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virologie > T4 > Flashcards

T4 Flashcards

1
Q

-T4 est parmi les ____ utilisés comme modèles pour étudier la virologie par le groupe de “Phage” de ___

A

7 phages d’E. coli

Delbrück

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Q

-on a donc découvert ____ , la ____ et la ____

A

la notion de gène

restriction de l’ADN

modification et réparation de l’ADN

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3
Q

-les virus ayant des propriétés similaires à T4 sont appelés phages ____

A

«T- pairs»

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4
Q

t4 lytique ou lysogénique

A

lytique

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Q

t4 , adn ???

A

double brin

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6
Q

-T4 se trouve dans_____ et dans _____

A

les intestins de mammifères

les eaux d’égouts

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7
Q

-des séquences ayant une homologie avec le génome de T4 sont réparties à l’échelle mondiale et se trouvent dans l’océan, dans le sol, dans les eaux usées et sont associées aux humains et aux animaux

A

ok

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8
Q

-les virus de type T4 («T4-like viruses») entrent dans l’un des 6 sous-familles et 39 genres de la famille____ dans l’ordre ____

A

Myoviridae

Caudovirales

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9
Q

-tous les phages des Caudovirales ont ___

A

des queues

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10
Q

-les phages des Myoviridae ont tous _____ etsont tous

A

de longues queues contractiles

virulents et ne sont capables que de cycle lytique

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11
Q

Le virion de T4 est une structure complexe qui est codée par plus de ____

A

40 gènes

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12
Q

fonction du col

A

Le col

-relie la tête au tube de la queue

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13
Q

Le tube de la queue:

-est

A

un tube creux à travers lequel l’ADN viral est injecté

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14
Q

_____

-agit comme un ressort -entoure le tube de la queue -est fixée à la plaque basale

A

La gaine contractile:

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15
Q

_______

  • est impliquée dans la fixation du virus au récepteur de la cellule
  • régule le flux de l’ADN
A

La plaque basale:

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16
Q

La plaque basale:

A
  • est impliquée dans la fixation du virus au récepteur de la cellule
  • régule le flux de l’ADN
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17
Q

Les crochets

A

-détectent la présence de cellules hôtes

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18
Q

-détectent la présence de cellules hôtes

A

Les crochets

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19
Q

les fibres de la queue (courtes et longues)

A
  • détectent des cellules hôtes

- se lient de manière réversible à la surface de la cellule (longues)

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20
Q
  • détectent des cellules hôtes

- se lient de manière réversible à la surface de la cellule (longues)

A

les fibres de la queue (courtes et longues)

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21
Q

combien de pb environ…

-il code pour ____ protéines avec des fonctions connues et il y a ___ cadres de lecture ouverts (CLO)(«ORF») dont la fonction est inconnue

A

170 000

160

120

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22
Q

multiple ori

A

ok

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23
Q

-décalage de façon circulaire («circularly permuted»):

A

Le point de départ du génome diffère pour chaque virus dans une même population.

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24
Q

Le point de départ du génome diffère pour chaque virus dans une même population.

A

décalage de facon circulaire

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25
Q

_____ : le génome contient des séquences répétées à chaque extrémité ~ 5000 pb de longueur. Ces extrémités se rejoignent pour former une molécule d’ADN circulaire

A

-les répétitions terminales («terminal redundancies»)

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26
Q

-le génome est décalé de façon circulaire avec les répétitions terminales de ____

A

~ 5000 pb

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27
Q

petite image 12

A

ok

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28
Q

L’ADN de T4 contient de la

A

5’-hydroxyméthylcytosine ( HMC )

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29
Q

La 5’-hydroxyméthylcytosine (HMC), est

A

un nucléotide modifié qui remplace la cytosine dans l’ADN de T4

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30
Q

Quels sont les avantages à avoir une base modifiée?

A
  • protéger l’ADN viral de l’action des systèmes de restriction de l’hôte
  • permettre de distinguer l’ADN viral de l’ADN hôte de sorte que l’ADN de l’hôte peut être dégradé et utilisé pour la réplication du phage
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31
Q

-pendant _____ , les cellules de l’hôte ne contiennent pas de virions matures

A

la phase d’éclipse

32
Q

la phase d’éclipse

A

les cellules de l’hôte ne contiennent pas de virions matures

33
Q

14-15

A

ok

34
Q

-La période de lyse est caractérisée par

A

la lyse de la cellule hôte et la libération rapide de virions

35
Q

la période ____ est caractérisé par la lyse de la cellule hôte et la libération rapide de virions

A

de llyse

36
Q

-À 37 °C, le plateau de la croissance est atteint après____ . La période d’éclipse est de ___ , et la période de latence de ___ .

A

30 min

~12 min

~22 min

37
Q

-le rendement de lyse («burst size») de T4 (le nombre de virus produits par cellule infectée) est

A

~100

38
Q

le nombre de virus produits par cellule infectée on appelle ca comment

A

rendement de lyse

39
Q

16

A

ok

40
Q

La réplication de T4 peut être divisée en 4 phases:

A
  • l’adsorption et la pénétration de la cellule hôte
  • la synthèse des acides nucléiques des virions et celle des protéines
  • l’assemblage des virions -la libération des virions
41
Q

Au cours de l’adsorption:

  • ____
  • les extrémités des fibres se lient de manière ___ avec a) ____ , ou b) ____ .
  • la protéine virale ____ se fixe à la surface de la cellule
  • le virion____
  • une fois que cela se produit, les ____ associées à la plaque basale sont libérées de leur position repliée et se lient de ____

et __

A

les fibres de la queue se décrochent de leur position fixe, à proximité des crochets

réversible

les
lipopolysaccharide (LPS)

les protéines OmpC.

gp37

se déplace sur la surface de la cellule jusqu’à ce qu’au moins trois de ses fibres y soient fixées

fibres caudales courtes

manière irréversible avec les LPS de l’hôte

la plaque basale passe d’une forme hexagonale à une forme en étoile

42
Q

Au cours de la pénétration:
-_________ initie la pénétration de la cellule
-____ de la gaine raccourcit le cylindre central
-le tube interne de la queue est poussé à travers ____ et ____ de l’hôte
-_____ facilite la pénétration
dans la cellule

A

une structure en forme d’aiguille en dessous de la plaque basale

la contraction

la plaque basale la couche de peptidoglycane

l’action lysozyme d’une protéine de plaque basale

43
Q

Lors de l’injection:

  • l’aiguille se détache
  • la protéine___ («tail tape measure protein)» située dans le canal du tube de la queue se rétracte pour permettre à l’ADN viral de sortir
  • l’ADN viral est libéré de la capside dans le tube puis dans le cytoplasme de la cellule
  • la capside reste attachée à l’extérieur de la cellule
A

étalon de queue

44
Q

Les caractéristiques générales de l’expression des gènes de T4:

A

-elle est très contrôlée et temporellement
ordonnée
-l’ARN polymérase de l’hôte est impliquée et est modifiée par T4 tout au long du cycle de réplication

45
Q

26

A

ok

46
Q

Dès que l’ADN de T4 pénètre dans la cellule, ____

A

l’ARN polymérase de l’hôte est modifiée pour favoriser les promoteurs de T4 par rapport à ceux de l’hôte

47
Q

Dès que l’ADN de T4 pénètre dans la cellule, l’ARN polymérase de l’hôte est modifiée pour favoriser les promoteurs de T4 par rapport à ceux de l’hôte
Ceci est accompli par:
-__, une protéine injectée en même temps que l’ADN viral, qui modifie la sous-unité___ de l’ARN polymérase de l’hôte par ribosylation ADP-dépendante («ADP-dependent ribosylation»), ce qui _____
-la protéine ___ oblige l’ARN polymérase à arrêter la transcription de l’ADN contenant la cytosine (hôte), tout en ignorant l’HMC de l’ADN viral

A

Alt

alpha

améliore l’activité des promoteurs T4

Alc

48
Q

Les gènes précoces sont transcrits en sens

A

anti-horaire

49
Q

La transcription _____
Dès que l’ADN de T4 pénètre dans la cellule, l’ARN polymérase de l’hôte est modifiée pour favoriser les promoteurs de T4 par rapport à ceux de l’hôte
Ceci est accompli par:
-Alt, une protéine injectée en même temps que l’ADN viral, qui modifie la sous-unité alpha de l’ARN polymérase de l’hôte par ribosylation ADP-dépendante («ADP-dependent ribosylation»), ce qui améliore l’activité des promoteurs T4
-la protéine Alc oblige l’ARN polymérase à arrêter la transcription de l’ADN contenant la cytosine (hôte), tout en ignorant l’HMC de l’ADN viral

A

précoce

50
Q

La transcription intermédiaire

Les produits de ces premières transcriptions comprennent ____ et ____

A

MotA et AsiA

51
Q

-MotA et AsiA modifient ____ de l’ARN polymérase de l’hôte de sorte que celui-ci initie la transcription dans les promoteurs des gènes ___

A

le motif du facteur sigma

intermédiaires uniques de T4

52
Q

Les gènes intermédiaires codent pour des fonctions de _____ , y compris:

  • ____
  • ____
  • _____
A

métabolisme et de réplication

des nucléases qui dégradent l’ADN de l’hôte

l’ADN polymérase dépendante de l’ADN

des protéines supplémentaires qui modifient l’ARN polymérase de l’hôte ( défavorise transcription des genes précoses ( car phage a deja terminé gene precoce .. on veut pas continuer à transcrire ces genes car tache deja achevée ) )

53
Q

La transition entre les gènes intermédiaires et tardifs nécessite les produits des gènes ____

A

33 et 55

54
Q

-la protéine 55 est

A

un facteur sigma viral qui remplace celui de l’hôte et redirige l’ARN polymérase vers les séquences des promoteurs de gènes tardifs uniques de T4

55
Q

-la protéine 33

A

modifie également l’ARN polymérase de sorte qu’elle ne peut plus se lier à l’ADN hôte ( La protéine 33 agit sur la sous-unité bêta de l’ARN polymérase )

56
Q

les gènes tardifs codent pour ____ et sont transcrits dans le sens ___

A

les protéines structurales

horairegog

57
Q

___ agit sur les sous-unités alpha de la polymérase tandis que___ et ___ agissent sur le facteur sigma

A

Alt

MotA

AsiA

58
Q

Le génome de T4 code pour toutes

A

les sous-unités de son réplisome et toutes les enzymes nécessaires à la synthèse de l’ADN, la polymérase y compris

59
Q

La réplication ne peut se réaliser que

A

lorsqu’il y a une accumulation suffisante de matériel (après expression des gènes tardifs)

60
Q

meme si genome de t4 grand … code pas pour sa propre

A

arn pol

61
Q

32

A

ok

62
Q

Les fragments d’Okasaki ont besoin d’une amorce au début de chaque fragment.
L’amorce d’ARN est synthétisée par la ____ .
Les deux fragments sont reliés par une ____ après le retrait des bases d’ARN L’activité ___ déroule le double brin
Les simples brins d’ADN sont recouverts par de petites protéines, ___ , qui les protègent

A

primase d’ARN

ligase

hélicase

SSB

63
Q

_____ sont plusieurs unités de génome reliées entre elles dans la même orientation

A

-les concatémères

64
Q

-les concatémères

A

plusieurs unités de génome reliées entre elles dans la même orientation

65
Q

-parce que _____ , les extrémités de chaque descendance virale ont des extrémités 3’ ADN sb (monocaténaires)

A

T4 ne peut pas initier la synthèse à l’extrémité 5’

66
Q

34

A

ok

67
Q

Le génome est intégré à la tête par

A

le mécanisme de la tête pleine

68
Q

mécanisme de la tête pleine

A

Le concatémère va être poussé dans la tête jusqu’à ce qu’elle soit pleine et il est
alors coupé

69
Q

36

A

ok

70
Q

L’empaquetage de l’ADN est effectué par un complexe protéique appelé le

A

«packasome»

71
Q

Le packasome se fixe à

A

la protéine-portail de la capside

72
Q

L’assemblage se fait en 3 lignes de production:

  • les protéines
  • les protéines
  • les protéines
A

de tête

de la plaque basale

des fibres de la queue

73
Q

T4 lyse E. coli quand ___ virions se sont accumulés dans la cellule hôte

A

~ 150

74
Q

Deux protéines sont impliquées dans la lyse:

____ : crée des trous dans la membrane plasmique de E. coli, ce qui permet au virus de se déplacer du cytoplasme à la paroi cellulaire
___ : dégrade le peptidoglycane, entraînant la destruction de la paroi cellulaire de l’hôte

A

Holine

Lysozyme de T4

75
Q

crée des trous dans la membrane plasmique de E. coli, ce qui permet au virus de se déplacer du cytoplasme à la paroi cellulaire

A

holine

76
Q

dégrade le peptidoglycane, entraînant la destruction de la paroi cellulaire de l’hôte

A

lysozyme de T4

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