Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Molekylärbiologi > Prokaryoter DNA; Uppbyggnad och Struktur+mutationer > Flashcards

Prokaryoter DNA; Uppbyggnad och Struktur+mutationer Flashcards

1
Q

Nukleinsyrors strukturnivåer, vilka finns?

A

• Primärstruktur: basernas ordning i
polynukleotidsekvensen
• Sekundärstruktur: Ryggradens 3D konformation
• Tertiärstruktur: Typen av molekylens supercoiling
• Kvartärstruktur: nukleinsyrornas interaktioner med
proteiner. T ex kromatin, kromosom, ribosomen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Finns två typer av nukleinsyror ?

A
  • DNA

- RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Största skillnaden i struktur hos RNA OCH DNA ?

A

Skillnader mellan dessa föreligger främst i

sekundär- & tertiärstrukturen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Numrering av kolatomer i sockerdelen, hur ?

A

Kolatomerna i sockret är numrerade 1’ till 5’. 2’ atomen på deoxiribos saknar en hydroxylgrupp.

Tillägg av hydroxylgrupp i 2’ –position bildar ribos, det socker som finns
i RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad består dsDNA för strängar ?

A

dsDNA består av antiparallella strängar som är komplementära med varandra

Komplementära innebär att den ena strängen basparar med den andra strängen.

G-C
A-T (Watson-Crick) kallas detta.

Besparning ordnar vridning

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hur fungerar basparning ?

A

Basparning genererar en vridning
Detta tack vare att T vill baspars med A och G med C

Ex om C AOCH A skulle basparar får dem inte plats i helixen.

3 vätebindningar för G och C
2 vätebindningar för A och T men dessa bidrar till stabiliteten hos DNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

DNA Kan förkomma i olika 3D strukturer , vilka?

A

A form- har man sett men man tror intr denna finns i celler utan mer vid DNA i ett provrör (packas ihop mer och varv blir kortare)
RNA kan anta en typ av A form.

B form - helix formen

Z form- vid GS rika regioner, den finns då i cellen, kan vara ett igenkänning för ett visst protein.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Denaturering av DNA-hyperkromeffekt, hur fungerad de?

A 
>> Hyperkromeffekt 
– DNA eller RNA abs. UV-
ljud vid 260 nm. 
– ssDNA abs. mer ljus än
dsDNA 
– således, kan man mäta 
denaturering genom 
ökning av A vid 260 nm. 
>> smältkurva &
smälttemperatur
– Graf: A260 vs temp 
– Tm =den temp vid vilken 
hälften av 
helixstrukturen gått 
förlorad
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vad innebär positiv- respektive negative supercolling ?

A

Negativ supercoiling=underwinding, naturligt förekommande för packning av DNA.

Positiv Supercoiling=overwinding, sker under replikation.
Speciella enzymer, topoisomeraser, kan ändra supercoilingen: Styrs av enzymer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Ge exempel på en linjär supercolling ?

A

Kromosompackning är en form av supercoiling av linjärt DNA!

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vad finns det för olika typer av mutationer ?

A

Punktmutation = förändring i ett enda baspar

Förändringen kan utgöras av:
* substitution (ersätta)
* deletion (ta bort)
* insertion (lägga till)
Deletion & insertion kan även gälla längre sekvenser (alltså
inte enbart ett enda baspar)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vad innebär Polymorfism?

A

genetisk variation bland befolkningen

Om en mutation har skett för så länge sedan att den är spridd bland
befolkningen (>1% av befolkningen har denna mutation) kallas den en polymorfism

Majoriteten av polymorfismer är s.k SNP = single nucleotide polymorfism är
en positionsbestämd variation i arvsmassan som berör en enda nukleotid.
Till exempel:

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Nämn substitutionerna ?

A
  • Transition
    Vilket innebär Purin till purin.
    A-G

Pyrimidin till pyrimidin
C-T

  • transversion
    Vilket innebär purin till pyrimidin
    A/G - C/T
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Potentiella effekter av en mutation, nämn några

A

Tyst mutation

  • Missense-mutation
  • Nonsense mutation
  • Läsramsförskjutning “Frame-shift mutation”
  • Splice site mutation
  • Suppressormutation
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vad innebär Den Genetiska Koden?

A

Den genetiska informationen på DNA och mRNA är en triplettkod, dvs tre baser kodar för en aminosyra.

mRNA sekvensen kan således läsas på tre olika sätt eftersom koden är just en
triplettkod. Man talar om
“läsramar” (reading frames).å

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hur fungerad eventuella mutationer som kan uppstå?

A

-Tyst mutation–> aminosyrasekvensen förblir densamma
T.ex. CUU muteras till CUC.
Bägge kodar för Leu.
-Missense-mutation–> aminosyrasubstitution. T.ex. CUU
muteras till UUU. Leo till Phe.
-Nonsense mutation–> stoppkodon introduceras. T.ex. AAG
muteras till UAG. Lys till Stopp.
-Läsramsförskjutning–> fel aminosyrasekvens erhålls efter
en mutation (insertion/deletion)
-Suppressormutation–> en mutation som delvis eller helt
återställer effekterna av en annan
mutation. “fel+fel=rätt

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Orsaker till skador på DNA i levande celler?

A

Spontana förändringar
Replikationsfel
Kortvågig Strålning
Kemikalier

18
Q

Vad kan ske för replikationafel?

A

DNA polymeraset kan ibland göra misstag under DNA kopieringen
(replikation)

19
Q

Vad kan ske av strålningsskador?

A

Energirik g-strålning (radioaktiv- eller röntgenstrålning) kan generera enkel eller (ännu värre) dubbelsträngsbrott på DNA molekylen.
Uv strålning (något mindre energirik) kan generera sk T-T dimerer (eller 6-4 fotoprodukt

20
Q

Vad kan syreradikaller gör med DNA molekylen?

A

Syreradikaler i närvaro av metalljoner (t.ex Fe2+) kan oxidera sockerdelen i DNA molekylen

21
Q

Vad ör ames test? När används detta?

A

Ames test används för att undersöka ett ämnes cancerogenitet (e.g mutagenicitet)

22
Q

Vad består nukleinsyra utav?

A

Av polymerer, som i sin tur består av mindre enheter som heter monomerer.

23
Q

Nämn RNA och DNA med dess långa namn ?

A

RNA= ribonucleotides

DNA= deoxyribonucleotides

24
Q

Skillnad på nukleotid och nukleosid?

A

Nukleotid är när alla tre kemiska grupper sitter ihop

Nukleosid har ingen fosfatgrupp

25
Q

I vilken riktning läser man DNA ?

A

DNA har en riktning vilket är 5’ till 3’ riktning : 5’-TGCA-3’

26
Q

Vad är base stacking?

A

Base stacking är en en interaktion mellan dem hydrofoba kvävebaserna.

27
Q

Benämning av följande ord :

  • mutation
  • mutant
  • vildtyp
A
  • mutation: permanent förändring i DNA molekylens nukleotidsekvens
  • mutant: organism med mutation
  • vildtyp: organism med ”normal” (icke-muterad) sekvens
28
Q

Hur kodas en aminosyra ?

A

De är en genetiskt kod (triplettkod) som innehåller tre baser

En aminosyra kan ha flera koder

29
Q

Vad kodar den ”genetiska koden” för? Och vad sker vid mRNA sekvensen?

A

Den genetiska informationen på DNA mRNA är en tripplernas, dvs tre baser kodar för en aminosyra.

mRNA Sekvensen kan således läses på tre olika sätt eftersom koden är just en triplettkod. Man talar om läsramar (reading frames)

30
Q

Hur fungerar läsramarna?

A

Det finns olika läsramar och läsramen bestämma i ribosomen.
Läsramen används för att veta vart man ska börja läsa för att de ska bli rätt aminosyra.

Läsram:
1 börjar direkt
2. Går innanför en ”bokstav”
3. Går innanför två ”bokstäver”

31
Q

Vad är en tyst mutation?

A

Aminosyrasekvensen förblir densamma tex. CUU muteras till CUC. Bägge kodar för Leu.

32
Q

Vad är en missense mutation?

A

Aminosyrasubstitution, det kan orsaka problem men behöver intr göra det.

Tex: CUU muteras till UUU. Leu blir då istället Phe.

33
Q

Vad är ett nonsense mutation?

A

Stoppkodon introduceras

Tex. AAG muteras till UAG, Lys till stopp. Detta innebär att det proteinsyntesen avbryts och då ett icke funktionellt protein.

34
Q

Vad är läsramsförskjutning?

A

Fel aminosyrasekvens erhålls efter en mutation (insertion/deletion)

En insertion leder till att en annan aminosyra bildas och därifrån sker en läsramsförskjutning.

Kan därefter ske en deletion som orsakas en läsramsförskjutning

35
Q

Vad är suppressormutation?

A

En mutation som delvis eller helt återställer effekterna av en annan mutation. Fel+fel=rätt

Mutation som gör proteinet ofullständigt sen sker en till mutation som återställer proteinets vanliga funktion.

Det sker inte ofta men det händer.

36
Q

Vad kan orsaka skada på DNA i levande celler ?

A
  • spontana förändringar
  • replikationsfel
  • kortvågig strålning
  • kemikalier
37
Q

Vad är spontana förändringar?

A

Purinbaser klyvs bort spontant. Detta kan repareras.

38
Q

Vad är replikationsfel ?

A

DNA polymeraste kan ibland göra misstag under DNA kopiering. (REPLIKATION)

Har inbyggd kontroll funktion vid en fel insatt nukleotid, detta gör den med proofreading. Men denna kan även ibland gå fel också!

39
Q

Vad är strålningsskador?

A

Energirik gamma strålning (ex röntgenstrålning) kan generera enkel eller dubbelsträngsbrott på DNA molekylen. UV strålning (mindre energirik) kan generera sk T-T dimerer.

Kroppen försöker reparera TT DIMERERNA! Därför är överdriven solning farligt!

40
Q

Vad kan kemiska mutationer orsaka?

A

Aklylera DNA - svårt att reparera för kroppen! Alkylerande reagens kan metylera DNA baser ex. Dimetylsulfat metylerar guanin

Deamonerande reagens ganska vanligt det å sådant man färgar kött med!
(Rökare utsätts för nitrosaminer)

Reaktiva oxidanter bildar fria syreradikaler -> attackerar DNA.

41
Q

Vad är ames test?

A

Används för att undersöka ett ämnes cancerogenitet

Molekylärbiologi (20 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions