Traduction Flashcards

1
Q

Question : Quels sont les codons signaux de la traduction ?
(initiateur et STOP)

A

AUG : codon initiateur (méthionine).

UAA, UAG, UGA : codons stop.

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2
Q

Question : Quelle est la différence entre ARNm procaryote et eucaryote ?

A

Procaryote : ARNm polycistronique, séquence Shine-Dalgarno pour le positionnement du ribosome.
Eucaryote : ARNm monocistronique, positionnement via la coiffe et scanning, séquence Kozak autour du codon initiateur.

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3
Q

Question : Qu’est-ce que le wobble ?

A

Réponse : La flexibilité d’appariement entre la 3ème base du codon et la 1ère base de l’anticodon, permettant à un ARNt de reconnaître plusieurs codons.

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4
Q

Question : Quelles sont les deux sous-unités du ribosome et leurs fonctions ?

A

Petite sous-unité : centre de décodage, assure la reconnaissance codon-anticodon.
Grande sous-unité : catalyse les liaisons peptidiques.

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5
Q

Question : Quels sont les trois sites principaux du ribosome ?

A

Site A (Aminoacyl) : lie l’aminoacyl-ARNt entrant.
Site P (Peptidyl) : lie le peptidyl-ARNt en élongation.
Site E (Exit) : libère l’ARNt déchargé.

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6
Q

Question : Quelles sont les étapes de l’élongation de la traduction ?

A

Réponse :

Entrée d’un aminoacyl-ARNt dans le site A (assisté par EF-Tu/eEF1).

Formation de la liaison peptidique.

Translocation du ribosome avec EF-G/eEF2 (déplacement des ARNt).

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7
Q

Question : Qu’est-ce qu’un polysome ?

A

Réponse : Ensemble de plusieurs ribosomes traduisant simultanément le même ARNm, augmentant l’efficacité de production des protéines.

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8
Q

Question : Quels sont les facteurs impliqués dans l’initiation de la traduction chez les eucaryotes ?

A

Réponse :

eIF1 et eIF1A : Positionnent correctement l’ARNt initiateur et empêchent une liaison erronée dans le site A.
eIF2 (GTPase) : Lie l’ARNt initiateur chargé au site P.
eIF3 : Stabilise la petite sous-unité et interagit avec les autres facteurs.
eIF4F (complexe) : Recrute l’ARNm via sa coiffe 5’.
eIF4E : Reconnaît la coiffe.
eIF4G : Lie eIF4E et les autres facteurs.
eIF4A (hélicase) : Défais les structures secondaires de l’ARNm.
eIF4B : Active l’hélicase eIF4A.
eIF5B (GTPase) : Recrute la grande sous-unité ribosomique (60S).

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9
Q

Question : Quels sont les facteurs nécessaires à la circularisation de l’ARNm eucaryote ?

A

eIF4G : Interagit avec la queue poly-A via PABP.

PABP (PolyA Binding Protein) : Stabilise l’interaction entre la coiffe 5’ et la queue poly-A.

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10
Q

Question : Quel est l’ordre d’intervention des facteurs d’initiation chez les procaryotes ?

A

IF3 : Se fixe sur la petite sous-unité (30S) pour empêcher son association avec la grande sous-unité.

IF1 : Bloque le site A pour éviter une liaison prématurée d’un ARNt.

IF2-GTP : Stabilise l’ARNt initiateur (fMet-ARNti) dans le site P.

Une fois le complexe formé, IF3 quitte pour permettre l’association de la grande sous-unité (50S).

Hydrolyse de GTP par IF2 entraîne son départ et libère le ribosome complet (70S).

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11
Q

Question : Quel est l’ordre d’intervention des facteurs d’initiation chez les eucaryotes ?

A

eIF1 et eIF1A : Positionnent correctement l’ARNt initiateur et bloquent les sites A et E de la petite sous-unité (40S).

eIF3 : Stabilise la petite sous-unité et interagit avec les autres facteurs.

eIF2-GTP : Lie l’ARNt initiateur chargé (Met-ARNti) au site P.

eIF4F : Recrute l’ARNm via la coiffe 5’.

eIF4E : Se lie à la coiffe.

eIF4G : Agit comme plateforme de liaison.

eIF4A (hélicase) : Défais les structures secondaires de l’ARNm.

eIF4B : Active l’hélicase eIF4A.
eIF5B-GTP : Recrute la grande sous-unité (60S) après reconnaissance du codon initiateur (AUG).

Hydrolyse de GTP par eIF2 et eIF5B entraîne leur départ et libère le ribosome complet (80S).

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12
Q

Question : Quel est l’ordre d’intervention des facteurs pendant l’élongation ?

A

Réponse :

EF-Tu-GTP (procaryote) / eEF1A-GTP (eucaryote) : Amène l’aminoacyl-ARNt au site A.
Si appariement correct, hydrolyse de GTP par EF-Tu/eEF1A.
EF-Tu/eEF1A quitte, et le ribosome catalyse la liaison peptidique.
EF-G-GTP (procaryote) / eEF2-GTP (eucaryote) : Facilite la translocation du ribosome en hydrolysant GTP.

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13
Q

Question : Quel est l’ordre d’intervention des facteurs pendant la terminaison chez les procaryotes ?

A

Réponse :

RF1 ou RF2 : Reconnaît le codon stop et catalyse la libération de la chaîne polypeptidique.
RF3-GTP : Facilite la dissociation de RF1/RF2 après hydrolyse de GTP.
RRF : Mime un ARNt pour déloger les sous-unités ribosomiques.
EF-G-GTP : Aide à expulser les ARNt restants et à dissocier les sous-unités.
IF3 : Stabilise la petite sous-unité pour une nouvelle traduction.

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14
Q

Question : Quels facteurs recyclent les ribosomes après la terminaison chez les procaryotes ?

A

Réponse :

RRF : Se lie au site A pour imiter un ARNt.
EF-G-GTP : Aide à expulser les ARNt restants et à dissocier les sous-unités.
IF3 : Stabilise la petite sous-unité et prépare une nouvelle traduction.

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15
Q

Question : Quelles sont les étapes principales du Western Blot ?

A

Réponse :

Séparation des protéines : SDS-PAGE pour séparer selon la masse moléculaire.
Transfert sur membrane : Déplacement des protéines sur une membrane (nitrocellulose ou nylon).
Ajout des anticorps : Liaison d’un anticorps primaire (spécifique) et secondaire (amplification).
Révélation et analyse : Visualisation des bandes correspondant à la protéine cible.

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