Tecnologías de secuenciación genómico Flashcards
La ___ de ADN es el proceso que determinan las secuencias de bases de nucleótidos en un fragmento de ADN
Secuenciación
tipos de secuenciacion
sanger, next generation sequencing, illu,ina, ion torrent, PAC bio y Oxford nanopore
que secuenciación es de 1era generación
sanger
Con cual secuenciacion se secuencio el genoma humano por 1era vez
con sanger
precisa, costosa e ineficiente para secuenciar genomas completos. Es similar a una reacción de PCR. De que secuenciación estamos hablando
sanger
pasos para la secuenciación de sanger
AND en fuente de calor – primers – reacción de polimerización (polimerasa +magnesio + nucleótidos) – ddNTPS(el cual genera cadenas con dif peso molecular)
No son precisas, + rápida, - costoso y secuencia de 100-300 pares de bases
nexr generation sequencing technologies
tipos de NGS
Síntesis/2da gen, molécula única/3era gen, nanoporos e hibridación
que secuenciación es de 2da generación (sintesis)
Illumina
+ usado, alto rendimiento, - costoso. Ideal para estudios de re-secuenciación y análisis de variantes
Illumina
que técnica se usa en Illumina
Incorporación de nucleótidos marcados con FLOURESENCIA
Cuáles son las desventajas de Illumina
lectura limitada, errores de homopolímeros y sesgo
pasos de Illumina
Preparación de bibliotecas, generación de clusters, secuenciación y análisis de datos (bioinformatica)
Secuenciación de síntesis de molecula de ADN por medio de iones.
Ion Torrent
que secuencia es de 3era generación
PAC Bio
+ precisa, útil para secuenciar lecturas muy largas (2- 50KB) Secuencia en tiempo real de molecula única
PAC Bio
lecturas largas, ideal para ensamblaje de genomas y estudios de variantes estructurales. - precioso y + costoso
Oxford nanopore
metodo utilizado para secuenciar el genoma humano
sanger
que es un deoxinucleotido
es lo que permite que no se una otro nucleotido
ya no hay afinidad por no tener O2 del OH
mientras mas grendes las piezas
mas faciles de leer y armar
que metodo usa la secuenciacion en sanger
utiliza electroforesis capilar
a que nos ayuda la electroforesis
a ver el tamaño del DNA
que lee ion torrent
las modificaciones de PH, a partir de alli obtiene los resultados
proceso en donde se corta el DNA , para poseer la misma cantidad en los diferentes pocillos
fragmentacion
que errores detecta Oxford Nanopore
traslocaciones
inserciones
inversiones
