Taksonomi Flashcards
Prokaryot genom size
typisk 1-6 millioner baser
Typisk 1000-6000 ORFs
DNA I cellekernen for hhv prokaryoter og eukaryoter
Pro: nej
Eu: ja
DNA oftest i cirkulær form for hhv prokaryoter og eukaryoter?
Pro: ja
Eu: nej
Plasmider for hhv prokaryoter og eukaryoter?
Pro: ofte
Eu: Sjældent
Introns I de fleste gener for hhv prokaryoter og eukaryoter?
Pro: nej
Eu: ja
Operons for hhv prokaryoter og eukaryoter?
Pro: ja
Eu: sjældent
Polycitronisk mRNA for hhv prokaryoter og eukaryoter?
Pro: ja
Eu: sjældent
Poly-A hale på mRNA for hhv prokaryoter og eukaryoter?
Pro: nej
Eu: ja
Antal beskrevne arter af bakterier og archaea
Bakterier: 17.000+
Archaea: 450+
Hvordan kan man ikke definere prokaryote arter?
Seksuelt kriterium kan ikke benyttes
Hvordan kan man definere prokaryote arter?
- stammer med mange fælles egenskaber, som adskiller sig tilstrækkeligt fra andre stammer, udgør en art
- Stammer med >70% ens DNA er en art
- Stammer med >97% ens 16S rDNA er en operational taxonomic unit (OTU) nogenlunde svarende til en art
Hvad er mikrobielle stammer?
Organismer der kan genkendes inden for en art
Nedstammer fra en enkelt organisme
Stammer kan være forskellige med hensyn til biokemi, fysiologi og/eller patogenese
Fx 190 E.coli serotyper
Vigtige gram positive rækker og slægter
Række: Firmicutes
- Bacillus
- Clostridium
- Staphylococcus
- Streptococcus
- Lactobacillus
Række: Actinobacteria
- Streptomyces
- Mycobacterium
- Corynebacterium
Bacillus og Clostridium spore og growth
Kan danne endosporer
Bacillus er aerobe eller fakultativt anaerobe
Clostridium er anaerobe
- mester-forgærere
B. mycoides
Fredelig jordbakterie