Eukaryota Kromosomer Flashcards
Hur är kromosomerna i olika organismer ?
- Virus: parasit, inf. värdorganismens celler
- Bakterier: cirkulärt DNA, en kromosom, flera plasmider
- Eukaryoter: DNA Uppdelat i kromosomer, organeller med eget DNA, varierande antal beroende på art, packas under mitosen- celldelning.
Skillnad mellan eukaryota och prokaryota kromosomer ?
- genomet av prokaryota är ihopsatta med med enstaka kromosomer, vanligtvis cirkulärt DNA molekyl.
- Genomet av eukaryota har flera kromosomer, varje innehåller linjär molekyl av DNA.
Vart packas allt DNA i eukaryota?
eukaryoter packas allt DNA i en kärna
Kromatines struktur
- vad är kromatin?
- vad består nukleosomen utav? Och vilka sorter av detta finns?
- kromatin är ett komplex bestående av DNA och protein. En kromatin kan bilda nukleosom.
- nukleosomen består av två grupper av protein.
» histoner positivt laddade
» icke histoner - fem olika sorters histoner
» H1, H2A, H3B och H4
» de olika histonerna är mycket lika mellan olika arter av eukaryota
Vad är nukleosomen?
The nucleosome core particles contain 147 base pairs of DNA wrapped 1.67 turns around a histone core
consisting of two each of H2A, H2B, H3, and H4 (the core histones).
A chromatosome consists of 166 base pairs of DNA wrapped around the histone core and held in place by H1 (a
linker histone).
Nukleosom kan binda 147 baspar av DNA Och vrider 1,67 varv runt histonen.
Kan ytterligare packa DNA och orsaka 166 baspar och H1 kan sedan i sin tur interagera med H1.
Det finns två typer av kromatiner vilka?
- Heterokromatin Sten hårt packat.
- Eukromatin- DNA göra mer tillgängligt.
Vissa regioner kan ha mer av en sort å andra ha mer av den andra.
Dessa är reversibla och från eukromatin kan dem övergå till heterokromatin.
Kromosomer i en human cell
• Kromosomerna är synliga endast i sin mest kondenserade form i
celldelningens metafas
• Mellan celldelningarna föreligger det mesta som 30 nm kromatin
Linjära kromosomer
- Replication origin
» de sekvenser på kromosomen där replikationen startar, finns ca 50 tusen olika men alla använda inte. - centromer
» viktigt funktion när de båda systerkeomatiderna ska fördelas till dottercellerna
-telomer
» kromosomänden består av repetitiva sekvenser som skyddar den kodande delen vid replikation
Hur sker Sortering av kromosomer?
- Kromosomer kan färgas och sorteras (kan färgas olika)
* Karyotyp - Karyogram
Vad för stort kromosom bandning finns det?
- G-bandning
- R-bandning
- Q-bandning
- C-bandning
Vad kan de humana cellernas kromosomer ha för struktur ?
Humana kromosomer är
antingen metacentriska,
submetacentriska eller acrocentriska
Detta utgår från vart centromereren sitter på kromosomen.
Varför karyotypering? Hur delar man upp dem?
identifiering av
kromosomala avvikelser!
- För strukturella avvikelser
» där en eller flera kromosomer har avvikande form
» 22q11 deletionssyndrom (exempel patienter med denna typ har deletion syndrom, nåt har försvunnit) - numerisk avvikelse
» där hela kromosomer saknas eller extra kromosomer tillkommit.
» ex, down syndrom (en extra kromosom var tillkommit här)
Strukturella kromosomavvikelse, vad ingår här?
- Deletioner (
- duplikationer
- translokationer
- inversioner
- förflyttning
- ringar
Vad är translokationer ?
Att delar av två kromosomer bryts av och byter plats med varandra. En balanserad translokation påverkar i allmänhet inte hälsan för den som bär på den.
Vad innebär deletioner ?
En del av kromosomen är delegerad eller saknas. Exempel på det är wolf-hirschhorn syndrom. En del av den korta armen på kromosomen 4 är deleterad hör till den här typen av kromosomal avvikelser.
Vad innebär duplikation
En bit av en kromosom är duplikerad vilket resulterar i extra genetiskt material
Vad innebär inversioner ?
En del av kromosomen bryts av och när den lagas av det reparationssystem som finns i cellerna sätts de båda ändarna ihop åt fel håll och det genetiska materialet är då inverterat
Vad innebär förflyttning?
En del av en gen har deleterats från sin normal site och intergrerats in i en annan kromosom
Vad innebär ringar ?
En del av en kromosom har gått av och sedan bildat en ringstruktur
Ge exempel på numerisk kromosomavvikelse …
- Down syndrom
- super Male syndrom
- Turners syndrom
Vad finns det för ploditet?
- Haploid
» en kromosom av varje sort
» finns i könsceller - diploid
» somatisk celler - polyploid
» triploid
» tertaploid
Vad kan polyploid göra? Kallas även gigas effekt
i allmänhet resulterar polyploidi i ökad blad- och blomstorlek, cellstorlek och kloroplastantal. Dessa fenomen kallas kollektivt gigaseffekten. Används i foder- och prydnadsavel.
Gör cellerna större
Histonkomplex, vad innebär detta? Hur bildas ett histone octamer?
H3 och H4 bildar tillsammans en dimer som kan med en till dimer bilda en tetramer komplex.
H2A och H2B kan tillsammans bilda dimer.
En tetramer och dimer från dessa olika kan därefter bilda en histone octamer.
Hur hänger kromosomer och kromatin ihop?
Nukleosomen är den naturliga strukturen av kromatiden.
DNA är virat runt histonen i nukleosomen och förseglad av histonen H1.
Vad händer med hårt packat DNA?
Hårt packat DNA är transkriptionellt inaktivt. Dem är dolda för transkriptions maskineriet.
Gener som transkriberas ofta är placerade i loopar. För att dessa för dem mer tillgängliga.
Hur är en kromosom uppbyggd?
Med
- kort arm (p arm)
- lång arm (q arm)
- telomerer
- centromerer
