Transcription Flashcards
Dans quel sens est polymérisé l’ARN?
5’ vers 3’
Dans quel sens est lu l’ADN du brin matrice?
3’ vers 5’
Quelle est la différence moléculaire entre l’uracil et la thymine?
CH3 au lieu de CH sur la thymine
Jusqu’à quel niveau de structure se rend l’ARN?
secondaire et tertiaire
Qu’est-ce qu’un pseudoknot?
Appariement de bases entre deux régions simple-brin de boucles
V ou F: l’ARN polymérase nécessite une amorce
FAUX
V ou F: la réplication est plus précise que la transcription
VRAI
Que créé l’ARN polymérase entre les nucléotides?
liens phosphodiesters
Quelle protéine signale le début de la transcription chez les procaryotes?
facteur sigma
Qu’est-ce qui s’associe au facteur sigma?
ARN polymérase
À quel niveau est relâché l’ARN polymérase de l’ADN?
Signal stop
Quand est relâché le facteur sigma?
10 nucléotides après le début de la transcription
Quelle protéine permet la sélection du promoteur du gène à transcrire chez les procaryotes?
Facteur sigma
V ou F: le facteur sigma se lie au promoteur AVANT de s’associer à la polymérase
VRAI
Quelles boîtes sont reconnues par le facteur sigma?
- -10
- -35
Comment se fait la reconnaissance et les liens moléculaires du promoteur avec le facteur sigma?
liaisons chimiques faibles
Quelle séquence sert de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription?
TATAAT (-10)
Que provoque le contact de l’ARN polymérase avec le promoteur au niveau de la structure de l’ADN?
Ouverture de la double hélice (bulle de transcription)
Quelle est la vitesse de la synthèse d’ARN?
50 ribonucléosides/seconde
Qu’est-ce qui donne le signal à la polymérase pour qu’elle soit relâchée?
Rencontre du signal de terminaison
En quoi consiste le signal de terminaison?
Forme que prend l’ARN grâce aux appariements locaux (intramoléculaire)
Quels nucléotides retrouve-t-on au niveau du site stop?
A T
La transcription de la séquence stop cause quoi?
Une terminaison de l’ARN en tige-boucle qui créé une contrainte au niveau du complexe de l’ADN polymérase
La séquence en tige-boucle est riche en quels nuléotides?
G-C
De quels nucléotides est suivie la séquence en tige-boucle?
série de U
Quels sont les types d’ARN?
- ARNm
- ARNr
- ARNt
- petits ARN (snRNA, snoRNA)
l’ARNm utilise quelle polymérase?
II
l’ARNr utilise quelle polymérase?
I
l’ARNt utilise quelle polymérase?
III
Les petits ARN utilisent quelle polymérase?
III
De quoi est composé le promoteur eucaryote?
Boîte TATA
Quelles sont les caractéristiques de la boite TATA?
- 25pb
- se trouve à -25
Globalement, qu’est-ce qui forme le complexe d’initiation de la transcription eucaryote?
Facteurs généraux de transcription (GTF ou TFII) s’associant à ARN polymérase II
V ou F: ARN polymérase II reconnait directement un promoteur
FAUX
Quels facteurs de transcription s’associent à l’ADN et permettent de lier l’ARN polymérase II?
TFIID et TFIIB
Quels sont d’autres exemples de facteurs généraux de transcription?
TFIIF, TFIIE, TFIIH
Quelles sont les actions moléculaires de TFIIH?
- Séparation des brins d’ADN (activité hélicase)
- Phosphorylation (kinase) de la queue N-terminale et C-terminale de l’ARN polymérase
Quels facteurs sont libérés par la phosphorylation de C-terminale de l’ARN polymérase par TFIIH?
TFIIB, TFIIE, TFIIF, TFIIH
Qu’est-ce qu’enclenche la libération des facteurs de l’ARN polymérase II?
Signal de départ
Quels facteurs ne sont pas libérés de l’ARN polymérase lors de l’élongation de l’ARN eucaryote?
TFIID et son TBP
Quelle séquence déclenche la fin de la transcription chez les eucaryotes?
terminateur
Que contient le terminateur eucaryote?
Signal de polyadénylation AAUAAA
Que se passe-t-il avec le pré-ARNm?
Clivé et polyadénylation
Quel est l’impact de l’efficacité de la transcription sur les protéines ?
Impacte la quantité de protéines traduites
V ou F: la vitesse d’élongation de la transcription est toujours la même
VRAI
Où est contrôlé le taux de transcription d’un gène?
au niveau de l’initiation
Quels sont les types de facteurs de régulation de la transcription?
- activateur (enhancers)
- répresseurs (silencers)
À quoi se lient les facteurs de régulation de la transcription?
Régions de contrôle spécifiques
V ou F: les régions de contrôle de la transcription se retrouvent uniquement en amont du promoteur
FAUX (parfois en aval)
Que cause une liaison d’une protéine sur une séquence de régulation?
Changement de conformation de l’ADN
Que peuvent attirer les facteurs d’activation?
- facteurs généraux de la transcription
- ARN polymérase
- complexes de remodelage de la chromatine
V ou F: une séquence enhancer se trouve près du promoteur
FAUX: peut être à des milliers de pb
Les facteurs spécifiques de transcription comprennent quels domaines actifs?
- domaine de liaison à l’ADN
- domaine d’activation ou de répression
Par quoi est modulée la synthèse de glycogène?
Glucocorticoïdes
Que se passe-t-il en cas d’effort physique?
Production de glucocorticoïdes
Quelle séquence spéciale peut contenir un promoteur eucaryote?
SSD: domaine de réponse à un signal
Que déterminent les facteurs de transcription se liant à l’ADN?
L’efficacité d’initiation de la transcription
V ou F: le complexe d’initiation de la transcription (ARN pol+TFII) est identique pour la transcription de tous les gènes
VRAI
V ou F: les facteurs de transcription et complexes protéiques des régions régulatrices sont identiques pour tous les gènes
FAUX
Donner un exemple d’activation de la transcription par les histones
Recrutement d’acétylase d’histones
Donner un exemple de répression de la transcription par les histones
Recrutement de déacétylases d’histones
Donner un exemple d’activation de la transcription par le nucléosome
Recrutement de complexe de remodelage de la chromatine
Quels sont les 3 types de répression?
- compétition activateur/répresseur
- masquage du domaine d’activation
- interaction directe ou indirecte
En quoi consiste le masquage du domaine d’activation?
Répresseur se lie au domaine d’activation de l’activateur(ne peut se lier au complexe d’initiation)
En quoi consiste l’interaction directe ou indirecte?
Répresseur se lie aux facteurs généraux de transcription, empêchant la liaison de l’activateur
Qu’est-ce qu’une séquence consensus?
Séquence idéale obtenue par analyse des fréquences des bases à chaque position
Qu’est-ce que cela signifie si la séquence du promoteur est similaire est la séquence consensus?
L’affinité est grande, tout comme le sera l’efficacité d’initiation de la transcription
