Técnicas en biología molecular Flashcards

1
Q

por qué se purifica el DNA?

A
  • detectar y cuantificar
  • clonar genes y crear DNA recombinante
  • secuenciación
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Q

por qué se se purifica RNA?

A

para el análisis de genes que se transcriben

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3
Q

Cómo se extraen los plasmidios

A

por lisis alcalina

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4
Q

EDTA

A

agente quelante que secuestra Mg+2

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5
Q

SDS

A

detergente que rompe membranas y denatura proteínas

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6
Q

para qué se utiliza el NaOH?

A

generar un gradiente de iones

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7
Q

fenol

A

agente corrosivo que denatura proteínas

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8
Q

KAc

A

aumenta la salinidad y precipita proteínas

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9
Q

para qué se utliza alcohol?

A

para precipitar al DNA

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10
Q

cómo se extrae el RNA?

A

método de chomczinsky y Sacchi (extracción ácida)
rompe la célula manteniendo la integridad del RNA

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11
Q

de qué maneras se puede secuenciar el DNA?

A

método químico o enzimático

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12
Q

En qué consiste la secuenciación por el método químico?

A

Se separa la muestra de DNA y se les elimina las bases por separado, y luego se les corta los enlaces fosfodiéster a ambos lados, dejando al fragmento marcado en el fosfato al extremo, hasta producir ~1 corte por hebra, representando las posiciones de cada base

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13
Q

En qué consiste la secuenciación por el método enzimático?

A

Se agregan diferentes dNTPs para marcar fragmentos de DNA en los extremos, uno para cada base.

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14
Q

PCR

A

reacción de polimerasa en cadena, es la amplificación enzimática de una muestra de DNA a traves de la manipulación de la t°

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15
Q

En qué consiste un PCR?

A

El DNA se denatura a altas t°, se hibrida con los partidores específicos y se sintetiza la hebra complementaria

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16
Q

Qué se requiere para realizar un PCR?

A

una molécula molde, primers, dNTPs y una DNA polimerasa termoestable

17
Q

PCR en gradiante

A

Se optimiza la reacción para establecer una mejor t° de hibridación

18
Q

PCR Hot-start

A

Se inactiva a la polimerasa a bajas t°, químicamente o con anticuerpos

19
Q

touchdown PCR

A

Se parte con alta t° de hibridación de partidores, y se va bajando cada ciclo hasta alcanzar la t° óptima

20
Q

RT - PCR

A

Se parte con mRNA y se utiliza una transcriptasa reversa para fabricar una hebra complementaria de DNA que luego se utiliza

21
Q

PRC anidado

A

Se utilizan 2 parejas de primers, unos externos y otros internos, es el PCR de un PCR.

22
Q

PCR con adición de adaptadores

A

se añaden adaptadores a los extremos de una muestra de secuencia desconocida

23
Q

PCR inverso

A

Solo se conoce una secuencia específica de la muestra, que se corta y se pega de manera que las partes conocidas queden en los extremos

24
Q

PCR en tiempo real

A

se monitorea con fluorescencia cada ciclo de amplificación en un termociclador que detecta fluorescencia

25
Q

Qué tipo de PCR se utiliza cuando se tiene primers desconocidos?

A

PCR en gradiante

26
Q

Qué tipo de PCR se utiliza para evitar productos inespecíficos?

A

PCR hot start

27
Q

Qué tipo de PCR se utiliza cuando los partidores fueron diseñados a partir de proteínas o para otra especie?

A

PCR touchdown

28
Q

Qué tipo de PCR se utiliza cuando se quiere eliminar inhibidores dela muestra?

A

PCR anidado

29
Q

Qué tipo de PCR se utiliza cuando solo se conoce una región pequeña de la secuendia de la muestra molde?

A

PCR inverso

30
Q

Qué tipo de PCR se utiliza si se requiere más presición?

A

PCR en tiempo real