Transkription prokaryot Flashcards
Vad är transkription?
När det går från DNA till RNA och därefter till olika proteiner
Vad för samband finns mellan DNA RNA och proteinets aminosyrasekvens?
Det finns ett linjärt samban mellan dessa.
Vet man DNA sekvensen då Vet man RNA och vet man RNA så ve man hur proteinet ser ut, (beöver viss hjälp å se vart de startar bara)
I RNA ändras T till något, vadå?
När det blir RNA så blir alla T till uracil “U” istället.
Ena strängen på det dubbel strängade DNA:t är templete strand, vad gör dne andra?
Den andra strängen är kodande därefter för RNA som sedan ska bli olika proteiner. Kallas för non-template strand
Vad är en gen?
är en nukleotidsekvens i DNA:t, som krävs för syntesen av ett fungerande protein eller en RNA molekyl.
Vad sker samtidigt i prokaryota celler ?
transkription och translation.
Detta eftersom båda sker i cytoplasman hos prokaryoter.
Vad är mRNA?
Messenger RNA “förmedlar” information från DNA:t till proteinet.
- Finns många olika typer av RNA.
Vad är housekeeping genes?
Gener som alltid är påslagna och som behövs för att bakt. skall fungerar normalt.
Hur definieras transkription?
Processen då DNA skrivs om till RNA
Vad för enzym behövs vid transkriptionen ?
- Sköts av RNA-polymeras, dessa kan syntetisera RNA “de novo” (behöver alltså ingen primer).
- Läser av DNA och bildar RNA, de öppnar bara upp DNA som en transkriptionsbubbla. RNA polymeraset binder till DNA, och med hjälp av andra proteiner vet vart dem ska börja läsa av DNA:t. NTP används för att sätta in dem och skapa ett RNA.
Vilken sträng är tempelate strängen egentligen?
Det finns ingen specifikt sträng utan båda strängarna i DNA:t kan användas som detta.
Men vad som bestämmer vilken sträng den ska ha är RNA-polyersets riktning. De ska alltid gå från 5´till 3´riktning.
HUR vet RNA-polymeraset vilken riktning den ska transkribera? HUr fungerar den?
- Det bestäms av promotorn. Bara delar av DNA transkriberas, de är därför viktigt att veta vart dem ska börja och sluta.
- Promotorn visar också exakt RNA-polymerasets skall start.
- RNA-polymeraset binder till promotorn
Vad talar om när de startar och slutar? Hur fungerar dessa sekvenser ?
- Det är sekvenser i DNA som talar om detta.
- Det startar vid promotorn och slutar vid terminatorn, dessa två talar om transkriptionsenheten.
- En transkriptions enhet är den sekvens i DNA:t som transkriberas till RNA.
- Promotorn och terminatorn består av speciella sekvenser.
Hur hittar RNA polymeraset promotorn?
RNA-polymeraset i E.coli består av 6 subenheter/proteiner. Alla subenheter har olika funktioner och bland annat att hitta promotorn hjälper subenhterna till med.
- SIgma är viktigast vid start av transkription
- två alfa subenheter, binder till reglersekvenser
- Beta subenhet syntetiserar RNA i 5´till 3´riktning
- Beta stjärna, binder RNA polymeraset till DNA:t
HUr fungerar sigma subenhetern, hur hittar dem promotorn ?
Kärnenzymet: binder starkt till icke-specifikt DNA. Och kan binda till sig sigma faktorn. Dessa tillsammans blir holoenzymet och då binder detta specifikt till promotorn, hittar den mycket fortare.
Finns flera sigmafaktorer,
Vad är konsensus sekvensen ?
Vanligaste sekvensen i DNA, denna kan variera lite.
Förklara kortfattat transkribtions förloppet?
Ingår 6 stycken steg:
- Bindning till promotorn
- Transkriptions bubblan
- Initiering av transkriptionen
- promotor clearence
- elongering av transkription
- Terminering av transkriptionen
Hur vet RNA-polymeraset när den ska sluta transkribera?
finns två sätt:
- Rho-oberoende transkriptionsterminering
- Rho beroende transkriptionsterminering
Hur fungerar Rho oberoende terminering ?
då är det en sepcifikt sekvens som RNA polymeraset kommer fram till, och RNA polymeraset kommer vi denna G-C rik hairpin loop att lossna från DNA och slutar.
Hur fungerar Rho beroende terminering?
vissa RNA har en sekvens i sitt RNA, som kodar, känns igen av Rho proteinet som binder in och med hjälp av ATP kan Rho proteinet vandra upp till RNA polymeraset och stör ut de. Och tillslut lossnar allt från DNA:t
