Procesamiento del mRNA Flashcards
El splicing o edición del producto de la transcripción solo ocurre en genes de clase II
Dónde ocurre el procesamiento del mRNA en eucariotas?
en el núcleo de la célula
En qué consiste el procesamiento del mRNA?
en la modificación para ser transportado al citoplasma
Splicing
corte de intrones mediante ribonucleoproteínas que se unen en los extremos del los intrones formando un lazo
Cómo saben dónde cortar las proteínas en el corte y empalme?
los intrón tienen secuencias señales en los límites, GU de inicio, y AG de término. Con el sitio de ramificación (PYNPPPAP)
Qué proteínas procesan al mRNA?
El spliceosoma es un complejo de proteínas y RNA
Cuál es la función de la proteína U1?
define el sitio de splicing en 5’
Cuál es la función de la proteína BBP?
(branch point binding protein) reconoce y se une al sitio de ramificación del intrón
Cuál es la función de la proteína U2AF?
unirse al sitio de empalme en la secuencia PY en 3’
Cuál es la función de las proteínas SR?
Definen el sitio de splicing en 5’ y forman un puente entre los complejos de proteínas en 5’ y 3’, donde hay interacciones a través del intrón o exón, y estas se intercambian para unir los extremos del intrón
Cuál es la función de U2?
Se une al sitio de ramificación para formar el lazo con U1
Cuál es la función de U6 y U5?
forman el centro catalítico del spliceosoma, donde U6 se une al sitio de ramificación en 5’ a U2 y U5 interactúa con ambos exones, formando el lazo y cortando el sitio de empalme en 5’ y 3’ (los exones quedan ligados)
Cuáles son los tipos de splicing alternativo?
- Retención del intrón
- y 3. sitios de empalme alternativos en 5’ y 3’
- inclusión/exclusión de exones
- exones mutuamente exclusivos
- selección combinatoria de exones
- empalme alternativo de promotor
- splicing alternativo de poliadenilación
Cómo se regula el splicing?
- las proteínas SR unen a los ESEs (exonic splicing enhancers) que reclutan a los factores en los sitios de empalme
- Enzimas NOVA/FOX
- enhancers/silenciadores (incluye todo)
En qué consiste la preparación del extremo 5’ del mRNA?
En la adición de guanina metilada al extremo 5’
Por qué se añade el CAP?
- para proteger al mRNA
- dirigirlo para ser procesado
- regular la síntesis de proteínas
RNA triofosfatasa
desfosforila el extremo 5’ del transcrito
RNA guanililtransferasa
guanilación
2’ O-guaninametiltransferasa
metila la ribosa
En qué consiste la preparación del extremo 3’?
Adición de una cola de adenosinas al final de la transcripción
CPFS
cleavage and polyadenylation factor, estimula el corte y la polyadenilación
CsTF
libera al mRNA, reclutando a PAP
PAP
polimerasa poli(A), añade adeninas
PABP
se une a las adeninas para protegerlas
Qué es la epigenética?
control de la expresión de secuencias sin cambiar al DNA directamente
Cuáles son los mecanismos de control epigenético?
- Metilación del DNA-citosina
- modificación post-traduccional de histonas
- remodelación de los complejos de cromatina
- RNA no codificantes
En qué consiste la metilación del DNA?
la metilación en los islotes Cp6 bloquea la unión de factores y transcripción
En qué consiste la modificación post-traduccional de histonas?
Al acetilar las histonas, se sueltan del DNA y permite la transcripción de esos genes
Qué regulan los miRNA?
la traducción
En qué procesos están involucrados los lncRNA?
5’ capping, modificación de cromatina, como componente estructural, splicing en la formación de paraspeckles
Cuál es la función de de los circRNAs?
Forman esponjas que asisten en el transporte
