Proteins

Question 1

Functions of proteins with examples

Answer 1

enymes, amylase

transport, hémoglobine

structure, actine

hormones, insuline

défense, immunoglobulines

contractile, actine/myosine

stockage, albumine

Question 2

explain the quaternary structure of a protein?

Answer 2

certaines protéines forment des assemblages avec d’autre molécule

n. de sous-unité:

1 protéine= monomère

2= dimère (2 pro. identiques: homodimère, 2 pro. diff: hétérodimère)

3= trimère

3+= polymère

Question 3

what are all amino acids names? 3 letters + 1 letter code?

Question 3

which aa are essentials and non essentials?

Answer 3

essentials: H,I,L,K,M,F,T,W,V

non essentials: A,R,D,C,E,Q,G,P,S,Y,N

Question 4

quelle est la base d’un acide aminé?

Answer 4

1. Carbon alpha ()
2. NH2
3. COOH
4. H
5. chaine R (détermine quel type de aminé)
6. toujours forme L (lévogyre)

Question 5

quelles sont les charges des aa?

Answer 5

• à ph 7.0 (dans notre corps) les aa snt dipolaires:
• NH2 → NH3+ et COOH → COO-

Question 6

comment se différenties les chaine de R?

Answer 6

dimensions, forme, charge, donneur/acceptuer de H+, hydrophobe ou hydrophyle, réactivité chimique

Question 7

comment se classe les aa

Answer 7

selon les charactéristique du groupe R

• aa hydrophobes, avec R non polaires
• aa polaires, avec des R neutres
• aa chargé +, avec R chargé positif
• aa chargé -, avec R chargé négatif

Question 8

explain the effect of ph and pk on amino acids and the purpose

Question 9

what are aa ionisable?

Answer 9

aa chargé a ph neutre: K, R, H, D, E

can form a “pond salins”; combo of 2 non-covalent interactions; Hyrdogen bonding + electrostatic attractions

Allows them to donate or accept proton, pKa value can be influenced by environment

Question 10

comment former des dipeptides?

Answer 10

• pendant traduction, la peptidyl transferase, forme la liasons peptidique par une liasons covalente entre NH2 de 1 aa et le COOH d’un autre aa
• liasons très stable

Question 11

quelle direction a un aa?

Answer 11

aa sont numérotés depuis NH3+ terminal vers les COO- terminale.

Question 12

how are secondary structures in proteins formed?

Answer 12

• starting from 50-100 aa
• based on the geometry; the alpha C will rotate, which results in some aa facing each other, or being on opposites.
• depending on the properties of the aa and the gêne stérique, ils vont se mettre ensemble ou pas.
• forme l’hélice alpha et le brin beta
• le molecule est toujours sur le même plan.

Question 13

que change l’hélice a pour la protéine?

Answer 13

• tout les aa hydrophobe se trouvent sur le même côté et tout les aa hydrophyle de même
• stabilisé pas des lisasons H, le sens de déroulement est de droite, favorbale pour aa L

Question 14

que détermine la structure et la fonction d’une protéine?

et que est la structure finale?

Answer 14

la séquence primaire, en gros l’ordre des aa pour struc.

la forme tridimensionelle détermine les actions qu’elle peut faire.

structure finale: provient de milliers d’interactions non-covalentes