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UE2 > ADN > Flashcards

ADN Flashcards

1
Q

A

A

Adénine (6-aminopurine)

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2
Q

les oses sont l ou d et α ou β

A

lévogyre et β

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3
Q

G

A

Guanine (2-amino-6-oxypurine)

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4
Q

T

A

Thymine (5-méthyl-2,4-dioxy pyrimidine)

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5
Q

C

A

Cytosine (4-amino-2-oxy pyrimidine)

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6
Q

U

A

Uracile (2,4-dioxypyrimidine)

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7
Q

(bactéries) : protège génome contre
attaque des bactériophages.

A

N6 -méthyladénine

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8
Q

méthylation génome humain

A

5-méthylcytosine (eucaryotes) : dans le génome humain,
la cytosine n’est méthylée que si suivie d’une guanine (motif CpG)

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9
Q

qu’elle est l’alkylation la plus fréquente

A

L’alkylation la plus fréquente est la méthylation en position O6 de la guanine (O6 -méthylguanine). Cette méthylation induit des défauts d’appariements dans les acides nucléiques.

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10
Q

les méthyl-xanthines, produits de dégradation d’alcaloïdes végétaux

A
  • 1,3-diméthylxanthine : théophylline (thé)
  • 3,7-diméthylxanthine : théobromine (cacao)
  • 1,3,7-triméthylxanthine : caféine (café)
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11
Q

site un analogue synthétique antimétabolite (anticancéreux)

A

Le 5-fluoro-uracile est un antimétabolite (anticancéreux).
Il compromet la polymérisation du génome des cellules cancéreuses.

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12
Q

les deux équilibre tautomérique + faveur de

A
  • A et C : Formes aminées et iminées
  • G, T et U : Formes cétoniques et énoliques

L’équilibre est largement en faveur des formes lactames (aminées et cétoniques) par rapport aux formes
lactimes (iminées et énoliques).

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13
Q

Pseudo-uridine

A

C’EST UN NUCLEOSIDE MODIFIER ET NON UNE BASE MODIFIEE

Pseudo-uridine (ψ)
Il s’agit d’une base liée à un ribose par le C5 (et non N1). La modification a lieu après la synthèse de l’ARN (au cours de la maturation).
On trouve la pseudo-uridine dans tous les types d’ARN sauf les ARNm.

CREATION D’UNE LIAISON C OSIDIQUE

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14
Q

méthode lutte contre herpès-virus

A

C’est la (2-hydroxyéthoxyl)-9-méthylguanine.
Cet analogue comporte uniquement une structure partielle de nucléoside car le sucre est remplacé par une chaîne linéaire.

L’herpès-virus en phase réplicative va transformer cet analogue (qui est en excès) par phosphorylation (kinase) en acyclo-GTP afin de l’utiliser dans sa réplication et lors de l’incorporation, il y aura terminaison de chaîne et sa réplication va être stoppée.

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15
Q

Forme B

A

forme B quand tout va Bien

C’est la forme naturelle dans les conditions physiologiques.
- Hélice droite
- Plan des bases perpendiculaire à l’axe
- 2 sillons profonds : majeur et mineur
- 10 paires de nucléotides par tour : 34 Å
- Oses en conformation C2’-endo/anti.

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16
Q

Forme A

A

forme A quand tu as souAf ou quand ya bcp de cAtion ou avec Arn

Forme observée en présence d’une importante concentration en cations, ou en cas de déshydratation ou
avec l’ARN lors de la transcription.
- Hélice droite
- 11 paires de nucléotides par tour : 26 à 28 Å
- Sillon étroit, profond et inaccessible, l’autre large et superficiel
- Plan des bases légèrement incliné par rapport au plan de l’hélice B
- Oses en conformation C3’- endo/anti

17
Q

Forme Z

A

forme Z elle est biZare : hélice gauche ?!??

Forme observée sur les portions d’ADN riche en séquences G et C
alternées (GCGCGCGC).
- Hélice gauche
- Plan des bases perpendiculaires à l’axe de l’hélice
- 12 paires de nucléotides par tour (45 Å)
- Un seul type de sillon, profond
- Alternance de nucléotides à base purine (C3’-endo/syn) et à
base pyrimidine (C2’-endo/anti).

18
Q

action cisplatine

A

Le cisplatine (agent alcalisant), un anticancéreux, peut se fixer sur des guanines, former des
adduits et perturber la structure de la double hélice d’ADN et donc les phénomènes de
réplication, de transcription, …

19
Q

quel est le nom du nucléoside de lorsqu’il est dans ARN ou l’ADN de la thymine

et le nom du nucléotide

A

ARN : ribothymidine
ADN : thymidine

ARN : Thymidylate ou thymidine 5’monophosphate

20
Q

Dihydro-uridine (D)

Puromycine

Azidothymidine (AZT)

A

Ce sont TOUS des analogue de nucléosides cda des nucléosides modifiés

saturation complète du cycle pyrimidine par hydrogénation. On la trouve surtout dans les ARNt (aussi dans les ARNr) => DONC JAMAIS DANS L’ARNm

antibiotique produit naturellement par Streptomyces

antirétroviral prescrit dans les thérapies anti-HIV.

21
Q

utilité : ATP, UTP, GTP, CTP

A

ATP : source centrale d’énergie cellulaire

UTP : source d’énergie dans le métabolisme glucidique (voie du galactose)

GTP : source d’énergie pour la synthèse protéique (traduction)

CTP : source d’énergie pour les synthèses lipidiques.

22
Q

quelles sont les nucléotides contenant un pont phosphodiester INTRAmoléculaire

A

AMPc et GMPc

Ce sont des seconds messagers intracellulaires.
Le sucre est estérifié 2 fois par le même phosphate (en 3’-5’)

23
Q

exemple de nucléotide modifié :

1) acide aminé « activé » pour pouvoir être transféré sur un ARN de transfert

2) substrat de la glycogène synthase

A

1) l’aminoacyl-AMP
2) l’UDP-glucose

24
Q

quel est le type de liaison dans l’acide nucléiques

quel est sont sens de lecture

quel est l’orientation des liaisons phosphodiester

A

liaisons phosphodiesters intErmoléculaires

Convention lecture Sens 5’P-3’OH: la chaîne est lue en partant de l’extrémité 5’ (phosphate libre) vers l’extrémité 3’ (groupe hydroxyle libre).

mais les liaisons phosphodiester relient chaque nucléotide dans l’orientation 3’ vers 5’ : Une liaison phosphodiester se forme entre le groupe hydroxyle en 3’ d’un nucléotide et le groupe phosphate en 5’ du nucléotide suivant. Cela crée un lien 3’–5’ entre chaque paire de nucléotides.

25
Q

siter les quatre appariement de Wobble

A

ARNt : I et ARNm : C

ARNt : I et ARNm : A

ARNt : I et ARNm : U

ARNt ou ARNm : G et ARNt ou ARNm : U

26
Q

formule Tm (= point de fusion = point de demi dénaturation) + de quoi dpt

A

Tm (°C) = 69,5 + 0,41 (% GC)

La Tm dépend de la longueur du fragment d’ADN, de sa composition en bases (proportion de liaisons H), de la présence de certains ions dans le milieu (la prof de fac dit: dpt force ionique).

27
Q

pH de l’ hydrolyse complète des acides nucléiques (rupture des liaisons osidiques
et ester phosphates) + qui est plus sensible à pH extreme basique et qui est plus sensible à pH extrene acide

A

pH = 1

L’ARN est plus sensible à l’hydrolyse basique que l’ADN (car l’hydroxyle en C5 s’expose plus à une attaque nucléophile) mais la sensibilité est la même à pH acide

28
Q

la desamination oxydative c plus pour les base purine ou pyrimidines

ph de la création spontané des AP

par quoi est réparer l’alkilation la plus fréquente (06-méthyl-guanine)

longueur onde abs max

A

100 * + pyrimidine

pH=4

MGMT car ca créer un mesapareillment

260nm

UE2 (10 decks)

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