Tecnologías de secuenciación genómico Flashcards

1
Q

La ___ de ADN es el proceso que determinan las secuencias de bases de nucleótidos en un fragmento de ADN

A

Secuenciación

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2
Q

tipos de secuenciacion

A

sanger, next generation sequencing, illu,ina, ion torrent, PAC bio y Oxford nanopore

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3
Q

que secuenciación es de 1era generación

A

sanger

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4
Q

Con cual secuenciacion se secuencio el genoma humano por 1era vez

A

con sanger

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5
Q

precisa, costosa e ineficiente para secuenciar genomas completos. Es similar a una reacción de PCR. De que secuenciación estamos hablando

A

sanger

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6
Q

pasos para la secuenciación de sanger

A

AND en fuente de calor – primers – reacción de polimerización (polimerasa +magnesio + nucleótidos) – ddNTPS(el cual genera cadenas con dif peso molecular)

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7
Q

No son precisas, + rápida, - costoso y secuencia de 100-300 pares de bases

A

nexr generation sequencing technologies

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8
Q

tipos de NGS

A

Síntesis/2da gen, molécula única/3era gen, nanoporos e hibridación

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9
Q

que secuenciación es de 2da generación (sintesis)

A

Illumina

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10
Q

+ usado, alto rendimiento, - costoso. Ideal para estudios de re-secuenciación y análisis de variantes

A

Illumina

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11
Q

que técnica se usa en Illumina

A

Incorporación de nucleótidos marcados con FLOURESENCIA

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12
Q

Cuáles son las desventajas de Illumina

A

lectura limitada, errores de homopolímeros y sesgo

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13
Q

pasos de Illumina

A

Preparación de bibliotecas, generación de clusters, secuenciación y análisis de datos (bioinformatica)

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14
Q

Secuenciación de síntesis de molecula de ADN por medio de iones.

A

Ion Torrent

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15
Q

que secuencia es de 3era generación

A

PAC Bio

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16
Q

+ precisa, útil para secuenciar lecturas muy largas (2- 50KB) Secuencia en tiempo real de molecula única

A

PAC Bio

17
Q

lecturas largas, ideal para ensamblaje de genomas y estudios de variantes estructurales. - precioso y + costoso

A

Oxford nanopore

18
Q

metodo utilizado para secuenciar el genoma humano

A

sanger

19
Q

que es un deoxinucleotido

A

es lo que permite que no se una otro nucleotido

ya no hay afinidad por no tener O2 del OH

20
Q

mientras mas grendes las piezas

A

mas faciles de leer y armar

21
Q

que metodo usa la secuenciacion en sanger

A

utiliza electroforesis capilar

22
Q

a que nos ayuda la electroforesis

A

a ver el tamaño del DNA

23
Q

que lee ion torrent

A

las modificaciones de PH, a partir de alli obtiene los resultados

24
Q

proceso en donde se corta el DNA , para poseer la misma cantidad en los diferentes pocillos

A

fragmentacion

25
Q

que errores detecta Oxford Nanopore

A

traslocaciones
inserciones
inversiones