transcritpion Flashcards
taux de codant et non codant chez eucaryotes et procaryotes
eucaryotes: 75% d’ADN transcrit, 8% pour la synthèse de protéines ARNm(dont 1 à 2% est codant) et 5% pour l’expression des gènes
procaryotes: 80% du génome est codant pour des protéines
unité de transcription
région de l’ADN qui est parcourue par l’ARN polymérase
ARNm
- codant
- ARN polymérase II
procaryotes: un ARN code pour plusieurs protéines (opérons)
eurcaryotes: 1 ARNm par protéine
ARNr
- non codant
- ARN polymérase I sauf pour 5S qui est ARN polymérase III
ARNt
- non codant
- ARN polymérase III
- liés à des acides aminés
- assurent l’interface entre ARNm et acides aminés
cistron
combinaison d’éléments de régulation en cis et en trans
élement cis
séquence d’ADN qui régule d’expressionn d’un gène. lorsque cet élément mis et positionné dans un promoteur, on parle d’élémentaires réponse (RE)
élement trans
gènes qui codent pour des protéines diffusibles jouant un rôle de facteurs de régulation de la transcription (FRT)
hélice-TOUR-hélice
- motif d’u e hélice en contact avec l’ADN qui interagit avec une seconde hélice stabilisatrice
- sont associés en homodimères, et reconnaissent des séquences palindromiques des grands sillons de l’ADN
- on peut citer CAP pour procaryotes comme exemple de FRT possédant un motif HTH
- homéodomaines pour eucaryotes
doigt de zinc
- spécifique aux eucaryotes
- recconait 4 à 6 nucléotides de l’ADN
- nécessiteuses un atome de zinc pour stabiliser cette structure en se liant à de la cystéine et/ou histamine (C4: cystéine / C2H2: histamine et cystéine)
- exemple des récepteurs nucléaires, et Sp1 - protéines possédant ce motif
deux domaines d’interaction à l’ADN
hélice-tour-hélice et doigt de zinc
deux domaines de dimérisation des FRT
hélice-bucle-hélice (HLH) et Leucine Zipper
Leucine Zipper
- deux hélices amphipatiqes, qui sont liées grâce à des liaisons hydrophobes
- formées de chaînes latérales de leucines sur un seul côté des hélices
- ces interactions favorisent la dimérisation des deux sous unités des FRT
HLH
- hélice-boucle-hélice
- plus petit que le motif Leucine Zipper, mais même fonction
voie majeur de l’activation de la régulation des gènes et exemple
c’est la phosphorylation par des kinases
exemple: la protéine CREB se lie à AMPc, qui sera donc posphorylée et activée. cette protéine recconait CRE, situé au niveau proximal de nimbes gènes EUCARYOTES