Virus Flashcards
Hvad er en virus?
Sup-mikroskopisk non-cellulær genetisk element
Afhængig af andre organismer for replikation
Obligat parasit
Frit ekstra-cellulært stadie
Arvemasse er nukleinsyre
Størrelsen af virus partikler
Der kan være mere end 500 virus partikler inde i en bakteriecelle
Pandoravirus
Base pairs: 2.5 million
Length: 1000 nm
Diameter: 500 nm
Megavirus chilensis
Base pairs: 1.26 million
Diameter: 500 nm
Influenza type A
Base pairs: 13500
Diameter: 100nm
Opdeling efter vært
Dyre-virus
Plante-virus
Bakterie-virus eller bakteriofag
Virus opbygning
Nukleinsyre
Kapsid
Enzymer
Membran
Nukleinsyre
DNA eller RNA
Enkelt eller dobbeltstrenget
2kb - 200 kb (2500kb)
4 gener -»_space;100 gener (>2000)
Morfologiske typer - kapsider
Icosahedral
Rørformet
Membran omsluttet
Komplekse
Kapsomer
Polymer af en eller flere protein enheder
Rørformede virus kapsider
Formet som et hult rør med en protein væg
Icosahedral virus kapsider
Icosahedron er en rumlig struktur med 20 trekantede sider
Komplekse virus kapsider
Influenza virus
Kobbe virus
T4 bakteriofag
Membran - virus
Almindelig ved dyrevirus
Lipid dobbeltmembran kommer fra værtsorganismen
Der forekommer ofte virus specifikke membranproteiner
Kapsid størrelse
Afhænger til dels af genomtype og størrelse
Enzymer - virus
Polimeraser
- MS2
Revers transcriptase
- Retrovirus
Lysozymer
Detektion af virus
Plaque
- Analog til bakterielle kolonier
- Titer (antal) betsemmes som plaque forming units - PFU
Direkte tælling af virus
Direkte tælling i elektron mikroskop EMS
- “efficiency of plating” angiver hvor mange fag partikler som kan give plaques.
Virulent livscyklus
1) Attachment (adsorption)
2) Penetration (injection)
3) Synthesis of nucleic acid and protein
4) Assembly and packaging
5) Release (lysis) of mature virus particles
Virus fasthæftning til cellen er specifik
Bakteriofager inficere derfor typisk kun en bakterieart
Dyrevirus inficere ofte kun specifikke vævstyper
Coronavirus - SARS-CoV-19
Enkelt strenget
+ RNA virus
Den lysogene livscyklus
1) Attachment of the virus to the host cell
2) Injection of viral DNA
3) Viral DNA is integrated into host DNA
4) Viral DNA is replicated with host DNA at cell division
5) Induces the lytic pathway
6) Phage components are synthesised and virions are assembled
7) Lysis of the host cell and release of new phage virions
Retrovirus livscyklus
1) Entry and uncaring of the retrovirus
2) Reverse transcriptase activity (two steps)
3) Viral DNA enters nucleus and integrates into the host genome
4) Transcription by host RNA polymerase froms viral mRNA and genome copies
5) Translation of mRNA forms viral proteins; new nucleocapsids assembles and released by budding
Andre infektiøse elementer
Plasmider
- Cirkulære DNA molekyler
Viroider
- Små cirkulære enkelt strengede RNA molekyler 250-375 nucleotider
Prioner
- kun protein
