Transcription de l'ADN

Question 1

What is the dogme central ?

Answer 1

l’information génétique dirige la synthèse des protéins

Question 2

How are genes transcribed differently?

Answer 2

chaque gène est produit a des rythmes différent ce qui permet de contrôler la quantité de protéine produit

Question 3

Difference between ADN et ARN

Answer 3

ADN
Fonction: support de l’information géntique
Sucre: désoxyribose (H)
Base: Adénine, Guanine, Thymine, Cytosine
Structure: 2 brins enroulé en double hélice

ARN
Fonction: Copie d’une partie de l’ADN
Sucre: ribose (OH)
Base: Adénine, Guanine, Uracil, Cytosine
Structure: 1 brins (monocaténaire) plus court que l’ADN

Question 4

Why is thymine replaced by uracil?

Answer 4

la pressence de T dans l’ADN permet la détection des mutations spontanées de la cytosine (elle se converti en uracil). La machinerie de reparation de l’ADN va détecter le U et effectuer une reparation.

doesnt occur with RNA, short life span, simply disintegrates

Question 5

What happens to ARN if it is damaged ?

Answer 5

Not repaired, short life span, aloes dégradé et recyclé

Question 6

structure de l’ARN?

Answer 6

Primaire: polymère linéaire composé de 4 types de ribonucleotides reeliés par des liasons phosphodiester

Secondaire: peut se replier en diff formes, des structures tridimensionell importantes pour sa fonction

Question 7

différents produits de l’ARN

Answer 7

ARNm= code pour des protéins

ARnr (ribosomale)= forne une partie des ribosomes et participe a la synthèse de proteins

ARNt (transfer)= its tRNA used in translation as un adaptateur entre l’ARNm et les acides aminés

ARNmi (régulateur)= controlent l’expression des gênes.

autres petits ARNs: utile dans l’épissage, entretien de télomères-

Question 8

l’ARN est complémentaire a quelle brinx de ADN?

Answer 8

brin non-codant ou brin transcrit

Question 9

dans quel sens et qui mène la transcription?

Answer 9

5’-3’, l’ARN polymèrase

pas besoin d’amorce, fait des erreurs chaque 10^4 ribonucléotides

Question 10

comapre l’ADN polymérase et l’ARN polymérase

Answer 10

similarité:
ADN comme matrice
précurseurs nucléotides triphosphate
5’-3’

ADN polym:
besoin d’amorce
peu de erreur, 10^7
désoxyribonucléotides (dNTP)

ARN
pas besoin d’amorce
erreurs fréquente
ribonucléotides (NTP)

Question 11

la transcription commence chez les procaryotes?

Answer 11

Initiation:
reconnaiscance du promoteur par le facteur sigma

Elongation:
ouverture de la double hélice de l’ADN
1 des 2 brins sert de matrice
ajout des ribonucléotides, lien covalent catalysé par l’ARN polym, 5’-3’
liberation du facteur sigma

Terminaison
arrêt de la transcription une fois arrivé au site de terminaison (TTTTTT) transcrits en (UUUUU) -> l’ARN forme un intra-brin en épingle a cheveux

-> détachement de l’ARN polym.
-> liberation de la molécule ARN.

Question 12

structure de l’ARN polymérase?

Answer 12

2 sous unité alpha
2 sous unité: beta (site active de polymérisation) et beta’ (site d’attachement de l’ADN)

1 facteur sigma qui reconnait le promoteurs

1 sous unité w
en gros un assemblage de protéins

forment ensemble un holoenzyme

Question 13

définiton de promoteur
procaryote et eucaryotes

Answer 13

région de l’ADN ou se fixe initialement l’ARN polymérase avant de démarrer la synthèse de l’ARN.

procaryotes
Boite TATA (position -10)
TTGACA (pos. -35)
-> l’assymétrie du promoteur orriente l’ARN polymérase et détermine la direction de la transcription

eucaryotes
Boite TATAAAA (-25) CAAT (-75)

Question 14

défini un ARN polycistronique

Answer 14

chez les procaryotes

un ARN messager qui contient plusieurs cistrons (gène) consécutif qui codent différent protéins

en gros contient linformation néccessaire à la synthèse de plusiers protéins qui vont souvent parti du même circuit métabolique

ils se trouvent sur le même opéron

Question 15

défini un opéron

Answer 15

une unité de ADN regroupant des gènes sous le controle d’un signal moléculaire réglateur

Question 16

ex de régulation d’expression des gênes dans les prokaryotes

Answer 16

opéron lactose

les gènes peuvent etre activer ou inhiber avec des activatuers ou des represseur protéiques. ils aggissent au niveau du promoteur et en fonction des nutriments possible

une gène code pour un enzyme qui métabolise le lactose en galactose et glucose

1. lactivatuer bactérien CAP se lier a l’AMP cyclique qui se lie a l’ADN sur le site CAP.

les gènes activé par CAP s’activent donc en réponse d’une augmentation de concentration intra cellulaire de l’AMP cyclique qui indique a la cellule qui manque du glucose.

en abscence de lactose le represseur de lac va se lier sur l’opérateur pour inhiber la transcription des gènes LacX, Y, et Z, (operon) si on a pas de lactose a métabolisé

L’opéron de lactose sera que active en préssence de lactose et en manque de glucose (dans ce cas la concentration de l’allactose, un isomère du lactose, augmente et le molécule se lie au répressuer qui change sa confirmation et le détache de l’ADN)

Question 17

combien de ARN polymerase existe chez les eucaryotes?

Answer 17

4
ARN Polymérase 1 (ribosomaux), nucléaire, ARNr (60-80%)

ARN Polymérase 2 (méssagé), nucléaire, ARNm, petits ARNs nucléaires (20-30% spliceosme)

ARN polymérase 3 (transfer, traduction), nucléaire, ARNT, ARN cystoplasmiques (5-10%)

ARN polymérase mitochondrial

Question 18

comment la transcription des gène est régulé chez les eucaryotes?

Answer 18

l’activation des gènes se fait a distance

l’ADN forment une boucle permettant le contact entre la proteine activetrice sur le enhancer et le complex de transcription

Question 19

défini monocistronique

Answer 19

chez les eucaryotes

ARN monocistronique contient qu’une seule information génétique

Question 20

comment l’ARNm eucaryotique voyage dans le cytoplasm depuis le noyau?

Answer 20

a traves des pores nucléaires

Question 21

que sont les 3 étapes de la maturation de l’ARN eucaryotique?

Answer 21

1. Formation de la coiffe (5’ de l’ARN)
2. Polyadénylation (3’ de l’ARN)
3. l’épissage

Question 22

explique la formation de la coiffe?

Answer 22

est une modification d’un nucléotide a l’extrémité 5’ de l’ARNm

• addition de Guanine sur laquelle un group méthyl est fixé

7-methylguanosine sur le 1. nucléotide de l’ARN par une liasons 5’-5’ triphosphate.

rôle:
- protection de l’ARN de la degradation enzymatique
-entre en jeu avec la traduction

Question 23

explique la polyadénylation?

Answer 23

effectuée par poly (A) Polymérase qui utlise l’ATP comme substrat pour allonger lextrémité 3’ de l’ARN.

-pas besoin de matrice
- poly A polymérase n’est pas codée dans le gênome
- fin de transcription, signal spécifique sur l’ARN de polyadénylation AAUAAA
- facteurs comme CPSF se fixe au signal et clive l’ARNm ou commence la polyadénylation.

rôle:
- protection contre la dégédation
- moins de dégradation si la queue poly A est longue
- implique dans le transport nucléo - cytoplasmique et dans la traduction

Question 24

explique l’épissage

Answer 24

exon 1, GU(site du donneur)————A du branchement————–AG(site accepteur), Exon 2

1. reaction de double trans-estérification: 2 attaque de la liasons phosphodiester au site donneur et on coupe
2. formation de la structure lasso
3. 2 attaque de la liasons phosphodiester au site accepteur
4. intron libérer sous forme de lasso puis destruction par des nucléase
5. liasons entre exon

spliceosome (composé de petits ARN nucléaires regrouper avec des protéins pour former des snRNPs)

• coupe les introns (lasso)
• petits ARN qui reconnaissent les limites exon-introns et qui participent aux reactions chimique

Question 25

que est l’épissage alternative?

Answer 25

choix de garder different exons qui vont formé des proteins isomère qui peuvent avoir d’autres structures/fonctions

spliceosome reconnait des signaux plus ou moins fort, donc des signaux faibles vont pas toujours être reconnu.

Question 26

que est l’ARNi

Answer 26

l’ARNi simple ou double brin interfèrent avec un ARN virale (double brin) spécifique et entraine sa dégradation

• a l’origine un meécanisme de défense contre les virus chez les eucaryotes

1. ARNm reconnue par DICER, clivage de l’ARN en petits fragments, libération de DICER
2. RISC se lie a un des fragments de l’ARN et va ciblé des fragment complémentaire, pour entrainer leur dégradation