Transcripción en eucariotas

Question 1

A qué se refiere “hebra codificante”?

Answer 1

Hebra no molde, no transcrita, codificante, sentido +, de secuencia idéntica al RNA transcrito

Question 2

A qué se refier “hebra molde”?

Answer 2

hebra molde o templado, transcrita, no codificante, antisentido o sentido -

Question 3

Porqué se dice que el proceso de transcripción eucariota es asimétrico?

Answer 3

Los genes se solapan en el DNA, y una parte de una hebra se utiliza como molde y en otra parte como codificante

Question 4

Cuál es la función de la RNA polimerasa I?

Answer 4

sintetiza los pre-rRNAs grandes (parte estructural de los ribosomas), ubicada en el nucleolo

Question 5

Cuál es la función de la RNA polimerasa II?

Answer 5

sintetiza los hnRNAs y la mayoría de snRNAs (heteronuclear, de distintos tamaños), son los pre-transcritos.

Question 6

Cuál es la función de la RNA polimerasa III?

Answer 6

sintetiza los pre-tRNAs y pre-rRNAs pequeños

Question 7

Cuál es la función de la RNA polimerasa?

Answer 7

sintetiza los rRNAs, mRNAs y tRNAs mitocondriales o cloroplásticos

Question 8

Características de la transcripción

Answer 8

la polimerasa utiliza ribonucleótidos y la síntesis va en sentido 5’->3’ (se lee al revés), utilizando iones metálicos divalentes como cofactores

Question 9

Cómo se regulan los genes de clase II en la transcripción?

Answer 9

mediante promotores y factores de transcripción

Question 10

Qué es un promotor basal?

Answer 10

secuencias muy próximos al origen que determinan el punto de inicio. Pueden contener a la caja TATA (-20,-30), o no contenerla (24,30)

Question 11

caja TATA

Answer 11

sitio de unión de factores como TBP y parte del promotor basal

Question 12

InR

Answer 12

motivo iniciador, este incluye al punto de inicio de la transcripción. Su secuencia es YYANYY.

Question 13

Qué es un promotor proximal?

Answer 13

Son elementos dispersos próximos al origen, que determinan la frecuencia del inicio. Se distribuyen entre -50 y -200

Question 14

Qué son los elementos distales?

Answer 14

Están próximos entre sí, pero alejados del origen, regulan la eficiencia del inicio de la transcripción. Se distribuyen en un margen de 100pb

Question 15

Qué es un potenciador o enhancer?

Answer 15

son factores de transcripción que aumentan la expresión de ciertos genes mediante la unión de proteínas.

Question 16

Qué es un silenciador?

Answer 16

son factores que reprimen la expresión de ciertos genes mediante la unión de proteínas

Question 17

Qué es un insulador?

Answer 17

Factores que bloquean el efecto de un enhancer, puede activar o suprimir la transcripción de un gen. Se une a ICR (imprinting control region)

Question 18

Cuáles son las maneras en las que se pueden activar los factores de transcripción?

Answer 18

por una proteína activadora, dosforilación, desfosforilación, unión con ligando, liberación por inhibidor, cambio de pareja, corte de proteína

Question 19

Cuáles son motivos proteicos comunes de factores?

Answer 19

Dedo de Zn, homodominio de 3 α-héñices y cierres de leucinas

Question 20

Cuáles son los factores de transcripción para los genes I, II y III?

Answer 20

TFI, II y III, respectivamente (transcription factor)

Question 21

Cómo se inicia la transcripción en genes de tipo I?

Answer 21

SL1 atrae a la TBP al DNA junto a UBF1 para que se una la RNA polimerasa I

Question 22

Cómo se inicia la transcripción en genes de tipo III?

Answer 22

la TBP recluta a TFIIIB al DNA junto a TFIIIC para que se una la RNA polimerasa III

Question 23

Cómo se inicia la transcripción en genes de tipo II?

Answer 23

los factores se ensamblan en un complejo de iniciación, en la secuencia TFIID, A, B, F, E y H/J

Question 24

Cuál es la función de TFIID?

Answer 24

Se une a la caja TATA en el DNA

Question 25

Cuál es la función de TFIIA?

Answer 25

Se une río arriba de la TFIID (-50,-40) y estabiliza su unión al DNA

Question 26

Cuál es la función de TFIIB?

Answer 26

Se une río abajo de Cuál es la función de TFIID y define el sitio de inicio de la transcripción al unir a la polimerasa II

Question 27

Cuál es la función de TFIIF?

Answer 27

Forma un complejo con la RNA polimerasa II y aumenta su afinidad con el promotor

Question 28

Cuál es la función de TFIIE?

Answer 28

Se une a la polimerasa II y modula la actividad de TFIIH

Question 29

Cuál es la función de TFIIH/J?

Answer 29

Helicasa

Question 30

Cómo termina la transcripción?

Answer 30

la RNA polimerasa alcanza las secuencia de término, se interrumpe la síntesis y se desacopla del DNA

Question 31

Cómo termina la transcripción en genes de clase I?

Answer 31

A través de una proteína terminadora

Question 32

Cómo termina la transcripción en genes de clase II?

Answer 32

A través de una proteína terminadora

Question 33

Cómo termina la transcripción en genes de clase III?

Answer 33

Se alcanzan secuencias específicas ricas en timina que desacopla a la polimerasa.

Question 34

Cómo se regulan los genes de clase I?

Answer 34

Donde la UBF se y une a UPE (upstream promoter element), que enrolla al DNA, y la SL-1 se une al promotor proximal,

Question 35

Cómo se regulan los genes de clase III?

Answer 35

En los que los promotores usan TFIIIA/C, se desplazan a la polimerasa III río arriba. Los que usan TFIIIC unen a la polimerasa III en las cajas A y B.