transcritpion Flashcards

1
Q

taux de codant et non codant chez eucaryotes et procaryotes

A

eucaryotes: 75% d’ADN transcrit, 8% pour la synthèse de protéines ARNm(dont 1 à 2% est codant) et 5% pour l’expression des gènes
procaryotes: 80% du génome est codant pour des protéines

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2
Q

unité de transcription

A

région de l’ADN qui est parcourue par l’ARN polymérase

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3
Q

ARNm

A
  • codant
  • ARN polymérase II
    procaryotes: un ARN code pour plusieurs protéines (opérons)
    eurcaryotes: 1 ARNm par protéine
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4
Q

ARNr

A
  • non codant
  • ARN polymérase I sauf pour 5S qui est ARN polymérase III
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5
Q

ARNt

A
  • non codant
  • ARN polymérase III
  • liés à des acides aminés
  • assurent l’interface entre ARNm et acides aminés
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6
Q

cistron

A

combinaison d’éléments de régulation en cis et en trans

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7
Q

élement cis

A

séquence d’ADN qui régule d’expressionn d’un gène. lorsque cet élément mis et positionné dans un promoteur, on parle d’élémentaires réponse (RE)

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8
Q

élement trans

A

gènes qui codent pour des protéines diffusibles jouant un rôle de facteurs de régulation de la transcription (FRT)

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9
Q

hélice-TOUR-hélice

A
  • motif d’u e hélice en contact avec l’ADN qui interagit avec une seconde hélice stabilisatrice
  • sont associés en homodimères, et reconnaissent des séquences palindromiques des grands sillons de l’ADN
  • on peut citer CAP pour procaryotes comme exemple de FRT possédant un motif HTH
  • homéodomaines pour eucaryotes
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10
Q

doigt de zinc

A
  • spécifique aux eucaryotes
  • recconait 4 à 6 nucléotides de l’ADN
  • nécessiteuses un atome de zinc pour stabiliser cette structure en se liant à de la cystéine et/ou histamine (C4: cystéine / C2H2: histamine et cystéine)
  • exemple des récepteurs nucléaires, et Sp1 - protéines possédant ce motif
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11
Q

deux domaines d’interaction à l’ADN

A

hélice-tour-hélice et doigt de zinc

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12
Q

deux domaines de dimérisation des FRT

A

hélice-bucle-hélice (HLH) et Leucine Zipper

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13
Q

Leucine Zipper

A
  • deux hélices amphipatiqes, qui sont liées grâce à des liaisons hydrophobes
  • formées de chaînes latérales de leucines sur un seul côté des hélices
  • ces interactions favorisent la dimérisation des deux sous unités des FRT
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14
Q

HLH

A
  • hélice-boucle-hélice
  • plus petit que le motif Leucine Zipper, mais même fonction
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15
Q

voie majeur de l’activation de la régulation des gènes et exemple

A

c’est la phosphorylation par des kinases
exemple: la protéine CREB se lie à AMPc, qui sera donc posphorylée et activée. cette protéine recconait CRE, situé au niveau proximal de nimbes gènes EUCARYOTES

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16
Q

répression de l’expression de l’opéron lactose

A
  • en absence de lactose, LacI se fixe sur opérateur et bloque la transcription de l’opérons lactose
  • opérons lactose et réprimé
17
Q

arrêt de la répression de l’expression de l’opéron lactose

A
  • en présence de lactose et glucose, l’allolactose (Isère du lactose) se fixe sur LacI, qui lui change de conformation et devient inactive
  • l’opéron lactose est non réprimé, mais avec un taux de transcription fiable - non induit
18
Q

activation e la transcription de l’opérons lactose

A
  • en présence de lactose et absence de glucose, on a la fabrication d’un messager secondaire AMPc, qui se fixe sur CAP, cette dernière est donc active
  • et CAP se fixe sur les nt -35 à -10 et active la transcription - elle stimule l’interaction holoenzyme alpha2BB’sigma avec le promoteur
  • l’opérons lactose est non réprimé et activé
19
Q

maturation des ARNt

A

post-traductionnelle
- élimination de séquences en 3’ et 5’ grâce à des ribonucléases
- épissage d’un intron par des endonucléases
- addition d’un séquence CCA à l’extrémité 3’ grâce à u nucléotidyl transférase
- modifications de Croatians nucéosides (pseudo-uridyne, dihydrouridyne, ribothimidine) par des enzymes spécifiques

20
Q

rifampicine

A
  • procaryotes
  • anti-mycobactérien (tuberculose/lèpre) qui inhibe ‘ARN polymérase
21
Q

actinomycine D

A

procaryote+eucaryote
- se fixe sur l’ADN et bloque le mouvement de outes les ARN poly
- c’est un anticancéreux

22
Q

comment on fait pour passer de l’hétérochromatine en euchromatine? et vice-versa

A

hétérochtmatine et euchromatine: histones acétyltransférases HAT

euchroatine en hétérochromatine: histones désacétylases HDAC

ces enzymes s’activent lorsque des FRT se fixent sur le promoteur discal

23
Q

modification de l’extrémité 5’ de l’ARNm

A
  • ajout d’une 7-méthylguanosine relié sur le premier nt par une liaison 5’-5’ triphosphate
  • les deux riboses qui suivent cette liaison seront méthylés sur l’oxygène en position C2’
  • a pour but de protéger l’ARNm des ARNases
  • a pour but égalée de recruter le complexe protéique CBC: le CBC jeue un rôle dans l’imitation de la traduction et permet l’exportation de l’ARNm hors du noyau
24
Q

que font les protéines SR?

A

vérifient que l’épiage soit correcte (maturation de l’ARNm eucaryote)

25
Q

qui est responsable de la maturation et du clivage des ARNr?

A

les snoARN