Virus : biologie et classification; Virus causant la diarrhée; Picornavirus et Adénovirus Flashcards

1
Q

Quelles sont les caractéristiques générales des virus ?

A
  • Ils ne sont pas considérés vivants
  • Ils sont des parasites intracellulaires obligatoires
  • Incapable de synthétiser des protéines ou produire de l’énergie par eux-même
  • Taille beaucoup plus petite que les bactéries (non visible au microscope optique)
  • Peuvent infecter les insectes, poissons, plantes, reptiles, mammifères et bactéries
  • Composé d’un génome viral d’ADN OU ARN (mais pas les deux)
  • Entouré d’une capside (protéine)
  • Certains virus sont entourés d’une enveloppe (composante interne (protéine) + composante externe (lipidique) + spikes (pas toujours))
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2
Q

Comment s’appel une particule virale ?

A

Virion

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3
Q

Décrit la structure d’un virus nu

A
  • Génome (ADN ou ARN)
  • Capside (protéine)
  • +/- enzymes et autres protéines

Capside + Génome forme le nucléocapside

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4
Q

Décrit la structure d’un virus enveloppé

A
  • Génome (ADN ou ARN)
  • Capside (protéine)
  • Enveloppe (composante interne et externe)
  • +/- spikes
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5
Q

Quelles sont les possibilités de classification au niveau de la forme des virus ?

A

Génomes des virus : ADN ou ARN

Structure du brin : Double ou simple brin

Forme du génome : Linéaire, circulaire ou segmenté

Forme de virus :
- Icosaèdre
- Sphérique
- Filamenteuse
- Balle de fusil

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6
Q

Décrire le cycle de réplication d’un virus nu

A
  1. Attachement du virus (via sa protéine d’attachement (sa clé) sur le récepteur de la cellule hôte (serrure)
  2. Pénétration dans la cellule
  3. Décapsidation
  4. Transcription et réplication du virus
  5. Assemblage
  6. Libération du virus de la cellule
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7
Q

Décrire le cycle de réplication d’un virus enveloppé

A
  1. Attachement du virus à la cellule via son enveloppe sur la matrice cellulaire
  2. Fusion de l’enveloppe avec la matrice cellulaire
  3. Pénétration dans la cellule
  4. Décapsidation
  5. Transcription et réplication du virus
  6. Assemblage
  7. Libération du virus de la cellule lors de lyse cellulaire
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8
Q

Où est-ce que les virus ADN se répliquent-ils dans la cellule ? Et ARN ? Quelle est l’exception à cette règle ?

A

Virus ADN : Dans le cytoplasme
Virus ARN : Dans le noyau

Exception : Rétrovirus
- Ce sont des virus ARN, mais produisent un brin d’ADN à partir de l’ARN viral
- Cet ADN viral peut être intégré à l’ADN de la cellule permettant au virus d’être à l’abri du système immunitaire
- Ex.: VIH

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9
Q

Quels virus sont de type ADN et enveloppé ?

A
  • Herpesviridea (famille de l’herpès)
  • Hépatite B
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10
Q

Quels virus sont de type ADN et nu ?

A
  • VPH
  • Adénovirus
  • Parvovirus B19
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11
Q

Quels virus sont de type ARN et enveloppé ?

A
  • Influenza
  • Coronavirus
  • VRS
  • Rougeole
  • Rubéole
  • Oreillons
  • VIH
  • Hépatite C
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12
Q

Quels virus sont de type ARN et nu ?

A
  • Hépatite A
  • Entérovirus
  • Rotavirus
  • Rhonavirus
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13
Q

Nomme d’autres classifications possibles pour les virus

A

Hôtes:
- Animal, plantes, bactéries

Basée sur la structure :
- Taille, morphologie, acide nucléique, nu ou enveloppé

Tropisme pour certains tissus :
- Adénovirus (adénoïdes)
- Entérovirus (tractus digestif)
- Hépatites (foie)

Capacité ou non de pouvoir être cultivés en laboratoire :
- Virus cultivables ou non cultivables

Mode de transmission

Basée sur une manifestation clinique :
- Jaunisse (hépatites)
- Encéphalite
- Diarrhée
- Virus exanthémateux (éruption cutanée en vésicules ou rougeur sur la peau)

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14
Q

Quels sont les virus provoquant des éruption cutanée de type rougeur ?

A
  • Rougeole
  • Rubéole
  • Herpès humain-6
  • Parvovirus B19
  • Virus Epstein-Barr (mono)
  • Entérovirus
  • VIH
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15
Q

Quels sont les virus provoquant des éruption cutanée de type vésicule ?

A
  • Varicella-zoster
  • Herpès simplex
  • Entérovirus
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16
Q

Décrire les caractéristiques des virus nus et expliquer comment ces caractéristiques influencent la survie dans l’environnement et la transmission à l’hôte

A
  • Résistants à la température, détergents, sécheresse et acide
  • Sont libérés de la cellule lors de la lyse cellulaire
  • Transmission fécale orale, gouttelette et contact
  • Bonne survie dans l’environnement et dans le tractus digestif
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17
Q

Décrire les caractéristiques des virus enveloppés et expliquer comment ces caractéristiques influencent la survie dans l’environnement et le tractus intestinal et la transmission à l’hôte

A
  1. Fragiles aux conditions adverses de l’environnement (ne survit pas longtemps sur les surfaces)
  2. Facilement détruits par l’acidité grastrique
  3. Transmission par gouttelette (virus respiratoires), contact direct ou exposition à des liquides biologiques
  4. Libérés de la cellule hôte par bourgeonnement ou lors de la lyse cellulaire
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18
Q

Quels sont les outils diagnostiques disponibles pour les infections virales ?

A
  • Culture virale (n’est plus utilisée depuis la pandémie COVID-19)
  • Détection antigènes viraux (test antigène rapide)
  • TAAN
  • Sérologie virale
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19
Q

Décrit moi le test antigène pour les infections virales.

A

Utile pour : Influenza, SRAS-CoV-2, VRS

Prélèvement : échantillons via écouvillonnage du nasopharynx OU via le sérum (pour hépatite B et VIH)

Désavantage :
- Moins sensible que TAAN (possibilité faux négatif)
- Moins spécifique que TAAN (possibilité faus positif)
- Applicable à peu de virus

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20
Q

Décrit moi le TAAN pour les infections virales

A
  • Je détecte le virus en lui-même
  • Technique de + en + utilisé
  • Coûteux
  • Rapide
  • Pas disponible partout

Applicable à beaucoup de virus :
- Virus respiratoires
- Herpès, varicelle, zona
- Oreillons, rubéole, rougéole (sur urine)
- VPH
- Hépatite B et C
- VIH

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21
Q

Décrit moi sérologie pour les infections virales

A

Recherche d’anticorps dans le sérum des patients
- On tente de détecter les IgM pour voir les infections récentes (IgG = infection plus vieille)

Virus pouvant faire l’objet d’une sérologie IgM :
- Cytomégalovirus (CMV)
- Esptein-Barr
- Oreillons
- Rougeole
- Rubéole
- Parvovirus B19
- Hépatite A et B

22
Q

Quels sont les principaux agents responsables des gastro-entérites virales chez les enfants et les adultes ?

A

Enfants :
- Norovirus
- Adénovirus 40-41
- Rotavirus
- Astrovirus

Adultes :
- Norovirus (le plus fréquent)
- Sapovirus

23
Q

Nommer les virus qui font partie du groupe des Caliciviridae

A
  • Norovirus
  • Sapovirus

Norovirus est le plus prédominant pour causer les diarrhée

24
Q

Quelles sont les caractéristiques générales en lien avec les diarrhées causées par les virus ?

A
  • Très contagieux (surtout Caliciviridea)
  • Transmission orale-fécale
  • Virus qui survivent dans l’environnement (virus nus)
  • Résistent à l’acidité gastrique
  • Plus fréquents l’hiver
  • Infection qui touche l’intestin grêle
  • Pas de traitement antiviral
25
Quels sont les signes et symptômes d'une gastro-entérite d'allure virale ?
- Nausée - Vomissement - Diarrhée non sanglante - Crampes abdominales - Parfois fièvre - Déshydratation
26
Décrire l’importance des virus Caliciviridae (surtout Norovirus) dans l’étiologie des éclosions de gastroentérites non bactériennes dans les pays industrialisés
- Besoin de peu d'organismes (18) pour causer des symptômes - Touche tous les groupes d'âges - Quand quelqu'un là, tout le monde autour l'attrape (CHSLD, navire de croisière, garderie)
27
Décrire l'épidémiologie du Norovirus
- **Transmission orale-féacle** (personne à personne, ingestion aliment contaminé, conact indirect avec surface, ingestion de gouttelettes générées par les vomissements) - **Incubation :** Environ 24h - **Durée maladie :** 1-3 jours - **Contagiosité :** Maximale lors des vomissements et diarrhée (peut durée jusqu'à 4 semaines après diarrhée) - Possibilité de réinfection
28
Qui est l'hôte des virus causant la diarrhée ?
Humain seulement
29
Quels sont les signes et symptômes de déshydratation chez les enfants et adultes ?
**Enfant/nourrisson :** - Yeux enfoncés - Muqueuse buccale sèche - Signe du pli cutané - Absence de larmes - Fontanelle enfoncée **Adulte :** - Soif - Muqueuse buccale sèche - Signe du pli cutané - Tachycardie, baisse de la PA - Grande faiblesse
30
Quelle infection peut être prévenue par la vaccination (au niveau des diarrhée) ?
**Infection au rotavirus** - Le vaccin des petits entraine une immunité de groupe (baisse chez les adultes et enfants plus âgés)
31
Quelle est la méthode diagnostique de choix pour détecter les diarrhées virales ?
TAAN sur selles de 5 patients par éclosion suspectée - *Possibilité d'un TAAN multiplex (détecte plusieurs virus) pour les hôpitaux riches*
32
Identifier les circonstances où une investigation est requise pour identifier l’agent infectieux responsable d’une gastro-entérite d’allure virale.
**Prescrire analyse seulement si éclosion** : - Croisière - Garderie - Hôpital
33
Quand est-ce qu'un médecin devrait soupçonner une épidémie de gastro-entérite d'allure virale ? Et quoi faire ?
**Soupçon quand :** - Plus de 2 cas de vomissement (2 vomissements par 24h) accompagnés de diarrhée (3 selles par 24h) dans un milieu fermée **Quoi faire :** - Investigation requise (TAAN sur les selles de 5 personnes) - Déclaration de l'éclosion à la Santé Publique
34
Quel est le traitement pour la diarrhée causée par les virus ?
Aucun traitement antiviral - Réhydratation
35
Quels sont les rôles du médecin dans un contexte de virus causant la diarrhée ?
- Faire promotion du vaccin rotavirus auprès des parents - Évaluer si patient en consultation doit être hospitalisé pour soit une réhydratation ou soit parce qu'il est incapable de prendre ses médicaments importants pour sa santé à cause des vomissements - Appliquer précautions aditionnelles pour pas acquérir/transmettre l'infection
36
Quelles sont les précautions additionnelles pour le personnel soigant en cas de possible exposition au virus causant la diarrhée ?
- Blouse de protection - Masque de procédure - Lunette protection (si vomissement) - Gants - Lavages des mains - Nettoyage de l'environnement
37
Nommez les virus de la famille des Picornaviridae qui sont pathogènes pour l’humain
**Entérovirus :** - Poliovirus - Coxsackievirus A et B - Echovirus **Hépatovirus :** - Hépatite A **Rhinovirus**
38
Décrire les principales caractéristiques des picornavirus humains.
- Petit virus nu - Virus ARN - Transmission orale-fécale (entérovirus et hépatite A) et gouttelette (rhinovirus) - Résiste acidité gastrique
39
Décrire l’épidémiologie, la pathogénèse et les moyens de prévention des infections à entérovirus.
**Pathogenèse :** 1. Transmission orale-fécale 2. Se rend à l'**oropharynx et l'intestin** (virus nu donc résistance à l'acidité gastrique) 3. Il poursuit son chemin soit vers les **amygdales (provenance de l'orpharynx)**, les **plaques de Peyer (provenant de l'intestin)** pour atteindre le sang et les organes cibles 4. Le reste va dans les selles **Réservoir :** Humain **Moyens de prévention :** - Vaccin (pour polio seulement) - Hygiène des mains - Masque - Isolation des cas - Assainissement environnement
40
Quels peuvent être les organes/tissus cibles des entérovirus et hépatite A ?
- Plèvre - Peau - Muscle - Cerveau - Méninges - Foie (hépatite A)
41
Décrire les principales manifestations cliniques des infections causées par les entérovirus en distinguant les maladies sévères des maladies non sévères.
**Manifestations peu sévères :** - Fièvre avec éruption généralisée - Pied-main-bouche (Coxsackie A) - Pleurodynie (Coxsackie B) - Herpangine - Conjonctivite - Rhume d'été **Manifestation sévères :** - Myocardite et péricardite (Coxsackie A) - Méningite (Coxsackie A + Polio) - Encéphalite - Paralysie aigue - poliomyélite (Polio) - Hépatite
42
Dans quelles situations des analyses sont justifiées pour confirmer une infection à entérovirus ?
**Aucun prélèvement requis :** Pour les manifestations cliniques non sévères **TAAN requis :** Pour manifestation cliniques sévères
43
Pourquoi les tests d’amplification d’acides nucléiques sont considérés comme la méthode de premier choix pour le diagnostic de la méningite à entérovirus.
- Rapide - Plus sensible et spécifique - Permet échantillon sur LCR - Utile en phase aïgue
44
Indiquer en quoi les poliovirus se distinguent des autres entérovirus au regard de l’épidémiologie, des manifestations cliniques et de la prévention.
**Épidémiologie :** - Virus nu ARN - Transmission orale fécale - Incubation 2-3 semaines - TRÈS CONTAGIEUX, mais éradiqué dans la majorité des pays grâce à la vaccination **Manifestations cliniques :** - Possibilité d'une atteinte de la corne antérieure de la moelle entrainant une **paralysie asymétrique (poliomyélite)** - Poliomyélite = maladie progressive pouvant se rendre jusqu'au voie respiratoire - Souvent, les muscles ne fonctionneront pas, mais il y aura une sensation **Prévention :** - Existence d'un vaccin soit inactif (par injection) ou vivant atténué (par voie orale)
45
Existe-t-il un vaccin contre les entérovirus de tipe Coxsackie ?
Non
46
Quelles sont les principales manifestations cliniques (peu sévères ou sévères) liées à Coxsackie A et Coxsackie B ?
**Coxsackie A :** - Pied-main-bouche (peu sévère) - Méningite (sévère) **Coxsackie B :** - Pleurodynie (inflammation au niveau de la plèvre) (peu sévère) - Myocardite et péricardite (sévère)
47
Décrit le syndrôme de pied-main-bouche
Infection peu sévère causée par Coxsackie A : - Fièvre - Lésions maculaires et vésiculaires aux pieds, mains et bouche - Lésions non purulentes
48
Décrire l’épidémiologie, la pathogenèse et les manifestations cliniques des infections à rhinovirus.
**Épidémiologie et pathogenèse :** - Virus ARN nu - Vit longtemps dans l'environnement - **Ne résiste pas à l'acidité gastrique** - Croissance à 33 degré (dans nez) **ne causant donc pas d'infection sévère** - Plus de 100 sérotypes - **Réservoir humain** **Transmission :** - Gouttelette et contact indirect **Manifestation clinique :** - Rhume d'été
49
Expliquer pourquoi il n’est pas nécessaire de faire des prélèvements pour le diagnostic d’infection à rhinovirus.
- Tableau clinique typique (rhume banal) - Infection bénigne se guérissant rapidement - Le traitement demeure symptomatique peu importe - Dépenses inutiles
50
Décrire l’épidémiologie, la pathogénèse, les manifestations cliniques, les méthodes diagnostiques, le traitement et la prévention des infections à adénovirus.
**Épidémiologie :** - Réservoir : Humain - Infection peut survenir toute l'année - Incubation d'environ 1 semaine - Les gens sont contagieux avant les premiers symptômes - Résistant acide gastrique **Pathogenèse :** - Transmission par gouttelette ou orale-fécale - Réplication dans cellules épithéliales du pharynx, de la conjonctive et du tractus digestif - Passage dans la lymphe jusqu'aux ganglions - Possibilité de virémie avec atteinte d'organes à distance (surtout chez les immunosupprimés) - L'hôte normal peut excréter le virus dans les selles pendant 1 an **Manifestations cliniques :** - Infections voies respiratoires (**pahryngite**) - **Cystite hémmoragique** - **Conjonctivite des 2 yeux** - Hépatite - Méningite / encéphalite - Myocardite - Gastroentérite **(seulement 40-41)** **Diagnostic :** - **TAAN** sur LCR, conjonctive, selles ou urines **pour les infections sévères (ex. méningites) ou épidémies (gastro)** **Traitement :** - Cidofovir en IV (réservé aux immunodéprimés car effets secondaires importants) - **PAS DE VACCIN**
51
Décrire les principales caractéristiques des adénovirus
- Virus nu ADN linéaire - Groupe hétérogène de virus - 100 sérotypes donc 52 infectent les humains - Infection touchant souvent les enfants - Tropisme pour adénoïdes