traduction Flashcards
codon stop et met
met : AUG
stop : UAA, UAG, UGA
mutation synonyme et non synonyme
Cette redondance (dégénérescence) diminue l’effet des mutations sur la séquence protéique. Elle peut conduire à une mutation synonyme (code pour le même acide aminé) ou une mutation non synonyme (acide aminé de nature équivalente, même classe d’acide aminé par ex deux aliphatique).
transition et transversion
transition: remplacement entre deux bases Y ou R
transversion : remplacement d’une Y par une R ou inv
2 classes d’AA-ARNt-synthétases :
- Classe I (monomérique) :
AA en position 2’ de l’ARNt
Besoin ensuite d’une trans-estérification pour repositionner l’AA en 3’. - Classe II (di- ou tétramérique) :
AA en position 3’ de l’ARNt
ribosome
Une particule de 30 nm de diamètre
Très peu évolué au cours évolution.
-> Synthèse protéique
Dans le bon cadre de lecture
=> ATTENTION : Assemblage que sur ARNm
Site A -> Aminoacyl-ARNt
Site P -> peptidyl-ARNt
Site E -> ARNt non chargé, Exit
- Bactéries (ribosome 70S)
La petite sous-unité (30 S)
La grande sous-unité (50 S). - Eucaryotes (ribosome 80S) Synthèse sous-unités dans le nucléole La petite sous-unité (40 S) La grande sous-unité (60 S).
Les polyribosomes bactériens
co trad
Un ARNm en cours de synthèse est traduit par un ensemble de
ribosomes présentant une structure linéaire, le polyribosome.
L’intérêt de cette structure linéaire des polyribosomes est de
localiser toutes les protéines codées par un même opéron
(l’ARNm est dit polycistronique) au même endroit dans la
cellule
Les polyribosomes eucaryotes
post trad
La transcription et la traduction sont dissociées car la
transcription a lieu dans le noyau et la traduction dans le cytosol.
Les polyribosomes vont s’enrouler en spirale due aux interactions
entre le complexe de coiffe et les PABP. Cette structure est
indispensable pour le recyclage des ribosomes qui parcourent
l’ARNm, dit monocistronique. En effet, le ribosome qui termine
de traduire l’ARNm en 3’ et qui se dissocie, sera moins loin du
site d’initiation pour recommencer à traduire ce même ARNm.
Initiation (1 GTP) pro
1- Le complexe SU 30S / IF1 / IF3 reconnaît la séquence RBS Shine-Dalgarno située en amont d’un codon démarrage AUG par association ARNr 16S-ARNm.
IF2(GTP) associé à fMet-ARNti se positionne sur AUG.
2- Libération IF3, glissement de SU 30S pour positionner le site P sous AUG.
3- Recrutement SU 50S, GTP hydrolysé et facteurs d’initiation libérés (IF1 et IF2).
1. Streptomycine à forte concentration (procaryotes)
Se lie à la sous-unité 30S du ribosome (site P) et empêche l’interaction de fMet-ARNt avec le ribosome.
2. Linézolide (procaryotes)
Se lie dans le site A de la sous-unité 50S pour bloquer la phase d’assemblage du ribosome.
Elongation et translocation (2 GTP) pro
Sur l’ARNm, le ribosome se déplace de 5’ vers 3’; donc la partie N-term de la protéine est synthétisée en premier.
1- 2ème AA-ARNt couplé à EFTu-GTP sur site A. GTP hydrolysé (si bon appariement).
Régénération de EF-Tu grâce à EF-Ts.
2- Glissement SU 50S. Formation liaison peptidique (activité peptidyl transférase) du site P vers le site A (alors que la réaction s’effectue du site A vers le site P).
3- Translocation ribosome impliquant le facteur EF-G (GTP) fixé sur site A. GTP
hydrolysé. Ejection ARNt libre. Arrivée nouvel AA-ARNt.
3. Erythromycine (procaryotes)
Bloque la sortie de la chaîne peptidique (blocage de la translocation).
4. Chloramphénicol (procaryotes)
Inhibe l’activité peptidyl-transférase de l’ARNr 23S.
5. Cycloheximide (eucaryotes)
Inhibe l’activité peptidyl-transférase de l’ARNr 28S.
6. Acide fusidique (procaryotes)
Bloque l’activité GTPase et donc la dissociation de EF-G.
Terminaison (1 GTP) pro
1- Codon de terminaison sur site A. Recrutement RF1 (codons UAA, UAG) ou RF2 (codons UAA, UGA) et RF3(GTP).
2- Hydrolyse liaison entre polypeptide et ARNt. Libération chaîne peptidique.
3- Hydrolyse GTP (du codon stop). Dissociation du ribosome.
1. Tétracyclines (procaryotes)
Empêchent la présentation de l’anticodon dans le site A (bactériostatique).
2. Streptomycine à faible concentration (procaryotes)
Perturbe le Wobble et entraîne des erreurs (site A), ce qui conduit à la mort de la bactérie (bactériolytique).
Initiation (2 GTP) euc
La Met de départ est non formylée.
1)L’ARNm est préparé avec eIF4 et le CBC sur la coiffe en 5’. Ça c’est pour la protection et l’export du noyau.
2)La petite sous-unité ribosomale (40S) se fixe sur l’ARNm avec les facteurs eIF3, eIF2(GTP) et l’ARNti (qui porte la Met).
3)Le complexe 40S/ARNti/eIF3/eIF2(GTP) scanne l’ARNm jusqu’à trouver le codon AUG (séquence Kozak).
4)Une fois le codon AUG trouvé, la grande sous-unité (60S) se fixe, les GTP sont hydrolysés, et les facteurs d’initiation sont libérés
