Transcription Flashcards

1
Q

Dans quel sens est polymérisé l’ARN?

A

5’ vers 3’

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Q

Dans quel sens est lu l’ADN du brin matrice?

A

3’ vers 5’

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3
Q

Quelle est la différence moléculaire entre l’uracil et la thymine?

A

CH3 au lieu de CH sur la thymine

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4
Q

Jusqu’à quel niveau de structure se rend l’ARN?

A

secondaire et tertiaire

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5
Q

Qu’est-ce qu’un pseudoknot?

A

Appariement de bases entre deux régions simple-brin de boucles

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6
Q

V ou F: l’ARN polymérase nécessite une amorce

A

FAUX

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7
Q

V ou F: la réplication est plus précise que la transcription

A

VRAI

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8
Q

Que créé l’ARN polymérase entre les nucléotides?

A

liens phosphodiesters

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9
Q

Quelle protéine signale le début de la transcription chez les procaryotes?

A

facteur sigma

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10
Q

Qu’est-ce qui s’associe au facteur sigma?

A

ARN polymérase

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11
Q

À quel niveau est relâché l’ARN polymérase de l’ADN?

A

Signal stop

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12
Q

Quand est relâché le facteur sigma?

A

10 nucléotides après le début de la transcription

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13
Q

Quelle protéine permet la sélection du promoteur du gène à transcrire chez les procaryotes?

A

Facteur sigma

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14
Q

V ou F: le facteur sigma se lie au promoteur AVANT de s’associer à la polymérase

A

VRAI

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15
Q

Quelles boîtes sont reconnues par le facteur sigma?

A
  • -10

- -35

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16
Q

Comment se fait la reconnaissance et les liens moléculaires du promoteur avec le facteur sigma?

A

liaisons chimiques faibles

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17
Q

Quelle séquence sert de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription?

A

TATAAT (-10)

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18
Q

Que provoque le contact de l’ARN polymérase avec le promoteur au niveau de la structure de l’ADN?

A

Ouverture de la double hélice (bulle de transcription)

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19
Q

Quelle est la vitesse de la synthèse d’ARN?

A

50 ribonucléosides/seconde

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20
Q

Qu’est-ce qui donne le signal à la polymérase pour qu’elle soit relâchée?

A

Rencontre du signal de terminaison

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21
Q

En quoi consiste le signal de terminaison?

A

Forme que prend l’ARN grâce aux appariements locaux (intramoléculaire)

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22
Q

Quels nucléotides retrouve-t-on au niveau du site stop?

A

A T

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23
Q

La transcription de la séquence stop cause quoi?

A

Une terminaison de l’ARN en tige-boucle qui créé une contrainte au niveau du complexe de l’ADN polymérase

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24
Q

La séquence en tige-boucle est riche en quels nuléotides?

A

G-C

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25
Q

De quels nucléotides est suivie la séquence en tige-boucle?

A

série de U

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26
Q

Quels sont les types d’ARN?

A
  • ARNm
  • ARNr
  • ARNt
  • petits ARN (snRNA, snoRNA)
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27
Q

l’ARNm utilise quelle polymérase?

A

II

28
Q

l’ARNr utilise quelle polymérase?

A

I

29
Q

l’ARNt utilise quelle polymérase?

A

III

30
Q

Les petits ARN utilisent quelle polymérase?

A

III

31
Q

De quoi est composé le promoteur eucaryote?

A

Boîte TATA

32
Q

Quelles sont les caractéristiques de la boite TATA?

A
  • 25pb

- se trouve à -25

33
Q

Globalement, qu’est-ce qui forme le complexe d’initiation de la transcription eucaryote?

A

Facteurs généraux de transcription (GTF ou TFII) s’associant à ARN polymérase II

34
Q

V ou F: ARN polymérase II reconnait directement un promoteur

A

FAUX

35
Q

Quels facteurs de transcription s’associent à l’ADN et permettent de lier l’ARN polymérase II?

A

TFIID et TFIIB

36
Q

Quels sont d’autres exemples de facteurs généraux de transcription?

A

TFIIF, TFIIE, TFIIH

37
Q

Quelles sont les actions moléculaires de TFIIH?

A
  • Séparation des brins d’ADN (activité hélicase)

- Phosphorylation (kinase) de la queue N-terminale et C-terminale de l’ARN polymérase

38
Q

Quels facteurs sont libérés par la phosphorylation de C-terminale de l’ARN polymérase par TFIIH?

A

TFIIB, TFIIE, TFIIF, TFIIH

39
Q

Qu’est-ce qu’enclenche la libération des facteurs de l’ARN polymérase II?

A

Signal de départ

40
Q

Quels facteurs ne sont pas libérés de l’ARN polymérase lors de l’élongation de l’ARN eucaryote?

A

TFIID et son TBP

41
Q

Quelle séquence déclenche la fin de la transcription chez les eucaryotes?

A

terminateur

42
Q

Que contient le terminateur eucaryote?

A

Signal de polyadénylation AAUAAA

43
Q

Que se passe-t-il avec le pré-ARNm?

A

Clivé et polyadénylation

44
Q

Quel est l’impact de l’efficacité de la transcription sur les protéines ?

A

Impacte la quantité de protéines traduites

45
Q

V ou F: la vitesse d’élongation de la transcription est toujours la même

A

VRAI

46
Q

Où est contrôlé le taux de transcription d’un gène?

A

au niveau de l’initiation

47
Q

Quels sont les types de facteurs de régulation de la transcription?

A
  • activateur (enhancers)

- répresseurs (silencers)

48
Q

À quoi se lient les facteurs de régulation de la transcription?

A

Régions de contrôle spécifiques

49
Q

V ou F: les régions de contrôle de la transcription se retrouvent uniquement en amont du promoteur

A

FAUX (parfois en aval)

50
Q

Que cause une liaison d’une protéine sur une séquence de régulation?

A

Changement de conformation de l’ADN

51
Q

Que peuvent attirer les facteurs d’activation?

A
  • facteurs généraux de la transcription
  • ARN polymérase
  • complexes de remodelage de la chromatine
52
Q

V ou F: une séquence enhancer se trouve près du promoteur

A

FAUX: peut être à des milliers de pb

53
Q

Les facteurs spécifiques de transcription comprennent quels domaines actifs?

A
  • domaine de liaison à l’ADN

- domaine d’activation ou de répression

54
Q

Par quoi est modulée la synthèse de glycogène?

A

Glucocorticoïdes

55
Q

Que se passe-t-il en cas d’effort physique?

A

Production de glucocorticoïdes

56
Q

Quelle séquence spéciale peut contenir un promoteur eucaryote?

A

SSD: domaine de réponse à un signal

57
Q

Que déterminent les facteurs de transcription se liant à l’ADN?

A

L’efficacité d’initiation de la transcription

58
Q

V ou F: le complexe d’initiation de la transcription (ARN pol+TFII) est identique pour la transcription de tous les gènes

A

VRAI

59
Q

V ou F: les facteurs de transcription et complexes protéiques des régions régulatrices sont identiques pour tous les gènes

A

FAUX

60
Q

Donner un exemple d’activation de la transcription par les histones

A

Recrutement d’acétylase d’histones

61
Q

Donner un exemple de répression de la transcription par les histones

A

Recrutement de déacétylases d’histones

62
Q

Donner un exemple d’activation de la transcription par le nucléosome

A

Recrutement de complexe de remodelage de la chromatine

63
Q

Quels sont les 3 types de répression?

A
  1. compétition activateur/répresseur
  2. masquage du domaine d’activation
  3. interaction directe ou indirecte
64
Q

En quoi consiste le masquage du domaine d’activation?

A

Répresseur se lie au domaine d’activation de l’activateur(ne peut se lier au complexe d’initiation)

65
Q

En quoi consiste l’interaction directe ou indirecte?

A

Répresseur se lie aux facteurs généraux de transcription, empêchant la liaison de l’activateur

66
Q

Qu’est-ce qu’une séquence consensus?

A

Séquence idéale obtenue par analyse des fréquences des bases à chaque position

67
Q

Qu’est-ce que cela signifie si la séquence du promoteur est similaire est la séquence consensus?

A

L’affinité est grande, tout comme le sera l’efficacité d’initiation de la transcription