Virus Flashcards

1
Q

Qu’est ce qu’un virus ?

A

Virus : parasite obligatoire qui dépend d’une cellule hôte (aussi appelée ‘cellule cible’) pour se répliquer.

Virus: agent infectieux constitué d’un seul acide nucléique = génome, entouré d’un coque protéique = capside, l’ensemble pouvant être (ou non) entouré d’une membrane lipidique = enveloppe.

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2
Q

Qu’est ce qu’un virion ?

A

Virion: particule virale complète et capable d’infecter une cellule susceptible.

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3
Q

Qu’est ce qu’un nucléocaspide ?

A

Nucléocapside = acide nucléique + capside.

N.B. La présence d’une enveloppe est caractéristique de certaines familles virales.

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4
Q

Qu’est ce qu’une bactérie ?

A

-sont des cellules avec organelles fonctionnelles
-génome = ADN
-possèdent leur propre appareillage pour synthétiser les macromolécules nécessaires à leur reproduction
-se répliquent par fission binaire
-sont sensibles aux antibiotiques

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5
Q

Comment le virus est différent de la bactérie ?

A

-ne sont pas considérés “cellules” (ne possèdent pas d’organelles)
-matériel génétique = ADN ou ARN
-dépendent obligatoirement de la «cellule hôte» pour se reproduire
-l’acide nucléique viral peut être infectieux
-ne sont pas affectés par les antibiotiques
-La plupart sont «filtrables», voulant dire qu’ils passent à travers les filtres bactériologiques

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6
Q

Quel est le diamètre des poliovirus ?

A

25-30 nm (microscope électronique)

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7
Q

Quel est le diamètre des pox virus ?

A

250-400 nm (microscope électronique)

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8
Q

Qui est le plus grand ? Virus ou bactéries ?

A

Bactéries

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9
Q

Qu’est ce que l’exception des virus géant ?

A

-On propose un nouvel ordre pour ces virus: «Mégavirales»
- Plusieurs genres : Mimivirus, Mamavirus, Pandoravirus, Pithovirus
-Les plus grands des virus géants ont un diamètre >1 µm et un génome ˃500 kpb
-Génome composé d’ADN
-Se répliquent dans le cytoplasme des amibes
-En 2008, le virophage Sputnik fut découvert comme virus satellite du Mimivirus, peut causer des pneumonies

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10
Q

de quelle origine est l’enveloppe des virus

A

D’origine cellulaire, fait de lipides et est sensible à l’environnement, ex : chlore

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11
Q

Qu’est ce que contient l’enveloppe viral ?

A

Glycoprotéines (peplomer) à la surface, qui permettent au virus d’entrer dans la cellule cible

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12
Q

Forme icosaédrique (Virus enveloppé)

A

Contient une enveloppe +
Glycoprotéine (= spike)

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13
Q

Forme icosaédrique vs forme hélicoïdale

A

Forme icosaédrique :
-Ressemble à un polyèdre à 20 faces triangulaires.
-Très stable grâce à sa symétrie géométrique.
Forme hélicoïdale :
-Structure en spirale ou en hélice autour du génome viral.
-Le matériel génétique (ARN ou ADN) est entouré par des capsomères (protéines de capside) disposés en hélice.

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14
Q

Le génome des virus

A

-ADN ou ARN
-Bicaténaire (ds = double-stranded) ou monocaténaire (ss = single-stranded)
-Segmenté ou non segmenté
-Linéaire ou circulaire
-Poids moléculaire très variable (1.5 x 106 à 160 x 106 daltons)

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15
Q

Types de génomes viraux

A
  1. ADN bicaténaire
  2. ADN monocaténaire
  3. ARN monocaténaire
  4. ARN bicaténaire
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16
Q

Qu’est ce que le cycle de réplication virale

A

-L’ensemble des étapes permettant au virus de se répliquer à l’intérieur d’une cellule hôte.
-Requiert une cellule susceptible et permissive à l’infection:
* la cellule susceptible est munie de récepteurs cellulaires spécifiques
*la cellule permissive est dotée des conditions permettant la production de nouveaux virions

17
Q

Conditions pour cycle réplicatif viral

A

-Cellule vivante
-Récepteur spécifique sur la membrane

18
Q

Étapes de la réplication virale

A
  1. Attachement – à l’aide d’une protéine à la surface du virus qui reconnaît un récepteur spécifique sur la cellule cible
  2. Entrée (Le virus entre dans la cellule)
  3. Décapsidation (‘uncoating’) (libérant le génome viral)
  4. Transcription (précoce : avant réplication de l’acide nucléique)
  5. Traduction (précoce : avant réplication de l’acide nucléique)
  6. Synthèse des enzymes de réplication
  7. Réplication de l’acide nucléique
  8. Transcription (tardive, pour structure)
  9. Traduction (tardive, pour structure)
  10. Synthèse des protéines structurales
  11. Assemblage des nucléocapsides : Les génomes viraux sont encapsidés dans de nouvelles capsides formées à partir des protéines virales et
    les virus enveloppés récupèrent leur enveloppe lipidique en bourgeonnant à partir de la membrane cellulaire.
  12. Libération
19
Q

Règles de nomenclature

A

1-Ordre (…virales)
2-Familles (…viridae)
- DNA ou RNA
- ds ou ss
- forme de la capside
- enveloppés ou non
3-Sous-familles (…virinae)
- poids moléculaire de l’acide nucléique
- diamètre des particules virales
- nombre de capsomères (= unités de capside)
- hôtes infectés, etc
4-Genres (…virus)
5-Espèces (lettre ou chiffre qualifiant le genre)

20
Q

4 Méthodes de diagnostic viral

A

1-Microscopie électronique (technique fastidieuse, peu utilisé)
2-Culture cellulaire + immunofluorescence (IF) avec un anticorps spécifique
3-PCR
4-Sérologie (recherche des anticorps dans le sérum par IF ou ELISA) (utile pour Virus de l’hépatite)

21
Q

Polymérisation en chaine (PCR)

A

1 cycle :
Au début : 1 ADN
1-Dénaturation (temp. élevé)
2-Hybridation des amorces (temp descend)
3-Extension avec enzyme Taq (temp remonte)
À la fin : 2 ADN

22
Q

Quels sont les 4 voies de transmission virale

A

1-Respiratoire
2-Gastrointestinale
3-Génitale
4-Parenterale

23
Q

Qu’est ce que la gastroentérite

A

Inflammation du système digestif (avec nausées, maux de ventre, vomissement, diarrhée, perte d’appétit, maux de tête, etc)

24
Q

Quels virus sont la cause de la gastroentérite

A

-Virus de l’hépatite A (anciennement entérovirus 72)
-Norovirus
-Virus de l’hépatite E
-Rotavirus
-Entérovirus
-Adénovirus (types 40 et 41)
-Astrovirus, Sapovirus, Adénovirus, -Parvovirus, Coronavirus, Aichavirus

25
Caractéristiques des virus causant la gastroentérite
1-Non-enveloppés (ENVELOPPE FRAGILISE LE VIRUS) 2-Résistants au chlore, solvants organiques et pH acide* 3-Résistants à la congélation 4-Sensibles à l’ébullition *Ne sont pas détruits par l’acidité de l’estomac, et résistent à l’acidité des fruits (fraises).
26
Gastroentérites virales: Modes de transmission
1-Voie fécale-orale. 2-Aliments contaminés par l’eau des égouts: mollusques, fruits et légumes. 3-Selles et vomissures de personnes infectées (>1 million particules virales / g de selles). Une charge virale de 10 virions est suffisante pour causer la gastro. 4-Transmission peut se faire par contact direct avec la personne infectée ou par contact indirect (si on touche des surfaces contaminées par le virus, ex: poignées de portes, aliments et boissons contaminés). *Transmission facile dans les milieux où les gens sont en contact étroit: écoles, garderies, établissements de soins de longue durée et de soins de santé, navires de croisière. *Résistants à des taux relativement élevés de chlore et à des températures diverses. *Beaucoup de ces virus survivent jusqu’à 12 heures sur des surfaces dures et jusqu’à 12 jours sur de la moquette contaminée
27
Gastroentérites virales: Prévention
-Se laver les mains fréquemment au savon et à l’eau tiède (pendant au moins 20 secondes), notamment après avoir utilisé les toilettes, après avoir changé des couches, et avant de manger et de préparer les aliments. Une telle pratique s’impose davantage si vous avez été malade récemment ou été en contact avec une personne malade. -Manger des aliments cuits à point (minimum 2 minutes à 70°C, idéalement 1½ minutes à 85°C), et encore chauds. -Bien laver fruits et légumes avant de les manger. -Nettoyer soigneusement l’endroit contaminé immédiatement après un épisode de maladie en utilisant de l’eau chaude et du savon. Utiliser des gants en vinyl. Désinfecter ensuite les surfaces en utilisant un désinfectant à base de chlore d’une concentration d’au moins 1500 ppm (0.15%). Retirer et laver immédiatement vêtements, literies et autres linges susceptibles d’être contaminés par des selles ou des vomissures. Utiliser la laveuse au cycle chaud (85°C). -Jeter selles et vomissures dans les toilettes et s’assurer que les surfaces environnantes soient propres. -Ne pas secouer le linge contaminé et porter des gants domestiques pour manipuler les objets contaminés.
28
Gastroentérites virales - vaccination
1-Vaccin Twinrix: protection contre l’hépatite A et l’hépatite B 2-Vaccin Rotarix: protection contre le Rotavirus
29
Gestion des manipulateurs d’aliments
-Tout employé souffrant de vomissement et diarrhée doit être libéré immédiatement, et ne doit pas retourner au travail avant une période asymptomatique d’au moins 48 heures. -Pour le virus de l’hépatite A, la période d’exclusion recommandée est de 1 semaine suite à l’apparition de jaunisse*. -L’honnêteté est essentielle: faut encourager les employés à déclarer leurs symptômes dès que possible.
30
Caractéristiques du modèle 1-Picornaviridae
-virus non enveloppés, résistants dans l’environnement -transmission fécale-orale -Exemple: poliovirus – cause la poliomyélite* -petits virus à RNA+ -stables à pH acide (pH 3 à 5) -multiplication dans le tube digestif -très large prédominance des infections inapparentes -diversité clinique des infections apparentes
31
Etiologie du Picornaviridae
Le poliovirus fait partie de la famille des Picornaviridae (« pico » = petit, RNA…viridae). Le genre Entérovirus est inclus dans cette famille virale. Ce genre est divisé en deux groupes d’espèces susceptibles d’infecter les humains : 1.Entérovirus de type A à J (> 75 sérotypes) 2.Rhinovirus de type A – C (> 99 sérotypes)
32
Poliovirus - physiopathologie
Virus ↓ voie digestive ↓ période d’incubation (amygdales, adénoides, tissu lymphoide du tube digestif), durée : 1-2 semaines infections inapparentes dans > 80% des cas - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ↓ phase d’invasion = virémie durée : 4 - 5 jours (fièvre, douleurs musculaires, malaises digestives, parfois avec maux de tête, vomissements = atteinte méningée) maladie bénigne dans >90% des cas - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ↓ paralysies = poliomyélite = infection des neurones moteurs de la corne antérieure de la moëlle épinière ↓ excrétion dans selles
33
Poliovirus - prévention, vaccin Salk
Coût de production : Élevé Coût d’administration : Élevé mais incorporé au DCT-HépB-Hib* Innocuité : Absolue Contre-indications : Non Neurovirulence possible : Non
34
Poliovirus - prévention, vaccin Sabin
Coût de production : Relativement élevé Coût d’administration : Faible Innocuité : Très grande Contre-indications : Grossesse, immunodéficience Neurovirulence possible : Oui
35
Caractéristiques du modèle 2 Coronaviridae
1-Virus enveloppés 2-Génome ARN+ 3-Causent des infections respiratoires, dont certaines sont des zoonoses très pathologiques pour l’humain (SRAS-2003, COVID-19) 4-Transmission: contact, gouttelettes, aérosol, fécale-orale(?)
36
Comment SRAS-CoV-2 est transmit
Le SRAS-CoV-2, responsable du COVID-19, se transmet principalement par trois voies : aérienne, par contact direct et par surfaces contaminées. -Direct : Toux -> aérosol (reste longtemps dans l'air) + gouttelettes respiratoire -Indirect: Surface contaminés -Digestif -> toilette
37
COVID-19 manifestations cliniques
Multisystème
38
COVID-19 prévention et traitement
-Mesures de santé publique: lavage des mains, distanciation sociale, port de masque, visière et autres EPP -Vaccins: Pfizer/BioNtech, Moderna, J&J, AstraZeneca, etc -Antiviraux: Remdesivir (?) -Monoclonaux -Sérums immuns (?) -Corticostéroïdes: dexaméthasone