Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

biomol-3 > Technologies de l'ADN > Flashcards

Technologies de l'ADN Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’une nucléase?

A

Enzyme qui clive les liens phosphodiesters entre 2 nucléotides d’un ADN double brin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Qu’est-ce qu’une exonucléase?

A

Exonucléase qui clive à partir d’une extrémité

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

V ou F: Les exonucléases ne clivent que dans le sens 5’->3’

A

FAUX

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Qu’est-ce que coupe l’endonucléase?

A

Le milieu de la chaine d’acide nucléique, produisant des fragments

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Que sont les endonucléases de restriction?

A

Endonucléase qui clive en un endroit caractérisé par une séquence de nucléotides spécifique, dite de restriction

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Quelles est l’utilité naturelle des enzymes de restriction?

A

Couper l’ADN étranger (système de défense des bactéries)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Donner des exemples d’enzymes de restriction

A
  • ECOR
  • HindIII
  • HaeIII
  • BamH1
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Quel type de séquences reconnaissent les enzymes de restriction?

A

Séquences palindromiques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Quels types de bouts peuvent laisser les enzymes de restriction?

A
  • bouts francs

- bouts collants

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Quel technique permet de faire une analyse de restriction?

A

électrophorèse sur gel

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Comment se fait la séparation sur gel d’agarose?

A

ADN (-) migre vers la cathode (+)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Quel agent permet la détection sur le gel?

A

Bromure d’éthydium, fluorescent

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Que fait le bromure d’éthidium?

A

Molécule fluorescente qui s’intercale à l’intérieur de la double hélice

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Comment obtient-on un ADN recombinant?

A

Recombiner les fragments d’ADN par ligase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

V ou F: l’efficacité de ligation des bouts francs est plus faible que celle des bouts collants

A

VRAI (facteur 100)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Pourquoi la ligation est plus efficace pour les bouts collants?

A

interagissent entre eux, contrairement aux bouts francs qui doivent entrer en collision

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Comment peut-on joindre un bout franc avec un bout collant?

A
  1. dNTPS pour terminer le bout collant

2. Ajout bout franc + ligase + ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Comment peut-on perpétrer et produire l’ADN recombiant?

A

Cloning: Insérer l’ADN dans un vecteur qui peut se répliquer de façon autonome

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Qu’est-ce qu’un plasmide?

A

Cercle d’ADN bicaténaire qui peut se répliquer de façon autonome

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Que doit minimalement contenir un vecteur?

A
  • ORI (origine de réplication)
  • gène de sélection
  • site de multiclonage
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Quelles sont les étapes d’amplification du plasmide

A
  • insérer l’ADN dans le vecteur
  • transformation (insérer dans des bactéries)
  • amplification
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Quelles sont les utilités de l’ADN amplifié? (2)

A
  • préparer une grande quantité de l’insert afin de le séquencer
  • produire des protéines recombinantes (GH, insuline)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Qu’est-ce que la transformation?

A

Introduction d’un plasmide dans une souche de bactérie ou de levure

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Quelle est au mieux l’efficacité de transformation?

A

1/2000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Comment identifier les cellules qui ont reçu le plasmide?

A

Sélection avec un antibiotique (marqueur de sélection)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Dans quelle section du plasmide est inséré le gène à traduire?

A

après le promoteur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Quelle protéine permet de reconnaitre en tant réel et in vivo les cellules transformées?

A

GFP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Que permet d’étudier GFP? (3)

A
  • niveau de transcription
  • niveau de traduction
  • localisation cellulaire de protéines
  • co-localisation cellulaire
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

L’ADN polymérase a toujours besoin de quoi?

A

d’une MATRICE simple brin

30
Q

Comment se fait l’ouverture du double brin in vivo vs in vitro?

A
  • in vivo: hélicase

- in vitro: dénaturation thermique

31
Q

Quelle est la forme de la courbe de dénaturation (% selon température) ?

A

sigmoïde

32
Q

V ou F: un double brin GC se dénature à plus basse température que AT?

A

FAUX car trois liens (inverse)

33
Q

Que se passe-t-il lorsqu’on revient aux conditions normales avec l’ADN dénaturé?

A

hybridation, redevient double brin (renaturation)

34
Q

Comment se fait la polymérisation de l’ADN in vitro?

A

brin matrice + nucléotides + polymérase

35
Q

Comment est synthétisée l’amorce de brin matrice à compléter?

A

Par une machine

36
Q

Que permet la méthode Senger?

A

Détecter une mutation, par exemple

37
Q

Comment se différencie le ddNTP du dNTP?

A

ddNTP n’a pas de OH en 3’ et donc termine la chaîne

38
Q

Quelles sont les étapes (4) de la méthode de terminaison de chaine?

A

1) Séparation des brins
2) ajout des amorces, des dNTPs, des ddNTPs marqués pour détection et de la DNA polymérase
3) séparation sur gel et détection des brins synthétisés
4) lecture sur gel

39
Q

Comment est l’amorce dans la méthode de terminaison de chaine?

A
  • 15 à 30 nucléotides

- oligonucléotide complémentaire au brin d’ADN matrice

40
Q

Que veut dire ddNTP?

A

didéoxynucléotides

41
Q

Que veut dire dNTP?

A

déoxynucléotide

42
Q

Quelles sont les 3 principales étapes de la PCR?

A

1) séparation des brins (95c)
2) hybridation des amorces (55c)
3) synthèse par ADN polymérase TaqI (72c)

43
Q

Quelle polymérase utilise-t-on en pcr?

A

Taq ADN polymérase, pas dénaturée par la chaleur

44
Q

Comment sont faites les amplifications?

A

20-30 cycles de 5min chacun

45
Q

Que sont les STR?

A

Séquences répétées de 5à200 fois dans un même locus

46
Q

Quel est l’utilité des STR et VNTR en technologie?

A

DNA Fingerprinting par électrophorèse

47
Q

Qu’est-ce qu’un VNTR?

A

Séquence répétée de 10-1500fois dans un même locus

48
Q

Qu’est- ce que le polymorphisme des STR/VNTR?

A

La variabilité du nombre de séquences répétées

49
Q

Quelle est l’utilité du polymorphisme?

A

Plus facile de faire un profil génétique, distinguer l’ADN des autres

50
Q

Qu’est-ce que le SNP?

A

Single nucleotide polymorphism: polymorphisme d’un seul nucléotide

51
Q

Quel pourcentage des variations génétique représentent les SNP?

A

90%

52
Q

Quel pourcentage de l’ADN entre deux personnes est identique?

A

99.9%

53
Q

V ou F: les variations d’ADN, même si elles ne présente que 0.1% entre les individus, peuvent fortement affecter le risque de maladie

A

VRAI

54
Q

Caractéristiques des SNP en chiffres (3)

A
  • 1/300 nucléotides

- 10 million/génome

55
Q

Que permettront les SNP dans le futur?

A

Comprendre et traiter les maladies humaines

56
Q

Quelle est la différence entre un SNP et une mutation?

A
  • SNP est une variation de base d’ADN retrouvée dans >1% de la population
  • Mutation est une variation de base d’ADN retrouvée dans <1% de la population
57
Q

Que peuvent déterminer les SNP sur le cancer?

A

probabilité de l’avoir ou non

58
Q

Quels traits peuvent être déterminés par les SNP (5)?

A
  • couleur yeux et cheveux
  • performance musculaire
  • comportement social
  • susceptibilité à des maladies
  • réponse aux médicaments
59
Q

Quels sont les types de SNP?

A
  1. causatifs
    1. 1des régions codantes
    2. 2des régions non codantes
  2. liés
60
Q

Comment se caractérisent les SNP causatifs?

A

Causent un trait génétique, une maladie, une susceptibilité

61
Q

Comment se caractérisent les SNP liés?

A

Sont à proximité d’un gène causant un trait génétique, ne causent pas de traits mais sont des marqueurs

62
Q

Comment se caractérisent les SNP des régions codantes?

A

Peuvent affecter la séquence et la fonction des protéines

63
Q

Comment se caractérisent les SNP des régions non-codantes?

A

Peuvent affecter l’épissage, la régulation du gène

64
Q

Comment nomme-t-on des SNP proches les uns des autres?

A

haplotype

65
Q

Comment se définit un haplotype?

A

Ensemble de variations de l’ADN pour de polymorphismes, qui ont tendance à être hérités ensemble

66
Q

V ou F: On a besoin d’identifier un grand nombre de SNP pour identifer l’haplotype

A

FAUX, un haplotype peut contenir un grand nombre de SNP mais on a besoin d’en identifier que quelque uns.

67
Q

Qu’est-ce que le projet HapMap?

A

Carte des blocs haplotypes et les SNP spécifique qui identifient les haplotypes (DNP-Tag)

68
Q

Quel est le but du projet HapMap à court terme?

A

Réduire le nombre de SNPs requis pour examiner l’ensemble du génome pour l’association avec un phénotype (10 millions à 500k étiquettes)

69
Q

Quels sont les buts du projet HapMap à long terme (3)?

A
  • prédire la susceptibilité à des maladies
  • tests génétiques pour prédisposition à une maladie
  • offrir un traitement personnalisé
70
Q

Que réglerait la médecine personnalisée quant aux médicaments?

A

Réduire le nombre de morts ou d’effets graves à cause des médicaments

71
Q

En quoi consiste la médecine personnalisée?

A

Utilisation d’analyses moléculaires pour aider les médecins dans le choix du traitement pour qu’il soit le plus efficace dans le contexte du profile génétique et environnemental du patient

72
Q

Que pourrait permettre la médecine personnalisée quant aux tumeurs?

A

Typer les tumeurs afin d’offrir le meilleur traitement possible

biomol-3 (11 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions