traduction Flashcards

1
Q

codons stop

A

UAG
UAA
UGA

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Q

convention d’écriture

A

N= tous les nt (A, G, U, C)
Y= pyrimidine (C,U)
R= purine (G,A)

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3
Q

codon de démarrage

A

AUG

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4
Q

ARNt

A
  • deux types qui chargent la méthionine (sauf pour la mitochondrie): 1 qui charge la méthionine de démarrage (toujours formylée) ARNti; un autre qui va charger le reste de méthionine
  • 32ARNt standards, or 22 ARNt chez la mitochondrie humaine
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5
Q

amminoacyl ARNt synthétase

A
  • il existe 20 AA-ARNt synthétase: 1 pour chaque AA
  • la fixation de l’AA sur l’ARNt se fait en deux étapes
    1) activation de l’acide aminé
    2) accrochage de l’acide aminé activé sur son ARNt

elles possèdent une activité de correction d’erreur (1 erreur sur 40000 couplages)

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6
Q

activation de l’acide aminé

A
  • 1ère étape de la fixation de l’AA sur l’ARNt
  • réaction entre acide aminé et ATP qui va donner de l’aminoacyl-AMP +pyrophosphate
  • c’est une réaction irréversible grâce à hydrolyse
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7
Q

accrochage de l’AA sur son ARNt

A
  • réaction d’estérification entre un acide aminé activé (amminoacyl-AMP) avec de l’ARNt = amminoacyl-ARNt + AMP
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8
Q

inhibiteur de la phase d’initiation

A
  • streptomycine à FORTE concentration: procaryotes: se lie à la sous unité 30S du ribosome et empêche l’interaction de fMet-ARNt avec le ribosome
  • linézolide: procaryote: se lie dans le site A de la sous unité 50S pour bloquer la phase d’assemblage du ribosome
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9
Q

inhibiteur de la phase d’élongation: test de l’appariement

A
  • tétracycline: procaryote: empêche la présentation de l’anticodon dans le site A - bactériostatique
  • streptomycine à FAIBLE concentration: procaryotes: bactériologique, car entraîne la mort de la bactérie lorsqu’elle perturbe Wooble et entraine des erreurs (site A)
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10
Q

inhibiteur de la phase d’élongation: formation de la liaison peptidique

A
  • erythromyocine (procaryotes): bloque la translocation en bloquant la sortie de la chaîne peptique

-chloramphénicol (procaryote): inhibe l’activité peptidyl-transférase de l’ARNr 23S

  • cycloheximide(eucaryotes): inhibe l’activité peptidyl-trasnférase de m’ARNr 28S
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11
Q

inhibiteur de la phase d’élongation: déplacement du ribosome

A

acude fusidique (procaryote): bloque activité GTPase et donc la dissociation de EF-G

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12
Q

exception UGA

A

tryptophane - mycoplasmes
cystéine - ciliés
sélénocystéine

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13
Q

exception UAA/UAG
UAG

A

glycine - ciliés
pyrrolysine - arches méthanogènes

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14
Q

phase d’initiation de la traduction chez les procaryotes

A
  • utilise 1 GTP
    1) complexe SU 30S / IF1 /IF3 recconait la séquence RBS située en amont d’un codon de démarrage AUG par association avec ARNr 16S
  • recrutent aussi de IF2 (GTP) fixé sur fMet-ARNt

2) libération de IF3 ; glissement de la sous unité 30 S pour faire glisser le site P sous AUG

3) libération Ides facteurs d’initiation F2 et IF1 ; recrutement GTP hydrolysé, SU 50S

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15
Q

phase d’élongation et translocation de la traduction chez les procayotes

A
  • utilise 2GTP
    1) le 2ème AA-ARNt se lie à du EF-Tu au niveau du site A - si bon appariement, Alors hydrolyse de GTP
    (EF-Tu disponible grâce à la régénération par EF-Ts)

2) glissement 50S - créer une liaison peptique de P vers A

3) translocation ribosome impliquant le facteur EF-G (GTP° fixé sur site A
- GTP est hydrolysé, ARNt libéré, arrivée d’un nouveau AA-ARNt

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16
Q

phase de terminaison de la traduction chez les procaryotes

A
  • necessite 1 GTP
    1) codon de terminaison sur site A
    RF1: UAA, UAG
    RF2: UAA, UGA
    RF3: GTP

2) hydrolyse d ela liaison polypeptideet ARNt - libération de la chaîne peptidique

3) hydrolyse GTP, dissociation du ribosome

17
Q

facteur d’initiation de la traduction chez les eucaryotes

A

eFI1, eFI2 (GTP), eFI3, eFI4, eIF5(GTP), eIF6

18
Q

facteur élongation de la traduction chez les eucaryotes

A

eEF1alpha (GTP)
eEF1betagamma
eEF2 (GTP)

19
Q

facteur de terminaison de la traduction chez les eucaryotes

A

eRF1 (UAA, UGA, UAG)
eRF2 (GTP)

20
Q

activité peptidyl-transférase obsédé par qui chez les proca et euca?

A

domaine V de 23S chez les procaryotes, et 28S chez les eucaryotes

21
Q

forme des polyribosomes chez les proca et euca

A

procaryotes: linéaire
eucaryotes: s’neorule e spirale