Virus Flashcards
Qu’est ce qu’un virus ?
Virus : parasite obligatoire qui dépend d’une cellule hôte (aussi appelée ‘cellule cible’) pour se répliquer.
Virus: agent infectieux constitué d’un seul acide nucléique = génome, entouré d’un coque protéique = capside, l’ensemble pouvant être (ou non) entouré d’une membrane lipidique = enveloppe.
Qu’est ce qu’un virion ?
Virion: particule virale complète et capable d’infecter une cellule susceptible.
Qu’est ce qu’un nucléocaspide ?
Nucléocapside = acide nucléique + capside.
N.B. La présence d’une enveloppe est caractéristique de certaines familles virales.
Qu’est ce qu’une bactérie ?
-sont des cellules avec organelles fonctionnelles
-génome = ADN
-possèdent leur propre appareillage pour synthétiser les macromolécules nécessaires à leur reproduction
-se répliquent par fission binaire
-sont sensibles aux antibiotiques
Comment le virus est différent de la bactérie ?
-ne sont pas considérés “cellules” (ne possèdent pas d’organelles)
-matériel génétique = ADN ou ARN
-dépendent obligatoirement de la «cellule hôte» pour se reproduire
-l’acide nucléique viral peut être infectieux
-ne sont pas affectés par les antibiotiques
-La plupart sont «filtrables», voulant dire qu’ils passent à travers les filtres bactériologiques
Quel est le diamètre des poliovirus ?
25-30 nm (microscope électronique)
Quel est le diamètre des pox virus ?
250-400 nm (microscope électronique)
Qui est le plus grand ? Virus ou bactéries ?
Bactéries
Qu’est ce que l’exception des virus géant ?
-On propose un nouvel ordre pour ces virus: «Mégavirales»
- Plusieurs genres : Mimivirus, Mamavirus, Pandoravirus, Pithovirus
-Les plus grands des virus géants ont un diamètre >1 µm et un génome ˃500 kpb
-Génome composé d’ADN
-Se répliquent dans le cytoplasme des amibes
-En 2008, le virophage Sputnik fut découvert comme virus satellite du Mimivirus, peut causer des pneumonies
de quelle origine est l’enveloppe des virus
D’origine cellulaire, fait de lipides et est sensible à l’environnement, ex : chlore
Qu’est ce que contient l’enveloppe viral ?
Glycoprotéines (peplomer) à la surface, qui permettent au virus d’entrer dans la cellule cible
Forme icosaédrique (Virus enveloppé)
Contient une enveloppe +
Glycoprotéine (= spike)
Forme icosaédrique vs forme hélicoïdale
Forme icosaédrique :
-Ressemble à un polyèdre à 20 faces triangulaires.
-Très stable grâce à sa symétrie géométrique.
Forme hélicoïdale :
-Structure en spirale ou en hélice autour du génome viral.
-Le matériel génétique (ARN ou ADN) est entouré par des capsomères (protéines de capside) disposés en hélice.
Le génome des virus
-ADN ou ARN
-Bicaténaire (ds = double-stranded) ou monocaténaire (ss = single-stranded)
-Segmenté ou non segmenté
-Linéaire ou circulaire
-Poids moléculaire très variable (1.5 x 106 à 160 x 106 daltons)
Types de génomes viraux
- ADN bicaténaire
- ADN monocaténaire
- ARN monocaténaire
- ARN bicaténaire
Qu’est ce que le cycle de réplication virale
-L’ensemble des étapes permettant au virus de se répliquer à l’intérieur d’une cellule hôte.
-Requiert une cellule susceptible et permissive à l’infection:
* la cellule susceptible est munie de récepteurs cellulaires spécifiques
*la cellule permissive est dotée des conditions permettant la production de nouveaux virions
Conditions pour cycle réplicatif viral
-Cellule vivante
-Récepteur spécifique sur la membrane
Étapes de la réplication virale
- Attachement – à l’aide d’une protéine à la surface du virus qui reconnaît un récepteur spécifique sur la cellule cible
- Entrée (Le virus entre dans la cellule)
- Décapsidation (‘uncoating’) (libérant le génome viral)
- Transcription (précoce : avant réplication de l’acide nucléique)
- Traduction (précoce : avant réplication de l’acide nucléique)
- Synthèse des enzymes de réplication
- Réplication de l’acide nucléique
- Transcription (tardive, pour structure)
- Traduction (tardive, pour structure)
- Synthèse des protéines structurales
- Assemblage des nucléocapsides : Les génomes viraux sont encapsidés dans de nouvelles capsides formées à partir des protéines virales et
les virus enveloppés récupèrent leur enveloppe lipidique en bourgeonnant à partir de la membrane cellulaire. - Libération
Règles de nomenclature
1-Ordre (…virales)
2-Familles (…viridae)
- DNA ou RNA
- ds ou ss
- forme de la capside
- enveloppés ou non
3-Sous-familles (…virinae)
- poids moléculaire de l’acide nucléique
- diamètre des particules virales
- nombre de capsomères (= unités de capside)
- hôtes infectés, etc
4-Genres (…virus)
5-Espèces (lettre ou chiffre qualifiant le genre)
4 Méthodes de diagnostic viral
1-Microscopie électronique (technique fastidieuse, peu utilisé)
2-Culture cellulaire + immunofluorescence (IF) avec un anticorps spécifique
3-PCR
4-Sérologie (recherche des anticorps dans le sérum par IF ou ELISA) (utile pour Virus de l’hépatite)
Polymérisation en chaine (PCR)
1 cycle :
Au début : 1 ADN
1-Dénaturation (temp. élevé)
2-Hybridation des amorces (temp descend)
3-Extension avec enzyme Taq (temp remonte)
À la fin : 2 ADN
Quels sont les 4 voies de transmission virale
1-Respiratoire
2-Gastrointestinale
3-Génitale
4-Parenterale
Qu’est ce que la gastroentérite
Inflammation du système digestif (avec nausées, maux de ventre, vomissement, diarrhée, perte d’appétit, maux de tête, etc)
Quels virus sont la cause de la gastroentérite
-Virus de l’hépatite A (anciennement entérovirus 72)
-Norovirus
-Virus de l’hépatite E
-Rotavirus
-Entérovirus
-Adénovirus (types 40 et 41)
-Astrovirus, Sapovirus, Adénovirus, -Parvovirus, Coronavirus, Aichavirus