Caractérisation et classification

Question 1

Qu’est-ce que la taxonomie?

Answer 1

établir des groupes naturels d’organismes présentant des caractères communs.

Question 2

Qu’est-ce qu’un taxon?

Answer 2

un groupe naturel d’organismes qui possèdent des caractères communs

Question 3

Quels sont les 3 étapes essentielles à la formation d’un taxon?

Answer 3

identification, nomenclature et classification

Question 4

Quel est la hiérarchie des taxons?

Answer 4

espèce, genre, famille, ordre, classe, phylum (embranchement), sous-embranchement, règne et domaine

Question 5

Qu’est-ce que cela implique pour l’organisme, d’être dans une hiérarchie non-chevauchante?

Answer 5

un organisme fait parti d’un seul taxon à un niveau donné de la pyramide

Question 6

Vrai ou faux, les cultures pures et les cellules souches sont des synonymes?

Answer 6

Faux. Les souches sont des descendants (sous-culture) des cultures pures.

Question 7

Qu’est-ce qui caractérise une espèce?

Answer 7

groupes de souches dont les caractéristiques sont presque identiques. C’est le taxon de base.

Question 8

En quoi consiste une souche-type?

Answer 8

souche possédant les caractéristiques représentatives de l’espèce (équivaut à la 1ere expérience)

Question 9

Quels sont les 2 centres de référence?

Answer 9

ATCC et NTCC

Question 10

En quoi consiste l’identification d’un taxon?

Answer 10

description et caractérisation d’une culture pure

Question 11

Selon quels critères généraux les taxons peuvent être identifiés?

Answer 11

morphologie, composition biochimique, physiologie, métabolisme, génétique, interaction avec hôte, écologie, moléculaire

Question 12

Dans quel type d’identification fait parti la réactions aux colorants?

Answer 12

identification morphologique

Question 13

Quelle caractéristique de l’organisme peut nous donner sa taille, sa forme, son arrangement et sa structure?

Answer 13

caractéristique morphologique

Question 14

Est-il possible d’identifier une espèce par la capacité à former des endospores? précisez.

Answer 14

oui, c’est une identification morphologique

Question 15

Selon quels critères de la composition biochimique les organismes peuvent être identifier?

Answer 15

la composition de la membrane (lipides, alcools) et de la paroi (polysaccharides, protéines)

Question 16

Les archea sont caractérisés par quel composant présent dans leur paroi cellulaire?

Answer 16

pseudomuréine

Question 17

L’identification des organismes peut se faire selon quelles caractéristiques physiologiques?

Answer 17

les exigences nutritionnelles (sources carbones, facteurs de croissance) et les conditions d’incubation (température, O2 et lumière)

Question 18

Quels sont les différents composants du métabolisme qui peuvent être identifiés?

Answer 18

produits finaux de fermentation

enzymes extracellulaires

Question 19

Quelle est la composition en C et G des animaux et plantes?

Answer 19

environ 30-50%

Question 20

Vrai ou faux? Un ADN bicaténaire a une densité optique plus grande qu’un ADN monocaténaire.

Answer 20

faux, la DO d’un bicaténaire est plus faible que monocaténaire

Question 21

Si la composition en C et G est haute, la T° de fusion sera haute ou basse?

Answer 21

plus haute

Question 22

Quel est le pourcentage de C et G en général chez les microorganismes? Qu’est-ce que cela implique?

Answer 22

25-80%, grande diversité

Question 23

Qu’est-ce que la T° de fusion?

Answer 23

T° à laquelle l’ADN bicaténaire devient monocaténaire

Question 24

La composition en C et G peut-elle changer entre les microorganismes?

Answer 24

oui au sein d’une espèce cela peut varier un peu, mais intra-genre ça reste très similaire

Question 25

l'identification par le nombre de chromosomes ou les particularités des plasmides font parti de quelle caractéristique des organismes ?

Answer 25

caractéristique génétique

Question 26

Quelles interactions entre les microorganismes et un hôte permet leur identification?

Answer 26

la pathogénicité, capacité de provoquer des maladies et symbiose

Question 27

L'identification d'un taxon par l'écologie se fait de quelle façon?

Answer 27

par l'étude de leur habitat, la niche écologique, le rôle dans les cycles de la matière

Question 28

Quelles méthodes moléculaires sont utilisées pour identifier des taxons?

Answer 28

comparaison de séquences, hybridation ADN-ADN,

Question 29

Quel est le pourcentage de complémentarité entre des ADN d'organismes de même espèce?

Answer 29

plus de 80%

Question 30

Quels types de séquences peuvent être étudiées afin d'identifier des taxons par une méthode moléculaire?

Answer 30

des gènes conservés, des protéines conservées, des séquences signatures et des homologies de séquences

Question 31

Qu'est-ce qu'une hybridation ADN?

Answer 31

Processus par lequel un ADN est dénaturer en simple brin puis réapparier avec des séquences possiblement complémentaires

Question 32

Qu'est-ce qui est nécessaire pour un taxonome pour attribuer un nom à un taxon?

Answer 32

identifier une nouvelle espèce avec un nombre élevé de caractéristiques différentes des autres espèces connues

Question 33

Vrai ou faux? Seulement Bergey’s Manuel of Determinative Bacteriology peut être utilisé en référence pour l'identification de nouveaux microorganismes

Answer 33

faux, des sites internet existent aussi, comme NCBI, Genbank, EMBL

Question 34

Qui est responsable d'attribuer les noms aux nouveaux microorganismes découverts ?

Answer 34

le comité international de Systématique des procaryotes/microorg eucaryotes

Question 35

Qui est responsable de l'invention de la nomenclature linéenne?

Answer 35

Carl von Linné

Question 36

Quelles sont les caractéristiques calligraphiques de la nomenclature des microorganismes?

Answer 36

écrit en italique ou soulignée et la première lettre du genre est en majuscule alors que l'espèce en minuscule

Question 37

Quelle nouvelle espèce fut découverte au CHUL en 2009?

Answer 37

Clostridium lavalense

Question 38

Qu'est-ce que la classification?

Answer 38

C'est l'arrangement en groupes et relations intergroupes selon les caractères communs et les liens évolutifs

Question 39

Quelles sont les classifications possibles?

Answer 39

naturelles, phénétiques, numérique, phylogénétique ou contemporaine

Question 40

Selon quoi la classification naturelle se fait?

Answer 40

selon la nature biologique des organismes (anatomie)

Question 41

Quel type de classification prendre en compte les similarités des caractères phénotypiques des organismes? Donnez des exemples.

Answer 41

la classification phénétique, selon la morphologie, métabolisme, génétique

Question 42

Comment se fait la classification numérique?

Answer 42

Par la comparaison de plusieurs organismes 2 par 2

Question 43

Quel est le minimum de caractères communs que doivent avoir des organismes pour être classifier ensemble par type numérique?

Answer 43

50

Question 44

Quel est le %S?

Answer 44

C'est le pourcentage de similarité où les caractères similaires sont divisés par le nombre de caractères totaux

Question 45

Quelles sont les limites de la classification numérique?

Answer 45

la pondération des caractères

Question 46

Quel type de classification prend en compte plus l'origine des microorganismes?

Answer 46

la classification phylogénétique

Question 47

Quels éléments peuvent être utiles pour étudier les relations évolutives probables entre des organismes?

Answer 47

les ancêtres communs, les comparaisons d'espèces distantes et les fossiles procaryotes

Question 48

Qu'est-ce qui sert de chronomètre moléculaire?

Answer 48

comparaison de séquences de gènes ou protéines conservées

Question 49

Vrai ou faux? Les mutations arrivent au hasard?

Answer 49

vrai

Question 50

Que peut-on dire d'une mutation qui a un effet neutre ou plus?

Answer 50

c'est une mutation conservée

Question 51

Dans les gènes d'ARNr, que représentent les région conservées?

Answer 51

des séquences essentielles à la fonction

Question 52

Dans les régions variables du génome, quel effet ont les mutations?

Answer 52

aucun, elles n'altèrent par la fonction

Question 53

Dans les régions variables, à quoi est proportionnel le nombre de différences?

Answer 53

proportionnel au temps depuis la divergence d'un ancêtre commun

Question 54

Vrai ou faux? Plus il y a de mutations dans une séquence donnée comparée à celle d'origine, plus l'ancêtre est proche.

Answer 54

Faux, plus de mutations (donc de différences entre 2 séquences) = plus loin (plus de temps s'est écoulé)

Question 55

Qu'est-ce qu'un nœud?

Answer 55

un événement de divergence

Question 56

À quoi correspond les branches entre les nœuds? Qu'est-ce que cela nous apprend?

Answer 56

Ce sont les ancêtres des espèces qui divergent en un nœud. La longueur de ces branches nous indiquent le nombre de changements entre les ancêtres communs et les ancêtres.

Question 57

Quel est l'avantage de la classification polyphasique?

Answer 57

elle combine les informations phénétiques et phylogénétiques, c'est donc plus complet

Question 58

La classification polyphasique permet de faire une réévaluation de quoi?

Answer 58

de la notion d'espèce

Question 59

En quelle année avait lieu la classification de linnaeus?

Answer 59

1753

Question 60

Qu'est-ce qui est ressorti de la classification de linneaus?

Answer 60

2 règnes animaux et plantes

Question 61

En 1865 le 3e règne protiste fu classifier par?

Answer 61

haeckel

Question 62

Qu'est-ce qui fut classifié en 1940?

Answer 62

les structures fines des microorganismes

Question 63

En quelle année et par qui a vu le jour les 5 règnes de l'évolution originelle unidirectionnelle?

Answer 63

whittaker en 1969

Question 64

Quels éléments faisaient partie de la classification de whittaker en 1969?

Answer 64

la nutrition et l'organisation cellulaire, la photosynthèse, absorption soluble et rigide (intestin), eucaryotes/procaryotes et les organismes uni et pluricellulaires

Question 65

Qu'est-ce que Woese a découvert en classifiant des microorganismes et en quelle année?

Answer 65

1977, a découvert (LUCA) le dernier ancêtre des 3 domaines eucaryotes, bactéries et archea

Question 66

Par quel approche Woese a pu faire ces découvertes?

Answer 66

approche phylogénétique/ARNr

Question 67

Quel serait l'origine des organites de la cellule?

Answer 67

selon la théorie de l'endosymbiose

Question 68

Quelles sont les particularités des mitochondries et des chloroplastes?

Answer 68

elles sont autoréplicatives, leur chromosome est circulaire et unique, les gènes ARNr sont apparentées aux eubactéries

Question 69

Quel est l'ancêtre de la mitochondrie?

Answer 69

une bactérie à métabolisme respiratoire (rickettsia)

Question 70

Quels sont les ancêtre des chloroplastes?

Answer 70

les cyanoabctéries

Question 71

quel organisme est un exemple d'endosymbioses récentes et multiples?

Answer 71

cyanophora paradoxa