Replication et réparation d l'ADN Flashcards
que sont les étapes de la réplication
- déroulement de l’ADN (topoisomerases)
- overture de l’ADN, helicases
- synthèse des amorces (primers), primases
- replication des brins matrices (polymerases)
- détachement des amorces, exo-nucleases
- ligation des brins discontinus et continus, ligases
- terminaison
structure de l’ADN?
super enroulé
la fonction des topoisomérases?
enzymes
1. régulent l’enroulement des molécules ADN en utilisent l’énergie de hydrolyse de l’ATP.
2. relachent la tension dans l’ADN en le faisant tourner au tour de l’autre brin.
la fonction de hélicases?
- d’ouvrir le double brin d’ADN.
- proteines motrice qui se déplacent, séparant les deux brins
- utilise l’énergie de hydrolyse d’ATP
- crée la fourche de réplication
pour combien de hélicases code le génome humain?
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la fonction des primers (amorce)?
- composé de ARN synthétisée par un enzyme, primase.
- permettre l’attachement de l’ADN polymerase
- primase reconnait que des brins singulier et crée des DNTP.
la fonction de ADN polymerase et de PCNA?
crée des molécules de ADN à partir de nucléosides triphosphates en s’attachent aux amorces.
dans le sens 5’ vers 3’
PCNA est une pince beta, qui se lie a l’ADN polymerases et empeche cette enzyme de se dissocier du brin d’ADN matrice.
- augemente le nombre de nucléotides que la polymerase peut ajouter et aussi la vitesse.
comment l’adn polymerase previent t’elle des erreurs dans la réplication?
- la capacité de lire un brin matrice, séléctionner le nucléoside triophosphate approprié et de l’insérer a ‘lextrémité 3’.
-proofreading: remplacer des mononucléotides incorrectement incorporés par les corrects.
explique la formation des fragments okazaki
le brin discontinu ne peut pas etre répliqué dans le sense 5’-3’ continuellement et doit donc etre réplicé dans des fragements appelé Okazaki.
amorce s’attache a chaque 1000-2000 nucléotide et l’ADN polymerase réplicque le brinx disconinu en sections.
comment les okazaki fragments on été découvert?
pulse chase experiment.
discovered DNA ligase enzyme which they discovered that in its abscence the some of the radiolabeled DNA would be either continous or/and form fragments.
fonction de ligase
catalysent la formation d’une liason phosphodiester entre 2 segments d’ADN.
-liés les fragments de okazaki et dans la réparation de l’ADN.
terminaison de la réplication?
- quand 2 fourches de réplication se croisent ou quand la fourche rencontre un signal de terminaison.
1.
réplication dans les prokaryotes vs eukaryotes
génome bactérien: longue molécule d’ADN circulaire, avec une seule origine de réplication
génome eucaryotes: composé de plusieurs chromosomes dont chacun a plusieurs origine de réplication.
que sont les télomères et la télomèrase?
sequence nucléotidiques répétitives a l’extrémité des chromosomes: prevent chromosomes from fusing, errors during replication, ou de subir une dégradation progressive au fil des divisons cellulaires.
contribue a la stabilité génomqiue.
télomérase va synthétiser les télomères au bout 3’ de l’ADN, et avec un primer l’ADN polymerase va synthétiser le télomère.
que sont les sources principales de mutations dans l’ADN?
Intraséque (accidental)
- erreurs de réplication
- insertions/délétions de nucléotides
- réarrangements de chromosomes
Chimique
- modification de base
-cassure de brin
- site abasiques (perte de base)
Radiations
- UV
- modifications de base
- cassure de brin
- site abasiques
que sont les types de mutation?
- substitution
- délétion
- insertion
que est une mutation de subsitution + exemple
remplacement d’un nucléotide par une autre dans l’ADN, ARN ou protéine
exemple:
la drépanocytose: A -> T; acide glutamique en valine
que est une mutation de délétion?
la perte du matériel génétique
soit une bases ou sinon aussi des pertes de morceaux de chromosomes
que est une mutations de insertion?
l’ajout de matériel génétique
soit un nucléotides ou un morceau de chromosomes
que sont les principaux mécanismse de réparation?
HR: Homologous recombination
NHEJ: Non- homologous end joining
BER: base excision repair
NER: nucleotide excision repair
MMR: mismatch repair
comment fonctionne HR?
homologous recombination
- protéine recombinase: RAD51
Filament présynaptique: helicase ouvre double brin + nucléases “clean off the cut” aka remove some more nucleotides
Phase synaptique:
filament présynaptique est assemblé alors RAD51 associé à l’ADN simple brin s’associé l’ADN de la chromatide soeur et cherche pour la séquence manquante homologue, aka invasion du chromosome homologue
phase post-synaptique:
ADN polymérase recopie l’information perdue.
comment fonction NHEJ?
les extrémitées de la rupture sont directement ligaturées sans qu’il soit vérifié.
Ku recrute des nucléases pour couper le brin casser et des ligases pour vite lié la molécule ensemble. ceci est risky et une perte de nucléotides est inévitables.
comment fonctionne BER?
occurs when a base of a nucleotide is damaged.
ADN glycosylases reconnaissent des erreurs de type depurination ou deamination et clive les nucléotides endommagé. ADN polymérase remplie le fragments manquant.
comment fonctionne NER?
rayons UV déclencher des rxn chimiques comme la dimérisation de la thymine
- enzyme exinuclease trouve le “damage” et coupe l’ADN (hélicase ouvre le double brin). 2. 12 nucléotides sont enlevés.
- ADN polymérase remplie le trou
- la ligase lie les 12 nucléotides
comment fonctionne MMR?
corrige les mésappariements d’ADN générés pendant la réplication.
- 2 enyzme MutS et MutL reconnaissent l’erreure
- enzyme MutH reconnais un groupe Méthyl sur l’ADN, just les brin d’ADN originelle contiennent des groupes méthyl
- MutL coupe l’erreur et l’enlève
- ADN polymérase remplie le trou et la ligase lie les nucléotides
