traduction Flashcards
codons stop
UAG
UAA
UGA
convention d’écriture
N= tous les nt (A, G, U, C)
Y= pyrimidine (C,U)
R= purine (G,A)
codon de démarrage
AUG
ARNt
- deux types qui chargent la méthionine (sauf pour la mitochondrie): 1 qui charge la méthionine de démarrage (toujours formylée) ARNti; un autre qui va charger le reste de méthionine
- 32ARNt standards, or 22 ARNt chez la mitochondrie humaine
amminoacyl ARNt synthétase
- il existe 20 AA-ARNt synthétase: 1 pour chaque AA
- la fixation de l’AA sur l’ARNt se fait en deux étapes
1) activation de l’acide aminé
2) accrochage de l’acide aminé activé sur son ARNt
elles possèdent une activité de correction d’erreur (1 erreur sur 40000 couplages)
activation de l’acide aminé
- 1ère étape de la fixation de l’AA sur l’ARNt
- réaction entre acide aminé et ATP qui va donner de l’aminoacyl-AMP +pyrophosphate
- c’est une réaction irréversible grâce à hydrolyse
accrochage de l’AA sur son ARNt
- réaction d’estérification entre un acide aminé activé (amminoacyl-AMP) avec de l’ARNt = amminoacyl-ARNt + AMP
inhibiteur de la phase d’initiation
- streptomycine à FORTE concentration: procaryotes: se lie à la sous unité 30S du ribosome et empêche l’interaction de fMet-ARNt avec le ribosome
- linézolide: procaryote: se lie dans le site A de la sous unité 50S pour bloquer la phase d’assemblage du ribosome
inhibiteur de la phase d’élongation: test de l’appariement
- tétracycline: procaryote: empêche la présentation de l’anticodon dans le site A - bactériostatique
- streptomycine à FAIBLE concentration: procaryotes: bactériologique, car entraîne la mort de la bactérie lorsqu’elle perturbe Wooble et entraine des erreurs (site A)
inhibiteur de la phase d’élongation: formation de la liaison peptidique
- erythromyocine (procaryotes): bloque la translocation en bloquant la sortie de la chaîne peptique
-chloramphénicol (procaryote): inhibe l’activité peptidyl-transférase de l’ARNr 23S
- cycloheximide(eucaryotes): inhibe l’activité peptidyl-trasnférase de m’ARNr 28S
inhibiteur de la phase d’élongation: déplacement du ribosome
acude fusidique (procaryote): bloque activité GTPase et donc la dissociation de EF-G
exception UGA
tryptophane - mycoplasmes
cystéine - ciliés
sélénocystéine
exception UAA/UAG
UAG
glycine - ciliés
pyrrolysine - arches méthanogènes
phase d’initiation de la traduction chez les procaryotes
- utilise 1 GTP
1) complexe SU 30S / IF1 /IF3 recconait la séquence RBS située en amont d’un codon de démarrage AUG par association avec ARNr 16S - recrutent aussi de IF2 (GTP) fixé sur fMet-ARNt
2) libération de IF3 ; glissement de la sous unité 30 S pour faire glisser le site P sous AUG
3) libération Ides facteurs d’initiation F2 et IF1 ; recrutement GTP hydrolysé, SU 50S
phase d’élongation et translocation de la traduction chez les procayotes
- utilise 2GTP
1) le 2ème AA-ARNt se lie à du EF-Tu au niveau du site A - si bon appariement, Alors hydrolyse de GTP
(EF-Tu disponible grâce à la régénération par EF-Ts)
2) glissement 50S - créer une liaison peptique de P vers A
3) translocation ribosome impliquant le facteur EF-G (GTP° fixé sur site A
- GTP est hydrolysé, ARNt libéré, arrivée d’un nouveau AA-ARNt