Thème 3 : génétique Flashcards
kognity
Génome
le « plan » complet de l’ADN d’un organisme
Un gène
un facteur héréditaire constitué d’une longueur d’ADN et qui influence une caractéristique spécifique
Mutations
changements dans la séquence d’ADN
Les cellules filles contiennent alors un ADN différent de celui de la cellule parentale.
Allèles
Les diverses formes spécifiques d’un gène qui varient généralement les unes des autres d’une ou de quelques bases.
Les allèles diffèrent généralement les uns des autres par seulement quelques paires de bases d’ADN , mais peuvent conduire à des caractéristiques et des phénotypes différents.
Les séquenceurs de gènes
Nature de Science
Des instruments permettant de déterminer l’ordre des bases azotées dans un échantillon d’ADN. La technique provoque la fluorescence des bases et les ordinateurs peuvent convertir ce motif de fluorescence en séquence de bases. Ces séquences peuvent ensuite être rassemblées pour déterminer le génome complet de l’organisme. La technique a considérablement amélioré la vitesse et la précision de la lecture de l’ADN. Des comparaisons de séquences peuvent être effectuées à l’aide de bases de données pour rechercher des mutations et des liens évolutifs.
Lien entre l’ADN et les protéines
Pour rappel, l’ADN stocke ses informations dans la séquence de ses quatre bases azotées, abrégées en A, T, C et G. Les bases forment un code qui se lit par groupes de trois (triplets) qui précisent quel acide aminé utiliser dans la construction de protéines. Ces protéines régulent ensuite les réactions cellulaires et bien plus encore .
Les chromosomes
Les organismes stockent leurs gènes sur de longues séquences d’ADN appelées chromosomes. Un seul chromosome peut contenir des centaines ou des milliers de gènes, chacun dans un emplacement ou un locus spécifique (pluriel : loci).
Le chromosome 11
Il a une longueur d’environ 135 millions de paires de bases d’ADN, soit environ 4 % du génome humain total. Le chromosome 11 possède environ 1 300 gènes codant pour des protéines. Chaque gène contient des informations que nos cellules peuvent utiliser.
Albinisme
Pour le gène TYR, un allèle code pour une enzyme qui convertit l’acide aminé tyrosine en mélanine, un pigment de la peau humaine. Un autre allèle avec une séquence d’ADN légèrement différente code pour une enzyme altérée qui ne peut pas convertir la tyrosine en mélanine. Le résultat du deuxième allèle est l’albinisme, ou l’absence de mélanine.
Le locus du gène
La position spécifique d’un gène sur un chromosome.
Avoir une paire de chaque type de chromosome
État diploïde
La plupart des cellules de votre corps sont diploïdes , ce qui signifie que le noyau contient deux copies de chaque chromosome, soit 23 paires homologues, pour un total de 46 chromosomes.
Avoir une copie de chaque chromosome
État haploïde
Les noyaux haploïdes, qui contiennent un seul chromosome de chaque paire, se trouvent uniquement dans vos gamètes ou cellules sexuelles (spermatozoïdes et ovules). Les cellules haploïdes sont produites à partir de cellules diploïdes par méiose .
Les humains sont haploïde ou diploïde ?
Comme la plupart des eucaryotes, les humains sont diploïdes et héritent d’une copie de chaque chromosome maternellement (de la mère) et l’autre paternellement (du père). En conséquence, les humains possèdent deux copies de chaque gène. (Il existe une exception liée aux chromosomes sexuels.)
homozygote et hétérozygote
Vous êtes homozygote pour un gène si vous avez deux copies du même allèle ; vous êtes hétérozygote si vous avez deux allèles différents.
La hiérarchie des informations génétiques
SAVOIR !
- Génome – comprend l’ensemble du matériel génétique d’un organisme.
- Chromosomes – longues molécules d’ADN contenant de nombreux gènes.
- Gènes – courtes séquences d’ADN, qui codent généralement pour une caractéristique.
- Allèle – une forme spécifique d’un gène.
Génotype et phénotype
Les allèles que vous avez pour un gène sont appelés votre génotype . Le trait que vous possédez en raison de vos allèles s’appelle votre phénotype .
Mutations
Lorsque l’ADN est répliqué , des erreurs sont parfois commises. Les cellules filles contiennent alors un ADN différent de celui de la cellule parentale. Ces changements dans la séquence d’ADN sont appelés mutations. Tous les nouveaux allèles sont créés par mutation. Cependant, une fois qu’un nouvel allèle existe, il est copié et transmis de la même manière que la séquence originale.
- la suppression ou l’ajout de bases dans la séquence d’ADN
- l’utilisation d’une base azotée différente à un endroit particulier
Causes des mutations
- mécanisme de réplication de l’ADN peut commettre des erreurs ; c’est un processus enzymatique très rapide, où plusieurs centaines de nouvelles bases par seconde sont incorporées dans un nouveau brin. Même avec des enzymes de « relecture », une erreur sera parfois commise.
- l’exposition aux radiations et à certains produits chimiques, appelés mutagènes. Si les mutagènes provoquent une tumorigenèse , ils sont également appelés cancérigènes.
Conséquences des mutations
Si un acide aminé est modifié, le polypeptide formé peut fonctionner différemment, voire pas du tout.
Une mutation qui modifie une base azotée dans une séquence
mutation par substitution de base
Dans quel cas, une mutation n’aura aucun impacte ?
- Certaines mutations se produisent dans une partie de l’ADN qui ne code pas pour un polypeptide.
- Certaines mutations dans les gènes codant pour les protéines n’entraînent aucun changement car le code génétique comprend plusieurs codons (triplets) pour le même acide aminé.
Le projet Génome humain
Le projet Génome humain a débuté en 1990 dans le but de déterminer la séquence complète du génome humain et d’identifier chaque gène qu’il contient. Il s’agissait d’une initiative multinationale et multidisciplinaire impliquant des laboratoires du monde entier. Le génome humain total était estimé à environ 3,2 milliards de bases. Sur la base des techniques disponibles à l’époque, on prévoyait que le séquençage prendrait environ 15 ans. Les progrès technologiques ont accéléré le séquençage et, en 2003,deux ans avant la date prévue, le premier génome humain complet a été publié.
Aujourd’hui, un génome humain entier pourrait être séquencé en une heure environ.
Avantages du séquençage génétique.
il est possible d’adapter le traitement médical au profil génétique de l’individu. Par exemple, l’asthme peut avoir différentes causes génétiques. Savoir quels allèles un patient possède pour des gènes clés indique aux médecins quels médicaments sont susceptibles d’être efficaces
Quelle est la taille moyenne des gènes chez l’humain ?
environ 2 000 paires de bases
Vous devriez être capable de comparer le nombre de gènes chez l’humain avec :
Conseil d’examen
- Une espèce nommée avec plus de gènes que les humains
- Une espèce nommée avec moins de gènes que les humains
- Une espèce bactérienne nommée
- Une espèce végétale nommée
L’anémie falciforme
une maladie génétique courante dans les régions où le paludisme est endémique. L’anémie falciforme est le type de drépanocytose le plus courant, et ces termes sont parfois utilisés de manière interchangeable. Dans certaines régions d’Afrique, jusqu’à un tiers de la population peut être porteur de l’allèle drépanocytaire, et jusqu’à 2 % des enfants naissent avec l’anémie falciforme.
Tous ces nombreux effets proviennent d’une substitution d’une seule base – un « T » au lieu d’un « A » – sur l’ensemble des 3,2 milliards de bases du génome.
Symptômes de l’anémie falciforme
une douleur extrême, une faiblesse, une crise cardiaque ou un accident vasculaire cérébral, une pneumonie, des malformations osseuses et la mort.
Le brin d’ADN qui n’est pas transcrit
brin sens
Possède la même séquence de bases que la molécule d’ARNm, à l’exception du remplacement de la thymine par l’uracile.
Le brin transcrit
brin antisens
complémentaire de la molécule d’ARNm.
Cause de l’anémie falciforme
Conseil d’examen
une substitution de base spécifique provoque la substitution de l’acide glutamique par la valine en tant que sixième acide aminé du polypeptide de l’hémoglobine bêta.
Votre explication des causes de l’anémie falciforme doit inclure la mutation précise par substitution de bases (de GAG → GTG dans l’ADN sens), la modification de la séquence de bases de l’ARNm transcrit (de GAG → GUG) et la modification correspondante de la séquence de bases de l’ARNm transcrit (de GAG → GUG) et la modification correspondante de l’ADN sens. séquence d’un polypeptide dans l’hémoglobine (de l’acide glutamique à la valine en sixième position).
L’hémoglobine
L’hémoglobine est une protéine vitale présente dans les érythrocytes (globules rouges) qui transporte l’oxygène dans tout le corps.
Deux copies des sous-unités bêta se combinent avec deux sous-unités alpha et quatre groupes hèmes. Ensemble, ils forment une molécule d’hémoglobine
L’impacte de la maladie falciforme sur l’hémoglobine.
Sa capacité à transporter l’oxygène est sévèrement réduite, et deuxièmement, les longues fibres pénètrent dans la membrane cellulaire, déformant sa forme et donnant au globule rouge la courbure caractéristique. aspect « faucille ».
La nouvelle forme des globules rouges falciformes pose de nombreux problèmes. Ils peuvent rester coincés et obstruer les vaisseaux sanguins n’importe où dans le corps, provoquant une douleur intense en cas de défaillance de l’approvisionnement en sang. Si cela se produit dans le cerveau, la personne pourrait avoir un accident vasculaire cérébral.
Les cellules falciformes doivent être décomposées et éliminées du corps, ce qui met à rude épreuve le foie et provoque un manque de globules rouges fonctionnels (anémie). De nouveaux globules rouges doivent être produits dans la moelle osseuse pour remplacer les cellules perdues, et ce travail supplémentaire peut endommager la structure osseuse. .
Chaque globule rouge contient combien d’hémoglobine ?
environ 270 millions de molécules d’hémoglobine.
Lorsqu’un gène a plusieurs effets, on parle de …
pléiotropie
Syn pour l’anémie falciforme
drépanocytose
Comment savoir s’il existe un lien de causalité entre deux facteurs, comme le paludisme et la drépanocytose, ou s’il s’agit simplement d’une corrélation ?
Théorie de la connaissance
Une corrélation est le degré de relation entre deux variables. La causalité est la relation entre un phénomène et la variable qui provoque cet effet. Une corrélation entre deux variables n’implique pas nécessairement une causalité.
Par exemple, dans certaines régions, il peut être démontré qu’il existe une forte corrélation entre la consommation de glaces et les coups de soleil. À mesure que la consommation de crème glacée augmente, les cas de coups de soleil augmentent également. Cela ne veut pas dire que manger de la glace provoque des coups de soleil ou vice versa. Il s’agit d’une corrélation et non d’un lien de causalité. Les scientifiques doivent y réfléchir attentivement – beaucoup sont tombés dans le piège de croire que leurs données corrélées ont démontré un lien de causalité.
Un nombre considérable de recherches sur les humains sont menées par des épidémiologistes qui étudient les types de maladies et tentent d’en trouver les facteurs causals. L’incidence du paludisme et la prévalence de l’allèle de l’anémie falciforme chez les Africains constituent une corrélation très étroite (voir Figure 3 ). Bien que les homozygotes pour l’allèle drépanocytaire aient un taux de mortalité élevé, les hétérozygotes ont un avantage en termes de survie par rapport à ceux dont l’hémoglobine est normale, car ils sont rarement infectés par le paludisme. L’idée de sélection naturelle (survie du plus apte) suggère une possible relation causale entre la présence du paludisme et l’allèle drépanocytaire
Les génotypes de la drépanocytose sont :
Hb A Hb A – homozygote pour une hémoglobine normale, pas de drépanocytose, aucune protection contre le paludisme
Hb A Hb S – hétérozygotes, porteurs du trait drépanocytaire, protection contre le paludisme
Hb S Hb S – homozygote en cas d’hémoglobine altérée, drépanocytose, aucune protection contre le paludisme
La dépranocytose et le plaudisme
SAVOIR
La drépanocytose est une maladie génétique héréditaire. Le paludisme est une maladie infectieuse causée par des parasites protozoaires transmis à l’homme par des moustiques infectés
Polymorphismes mononucléotidiques (SNP) et diversité
Esprit international
Un polymorphisme nucléotidique unique (SNP) est une différence de base unique dans la séquence de bases d’un gène. Cette mutation peut provoquer un changement structurel dans un polypeptide ou peut se produire dans des parties non codantes de l’ADN impliquées dans la régulation des gènes. Les deux contribuent à la variation de la population et certains SNP peuvent provoquer des troubles héréditaires. Il existe plusieurs variantes de SNP de l’hémoglobine humaine, dont beaucoup sont inoffensives mais dont certaines provoquent des troubles sanguins comme la drépanocytose et la thalassémie .
Comment est-ce que les nouvelles allèles sont-elles créer ?
Par mutations
Le génome des procaryotes
- généralement un seul chromosome qui contient l’intégralité du génome, y compris tous les gènes nécessaires au fonctionnement de la vie.
- L’ADN procaryote est appelé « ADN nu » car, contrairement à l’ADN eucaryote, il n’est pas organisé autour de protéines histones associées.
- les procaryotes contiennent souvent des boucles d’ADN beaucoup plus petites, appelées plasmides.
- Une bactérie peut contenir une ou plusieurs copies d’un plasmide, voire aucune.
Les plasmides
Les plasmides sont des molécules d’ADN circulaires beaucoup plus petites qui s’échangent facilement entre les procaryotes et peuvent contenir plusieurs gènes.
Un plasmide peut contenir un ou plusieurs gènes, souvent liés à une fonction spécifique telle que la digestion d’une source de nourriture particulière ou la résistance à un antibiotique autrement mortel.
Les bactéries peuvent facilement échanger des plasmides, parfois même avec une autre espèce de procaryote. Bien que les plasmides soient très courants chez les procaryotes, on ne les trouve généralement pas chez les eucaryotes.
(Il existe cependant des exceptions. Par exemple, Saccharomyces cerevisiae , une levure unicellulaire utilisée en pâtisserie, contient un petit plasmide.)
Les bactéries et les antibiotiques
Les plasmides peuvent être facilement échangés entre bactéries, fournissant ainsi un mécanisme par lequel la résistance aux antibiotiques (l’ampicilline et la tétracycline) se propage. Les bactéries résistantes aux antibiotiques constituent un problème majeur dans les hôpitaux.
Le génome des eurcaryotes
Les espèces eucaryotes peuvent être unicellulaires ou multicellulaires. Ils séparent leur matériel génétique du cytoplasme en le contenant dans le noyau lié à la membrane.
Les chromosomes (eucaryotes)
Les chromosomes eucaryotes sont constitués d’une ou deux longues molécules d’ADN linéaires, selon la phase du cycle cellulaire. La molécule d’ADN est enroulée autour de protéines basiques (alcalines) appelées histones.
L’ADN enroulé autour des histones globulaires donne l’apparence de billes sur une chaîne (dans des micrographies).
Les chromatines
Pendant l’interphase, lorsque les informations sur l’ADN sont activement utilisées, les chromosomes ne sont visibles qu’au microscope électronique sous une forme moins organisée appelée chromatine . Cela permet aux enzymes de transcription de l’ADN d’accéder aux gènes avec les informations dont elles ont besoin pour maintenir le fonctionnement de la cellule.
Les chromatides soeurs et centromère
Dans les premiers stades de la mitose (et de la méiose ), les chromosomes se condensent pour former **des structures hautement organisées **en « forme de X », visibles au microscope optique. Les deux lignées qui forment le « X » sont des copies identiques du chromosome, appelées chromatides sœurs.
L’endroit où les deux brins se connectent s’appelle le centromère. Il maintient ensemble les chromatides sœurs d’un chromosome jusqu’à ce qu’elles soient séparées en anaphase (à ce stade, chaque chromatide est considérée comme un chromosome). L’état super-enroulé leur permet de se séparer sans s’emmêler ni se déchirer.
Les chromosomes homologues
Vos deux versions du même chromosome sont appelées une paire homologue.Les chromosomes homologues portent le même ensemble de gènes aux mêmes endroits. Cependant, il peut exister de légères différences entre les séquences nucléotidiques d’un même gène.
Chromosomes eucaryotes
IMPORTANT
Les chromosomes eucaryotes sont des molécules d’ADN linéaires associées à des protéines histones. Les chromosomes homologues portent la même séquence de gènes mais pas nécessairement les mêmes allèles de ces gènes.
Le génome humain
Le génome humain est organisé en 23 paires de chromosomes, soit 46 chromosomes au total.
Une paire, appelée chromosomes sexuels , détermine le sexe de l’organisme.
Les chromosomes des 22 autres paires sont appelés autosomes , ce qui signifie qu’ils n’influencent pas la détermination du sexe.
Les chromosomes autosomes
Ils sont numérotés grossièrement selon leur longueur. Le chromosome 1 est le plus long et le chromosome 22 est presque le plus court. Le chromosome 1 mesure environ 250 millions de bases et porte environ 2 000 gènes, tandis que le chromosome 22 ne compte que 51 millions de bases et porte environ 500 gènes. Différents chromosomes portent différents ensembles de gènes.
Taille du génome homo sapiens en millions de paires de bases.
3200
Vous devriez pouvoir comparer la taille du génome du phage T2, d’Escherichia coli , de Drosophila melanogaster , d’Homo sapiens et de Paris japonica .
Conseil d’examen
Phage T2 (virus qui infecte les bactéries) : 0,18
Escherichia coli (bactétrie intestinale commune) : 5
Drosophile melanogaster (mouche des fruits) : 140
Homo sapiens (humain) : 3200
Paris japonica : 150 000
Taille du génome en millions de paires de bases
Un zygote
- Fusion d’un spermatozoïde haploïde et d’un ovule haploïde.
- L’embryon qui se développe par divisions mitotiques aura les 46 chromosomes dans chacune de ses cellules.
Toutes les paires d’autosomes sont homologues car la copie maternelle et la copie paternelle contiennent les mêmes gènes aux mêmes positions sur le chromosome.
Bien que les chromosomes sexuels aient des gènes différents et des longueurs différentes, ils partagent une région homologue qui leur permet d’agir par paire pendant la méiose.
tétrade
Ensemble formé par une paire de chromosomes dédoublés, lors de la méiose.
Chaque chromosome d’une paire homologue est appelé homologue. Une structure composée de deux homologues s’appelle une tétrade.
Habituellement, tous les individus d’une espèce possèdent le même nombre de chromosomes (sauf en cas de mutations chromosomiques). Chez certaines espèces, les différents sexes possèdent un nombre différent de chromosomes.
Chez Wallabia bicolor (wallaby des marais), les femelles ont 10 chromosomes et les mâles 11.
Cependant, même dans ces cas, les individus de chaque sexe ont un numéro de chromosome caractéristique connu.