Trafic membranaire Flashcards
Quelles sont les 2 voies principales de trafic membranaire intracellulaire?
- voie endosomale/dégradation
- voie de sécrétion/de biosynthèse
Quel compartiment est donneur pour l’endocytose et cible pour la sécrétion?
Membrane plasmique
V ou F: le trafic membranaire est plutôt statique
FAUX
V ou F:le cytoplasme est extrêmement dense
VRAI
Qu’est-ce qui sert d’intermédiaire de transport de molécules de chargement entre les différents compartiments?
vésicules
Avec quoi la cellule contrôle-t-elle la spécificité de transport?
des étiquettes
En quoi consiste l’exocytose?
Sécrétion (fusion à la membrane plasmique)
En quoi consiste l’endocytose?
internalisation (formation de vésicules à la membrane plasmique)
V ou F: lors de l’exocytose/endocytose, le feuillet face à la lumière devient le feuillet interne de la MP
FAUX (inverse)
Quels sont les 3 mécanismes d’internalisation à la MP?
- phagocytose
- macropinocytose
- endocytose
La phagocytose mène à la création de quel compartiment?
lysosome
De quoi dépend le pseudopode?
des filaments d’actine pour permettre la phagocytose
Qu’est-ce qui est reconnu par les macrophages et qui cause la phagocytose?
Phosphatidylsérine
V ou F: la phosphatidylsérine est normalement exposée sur le feuillet interne de la MP
VRAI
V ou F: la macropinocytose est similaire à la phagocytose mais n’inclut pas de particules fluides
FAUX, elle n’inclut pas de particules SOLIDES (ingestion de goutelettes de fluide)
V ou F: la macropinocytose et la phagocytose dépendent toutes les deux de l’actine
VRAI
Quels sont les types d’endocytose?
- dépendante de la clathrine
- dépendante de la cavéoline
- indépendante de la clathrine et de la cavéoline
Quelles sont les étapes de l’endocytose dépendante de clathrine? (4)
- recrutement de clathrine et déformation de la membrane
- Scission par la dynamine (hydrolyse de GTP)
- Vésicule mantelée de clathrine
- Perte de manteau (hydrolyse ATP)
Quelle forme a la clathrine?
Triskèle
La polymérisation de la clathrine lui donne quelle forme?
polyédrale
Par quoi est facilitée la formation d’une vésicule mantelée de clathrine?
actine
V ou F: la scission pour l’endocytose médiée par la cavéoline n’utilise pas de dynamine
FAUX
De quoi sont entourés les endosomes?
simple membrane
V ou F: au fur et à mesure que l’endosome mature, son pH diminue
VRAI
Quelles sont les principales étapes de maturation de l’endosome?
- endosome précoce
- endosome tardif
- endolysosome
- lysosome
Quelle est la fonction du lysosome?
dégradation
Par quoi est médié le transport de l’endosome précoce?
microtubule
À quelle étape peut-il y avoir formation de corps multi-vésiculaires?
endosome précoce et tardif
Donner les étapes de l’internalisation du cholestérol
- LDL se lie au récepteur
- endocytose avec clathrine
- perte du manteau
- fusion avec endosome (acidification->séparation ligand/récepteur)
- tri
(6) . transfert au lysosome et libération du cholestérol
(6) . recyclage des récepteurs par formation de vésicules
En quoi sont riches les lysosomes?
hydrolases
À quel moment les hydrolases de lysosomes peuvent-elles s’activer?
À bas pH (5)
Comment le lysosome devient-il acide?
pompe à H+ (consommation ATP)
Que sont les exosomes?
Vésicules extracellulaires qui proviennent du système endosomal (MVB)
À quel moment les exosomes sont-ils libérés?
Quand les MVB se fusionnent avec la membrane plasmique
V ou F: les lysosomes reçoivent du matériel d’une seule source
FAUX
V ou F: les lysosomes peuvent dégrader les mitochondries
VRAI
Comment nomme-t-on la dégradation des mitochondries par les lysosomes?
Mitophagie
Donner les étapes de la mitophagie
- Une membrane double se forme autour de la mitochondries
2. Fusion avec l’endosome lysosome
Comment appelle-t-on le processus général de dégradation d’une organite par un lysosome?
autophagie
V ou F: les peroxysomes font partie du système endosomal
FAUX
À quelle organite ressemblent les peroxysomes?
lysosomes
V ou F: les peroxysomes possèdent une membrane SIMPLE
VRAI
Les peroxysomes sont importants pour quoi?
Métabolisme et détoxification
Décrire physiquement les peroxysomes
- Sphérique
- Simple membrane
- Diamètre = 200-1000nm
Quel est le rôle de métabolisme du peroxysome?
Oxidation des acides gras
Quel est le rôle de détoxification du peroxysome?
Production et dégradation H2O2 et métabolisme des ROS
Donner quelques caractéristiques des enzymes du peroxysome (4)
- > 50enzymes
- ROS est la catalase la plus abondante
- synthèse des acides biliaires
- synthèse de lipides
Décrire la biogénèse des peroxysomes
- bourgeonnement du RE
- croissance
- import de protéines
- peroxysome mature
V ou F: la majorité des peroxysomes sont formés par biogénèse
FAUX la majorité sont formés par fission et croissance (comme les mitochondries)
Quelles protéines médient la fusion des membranes?
SNARE
Quelles SNARES sont sur la vésicule?
v-SNARES
Quelles SNARES sont sur la membrane cible?
t-SNARES
De quoi dépend le désassemblage des complexes v/t-SNARE?
hydrolyse de l’ATP
Donner les étapes de fusion des membranes par les protéines SNARE?
- Arrimage de la vésicule
- Coalescence des membranes
- Fusion membranaire
V ou F: Les SNARES sont toujours pareilles, peu importe quel compartiment est visé
FAUX il s’agit d’une méthode d’étiquetage
Quelle protéine permet l’attachement d’une vésicule à la membrane?
Rab-GTP
De quelle famille font partie les Rab?
superfamille Ras
Qu’est-ce qui active Rab GTP?
GEF: guanine nucleotide exchange factor
Qu’est-ce qui inactive Rab GTP?
GAP: GTPase Activating Protein
Que fait Rab sous sa forme GTP (active)?
Se lie à des protéines effectrices et permettent le trafic vésiculaire
V ou F: il n’existe qu’un seul type de protéine Rab
FAUX Rabs sont spécifiques pour la localisation intracellulaire (étiquetage/triage)
V ou F: la membrane des compartiments diffère
VRAI
Quelle est la particularité du phosphoinositide?
Anneau inositol peut être phosphorylé/ déphosphorylé sur ses positions 3,4,5 par des kinases et phosphatases
Sur quel feuillet est situé PI?
feuillet interne
V ou F: les différentes PI sont enrichies différemment sur les membranes des compartiments?
VRAI
Quelles organites inclut la voie de biosynthèse?
- RE
- golgi
Donner les principales étapes de la voie de biosynthèse/sécrétion
- passage des protéines au RER
- exportation par sécrétion à d’autres organites
Qu’est-ce qui fabrique les membranes des cellules?
RE
Qu’est-ce qui donne la rugosité au RER?
ribosomes
V ou F: le REL et le RER sont en continuité
VRAI
V ou F: le REL contient des ribosomes
FAUX
Quels sont les rôles du REL?
- synthèse lipidique
- Réservoir Ca2+ (reticulum sarcoplasmique)
V ou F: le REL est un réseau de citernes
FAUX: réseau de tubules
V ou F: le RER est un réseau de tubules
FAUX: réseau de citernes
Quels sont les rôles du RER?
- synthèse protéique
- repliement des protéines
- contrôle de qualité
- glycosylation des protéines
Que contiennent les ribosomes?
ARNs ribosomales et protéines
Quelles sont les sous-unités du ribosome?
50S et 30S
Que possèdent les protéines destinées à être sécrétées ou transmembranaires?
séquence signal “peptide signal” au N-terminal
Où dirige le peptide signal d’une protéine sur N-terminal?
RE
Quels sont les types d’étiquettes d’AA possibles (5)?
- importation RE
- rétention lumière RE
- importation mitochondries
- importation noyau
- importation peroxysome
Les protéines des ribosomes libres sont destinées où?
cytosol, ou noyau, ou mitochondries
Les protéines des ribosomes du RER sont destinées où?
sécrétion ou transmembranaire ou endomembranaire
Comment se fait la translocation d’une protéine dans le RER?
- particule de reconnaissance(SRP) se lie sur la séquence signal de la chaîne polypeptidique
- SRP est liée à un récepteur dans la membrane du RE
- La protéine est transloquée dans le canal de translocation
- clivage de la séquence signal pars une peptidase
Comment appelle-t-on le complexe protéique qui insère le polypeptide et son ribosome dans la membrane du RE?
translocon
V ou F: NH2 est dans la lumière du RE
VRAI
Les séquences de départ et d’arrêt contiennent quels types d’AA?
hydrophobes
Quelle étape de maturation des protéines importante commence dans la lumière du RE?
glycosylation des protéines
Quels sont les 2 classes majeures de glycoprotéines?
N-glycosylation
O-glycosylation
En quoi consiste la N-glycosylation?
Glucides liés au N de l’asparagine de façon co-traductionnelle
Où a lieu la N-glycosylation?
RE
En quoi consiste la O-glycosylation?
Glucides liés à O de la sérine/thréonine de façon post-traductionnelle
Où a lieu la O-glycosylation?
Golgi
Qu’est-ce qui est ajouté à l’asn lors de la N-glycosylation?
Chaîne de 14 sucres (précurseur de glycane)
Que contient le précurseur de glycane?
Glc3Man9GlcNAc2
la chaîne de sucre est transférée à l’asn comment?
Clivée du dolichol et ses 2 phosphates
Dans quelle organite se termine la glycosylation?
golgi
En quoi est enrichi l’oligosaccharides primitif (dans le RER)?
mannose
La glycosylation est importante pour quoi dans la protéine?
Son repliement
Qu’est-ce que le glucose trimming?
Coupe des glucoses pour replier correctement la protéine
Quelle chaperone replie les protéines mal repliées avec le glucose trimming?
Calnexine
Que se passe-t-il s’il y a trop de protéines mal repliées?
UPR: unfolded Protein Response: transcription des gènes de chaperons comme la calnexine
Que se passe-t-il avec les protéines anormalement repliées?
Ubiquitylation et dégradation
Quelles sont les sections de l’appareil de golgi?
série de citernes cis, médianes et trans
Que fait COPII?
transport antérograde
Que fait COPI?
transport de récupération
Quels sont les rôles de l’appareil de golgi?
- finition des protéines du RER par glycosylation
- étiquetage pour la destination finale
- triage, concentration et emballage des protéines
Que forment le RE et le golgi?
Compartiment intermédiaire RE-Golgien (ERGIC)
Quel est le chemin des vésicules entourés de COPII?
Du RE vers le cis golgien
Quel est le chemin des vésicules entourés de COPI?
Des clusters vésiculaires ou du cis-golgien vers le RE
Comment se fait le transport antérograde?
Les protéines se chargent sur les récepteurs Cargo, recrutement du manteau COPII et formation de la vésicule
Comment se fait le transport rétrograde?
Protéine résidente du RE dans le cis-golgien ou ERGIC se lie à KDEL, qui se lie au récepteur à KDEL, formation du manteau COP1 et retourne au RE
Dans quelle partie du golgi se fait le tri?
trans-golgien
Quelles particules sortent du trans-golgien?
- lysosomes
- MP
- vésicule de sécrétion
En quoi consiste la sécrétion constitutive?
Faite par toutes les cellules, sécrète des protéines solubles sécrétées en permanence
Quel est un exemple de sécrétion constitutive?
Na+/K+ ATPase: maintien de l’homéostasie
Quel type de cellules pratique la sécrétion régulée?
Les cellules sécrétoires qui reçoivent un signal extracellulaire
Quel est un exemple de sécrétion régulée?
Cellules beta du pancréas, adipocytes, neurones
Comment se fait la neurotransmission au bouton synaptique?
exocytose régulée, contre-balancée par l’endocytose
Quels sont les 2 types d’endosomes dans les cellules polarisées?
- apical
- basolatéral
Qu’est-ce que la trancytose?
endocytose de la membrane plasmique, traverse la cellule et fusionne avec la membrane plasmique basolatérale