Transcripción en eucariotas Flashcards
A qué se refiere “hebra codificante”?
Hebra no molde, no transcrita, codificante, sentido +, de secuencia idéntica al RNA transcrito
A qué se refier “hebra molde”?
hebra molde o templado, transcrita, no codificante, antisentido o sentido -
Porqué se dice que el proceso de transcripción eucariota es asimétrico?
Los genes se solapan en el DNA, y una parte de una hebra se utiliza como molde y en otra parte como codificante
Cuál es la función de la RNA polimerasa I?
sintetiza los pre-rRNAs grandes (parte estructural de los ribosomas), ubicada en el nucleolo
Cuál es la función de la RNA polimerasa II?
sintetiza los hnRNAs y la mayoría de snRNAs (heteronuclear, de distintos tamaños), son los pre-transcritos.
Cuál es la función de la RNA polimerasa III?
sintetiza los pre-tRNAs y pre-rRNAs pequeños
Cuál es la función de la RNA polimerasa?
sintetiza los rRNAs, mRNAs y tRNAs mitocondriales o cloroplásticos
Características de la transcripción
la polimerasa utiliza ribonucleótidos y la síntesis va en sentido 5’->3’ (se lee al revés), utilizando iones metálicos divalentes como cofactores
Cómo se regulan los genes de clase II en la transcripción?
mediante promotores y factores de transcripción
Qué es un promotor basal?
secuencias muy próximos al origen que determinan el punto de inicio. Pueden contener a la caja TATA (-20,-30), o no contenerla (24,30)
caja TATA
sitio de unión de factores como TBP y parte del promotor basal
InR
motivo iniciador, este incluye al punto de inicio de la transcripción. Su secuencia es YYANYY.
Qué es un promotor proximal?
Son elementos dispersos próximos al origen, que determinan la frecuencia del inicio. Se distribuyen entre -50 y -200
Qué son los elementos distales?
Están próximos entre sí, pero alejados del origen, regulan la eficiencia del inicio de la transcripción. Se distribuyen en un margen de 100pb
Qué es un potenciador o enhancer?
son factores de transcripción que aumentan la expresión de ciertos genes mediante la unión de proteínas.
Qué es un silenciador?
son factores que reprimen la expresión de ciertos genes mediante la unión de proteínas
Qué es un insulador?
Factores que bloquean el efecto de un enhancer, puede activar o suprimir la transcripción de un gen. Se une a ICR (imprinting control region)
Cuáles son las maneras en las que se pueden activar los factores de transcripción?
por una proteína activadora, dosforilación, desfosforilación, unión con ligando, liberación por inhibidor, cambio de pareja, corte de proteína
Cuáles son motivos proteicos comunes de factores?
Dedo de Zn, homodominio de 3 α-héñices y cierres de leucinas
Cuáles son los factores de transcripción para los genes I, II y III?
TFI, II y III, respectivamente (transcription factor)
Cómo se inicia la transcripción en genes de tipo I?
SL1 atrae a la TBP al DNA junto a UBF1 para que se una la RNA polimerasa I
Cómo se inicia la transcripción en genes de tipo III?
la TBP recluta a TFIIIB al DNA junto a TFIIIC para que se una la RNA polimerasa III
Cómo se inicia la transcripción en genes de tipo II?
los factores se ensamblan en un complejo de iniciación, en la secuencia TFIID, A, B, F, E y H/J
Cuál es la función de TFIID?
Se une a la caja TATA en el DNA
Cuál es la función de TFIIA?
Se une río arriba de la TFIID (-50,-40) y estabiliza su unión al DNA
Cuál es la función de TFIIB?
Se une río abajo de Cuál es la función de TFIID y define el sitio de inicio de la transcripción al unir a la polimerasa II
Cuál es la función de TFIIF?
Forma un complejo con la RNA polimerasa II y aumenta su afinidad con el promotor
Cuál es la función de TFIIE?
Se une a la polimerasa II y modula la actividad de TFIIH
Cuál es la función de TFIIH/J?
Helicasa
Cómo termina la transcripción?
la RNA polimerasa alcanza las secuencia de término, se interrumpe la síntesis y se desacopla del DNA
Cómo termina la transcripción en genes de clase I?
A través de una proteína terminadora
Cómo termina la transcripción en genes de clase II?
A través de una proteína terminadora
Cómo termina la transcripción en genes de clase III?
Se alcanzan secuencias específicas ricas en timina que desacopla a la polimerasa.
Cómo se regulan los genes de clase I?
Donde la UBF se y une a UPE (upstream promoter element), que enrolla al DNA, y la SL-1 se une al promotor proximal,
Cómo se regulan los genes de clase III?
En los que los promotores usan TFIIIA/C, se desplazan a la polimerasa III río arriba. Los que usan TFIIIC unen a la polimerasa III en las cajas A y B.
