Virus - Jorma Hinkkula

Question 1

Nämn ett par dsDNA-virus

Answer 1

Poxvirus: orthopoxvirus

Herpesvirus: HSV (herpes simplex virus), CMV

EBV (Ebstein-Barr virus)

Papillomvirus

Question 2

Nämn ett par ssDNA-virus

Answer 2

Parovrius

Humant parovirus B19

Question 3

Nämn ett par dsRNA-virus

Answer 3

Ortoreovirus: rotavirus

Question 4

Nämn ett par plussträngade ssRNA-virus (+ssRNA)

Answer 4

Poliovirus

Calicivirus

Question 5

Nämn ett par minussträngade ssRNA-virus (-ssRNA)

Answer 5

Ortomyxvirus: influensa A, B, C

Question 6

Vad är ett retrovirus?

Answer 6

Det är virus vars genom (arvsmassa) genomgår omvänd transkription, vilket innebär att virusets RNA omvandlas till DNA

Question 7

Nämn några kända zoonoser

Answer 7

Parasiter: Malaria

Ortomyxvirus, -ssRNA: Influensa A (helikal struktur och hölje)

Question 8

Det finns strukturella proteiner, specifikt tre stycken, som är viktiga för retrovirus. Vilka?

Answer 8

GAG: bildar kärnan (core), polyprotein “Group AntiGens” (GAG)

POL: omvänt transkriptas (RNA –> DNA)

ENV: “envelope”, kallas även för yttre hölje - det allra yttersta av en virionpartikel.

Question 9

Ge exempel på ett DNA-virus med ikosaedral struktur och yttre hölje

Answer 9

Herpesvirus, EBV, HSV

Question 10

Ge exempel på ett RNA-virus med helikal struktur och yttre hölje (envelope)

Answer 10

-ssRNA ortomyxvirus (influensa)

Question 11

Vilka virus har kapacitet att utveckla latent eller kronisk infektion?

Answer 11

Herpesvirus: HSV 1/2, CMV, EBV

Papillomvirus: “vårtvirus” (HPV6, 11) - finns dock över 160 olika HPV-virus.

Question 12

Vad är en nukleokapsid?

Answer 12

nukleinsyra + kapsid.

Kapsid = täta proteinstrukturer uppbyggd av kapsomerer.

Question 13

En nukleokapsid kan ha både ett inre och yttre hölje. Vad består respektive hölje av?

Answer 13

Inre: matrixproteiner

Yttre: envelope, derived from host cell membranes (surface, internal, nuclear) & viral glycoproteins
“Many enveloped viruses are so because they become covered with host cytoplasmic membrane as they are released from the cell” - dvs under egress (sista replikationssteget)

Question 14

Vilka olika former kan en kapsid anta?

Answer 14

Ikosaedral

Helikal

Question 15

Vad består yttre hölje av?

Answer 15

Neuroaminidas (NA) och Hemaglutinin (HA)

Question 16

Vad består det inre höljet av?

Answer 16

Neuropeptidas (NP) - kuggis!

Question 17

Vilka subgrupper kan RNA-virus indelas i?

Answer 17

1. Ikosaedral: 
• Naked 
    - dsRNA: reovirus
    - dsRNA: biRNAvirus
    - +ssRNA: calicivirus
    - -ssRNA: picoRNA 

• Enveloped

• +ssRNA: flavi
• +ssRNA: toga
• +ssRNA: retrovirus: HIV, har ikosaedral struktur med yttre hölje. retrovirus är alltid RNA-virus pga innebär att transkription sker från RNA till DNA.

2. Helikal
• Enveloped (alltid enveloped, yttre hölje!)
   - +ssRNA: coronavirus
   - -ssRNA: orthomyxovirus
   - -ssRNA: paramyxovirus

Question 18

Vilka subgrupper kan DNA-virus indelas i?

Answer 18

1. Ikosaedral:
• Naked:
   - dsDNA: papillomvirus
• Enveloped:
   - dsDNA: herpesvirus
• Finns en tredje variant - blandning. 

2. Komplex:
   • Enveloped (cytoplasmic):
   
   • dsDNA: POXvirus.

Question 19

Ange de åtta stegen i viralreplikation

Answer 19

1. Adsorption
2. Penetration
3. Avklädning - uncoating
4. Transkription
5. Translation
6. Syntes av virus-nukleinsyra & produktion av virala proteiner
7. Assembly: sammansättning/ihopsättning av nya viruspartiklar (nu har vi skapat alla nödvändiga beståndsdelar: time to assemle)
8. Egress: den nya virionpartikeln lämnar hostcell.

Question 20

Vad styrs replikationsförmågan av?

Answer 20

1. värdspecificitet: handlar om ex. virala receptorer.
2. mottaglighet (susceptibility): har att göra med hur mottaglig värdcellen är för virus. om man ex är immunosuppressiv är ens celler mkt mer mottagliga. den individuella genetiken/omgivningen har således en avgörande roll.

Question 21

Infektionen som resulterar av ett viralt angrepp kan se ut på olika sätt. Nämn dessa:

Answer 21

1. Produktiv: infektiös
2. Restriktiv: transient/kortvarig permissiv
3. Abortiv: viruset är defekt –> ingen effekt på mottagarcell, eller kanske att individen är vaccinerad –> viruset kan ej fästa.
4. Latent: persistens av viralt genom/gener

Question 22

Vilka är de kritiska stegen vid viral patogenes?

Answer 22

För att ett virus ska vara patogent krävs att det kan infektera och orsaka sjukdomssymtom hos värden.

1. Viruset måste ta sig in i värdcellen (adsorption och penetration)
2. Viral replikation
3. Viral spridning
4. Cellskada
5. Värd-immunsvar
6. Viral “clearance” - alltså att man tar bort det sjuka ELLER –> ihärdig infektion.
7. Viral shedding: typ spridning, när en nyproducerad virion-partikel i en värdcell lämnar cellen och vandrar vidare till en ny cell. till en annan del av kroppen.

Question 23

Infektioner kan vara olika “effektiva”. Beskriv hur.

Tips: latent, kronisk infektion..

Answer 23

Akut, självbegränsande: rotavirus, influensa.

Kronisk infektion med virusutsöndring (shedding): EBV, hepatit B

Latent infektion: HSV, malaria.

Kronisk infektion efter en akut infektion: HIV (AIDS), HTLV1 (leukemi)

Kronisk, långsam infektion (ingen akut fas som vid HIV!): Creutzfeld- Jakob disease

Question 24

HIV entry process: huvudsakligen tre steg. Beskriv dessa.

Answer 24

1. Binding (attachment): HIV binder en CD4-molekyl
2. Komplexbindning: HIV-envelope-CD4-komplex binder till kemokinreceptorn CCR5/CXCR4 (på makrofag eller primär T-cell). HIV finns dock i olika fenotyper så kan binda till olika kemoreceptorer.
3. Fusion: virus och cellmembran-fusion.

Question 25

Virus skiljer sig sinsemellan på så sätt att de har olika målceller & olika receptorer för inbindning (docking proteins, receptorbindande proteiner)

Ge exempel på några virus och deras målcell.

Answer 25

1. EBV: B-cell
2. HSV: flera celler
3. Polio: drabbar främst epitelceller
4. Influensa A: epitelceller
5. HIV: t-hjälparcelller. (CD4 + CCR = receptor)

Question 26

Beskriv influensavirusets uppbyggnad.

Answer 26

Tillhör orthomyxovirus. Har helikal struktur, yttre hölje (NA, HA). Nukleinsyran: segmenterat minussträngat ssRNA.

Question 27

Beskriv mässlingsvirusets uppbyggnad.

Answer 27

Tillhör paramyxovirus. Helikal struktur, yttre hölje (HA). Nukleinsyra: minussträngat ssRNA.

Question 28

Beskriv herpesvirusets uppbyggnad.

Answer 28

dsDNA, ikosaedral struktur med yttre hölje.

Question 29

Vad är virion?

Answer 29

Den fysiska viruspartikeln

Question 30

Vad är peplomer?

Answer 30

Morfologisk proteinenhet som sticker ut ur virionytan

Question 31

Vilka virala enzymer finns det?

Answer 31

vRNA-beroende RNA-polymeras hos RNA-virus

vDNA-polymeras hos DNA-virus

vOmvänt RNA-polymeras hos retro- och hepanadvirus

vProteaser