TT vragen 2A1 Flashcards
Waar is de ‘sluis’ van het ministerie van VWS op gericht?
Gericht op het betaalbaar houden van effectieve middelen –> door sluisplaatsing wordt de prijs van de middelen voor toetreding tot de Nederlandse markt lager.
(Oncologen gebruiken criteria die door een commissie van oncologen zijn vastgesteld om nieuwe behandelingen te beoordelen op toepasbaarheid in Nederland)
Wat doet het enzym telomerase?
Telomeren verkorten elke celdeling met de uitzondering van stamcellen: hier wordt het enzym telomerase geactiveerd. Dit zorgt ervoor dat stamcellen oneindige celdeling heb.
Telomerase remmers grijpt aan op de hallmark oneindige celdeling (enabling replicative immortality). –> gastank
Wat is de positief voorspellende waarde?
de kans dat je ziek bent als je een positieve test hebt.
Welke chromosomale afwijkingen zullen aanwezig zijn in een tumor met BUB1 eiwit mutatie?
BUB1 is een eiwit betrokken bij de anafase checkpoint. Het checkpoint bekijkt of de chromosomen goed zijn gerangschikt en over de dochtercellen verdeeld kunnen worden?
BUB1 (en MAD1) is een spanningsgevoeligeiwit wat meet of de microtubuli gebonden is aan de chromosomen.
Bij een defect kan anaploidie ontstaan –> deleties van chromosomen. (een chromosoom minder in de cel en in een andere cel een chromosoom meer)
Wat is het verschil tussen de DNA reparatiesystemen Homologe Recombinatie en Niet-Homologe EndJoining? Beide herstellen dubbelstrengs breuken
Homologe recombinatie is de uitwisseling van DNA strengen tussen DNA moleculen met behulp van voornamelijk de zusterchromatide (als er geen zusterchromatide, maar een homoloog chromosoom wordt gebruikt, krijg je mogelijk verlies van heterozygositeit)
Bij niet-homologe DNA EndJoining worden de 2 uiteinden van een DNA breuk direct aan elkaar geligeert zonder hulp van een template.
Welk enzym is wel nodig voor reparatie van oxidatieve schade, maar niet voor herstel van enkelstrengs breuken?
Glycosylase –> DNA schade wordt hierdoor herkent.
Oxidatieve schade is schade door endogene stoffen: zoals zuurstofradicalen. Dit wordt gedaan door middel van BER (oxidatieve schade valt onder herstel kleine adducten).
Glycosylase herkent een abasische plaats (dus een fout ingebouwde base) en ap-endonuclease kan deze dan eruit halen —> bij een enkelstrengs breuk sla je dit stapje over omdat er al een gat zit wat je alleen maar dicht hoeft te maken (je hoeft er niet eerst nog iets uit te halen)
Wat doen de volgende stoffen? PARP, DNA ligase en BRCA1 (niet nodig voor reparatie oxidatieve schade, wel voor herstel van enkelstrengs breuken??)
DNA ligase herstelt DNA (nadat fout DNA er al uit is gehaald, bouwt het een nieuwe goede nucleotide in) –> BER, NER, HR en NHEJ
BRCA1 (en BRCA2) zorgen dat RAD51 eiwit naar de plek van DNA schade gaat. RAD51 vormt een filament op enkelstrengs staart en dit bevordert baseparing tussen gebroken en intact zusterchromatide –> HR
PARP bindt aan enkelstrengs DNA breuk en modificeert eiwitten waardoor reparatie effectiever wordt (PARP remmers gebruikt bij anti-kankertherapie) –> BER
Waarom worden longtumoren die door roken veroorzaakt zijn vooral veel G naar T mutaties bevatten in hun DNA.
Benzo-a-pyreen (wordt door enzymen omgezet in BPDE wat bindt aan DNA) (1p) uit sigarettenrook bindt covalent aan G nucleotiden en veroorzaakt een GBPDE adduct (1p). GBPDE gedraagt zich eigenlijk dan als een T, hierdoor wordt
bij replicatie niet een C, maar een A ingebouwd in de tegenoverliggende DNA streng (1p). En dus verandert C naar A, wat hetzelfde is als G
naar T in de complementaire streng.
Wat gebeurt er bij de verschillende celcyclus ‘checkpoint’?
Het restrictiepunt is het moment dat een cel besluit of wel of niet te delen?
Het G1/S checkpoint bekijkt of er DNA schade is en of de cel klaar is voor S-fase?
Het intra-S checkpoint controleert of er DNA schade is.
Het G2/M checkpoint bekijkt of er DNA is en of de replicatie volledig is
Het anafase checkpoint kijkt of de chromosomen goed zijn gerangschikt en over de dochtercellen verdeeld kunnen worden, dit gebeurt door middel van het controleren of alle chromosomen aan beide centrosomen verbonden zijn via tubulinefilamenten.
Is RNA-seq (= NGS wordt informatie verkregen over RNA geisoleerd uit tumoren) een geschikte methode om oncogene mutaties in eiwitten op te sporen?
Ja. Met RNA-seq krijg je sequentie informatie over alle genen (exons) die tot expressie komen (1p).
Zijn traditionele micro-array of RT-qPCR analyses geschikt om oncogene mutaties in eiwitten op te sporen?
Nee. Met deze methodes moet je van tevoren weten welke genen en sequenties je wilt bekijken. Met RNA-seq kun je onbekende mutaties
in genen (exon) opsporen
Welke functie blijft behouden bij het ontstaan van nieuwe MLL fusie-eiwitten?
binden aan specifieke target genen in het genoom
Wat doet het p53 eiwit?
p53 is een transcriptie factor die door DNA schade wordt geactiveerd.
p53 activeert de expressie van BAX waardoor de cel in apoptose gaat.
p53 activeert de expressie van p21 waardoor de celcyclus wordt geremd.
MDM2 reguleert de concentratie van p53 eiwit.
Wat is het verschil in microscopische beeld tussen CML en AML?
CML heb je veel megakaryocyten, het bloed is hypercellulair, geen onderdrukking van normale bloedcelvorming, alle bloedcellen myeloide reeks vind je in het bloed –> defect in de groeiregulatie
Bij AML heb je een ophoping van onrijpe, niet-functionele cellen, vooral blasten vind je in het bloed (uniform beeld), onderdrukken normale bloedcelvorming –> defect in de groeiregulatie en uitrijping (differentiatie)
Wat gebeurt er als het RAS eiwit ten gevolge van puntmutaties oncogeen wordt?
De omzetting van GTP naar GDP aan het RAS eiwit is sterk vertraagd (uit college van dit jaar gehaald)
Wat kan je zeggen over verworven mutaties in clonale hematopoëse bij ouderen?
Verworven mutaties/mutaties in clonale hematopoiese verhogen de kans op AML.
Het zijn vaak ‘driver’ mutaties die AML veroorzaken
Verworven mutaties zijn als geïsoleerde mutaties niet pathogeen
NIET ze verschillen van de mutaties die bij AML kunnen worden gevonden, want zowel in tumorcellen als in normale cellen kunnen age-related en passengermutaties worden gevonden. Het enige verschil tussen deze 2 is dat er bij een tumorcel naast age-related en passengermutaties ook een drivermutatie bevindt.
Welke evolutionaire voordelen biedt het hebben van een circadiane klok?
- geeft tijdsstructuur aan ons lichaam (de activiteit van organen kan op elkaar worden afgestemd)
- Zorgt er voor dat het lichaam anticipeert op dagelijkse veranderingen in de omgeving en afstemmen/anticiperen van onze behoefte
Welke type receptor is hoofdverantwoordelijk voor de beweeglijkheid van cellen in de extracellulaire matrix?
Integrine receptoren, deze bevinden zich in het basaalmembraan (= onderdeel van extracellulaire matrix). Functie is het maken van contact tussen cel en basaal-membraan.
Wat doen de volgende receptoren? WNT receptor, EGF receptor?
WNT receptor: WNT pathway. Als WNT bindt dan valt het APC destructiecomlex uit elkaar –> hogere concentratie beta-catenine –> kan binden aan TcF receptor –> zet transcriptie aan –> leidt tot celproliferatie.
EGF receptor: restrictiepunt celcyclus. Als EGF bindt aan de receptor –> stijging niveau cycline D –> cycline D/CDK 4 wordt actief dit zorgt voor de omzetting van E2F/RB-P (= transcriptiefactor voor genen nodig in de S-fase) naar het actieve E2F. E2F schakelt cycline E aan wat zorgt voor de overgang naar de S-fase.
