Maturation des ARNm Flashcards
Où sont transcrits et maturés les ARN eucaryotes?
noyau
Que recrute l’ARN pol sur sa queue hyperphosphorylée?
des protéines impliquées dans la maturation de l’ARN
Qu’est-ce qui est ajouté à l’extrémité 5’ de l’ARN?
coiffe
Quand est-ce que la coiffe est ajoutée?
Après que l’ARN aie une longueur de 25pb
Que contient la coiffe?
7-méthyl guanosine
Que permet la liaison inhabituelle de la coiffe en 5’?
résistance aux nucléases qui digèrent de 5’ vers 3’
Quelles sont les fonctions de la coiffe (3)?
- stabilité (protection contre exonucléases)
- facilite export de l’ARNm de cytoplasme
- stimule la traduction par les ribosomes
À quoi servent les facteurs de clivage?
Cliver pour additionner la queue poly-A
Quels sont les facteurs de clivage?
CPSF: cleavage/polyadenylation specificity factor
CstF: cleavage stimulation factor
Où sont situés les facteurs de clivage?
Portés par la queue phosphorylée de l’ARN pol
Sur quoi sont transférés les facteurs de clivage?
séquence AUAAA
Qu’est-ce qui est recruté pour synthétiser la queue poly-A?
PAP: Poly-A polymerase
À quelle extrémité se fait la polyadenylation?
3’
Où est clivé l’ARN pour former la queue poly-A?
Environ 15 nucléotides après AUAAA
Quelle est la longueur de la séquence poly-A?
200-250A
Quelles sont les fonctions de la queue poly-A (3)?
- augmenter la stabilité de l’ARN (dégradation)
- facilite exportation vers cytoplasme
- favorise traduction en identifiant ARNm matures
V ou F: les exons n’ont jamais de séquences non-codantes
FAUX: les premiers et derniers exons contiennent des séquences non-codantes 5’ et 3’
Comment nomme-t-on les séquences non-codantes des exons?
5’ UTR
3’ UTR
UTR = untranslated region
Quel gène est défectueux dans l’hémophilie?
Celui responsable de la biosynthèse du facteur VIII, responsable de la coagulation
Quelle séquence contient la fin d’un exon?
AG
Quelle séquence contient le début d’un intron?
GURAGU R=purine
Quelle séquence contient la fin d’un intron?
CAG
Quelle séquence au milieu de l’intron est nécessaire à son clivage?
Point de branchement: CTRAYY
Quelle séquence contient le début d’un exon?
G
Qu’est-ce que le site donneur?
Passage de l’exon à l’intron
Qu’est-ce que le site receveur?
Passage de l’intron à l’exon
Donner les étapes de l’épissage
- Adénine du point de branchement se lie à 5’ de l’intron et coupe le squelette sucre-phosphate
- Extrémité 5’ de l’intron se lie au A au niveau du ribose OH 2’ pour former le lasso
- Extrémité OH de 3’ de l’exon 1 réagit avec l’extrémité 5’ de l’exon 2 pour former une séquence codante continue
- dégradation du lasso
Quels snRNP interviennent dans l’épissage?
- U1
- U2
- U4
- U5
- U6
À quoi se lie U1?
possède de l’ARN complémentaire à la première jonction exon-intro et vient s’y lier
À quoi se lie U2?
séquence entourant le branch site
Quelles snRNP viennent se lier après U1 et U2?
4-5-6
Que fait U5?
force association de U1 et U2, ramène Adénine sur UAAC du branch site
Que se passe-t-il avec les snRNP suite à liaison U4-5-6 (3)?
- relâchement U1 et U4
- A du branch site attaque G en 5’ de l’intron
- formation du lasso
Que se passe-t-il avec les snRNP suite à la formation du lasso?
extrémité 3’ OH de l’exon 1 attaque le premier G de l’exon 2 en hydrolysant le lien phosphodiester avec l’intron et en ligant les 2 exons
À quoi a servi l’épissage durant l’évolution?
Apparition de nouvelle protéines
Compte-tenu du petit nombre de gènes, qu’est-ce qui explique la grande diversité des protéines chez l’humain?
Épissage alternatif
En quoi consiste l’épissage alternatif?
Épissage différent d’un transcrit primaire
Quel pourcentage des gènes humain codent un ARN qui est épissé alternativement?
60%
Qu’est-ce qui peut se produire avec les exons lors de l’épissage alternatif?
élimination ou inclusion
Donner des exemples de méthodes d’épissage alternatif (4)?
- rétention d’introns
- sites de splicing alternatifs
- promoteurs alternatifs
- polyadenylation différente
Donner un exemple de gène qui subit un épissage alternatif
alpha-tropomyosine
Que régule l’alpha tropomyosine?
Régule les interactions actine-myosine
Quels sont les différentes protéines générées par l’épissage alternatif de l’alpha tropomyosine (4)?
- muscle strié
- muscle lisse
- fibroblaste
- cerveau
Quel est le rôle de l’alpha tropomyosine dans les cellules non-musculaires?
régulation du cytosquelette
Quel mécanisme est le plus important pour différencier les protéines issues de la tropomyosine?
polyadenylation à différents endroits
V ou F: les introns ne servent jamais dans les protéines
FAUX, peuvent être conservés s’il y a présence d’un répresseur
V ou F: seuls les ARNm matures peuvent quitter le noyau
VRAI: le complexe de pores nucléaires reconnait et exporte seulement les ARNm matures
Quelles protéines signalent que l’ARN est bien mature?
- PABP: sur la queue poly-A
- Cap-binding protein: sur le Cap
- EJC (Exon junction complex): après épissage
