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Microbiologie > Caractérisation et classification > Flashcards

Caractérisation et classification Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la taxonomie?

A

établir des groupes naturels d’organismes présentant des caractères communs.

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Q

Qu’est-ce qu’un taxon?

A

un groupe naturel d’organismes qui possèdent des caractères communs

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3
Q

Quels sont les 3 étapes essentielles à la formation d’un taxon?

A

identification, nomenclature et classification

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4
Q

Quel est la hiérarchie des taxons?

A

espèce, genre, famille, ordre, classe, phylum (embranchement), sous-embranchement, règne et domaine

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Q

Qu’est-ce que cela implique pour l’organisme, d’être dans une hiérarchie non-chevauchante?

A

un organisme fait parti d’un seul taxon à un niveau donné de la pyramide

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6
Q

Vrai ou faux, les cultures pures et les cellules souches sont des synonymes?

A

Faux. Les souches sont des descendants (sous-culture) des cultures pures.

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7
Q

Qu’est-ce qui caractérise une espèce?

A

groupes de souches dont les caractéristiques sont presque identiques. C’est le taxon de base.

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8
Q

En quoi consiste une souche-type?

A

souche possédant les caractéristiques représentatives de l’espèce (équivaut à la 1ere expérience)

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9
Q

Quels sont les 2 centres de référence?

A

ATCC et NTCC

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10
Q

En quoi consiste l’identification d’un taxon?

A

description et caractérisation d’une culture pure

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11
Q

Selon quels critères généraux les taxons peuvent être identifiés?

A

morphologie, composition biochimique, physiologie, métabolisme, génétique, interaction avec hôte, écologie, moléculaire

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12
Q

Dans quel type d’identification fait parti la réactions aux colorants?

A

identification morphologique

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13
Q

Quelle caractéristique de l’organisme peut nous donner sa taille, sa forme, son arrangement et sa structure?

A

caractéristique morphologique

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14
Q

Est-il possible d’identifier une espèce par la capacité à former des endospores? précisez.

A

oui, c’est une identification morphologique

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15
Q

Selon quels critères de la composition biochimique les organismes peuvent être identifier?

A

la composition de la membrane (lipides, alcools) et de la paroi (polysaccharides, protéines)

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16
Q

Les archea sont caractérisés par quel composant présent dans leur paroi cellulaire?

A

pseudomuréine

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17
Q

L’identification des organismes peut se faire selon quelles caractéristiques physiologiques?

A

les exigences nutritionnelles (sources carbones, facteurs de croissance) et les conditions d’incubation (température, O2 et lumière)

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18
Q

Quels sont les différents composants du métabolisme qui peuvent être identifiés?

A

produits finaux de fermentation

enzymes extracellulaires

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19
Q

Quelle est la composition en C et G des animaux et plantes?

A

environ 30-50%

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20
Q

Vrai ou faux? Un ADN bicaténaire a une densité optique plus grande qu’un ADN monocaténaire.

A

faux, la DO d’un bicaténaire est plus faible que monocaténaire

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21
Q

Si la composition en C et G est haute, la T° de fusion sera haute ou basse?

A

plus haute

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22
Q

Quel est le pourcentage de C et G en général chez les microorganismes? Qu’est-ce que cela implique?

A

25-80%, grande diversité

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23
Q

Qu’est-ce que la T° de fusion?

A

T° à laquelle l’ADN bicaténaire devient monocaténaire

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24
Q

La composition en C et G peut-elle changer entre les microorganismes?

A

oui au sein d’une espèce cela peut varier un peu, mais intra-genre ça reste très similaire

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25
Q

l’identification par le nombre de chromosomes ou les particularités des plasmides font parti de quelle caractéristique des organismes ?

A

caractéristique génétique

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26
Q

Quelles interactions entre les microorganismes et un hôte permet leur identification?

A

la pathogénicité, capacité de provoquer des maladies et symbiose

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27
Q

L’identification d’un taxon par l’écologie se fait de quelle façon?

A

par l’étude de leur habitat, la niche écologique, le rôle dans les cycles de la matière

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28
Q

Quelles méthodes moléculaires sont utilisées pour identifier des taxons?

A

comparaison de séquences, hybridation ADN-ADN,

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29
Q

Quel est le pourcentage de complémentarité entre des ADN d’organismes de même espèce?

A

plus de 80%

30
Q

Quels types de séquences peuvent être étudiées afin d’identifier des taxons par une méthode moléculaire?

A

des gènes conservés, des protéines conservées, des séquences signatures et des homologies de séquences

31
Q

Qu’est-ce qu’une hybridation ADN?

A

Processus par lequel un ADN est dénaturer en simple brin puis réapparier avec des séquences possiblement complémentaires

32
Q

Qu’est-ce qui est nécessaire pour un taxonome pour attribuer un nom à un taxon?

A

identifier une nouvelle espèce avec un nombre élevé de caractéristiques différentes des autres espèces connues

33
Q

Vrai ou faux? Seulement Bergey’s Manuel of Determinative Bacteriology peut être utilisé en référence pour l’identification de nouveaux microorganismes

A

faux, des sites internet existent aussi, comme NCBI, Genbank, EMBL

34
Q

Qui est responsable d’attribuer les noms aux nouveaux microorganismes découverts ?

A

le comité international de Systématique des procaryotes/microorg eucaryotes

35
Q

Qui est responsable de l’invention de la nomenclature linéenne?

A

Carl von Linné

36
Q

Quelles sont les caractéristiques calligraphiques de la nomenclature des microorganismes?

A

écrit en italique ou soulignée et la première lettre du genre est en majuscule alors que l’espèce en minuscule

37
Q

Quelle nouvelle espèce fut découverte au CHUL en 2009?

A

Clostridium lavalense

38
Q

Qu’est-ce que la classification?

A

C’est l’arrangement en groupes et relations intergroupes selon les caractères communs et les liens évolutifs

39
Q

Quelles sont les classifications possibles?

A

naturelles, phénétiques, numérique, phylogénétique ou contemporaine

40
Q

Selon quoi la classification naturelle se fait?

A

selon la nature biologique des organismes (anatomie)

41
Q

Quel type de classification prendre en compte les similarités des caractères phénotypiques des organismes? Donnez des exemples.

A

la classification phénétique, selon la morphologie, métabolisme, génétique

42
Q

Comment se fait la classification numérique?

A

Par la comparaison de plusieurs organismes 2 par 2

43
Q

Quel est le minimum de caractères communs que doivent avoir des organismes pour être classifier ensemble par type numérique?

A

50

44
Q

Quel est le %S?

A

C’est le pourcentage de similarité où les caractères similaires sont divisés par le nombre de caractères totaux

45
Q

Quelles sont les limites de la classification numérique?

A

la pondération des caractères

46
Q

Quel type de classification prend en compte plus l’origine des microorganismes?

A

la classification phylogénétique

47
Q

Quels éléments peuvent être utiles pour étudier les relations évolutives probables entre des organismes?

A

les ancêtres communs, les comparaisons d’espèces distantes et les fossiles procaryotes

48
Q

Qu’est-ce qui sert de chronomètre moléculaire?

A

comparaison de séquences de gènes ou protéines conservées

49
Q

Vrai ou faux? Les mutations arrivent au hasard?

A

vrai

50
Q

Que peut-on dire d’une mutation qui a un effet neutre ou plus?

A

c’est une mutation conservée

51
Q

Dans les gènes d’ARNr, que représentent les région conservées?

A

des séquences essentielles à la fonction

52
Q

Dans les régions variables du génome, quel effet ont les mutations?

A

aucun, elles n’altèrent par la fonction

53
Q

Dans les régions variables, à quoi est proportionnel le nombre de différences?

A

proportionnel au temps depuis la divergence d’un ancêtre commun

54
Q

Vrai ou faux? Plus il y a de mutations dans une séquence donnée comparée à celle d’origine, plus l’ancêtre est proche.

A

Faux, plus de mutations (donc de différences entre 2 séquences) = plus loin (plus de temps s’est écoulé)

55
Q

Qu’est-ce qu’un nœud?

A

un événement de divergence

56
Q

À quoi correspond les branches entre les nœuds? Qu’est-ce que cela nous apprend?

A

Ce sont les ancêtres des espèces qui divergent en un nœud. La longueur de ces branches nous indiquent le nombre de changements entre les ancêtres communs et les ancêtres.

57
Q

Quel est l’avantage de la classification polyphasique?

A

elle combine les informations phénétiques et phylogénétiques, c’est donc plus complet

58
Q

La classification polyphasique permet de faire une réévaluation de quoi?

A

de la notion d’espèce

59
Q

En quelle année avait lieu la classification de linnaeus?

A

1753

60
Q

Qu’est-ce qui est ressorti de la classification de linneaus?

A

2 règnes animaux et plantes

61
Q

En 1865 le 3e règne protiste fu classifier par?

A

haeckel

62
Q

Qu’est-ce qui fut classifié en 1940?

A

les structures fines des microorganismes

63
Q

En quelle année et par qui a vu le jour les 5 règnes de l’évolution originelle unidirectionnelle?

A

whittaker en 1969

64
Q

Quels éléments faisaient partie de la classification de whittaker en 1969?

A

la nutrition et l’organisation cellulaire, la photosynthèse, absorption soluble et rigide (intestin), eucaryotes/procaryotes et les organismes uni et pluricellulaires

65
Q

Qu’est-ce que Woese a découvert en classifiant des microorganismes et en quelle année?

A

1977, a découvert (LUCA) le dernier ancêtre des 3 domaines eucaryotes, bactéries et archea

66
Q

Par quel approche Woese a pu faire ces découvertes?

A

approche phylogénétique/ARNr

67
Q

Quel serait l’origine des organites de la cellule?

A

selon la théorie de l’endosymbiose

68
Q

Quelles sont les particularités des mitochondries et des chloroplastes?

A

elles sont autoréplicatives, leur chromosome est circulaire et unique, les gènes ARNr sont apparentées aux eubactéries

69
Q

Quel est l’ancêtre de la mitochondrie?

A

une bactérie à métabolisme respiratoire (rickettsia)

70
Q

Quels sont les ancêtre des chloroplastes?

A

les cyanoabctéries

71
Q

quel organisme est un exemple d’endosymbioses récentes et multiples?

A

cyanophora paradoxa

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