Virus : biologie et classification; Virus causant la diarrhée; Picornavirus et Adénovirus Flashcards
Quelles sont les caractéristiques générales des virus ?
- Ils ne sont pas considérés vivants
- Ils sont des parasites intracellulaires obligatoires
- Incapable de synthétiser des protéines ou produire de l’énergie par eux-même
- Taille beaucoup plus petite que les bactéries (non visible au microscope optique)
- Peuvent infecter les insectes, poissons, plantes, reptiles, mammifères et bactéries
- Composé d’un génome viral d’ADN OU ARN (mais pas les deux)
- Entouré d’une capside (protéine)
- Certains virus sont entourés d’une enveloppe (composante interne (protéine) + composante externe (lipidique) + spikes (pas toujours))
Comment s’appel une particule virale ?
Virion
Décrit la structure d’un virus nu
- Génome (ADN ou ARN)
- Capside (protéine)
- +/- enzymes et autres protéines
Capside + Génome forme le nucléocapside
Décrit la structure d’un virus enveloppé
- Génome (ADN ou ARN)
- Capside (protéine)
- Enveloppe (composante interne et externe)
- +/- spikes
Quelles sont les possibilités de classification au niveau de la forme des virus ?
Génomes des virus : ADN ou ARN
Structure du brin : Double ou simple brin
Forme du génome : Linéaire, circulaire ou segmenté
Forme de virus :
- Icosaèdre
- Sphérique
- Filamenteuse
- Balle de fusil
Décrire le cycle de réplication d’un virus nu
- Attachement du virus (via sa protéine d’attachement (sa clé) sur le récepteur de la cellule hôte (serrure)
- Pénétration dans la cellule
- Décapsidation
- Transcription et réplication du virus
- Assemblage
- Libération du virus de la cellule
Décrire le cycle de réplication d’un virus enveloppé
- Attachement du virus à la cellule via son enveloppe sur la matrice cellulaire
- Fusion de l’enveloppe avec la matrice cellulaire
- Pénétration dans la cellule
- Décapsidation
- Transcription et réplication du virus
- Assemblage
- Libération du virus de la cellule lors de lyse cellulaire
Où est-ce que les virus ADN se répliquent-ils dans la cellule ? Et ARN ? Quelle est l’exception à cette règle ?
Virus ADN : Dans le cytoplasme
Virus ARN : Dans le noyau
Exception : Rétrovirus
- Ce sont des virus ARN, mais produisent un brin d’ADN à partir de l’ARN viral
- Cet ADN viral peut être intégré à l’ADN de la cellule permettant au virus d’être à l’abri du système immunitaire
- Ex.: VIH
Quels virus sont de type ADN et enveloppé ?
- Herpesviridea (famille de l’herpès)
- Hépatite B
Quels virus sont de type ADN et nu ?
- VPH
- Adénovirus
- Parvovirus B19
Quels virus sont de type ARN et enveloppé ?
- Influenza
- Coronavirus
- VRS
- Rougeole
- Rubéole
- Oreillons
- VIH
- Hépatite C
Quels virus sont de type ARN et nu ?
- Hépatite A
- Entérovirus
- Rotavirus
- Rhonavirus
Nomme d’autres classifications possibles pour les virus
Hôtes:
- Animal, plantes, bactéries
Basée sur la structure :
- Taille, morphologie, acide nucléique, nu ou enveloppé
Tropisme pour certains tissus :
- Adénovirus (adénoïdes)
- Entérovirus (tractus digestif)
- Hépatites (foie)
Capacité ou non de pouvoir être cultivés en laboratoire :
- Virus cultivables ou non cultivables
Mode de transmission
Basée sur une manifestation clinique :
- Jaunisse (hépatites)
- Encéphalite
- Diarrhée
- Virus exanthémateux (éruption cutanée en vésicules ou rougeur sur la peau)
Quels sont les virus provoquant des éruption cutanée de type rougeur ?
- Rougeole
- Rubéole
- Herpès humain-6
- Parvovirus B19
- Virus Epstein-Barr (mono)
- Entérovirus
- VIH
Quels sont les virus provoquant des éruption cutanée de type vésicule ?
- Varicella-zoster
- Herpès simplex
- Entérovirus
Décrire les caractéristiques des virus nus et expliquer comment ces caractéristiques influencent la survie dans l’environnement et la transmission à l’hôte
- Résistants à la température, détergents, sécheresse et acide
- Sont libérés de la cellule lors de la lyse cellulaire
- Transmission fécale orale, gouttelette et contact
- Bonne survie dans l’environnement et dans le tractus digestif
Décrire les caractéristiques des virus enveloppés et expliquer comment ces caractéristiques influencent la survie dans l’environnement et le tractus intestinal et la transmission à l’hôte
- Fragiles aux conditions adverses de l’environnement (ne survit pas longtemps sur les surfaces)
- Facilement détruits par l’acidité grastrique
- Transmission par gouttelette (virus respiratoires), contact direct ou exposition à des liquides biologiques
- Libérés de la cellule hôte par bourgeonnement ou lors de la lyse cellulaire
Quels sont les outils diagnostiques disponibles pour les infections virales ?
- Culture virale (n’est plus utilisée depuis la pandémie COVID-19)
- Détection antigènes viraux (test antigène rapide)
- TAAN
- Sérologie virale
Décrit moi le test antigène pour les infections virales.
Utile pour : Influenza, SRAS-CoV-2, VRS
Prélèvement : échantillons via écouvillonnage du nasopharynx OU via le sérum (pour hépatite B et VIH)
Désavantage :
- Moins sensible que TAAN (possibilité faux négatif)
- Moins spécifique que TAAN (possibilité faus positif)
- Applicable à peu de virus
Décrit moi le TAAN pour les infections virales
- Je détecte le virus en lui-même
- Technique de + en + utilisé
- Coûteux
- Rapide
- Pas disponible partout
Applicable à beaucoup de virus :
- Virus respiratoires
- Herpès, varicelle, zona
- Oreillons, rubéole, rougéole (sur urine)
- VPH
- Hépatite B et C
- VIH
Décrit moi sérologie pour les infections virales
Recherche d’anticorps dans le sérum des patients
- On tente de détecter les IgM pour voir les infections récentes (IgG = infection plus vieille)
Virus pouvant faire l’objet d’une sérologie IgM :
- Cytomégalovirus (CMV)
- Esptein-Barr
- Oreillons
- Rougeole
- Rubéole
- Parvovirus B19
- Hépatite A et B
Quels sont les principaux agents responsables des gastro-entérites virales chez les enfants et les adultes ?
Enfants :
- Norovirus
- Adénovirus 40-41
- Rotavirus
- Astrovirus
Adultes :
- Norovirus (le plus fréquent)
- Sapovirus
Nommer les virus qui font partie du groupe des Caliciviridae
- Norovirus
- Sapovirus
Norovirus est le plus prédominant pour causer les diarrhée
Quelles sont les caractéristiques générales en lien avec les diarrhées causées par les virus ?
- Très contagieux (surtout Caliciviridea)
- Transmission orale-fécale
- Virus qui survivent dans l’environnement (virus nus)
- Résistent à l’acidité gastrique
- Plus fréquents l’hiver
- Infection qui touche l’intestin grêle
- Pas de traitement antiviral