virologie Flashcards
qu’est-ce qu’un virus?
agent infectieux (infecte tous sans exception)
les virus sont-ils vivants ou morts?
sont considérés morts lorsqu’en dehors d’un hôte et vivant lorsque dedans.
nommer les caractéristiques des virus lorsqu’ils sont sous forme extracellulaire
molécules organiques inertes, absence de métabolisme
nommer les caractéristiques des virus sous forme intracellulaire
présence de réactions et molécules caractéristiques d’être vivant (réplication acides nucléiques, composition protéique(
un virus est un parasite intracellulaire obligatoire, expliquer.
le virus monopolise les activités cellulaires (prennent le contrôle de l’hôte) et produisent des particules virales
quelle est l’unité infectieuse de base d’un virus?
virion
de quelle structure est fait un virus?
acellulaire
vrai ou faux ? les virus possèdent une origine évolutive provenant des procaryotes.
faux!! leur origine évolutive est inconnue, car aucun gène commun n’a été trouvé
quelle taille fait un mimivirus?
1000nm
quelle est le range de taille moyenne pour des virus considérés comme petits?
10-400nm
quelle taille font des gros virus?
0.01-0.4micron
vrai ou faux? les virus possèdent un nombre impressionnant d’espèces cellulaires.
faux, leur nombre de constituants/macromolécules cellulaires est limité
quels sont les constituants de base des virus?
acide nucléique, capside, enveloppe
qu’est-ce que la nucléocapside?
combinaison de l’acide nucléique, capside et les protéines capsidiques
vrai ou faux? la capside et l’acide nucléique sont présents chez la majorité des virus.
faux, présents chez TOUS les virus
qu’est-ce qui constitue le génome du virus?
son acide nucléique
qu’est-ce qui différencie le génome des virus à celui des autres types cellulaires?
les cellules ont normalement un ADN bicaténaire ou ARN mono (selon l’organisme), alors que les virus peuvent avoir ADN:1 ou :2 ou ARN:1 ou :2
vrai ou faux? le génome d’un virus peut contenir à la fois de l’ADN et de l’ARN.
faux, c’est l’un ou l’autre, mais pas les deux
quel type de génome est présnt chez le virus de la covid-19?
ARN:1
sous quelle forme peut se retrouver l’acide nucléique chez un virus?
linéaire, circulaire, unique ou multiple
pourquoi la réplication de l’acide nucléique d’un virus nécessite des enzymes virales?
car les ADN:1 ou ARN:2 sont absents des cellules hôtes, donc les virus qui doivent se répliquer avec ça ne peuvent pas le faire avec la machinerie de base de la cellule
quelle taille peut faire le génome d’un virus? qu’est-ce que cela nous apprend?
4-1200kb, donc même un très petit virus (petit génome) peut infecter de manière efficace une cellule
1 gène fait en moyenne quelle taille?
1kb
quelle est la grosseur du génome des homo sapiens?
10E6 kb
quel organisme a une taille de génome de 4x10E3 kb?
e.coli
le génome des virus est majoritairement haploide ou diploide?
haploide, parfois diploide
qu’est-ce qu’un génome fragmenté?
génome divisé en fragments séparés
quel est le rôle de l’acide nucléique?
porter l’information génétique (protéines de structures, enzymes, reprogrammation cellulaire)
où se trouve la capside?
structure protéique se trouvant à l’extérieur de l’acide nucléique
quelle est la sous-unités structurale de la capside?
les capsomères (eux-mêmes sont des assemblages de protomères)
compléter la phrase: la capside est un … de capsomères qui donne … au virion
assemblage et la forme
quels sont les rôles de la capside?
protection de l’acide nucléique, attachement de la cellule via protéines de capsides, les fibres/spicules ou queue
nommer les types de symétrie possible pour la capside.
hélicoidale, polyèdre et binaire
vrai ou faux? un virus peut présenter un mélange de type de capside.
faux, 1 seul type
quels sont les types de capsomères employés pour former une capside polyèdre?
faces, arêtes et sommets
décrire la forme de la capside polyèdre
icosaèdre, 20 côtés formés par un assemblage de capsomères en triangles
donner un exemple de virus qui possède une capside polyèdre.
virus de la poliomyélite (fièvre aptheuse)
quel(s) type(s) de capsomère compose la capside hélicoidale?
1 seul type
quelle forme possède un virus ayant une capside hélicoidale?
forme de bâtonnet creux
donner des exemples de virus ayant une capside hélicoidale?
virus de la mosaïque du tabac, rage, oreillons, rougeole, covid, bactériophage M13
quel type de capside possède SRAS-CoV2?
hélicoidale
une capside binaire est retrouvé chez quel type de virus?
exclusif aux bactériphages
vrai ou faux? tous les phages ont une capside binaire.
faux, pas tous les phages, mais les capsides binaires sont réservés aux phages
quelle est la forme des virus ayant une capside binaire?
mixte de 2 symétrie, soit une tête polyèdre et une queue hélicoidale
donner des exemples de virus ayant une capside binaire?
T paires d’e.coli, DT1 de streptococcus thermophilus
que sont les nucléoprotéines?
se sont des protéines d’origine virale (absente chez l’hôte) présente dans la capside du virus
quels sont les rôles des nucléoprotéines?
permet l’empaquetage de l’acide nucléique virale, réplication et lecture de l’acide nucléique virale
qu’est-ce qu’une ARN polymérase dépendante de l’ARn?
c’est une polymérase qui copie l’ARN pour produire de l’ARN?
quelle est l’utilité pour un virus d’avoir une transcriptase inverse?
la transcriptase inverse permet de produire de l’ADN depuis de l’ARN, donc plus facile pour le virus d’intégrer sin génome dans la cellule hôte
qu’est-ce que l’enveloppe?
c’est une couche extérieur à la capside qui est fréquente chez les virus, mais pas toujours présente
quelle est l’origine de l’enveloppe?
provient de la membrane cytoplasmique ou nucléaire selon l’endroit où le virus réplique son acide nucléique et est liée au mécanisme de sortie des virus
quels sont les rôles de l’enveloppe?
protection du virus, reconnaissance des récepteurs spécifiques de la cellule hôte cible et pénétration et sortie du virus
de quoi est composée l’enveloppe?
de phospholipides, protéines cellulaires et glycoprotéines virales
qu’est-ce qu’un péplomère?
c’est une glycoprotéine virale
donner des exemples de péplomère chez le virus influenza
hémagglutinine et neuraminidase
qu’est-ce qui a permis de créer un vaccin pour la grippe H1N1?
selon le type de H et N (hémagglutinine et neuraminidase) présent dans le virus
vrai ou faux? le virus de la covid est un virus enveloppé.
vrai
qu’est-ce que fait la neuraminidase?
digère l’acide neuraminique
qu’est-ce qui permet d’agglutiner les globules rouges?
la présence de la glycoprotéine hémagglutinine
quels sont les 2 caractéristiques principales de la réplication virale?
absence de croissance (pas d’augmentation de la taille) et production de copies identiques (répliques)
nommer les 5 étapes du cycle viral.
adsorption à la surface cellulaire, pénétration de la cellule infectée, réplication des constituants viraux, assemblages des constituants et sortir du virus
l’étape de reconnaissance du virus à la surface se produit de quelle façon?
se fait par la collision au hasard et par les forces électrostatiques
vrai ou faux? l’adsorption à la surface cellulaire est un processus irréversible.
faux, la première étape, soit la reconnaissance est réversible, mais l’attachement est irréversible.
qu’est-ce qui permet l’attachement finale entre le virus et la cellule infectée?
la complémentarité virus-récepteurs membranaires de surface
de quelle façon se fait l’infection des virus des plantes?
par piqure d’insecte ou abrasion mécanique car pas de récepteur connu
la présence des récepteurs au niveau de la surface cellulaire est essentielle pour quoi?
pour la spécificité et le trophisme
quelle est la protéine membranaire reconnu par le virus de la covid?
ACE2
de quelle façon les bactériophages pénètres leur cellule hôte?
l’acide nucléique pénètre directement et la capside reste à l’extérieur
par quel moyen les virus enveloppés pénètrent-ils dans les cellules infectées?
par la fusion directe entre enveloppe et membrane cytoplasmique
quel type de virus peut pénétrer une cellule par endocytose?
virus enveloppés ou nus
suite à la pénétration par endocytose, comment l’acide nucléique du virus peut se rendre au site de réplication?
libération de nucléocapside et par la décapsidation (bris de la capside) et libération de l’acide nucléique
où se retrouve l’acide nucléique suite à sa libération?
soit dans le noyau ou dans le cytoplasme selon sa migration
par quoi est caractérisée le début de la phase d’élipse?
depuis la perte de la capside, le virus devient absent lorsqu’observé au microscope
quels sont les événements précoces de la réplication des constituants vitaux?
réplication des enzymes de réplication et enzymes de lecture de l’acide nucléique et ensuite réplication de l’acide nucléique
quels sont les événements tardifs de la réplication des constituants vitaux?
réplication des protéines de structures (capsomères, glycoprotéines d’enveloppe, protéines de queue et enzymes de lyse)
qu’est-ce qui est nécessaire avant de débuter les événements tardifs de la réplication?
atteinte d’un certain seuil d’acide nucléique dans la cellule
vrai ou faux? l’encapsidation des différents type de symétrie se fait de la même façon.
faux, l’assemblage des constituants se fait selon le mécanisme propre à chaque type de symétrie
de quelle façon se fait l’assemblage des constituants d’une capside binaire?
la queue et la tête s’assemble séparément et se joignent ensuite ensemble
à quel étape du cycle viral prend fin la phase d’éclipse?
après l’étape d’assemblage des constituants, donc une fois que la capside est assemblée
expliquer le processus par lequel l’assemblage d’une capside hélicoïdale se produit.
via interaction entre chaque capsomère et l’acide nucléique du virion et assemblage un par un de façon héloicoidale
Quel est le temps moyen pour un bactériophage pour passer au travers la phase d’éclipse?
quelques minutes seulement
combien de temps prend un virus animal pour sa phase d’éclipse?
de 1 à 10h
nommer les types de sortie possibles des virus de la cellule hôte.
lyse cellulaire, bourgeonnement, canaux cellulaires
quel type de virus sort de hôte par lyse cellulaire?
les virus nus, car absence d’enveloppe
quel est le devenir de la cellule hôte d’un virus qui sort par lyse cellulaire?
mort de la cellule
par quel type de virus est effectuée les sorties de la cellule infectée par bourgeonnement?
les virus enveloppés
comment les virus savent par où sortir de la cellule? peuvent-ils sortir n’importe où?
ils doivent sortir à l’endroit d’où proviennent les signaux, envoyés par les glycoprotéines virales présentes dans la membrane
quel est le devenir de la cellule hôte infectée par un virus enveloppés?
survie de la cellule pour une période prolongée
les virus à réplication nucléaire sortent de quelle manière de la cellule infectée?
par des canaux cellulaires (tels le Golgi ou RE)
combiens de virions sont produits par l’infection d’une cellule pour un virus animal?
entre 10E3à6
les phages produisent en moyenne combien de nouveaux phages en infectant une cellule?
T paires 10E2-3
selon quelles caractéristiques pouvons-nous classifier les virus?
type d’acide nucléique, présence d’enveloppe ou pas, processus de réplication, taille, nombre de capsomères, propriétés immunologiques, nombre de gènes/carte génomique, site de réplication (cytoplasme/noyau), tissu ou hôte
qu’est-ce que permet d’identifier le test de chloroforme?
présence d’une enveloppe sur un virus
expliquer ce qu’est un test au chloroforme?
un virus enveloppé est mise en contact avec du chloroforme. l’enveloppe sera dégradée et le virus ne sera plus infectieux lorsque placé chez un hôte
pourquoi un virus enveloppé mis en présence de chloroforme ne peut plus infecter une cellule hôte?
car ces glycoprotéines virales de surface nécessaire à l’infection ne sont plus présente en raison de la dégradation de l’enveloppe
de quel type de nomenclature fait partieles virus?
nomenclature linéenne (italique ou soulignée)
quelles sont les classifications présentes dans le nom d’un virus? Est-ce que cela nous informe sur le virus?
c’est l’ordre et la famille. oui le nom doit nous donner de l’information sur le virus
de quel virus parle-t’on: tobamovirus
virus de la mosaique du tabac
dans quel type de culture pouvons-nous observer des plages de lyse?
en milieu gélosé
qu’est-ce qui est nécessaire pour faire une bonne infection de cellule hôte par un bactériophage dans un milieu gélosé?
des cellules bactériennes métaboliques actives (vivantes) idéalement en phase exponentielle pour optimiser les résultats
comment peuvent être isoler des virus animaux?
par l’infection de celui-ci dans un oeuf embryonné de poulet
quelle cellule hôte est à l’origine de la création du vaccin contre la polio?
cellules de rein de singe
qu’est-ce que l’infection d’œuf embryonné de poulet à permis de faire?
production de vaccin, comme celui pour l’influenza
la création de vaccin à partir d’oeuf de poulet est problématique pour qui?
ceux qui sont allergiques aux oeufs
qu’est-ce qui est étudié lors de l’isolement de virus à partir de culture de tissus humains ou animaux?
les effets cytopathiques caractéristiques de l’infection du virus
quels sont les changements conformationnels typiques observés au niveau des cellules des tissus suite à une infection virale?
cellules arrondies, augmentation ou baisse du volume, agrégation, corps d’inclusion, lyse, formation de syncitia
qu’est-ce qu’un syncitia?
c’est une cellule multinucléé qui s’est produite suite à la fusion des membranes de plusieurs cellules
dans quel contexte on doit faire l’identification d’un virus par les techniques plus élaborées et couteuse?
si ont doit absolument savoir quel est le virus ou si les symptômes du patient ne sont pas concluent
lorsqu’on observe un virus par microscopie électronique que peut-on voir?
capside, enveloppe et site de réplication (cytoplasme ou noyau)
quelles sont les techniques d’identification d’un virus?
microscopie électronique, immunofluorescence, infection expérimentale, séquençage de l’acide nucléique
comment est-il possible d’identifier un virus via l’immunofluorescence?
utilisation d’anticorps spécifiques (fixé des à fluorochromes ou autres colorants fluo) qui reconnaissent les glycoprotéines de surface des virus
qu’elle serait l’origine des virus?
ils auraient des origines multiples
d’où provient l’acide nucléique des virus?
d’un ADN égoiste spécialisé qui s’autopropageait et qui a acquis des gènes codant pour les structures des capsides
qu’est-ce qui explique l’évolution rapide des virus? donner un exemple.
le nombre élevé d’erreurs fait par la polymérase qui crée de nombreuses mutations au sein du virus. ex du VIH qui peut évolue intra patient
pour 1 ml d’eau présent dans les océans, combien retrouve-t’on de virions?
10E6-9
combien de virions sont trouvés par mm de surface terrestre?
3 x 10E30-31
vrai ou faux? les virus représente l’entité biologique la plus abondante de la biosphère.
vrai
quelles sont les fonctions écologiques des virus?
contrôle des mono-espèces et faire court-circuit de la matière organique en créant une boucle microbienne viral shunt
quel genre de population peut contrôler les virus?
marée d’algues rouges ou fermentations industrielles
de quel(s) cycle(s) terrestres font partie les virus?
C et N
vrai ou faux? un viroide est un synonyme pour virion.
faux, viroide est un autre type d’agent infectieux mais pas comme un virion
un viroide est phytopathogène, expliquez.
les viroides peuvent produire plus de 20 types de pathogènes différents
donner un exemple de maladie produite par un viroide?
tuberculose en fuseaux de la pomme de terre
quel est le type d’acide nucléique rencontré chez un viroide?
ARN:1 circulaire en général
de combien de fois le génome du viroide est-il plus petit que celui du virus?
10 fois
on retrouve combien de nucléotides dans le génome d’un viroide?
entre 250-370
quel type d’agent infectieux a besoin d’un virus auxilaire pour se répliquer ?
virusoide
comment se fait la transmission des virusoides?
cellules/cellules, pollen ou abrasion
vrai ou faux? tout comme les virus, les viroides possèdent des capsides
faux, les viroides n’encodent pas pour les protéines des capsides
les viroides se répliquent de la même façon que les virus. expliquez
la réplication se fait grâce aux enzymes de l’hôte, ne peut pas se répliquer seul
à quel endroit s’accumule les nouveaux viroides produits?
dans le cytoplasme
quelle est la différence majeure entre un viroide et virusoide?
présence d’une capside et besoin d’un virus auxiliaire
quel type d’ARN est présent chez les virusoide?
ARN satellites
le virus de l’hépatite B est le virus auxiliaire de quel virusoide?
celui de la l’hépatite D
décrire le génome du virusoide de l’hépatite D.
ARN:1 circulaire, 1700nt, code pour protéine sigma
qu’est-ce qu’un virophage?
c’est un virus qui infecte un autre virus pour se répliquer
donner un exemple de virophage et de virus qu’il peut infecter.
sputnik peut infecter des mimivirus, mamavirus et mégavirus
quel est l’effet de l’infection d’un mégavirus par un virophage?
diminution de l’efficacité du mégavirus
qu’est-ce qu’un prion?
protéine infectieuse (proteinaceous infective particles)
la découverte de quel agent infectieux a permis de gagner un prix Nobel?
découverte du prion
qui a recu un prix nobel en 1977?
prusiner
quels sorte(s) de pathogènes causent en majorité les prions?
pathogènes animaux
de quelle façon les prions se répliquent-ils?
se réplique par la modification d’une protéine cellulaire
vrai ou faux? les prions n’ont pas de capside.
vrai
quelle est la grandeur du génome d’un prion?
environ 250 aa, ce qui est 100 fois plus petit que les virus
la forme infectieuse des prions est difficile à tuer, expliquer.
ils résistent des heures dans l’autoclave, aux protéases et aux UV.
comment les prions peuvent-ils s’accumuler dans la cellule hôte?
les prions obligent les protéines normales à se transformer en anormales (maintenant en prion)
quelles sont les conséquences de l’accumulation de prions dans la cellule hôte?
polymérisation du matériel fibreux et dérèglement des activités cellulaires
nommer des pathologies possibles causées par des prions?
tremblante du mouton, encéphalopathie spongiforme bovine, contagieuse du vison, sup 35 de cerevisiae
de quelle façon peuvent se développer les maladies dégénératives du SNC?
acquises ou génétiques
comment peuvent se transmettre les maladies causées par le prions?
ingestion, transmission, génétique ou mutation spontannée
comment peuvent se traiter les maladies causées par les prions?
aucun traitement, thérapie ou vaccin n’est connu
nommer des maladies dégénératives causées par les prions.
kuru, insomnie familiale fatale, syndrome alpers
de quelle sorte de maladie fait partie celle causée par les prions?
maladie non-immunogène
quels sont les impacts des agents infectieux acellulaires?
impacts sur les fonctions des virus, compte pour 8% du génome humain, répercussion sur la santé et développement (régulation hormonale dictant la gestation)
ADN de virus endogènes étaient présents dans le génome de quel organisme?
homo neanderthalis
