Transcription de l'ADN Flashcards
What is the dogme central ?
l’information génétique dirige la synthèse des protéins
How are genes transcribed differently?
chaque gène est produit a des rythmes différent ce qui permet de contrôler la quantité de protéine produit
Difference between ADN et ARN
ADN
Fonction: support de l’information géntique
Sucre: désoxyribose (H)
Base: Adénine, Guanine, Thymine, Cytosine
Structure: 2 brins enroulé en double hélice
ARN
Fonction: Copie d’une partie de l’ADN
Sucre: ribose (OH)
Base: Adénine, Guanine, Uracil, Cytosine
Structure: 1 brins (monocaténaire) plus court que l’ADN
Why is thymine replaced by uracil in ARB?
la pressence de T dans l’ADN permet la détection des mutations spontanées de la cytosine (elle se converti en uracil). La machinerie de reparation de l’ADN va détecter le U et effectuer une reparation.
doesnt occur with RNA, short life span, simply disintegrates
What happens to ARN if it is damaged ?
Not repaired, short life span, aloes dégradé et recyclé
structure de l’ARN?
Primaire: polymère linéaire composé de 4 types de ribonucleotides reeliés par des liasons phosphodiester
Secondaire: peut se replier en diff formes, des structures tridimensionell importantes pour sa fonction
différents produits de l’ARN
ARNm= code pour des protéins
ARnr (ribosomale)= forne une partie des ribosomes et participe a la synthèse de proteins
ARNt (transfer)= its tRNA used in translation as un adaptateur entre l’ARNm et les acides aminés
ARNmi (régulateur)= controlent l’expression des gênes.
autres petits ARNs: utile dans l’épissage, entretien de télomères-
l’ARN est complémentaire a quelle brinx de ADN?
brin non-codant ou brin transcrit
dans quel sens et qui mène la transcription?
5’-3’, l’ARN polymèrase
pas besoin d’amorce, fait des erreurs chaque 10^4 ribonucléotides
comapre l’ADN polymérase et l’ARN polymérase
similarité:
ADN comme matrice
précurseurs nucléotides triphosphate
5’-3’
ADN polym:
besoin d’amorce
peu de erreur, 10^7
désoxyribonucléotides (dNTP)
ARN
pas besoin d’amorce
erreurs fréquente
ribonucléotides (NTP)
la transcription commence comment chez les procaryotes?
Initiation:
reconnaiscance du promoteur par le facteur sigma
Elongation:
ouverture de la double hélice de l’ADN
1 des 2 brins sert de matrice
ajout des ribonucléotides, lien covalent catalysé par l’ARN polym, 5’-3’
liberation du facteur sigma
Terminaison
arrêt de la transcription une fois arrivé au site de terminaison (TTTTTT) transcrits en (UUUUU) -> l’ARN forme un intra-brin en épingle a cheveux
-> détachement de l’ARN polym.
-> liberation de la molécule ARN.
structure de l’ARN polymérase?
2 sous unité alpha
2 sous unité: beta (site active de polymérisation) et beta’ (site d’attachement de l’ADN)
1 facteur sigma qui reconnait le promoteurs
1 sous unité w
en gros un assemblage de protéins
forment ensemble un holoenzyme
définiton de promoteur
procaryote et eucaryotes
région de l’ADN ou se fixe initialement l’ARN polymérase avant de démarrer la synthèse de l’ARN.
procaryotes
Boite TATA (position -10)
TTGACA (pos. -35)
-> l’assymétrie du promoteur orriente l’ARN polymérase et détermine la direction de la transcription
eucaryotes
Boite TATAAAA (-25) CAAT (-75)
défini un ARN polycistronique
chez les procaryotes
un ARN messager qui contient plusieurs cistrons (gène) consécutif qui codent différent protéins
en gros contient linformation néccessaire à la synthèse de plusiers protéins qui vont souvent parti du même circuit métabolique
ils se trouvent sur le même opéron
défini un opéron
une unité de ADN regroupant des gènes sous le controle d’un signal moléculaire réglateur
ex de régulation d’expression des gênes dans les prokaryotes
opéron lactose
les gènes peuvent etre activer ou inhiber avec des activatuers ou des represseur protéiques. ils aggissent au niveau du promoteur et en fonction des nutriments possible
une gène code pour un enzyme qui métabolise le lactose en galactose et glucose
- lactivatuer bactérien CAP se lier a l’AMP cyclique qui se lie a l’ADN sur le site CAP.
les gènes activé par CAP s’activent donc en réponse d’une augmentation de concentration intra cellulaire de l’AMP cyclique qui indique a la cellule qui manque du glucose.
en abscence de lactose le represseur de lac va se lier sur l’opérateur pour inhiber la transcription des gènes LacX, Y, et Z, (operon) si on a pas de lactose a métabolisé
L’opéron de lactose sera que active en préssence de lactose et en manque de glucose (dans ce cas la concentration de l’allactose, un isomère du lactose, augmente et le molécule se lie au répressuer qui change sa confirmation et le détache de l’ADN)
combien de ARN polymerase existe chez les eucaryotes?
4
ARN Polymérase 1 (ribosomaux), nucléaire, ARNr (60-80%)
ARN Polymérase 2 (méssagé), nucléaire, ARNm, petits ARNs nucléaires (20-30% spliceosme)
ARN polymérase 3 (transfer, traduction), nucléaire, ARNT, ARN cystoplasmiques (5-10%)
ARN polymérase mitochondrial
comment la transcription des gène est régulé chez les eucaryotes?
l’activation des gènes se fait a distance
l’ADN forment une boucle permettant le contact entre la proteine activetrice sur le enhancer et le complex de transcription
défini monocistronique
chez les eucaryotes
ARN monocistronique contient qu’une seule information génétique
comment l’ARNm eucaryotique voyage dans le cytoplasm depuis le noyau?
a traves des pores nucléaires
que sont les 3 étapes de la maturation de l’ARN eucaryotique?
- Formation de la coiffe (5’ de l’ARN)
- Polyadénylation (3’ de l’ARN)
- l’épissage
explique la formation de la coiffe?
est une modification d’un nucléotide a l’extrémité 5’ de l’ARNm
- addition de Guanine sur laquelle un group méthyl est fixé
7-methylguanosine sur le 1. nucléotide de l’ARN par une liasons 5’-5’ triphosphate.
rôle:
- protection de l’ARN de la degradation enzymatique
-entre en jeu avec la traduction
explique la polyadénylation?
effectuée par poly (A) Polymérase qui utlise l’ATP comme substrat pour allonger lextrémité 3’ de l’ARN.
-pas besoin de matrice
- poly A polymérase n’est pas codée dans le gênome
- fin de transcription, signal spécifique sur l’ARN de polyadénylation AAUAAA
- facteurs comme CPSF se fixe au signal et clive l’ARNm ou commence la polyadénylation.
rôle:
- protection contre la dégédation
- moins de dégradation si la queue poly A est longue
- implique dans le transport nucléo - cytoplasmique et dans la traduction
explique l’épissage
exon 1, GU(site du donneur)————A du branchement————–AG(site accepteur), Exon 2
- reaction de double trans-estérification: 2 attaque de la liasons phosphodiester au site donneur et on coupe
- formation de la structure lasso
- 2 attaque de la liasons phosphodiester au site accepteur
- intron libérer sous forme de lasso puis destruction par des nucléase
- liasons entre exon
spliceosome (composé de petits ARN nucléaires regrouper avec des protéins pour former des snRNPs)
- coupe les introns (lasso)
- petits ARN qui reconnaissent les limites exon-introns et qui participent aux reactions chimique
que est l’épissage alternative?
choix de garder different exons qui vont formé des proteins isomère qui peuvent avoir d’autres structures/fonctions
spliceosome reconnait des signaux plus ou moins fort, donc des signaux faibles vont pas toujours être reconnu.
que est l’ARNi
l’ARNi simple ou double brin interfèrent avec un ARN virale (double brin) spécifique et entraine sa dégradation
- a l’origine un meécanisme de défense contre les virus chez les eucaryotes
- ARNm reconnue par DICER, clivage de l’ARN en petits fragments, libération de DICER
- RISC se lie a un des fragments de l’ARN et va ciblé des fragment complémentaire, pour entrainer leur dégradation
permet d’inactiver des gènes en laboratoire
