herpes simplex virus), CMV
EBV (Ebstein-Barr virus)
Papillomvirus
Nämn ett par ssDNA-virus
Parovrius
Humant parovirus B19
Nämn ett par dsRNA-virus
Ortoreovirus: rotavirus
Nämn ett par plussträngade ssRNA-virus (+ssRNA)
Poliovirus
Calicivirus
Nämn ett par minussträngade ssRNA-virus (-ssRNA)
Ortomyxvirus: influensa A, B, C
Vad är ett retrovirus?
Det är virus vars genom (arvsmassa) genomgår omvänd transkription, vilket innebär att virusets RNA omvandlas till DNA
Nämn några kända zoonoser
Parasiter: Malaria
Ortomyxvirus, -ssRNA: Influensa A (helikal struktur och hölje)
Det finns strukturella proteiner, specifikt tre stycken, som är viktiga för retrovirus. Vilka?
GAG: bildar kärnan (core), polyprotein “Group AntiGens” (GAG)
POL: omvänt transkriptas (RNA –> DNA)
ENV: “envelope”, kallas även för yttre hölje - det allra yttersta av en virionpartikel.
Ge exempel på ett DNA-virus med ikosaedral struktur och yttre hölje
Herpesvirus, EBV, HSV
Ge exempel på ett RNA-virus med helikal struktur och yttre hölje (envelope)
-ssRNA ortomyxvirus (influensa)
Vilka virus har kapacitet att utveckla latent eller kronisk infektion?
Herpesvirus: HSV 1/2, CMV, EBV
Papillomvirus: “vårtvirus” (HPV6, 11) - finns dock över 160 olika HPV-virus.
Vad är en nukleokapsid?
nukleinsyra + kapsid.
Kapsid = täta proteinstrukturer uppbyggd av kapsomerer.
En nukleokapsid kan ha både ett inre och yttre hölje. Vad består respektive hölje av?
Inre: matrixproteiner
Yttre: envelope, derived from host cell membranes (surface, internal, nuclear) & viral glycoproteins
“Many enveloped viruses are so because they become covered with host cytoplasmic membrane as they are released from the cell” - dvs under egress (sista replikationssteget)
Vilka olika former kan en kapsid anta?
Ikosaedral
Helikal
Vad består yttre hölje av?
Neuroaminidas (NA) och Hemaglutinin (HA)
Vad består det inre höljet av?
Neuropeptidas (NP) - kuggis!
Vilka subgrupper kan RNA-virus indelas i?
1. Ikosaedral:
• Naked
- dsRNA: reovirus
- dsRNA: biRNAvirus
- +ssRNA: calicivirus
- -ssRNA: picoRNA
• Enveloped
- +ssRNA: flavi
- +ssRNA: toga
- +ssRNA: retrovirus: HIV, har ikosaedral struktur med yttre hölje. retrovirus är alltid RNA-virus pga innebär att transkription sker från RNA till DNA.
2. Helikal • Enveloped (alltid enveloped, yttre hölje!) - +ssRNA: coronavirus - -ssRNA: orthomyxovirus - -ssRNA: paramyxovirus
Vilka subgrupper kan DNA-virus indelas i?
1. Ikosaedral: • Naked: - dsDNA: papillomvirus • Enveloped: - dsDNA: herpesvirus • Finns en tredje variant - blandning.
- Komplex:
• Enveloped (cytoplasmic):- dsDNA: POXvirus.
Ange de åtta stegen i viralreplikation
- Adsorption
- Penetration
- Avklädning - uncoating
- Transkription
- Translation
- Syntes av virus-nukleinsyra & produktion av virala proteiner
- Assembly: sammansättning/ihopsättning av nya viruspartiklar (nu har vi skapat alla nödvändiga beståndsdelar: time to assemle)
- Egress: den nya virionpartikeln lämnar hostcell.
Vad styrs replikationsförmågan av?
- värdspecificitet: handlar om ex. virala receptorer.
- mottaglighet (susceptibility): har att göra med hur mottaglig värdcellen är för virus. om man ex är immunosuppressiv är ens celler mkt mer mottagliga. den individuella genetiken/omgivningen har således en avgörande roll.
Infektionen som resulterar av ett viralt angrepp kan se ut på olika sätt. Nämn dessa:
- Produktiv: infektiös
- Restriktiv: transient/kortvarig permissiv
- Abortiv: viruset är defekt –> ingen effekt på mottagarcell, eller kanske att individen är vaccinerad –> viruset kan ej fästa.
- Latent: persistens av viralt genom/gener
Vilka är de kritiska stegen vid viral patogenes?
För att ett virus ska vara patogent krävs att det kan infektera och orsaka sjukdomssymtom hos värden.
- Viruset måste ta sig in i värdcellen (adsorption och penetration)
- Viral replikation
- Viral spridning
- Cellskada
- Värd-immunsvar
- Viral “clearance” - alltså att man tar bort det sjuka ELLER –> ihärdig infektion.
- Viral shedding: typ spridning, när en nyproducerad virion-partikel i en värdcell lämnar cellen och vandrar vidare till en ny cell. till en annan del av kroppen.
Infektioner kan vara olika “effektiva”. Beskriv hur.
Tips: latent, kronisk infektion..
Akut, självbegränsande: rotavirus, influensa.
Kronisk infektion med virusutsöndring (shedding): EBV, hepatit B
Latent infektion: HSV, malaria.
Kronisk infektion efter en akut infektion: HIV (AIDS), HTLV1 (leukemi)
Kronisk, långsam infektion (ingen akut fas som vid HIV!): Creutzfeld- Jakob disease
HIV entry process: huvudsakligen tre steg. Beskriv dessa.
- Binding (attachment): HIV binder en CD4-molekyl
- Komplexbindning: HIV-envelope-CD4-komplex binder till kemokinreceptorn CCR5/CXCR4 (på makrofag eller primär T-cell). HIV finns dock i olika fenotyper så kan binda till olika kemoreceptorer.
- Fusion: virus och cellmembran-fusion.
Virus skiljer sig sinsemellan på så sätt att de har olika målceller & olika receptorer för inbindning (docking proteins, receptorbindande proteiner)
Ge exempel på några virus och deras målcell.
- EBV: B-cell
- HSV: flera celler
- Polio: drabbar främst epitelceller
- Influensa A: epitelceller
- HIV: t-hjälparcelller. (CD4 + CCR = receptor)
Beskriv influensavirusets uppbyggnad.
Tillhör orthomyxovirus. Har helikal struktur, yttre hölje (NA, HA). Nukleinsyran: segmenterat minussträngat ssRNA.
Beskriv mässlingsvirusets uppbyggnad.
Tillhör paramyxovirus. Helikal struktur, yttre hölje (HA). Nukleinsyra: minussträngat ssRNA.
Beskriv herpesvirusets uppbyggnad.
dsDNA, ikosaedral struktur med yttre hölje.
Vad är virion?
Den fysiska viruspartikeln
Vad är peplomer?
Morfologisk proteinenhet som sticker ut ur virionytan
Vilka virala enzymer finns det?
vRNA-beroende RNA-polymeras hos RNA-virus
vDNA-polymeras hos DNA-virus
vOmvänt RNA-polymeras hos retro- och hepanadvirus
vProteaser
