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biomol-3 > Petits ARN > Flashcards

Petits ARN Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un ARN non-codant?

A

séquence d’ARN fonctionnelle qui est transcrite mais ne code pas pour une protéine

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2
Q

En comptant les ncRNA, quelle proportion du génome peut être transcrite?

A

70%

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3
Q

Combien le génome humain peut-il coder de miRNA?

A

400 à 600

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4
Q

Combien d’ARN sont de longs non-coding RNA? (lncRNA)

A

150 000

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5
Q

À quel niveau les ncRNA régulent-ils la biologie moléculaire (3)?

A
  • épissage
  • transcription
  • post-transcription
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6
Q

V ou F: les ncRNA sont impliqués dans des pathologies

A

VRAI

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7
Q

Comment est la longueur de lncRNA et des sncRNA?

A
  • lnc: >200 nucléotides

- snc: <200 nucléotides

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8
Q

Quels rôles joue la RNA interference (iRNA)?

A

défence des cellules contre les séquences nucléotidiques parasitiques (virus et transposons)

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9
Q

Qu’est-ce que fait la iRNA moléculairement?

A
  • inhibent l’expression ou la traduction de gènes
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10
Q

Quel est l’intérêt des iRNA en recherche?

A

développer des dsRNA pour cibler et inhiber l’expression de certains gènes d’intérêt

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11
Q

Combien de nucléotides contient un ncRNA

A

22 environ

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12
Q

Dans quelle régulation fonctionne les miRNA?

A

post-transcriptionnelle

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13
Q

Les miRNA ciblent quel % des gènes humaines?

A

60%

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14
Q

V ou F: les miRNA ne sont pas conservés entre les espèces

A

FAUX

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15
Q

Quel est le fonctionnement des miRNA? (3)

A
  1. clivage du brin d’ARNm en 2 morceaux
  2. déstabilisation de l’ARNm par raccourcissement de sa queue poly-A
  3. réduction de l’efficacité de traduction de l’ARNm en protéines
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16
Q

Par quoi sont transcrits les miRNA?

A

RNA pol 2

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17
Q

V ou F: le miRNA subit les mêmes modifications post-transcriptionnelle (queue poly-A, cap, splicing) que l’ARNm

A

VRAI

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18
Q

Que forment les miRNA une fois transcrits?

A

boucle-tige de 70-80 nucléotides

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19
Q

Qu’est-ce que le miRNA primaire?

A

précurseur du miRNA composé de plusieurs centaines de nucléotides

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20
Q

Que contient un pri-miRNA?

A

1-6 précurseurs de miRNA

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21
Q

Quelle protéine reconnait l’ADN double brin des épingles de miRNA?

A

DGCR8 ou “Pasha”

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22
Q

À quoi s’associe DGRC?

A

Drosha

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23
Q

Quelle est l’action de Drosha?

A

Coupe l’ARN pour former le complexe du microprocesseur

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24
Q

Quel est le résultat du cropping par drosha?

A

pre-miRNA

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25
Q

Qu’est-ce que possède le pre-miRNA?

A

2 nucléotides non-appariés à son extrémité 3’

26
Q

V ou F: les gènes des miRNA se trouvent uniquement dans les introns de d’autres gènes

A

FAUX, exons aussi

27
Q

Que sont les Mirtons?

A

des pré-miRNA épissés directement à partir d’introns qui contournent le complexe de microprocesseur et sont processés par la Debranching enzyme

28
Q

Qu’est-ce que possèdent les miRNA en 3’ et 5’?

A
  • 3’: OH

- 5’: phosphate

29
Q

Par quoi sont exportés les pré-miRNA?

A

Exportin 5

30
Q

Qu’est-ce que reconnait l’exportine 5?

A

Les 2 nucléotides laissés en 3’ par Drosha

31
Q

De quoi dépend le transport par l’exportine 5?

A

énergie: GTP lié à Ran (Ran-GTP)

32
Q

Qu’arrive-t-il à la pre-miRNA?

A

processé par DICER, qui couple la boucle

33
Q

Quel est le résultat du DICING?

A

duplex miARN:miARN* d’environ 22 nucléotides de long

34
Q

Comment nomme-t-on les deux brin du duplex miRNA:miRNA* ?

A
  • brin guide

- brin passager

35
Q

V ou F: Seul un des deux brins du duplex de miRNA sera utile

A

VRAI, le brin guide

36
Q

De quel complexe fait partie le miRNA?

A

Complexe de Silencing par l’ARN (RISC)

37
Q

Que contient le RISC?

A

Argonaute (AGO) et d’autres protéines

38
Q

Quel est un autre nom de RISC?

A

miRNP: complexe miRNA ribonucléoprotéine

39
Q

Que fait Ago?

A

lie le miRNA mature et le guide pour une interaction avec ARNm cible

40
Q

Que se passe-t-il si l’appariement entre mRNA et Ago est étendu?

A

SLICING: mRNA clivé puis dégradé

41
Q

V ou F: les Ago ne clivent pas directement le mRNA

A

FAUX Ago2 peut le faire directement

42
Q

Quelles peuvent être l’action des miRNA partiellement complémentaires? (2)

A
  • inhiber la traduction

- accélérer la déadénylation->dégradation précoce

43
Q

Quelles peuvent être les autres actions des miRNA? (2)

A
  • inhibition de l’initiation indépendante de la déadénylation
  • modification d’histones, méthylation ADN
44
Q

Si l’appariement de la miRNA n’est pas extensif, que se passe-t-il?

A
  • pas de slicing, traduction inhibée

- p-bodies

45
Q

Si l’appariement de la miRNA n’est pas extensif, que se passe-t-il avec le mRNA?

A

se retrouve séquestré dans un P-body et dégradé

46
Q

Que retrouve-t-on dans un P-body? (2)

A
  • Dcp1

- enzymes de dégradation

47
Q

Donner les mécanismes d’action des miRNA (9)

A
  • cap-40S initiation inhibition
  • 60S Ribosomal unit joining inhibition
  • elongation inhibition
  • ribosome drop-off
  • co-translational nascent protein degradation
  • p-bodies sequestration
  • mRNA decay
  • mRNA cleavage
  • transcriptional inhibition through chromatine changes
48
Q

V ou F: la majorité des miRNA sont intracellulaires

A

VRAI

49
Q

Quels miRNA ont été découverts dans un environnement extracellulaire?

A
  • circulants ou extracellulaires
50
Q

Quelle est la différence d’origine entre les miRNA et les siRNA?

A
  • miRNA: dérivent de régions de transcrits en ARN qui se replient sur elle-même en épingle
  • siRNA dérivent de régions plus longues d’ARN double brin (dsRNA)
51
Q

Quelle est la différence en terme d’intensité d’inhibition pour les miRNA vs les siRNA?

A

siRNA l’inhibition est plus efficace car on obtient plusieurs fragments de 23 pb

52
Q

Quel est le nom du mécanisme d’inhibition de la transcription par les siRNA?

A

silençage pré-transcriptionnel de l’interférence ARN (RITS)

53
Q

En quoi consiste RITS?

A

Complexe enzymatique catalyse la méthylation de l’ADN à des positions génomiques complémentaires à des siRNA ou des complexes miRNA

54
Q

V ou F: une fois que le siRNA disparait, l’inhibition est arrêté

A

FAUX car l’hétérochromatine s’auto-propage

55
Q

Donner des caractéristiques des lnRNA (4)

A
  • exprimés plus faiblement que les gènes codant pour des protéines
  • expression remarquablement spécifique
  • enrichis dans le noyau
  • faible conservation de séquence
56
Q

Que sont les lncRNA intergéniques?

A

lncRNA localisés dans une région non annotée du génome

57
Q

Que sont les lncRNA antisens

A

sont des de lncRNA transcrits dans la direction opposée du gène codant dont la séquence chevauche en partie ou totalement le gène codant lui étant assoociée

58
Q

Que sont les lncRNA introniques?

A

lncRNA contenus dans un intron d’un gène codant

59
Q

Que sont les lncRNA divergents?

A

transcrits de façon divergente au promoteur d’un gène codant

60
Q

Les lncRNA peuvent influencer les gènes localisés où p/r à eux? (2)

A
  • voisins

- indépendamment de la localisation de leurs gènes cibles

61
Q

V ou F: les lncRNA ont seulement un contrôle négatif sur l’expression des gènes

A

FAUX positif ou négatif

62
Q

Quelles sont les actions possibles des lncRNA? (5)

A
  • dirigent des modificateurs de la chromatine vers un gène cible
  • déplacent des régulateurs de l’expression (activateur/répresseur) des séquences régulatrices de l’expression
  • entre en compétition des des miRNA et protègent mRNA en dégradant les miRNA
  • modulent des évènements d’épissage et interfèrent avec la traduction
  • promeuvent l’association de séquences amplificatrices et promotrices pour initier la transcription

biomol-3 (11 decks)

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