retroviridae Flashcards
virus trouvés chez
tous les vertébrés
famille des retroviridae divisés en 2 groupes :
- rétrovirus simples
2. rétrovirus complexes
rétrovirus simples :
alpha
beta
gamma
codent pour les protéines Gag, Pro, Pol, Env
rétrovirus coplexes :
delta epsilon lenti spuma codent pour les protéines Gag, pro, Pol, Env et un ensemble de protéines régulatrices
autres éléments génétiques capables de transcription inverse :
rétroéléments
exemples de rétroéléments :
d’autre familles de virus
rétrotransposons
introns
particules :
sphériques ( forme complexe )
sensible à chaleur, détergents et formaldéhyde ( enveloppé donc )
SU :
protéine de surface
TM :
protéine transmembranaire
elles fonctionnent ensemble :
SU et TM
PR :
protéase
protéines MA :
matrice
protéine NC :
nucléocapside
protéine CA :
capside
prtéine IN
intégrase
protéine RT :
transciptase inverse
genome dans le virion :
deux copies linéaires d’ARN simple brin + où chaque monomere possède 13,7 kb
enveloppe comment ?
membrane bicouche lipidique
intégrée dans le génome de l’hôte en ordre :
U5 : site requis pour intégration provirale
GAG : antigene specifique de groupe
pol
env
U3 : expression du gene viral et intégration de l’Adn
Le ____ est libéré dans le cytoplasme suite à____
«core» viral
la fusion des enveloppes du virion et de la cellule
transcription inverse dans cytoplasme ou noyau
cytoplasme
amenéé par virus dans cellule
intégrase
RT
la recombinaison intégrative, catalysée par l’IN, se traduit par l’insertion de l’ADN viral, qui peut avoir lieu où
à n’importe quel endroit dans le génome des hôtes
La transcription de l’ADN viral intégré (appelé ____ ) par ____ de l’hôte produit des transcrits de longueur complète
provirus
l’ARN polymérase II
Certaines molécules d’ARN pleine longueur sont exportées à partir du noyau et servent comme des ARNm, Ces transcrits sont traduits par ____ pour former les ____
des ribosomes cytoplasmiques
polyprotéines précurseures Gag et Gag-Pol
3 objectifs de transcrits d’adn
- polyprotéine
- genome
- prot de surface
D’autres molécules d’ARN pleine longueur sont ___ dans le noyau pour former les ARNm, codant pour les protéines précurseures de la polyprotéine Env
épissées
L’ARNm d’Env est traduit par les ribosomes liés ___
au RE
Les protéines Env sont transportées à travers ____ où elles sont glycosylées et clivées par des enzymes cellulaires pour former ____
l’appareil de Golgi
le complexe SU-TM mature
Les composants du virion (ARN viral, les précurseurs de Gag et Gag-Pol et SU-TM), se réunissent ____ via la machinerie de ____
au site de bourgeonnement
trafic vésiculaire intracellulaire
Le virus s’assemble sur ____ et les virions naissants bourgeonnent à la surface de la cellule
la face interne de la membrane plasmique
Le virus devient infectieux quand _______ pour produire les protéines de virions matures
la protéase PR clive les précurseurs Gag et Gag-Pol
meme apres bourgeonnement , virus pas encore mature..
faut que protéase clive la polyprotéine pour finalement former particule mature
important pcq virus ne veut pas infecter cellule en train de mourir… donne un peu
de distane entre virus descendant et cellule utilisée pour les produire
ok
L’attachement a lieu entre
un récepteur cellulaire et la protéine Env (SU + TM) du virus
La sous-unité ___ de l’Env fait le premier contact avec le récepteur, et la sous-unité __ est le principal acteur dans la fusion membranaire
SU
TM
L’entrée du virus exige des régions membranaires cellulaires qui possèdent
une composition lipidique spéciale appelée les “radeaux” lipidiques
Le signal qui déclenche le début de la synthèse de l’ADN semble être
l’exposition de la nucléocapside virale à des niveaux élevés de dNTP présents dans le cytoplasme
Les composants essentiels de la réaction de RT sont 3 choses
l’ARN génomique viral, une amorce et la transcriptase inverse
La NC facilite le «template switching», (changement de gabarit) et améliore l’efficacité de l’allongement (processivité)
ok
____ sert d’amorce pour l’initiation de la RT
molécules d’ARNt cellulaire
virus vol adn T lors de
encapsidation ( coquin )
L’amorce d’ARNt est acquise à partir de la cellule pendant l’assemblage du virus, et elle se lie à une région du génome appelée ____ à proximité de l’extrémité 5’
le site principal de liaison (PBS)
La synthèse de l’ADN a lieu principalement dans le cytoplasme d’une
structure sous-virale appelée la ___
«RT complex»
La RT est capable des activités catalytiques suivantes:
- la polymérisation dépendante de l’ARN ou de l’ADN («RNA-dependent and DNA-dependent polymerisation»)
- le déroulement de l’ADN
- et l’hydrolyse de l’ARN dans l’hybride ARN-ADN par la RNase H
Le domaine de RNase H de la RT:
- dégrade l’ARN génomique après qu’il ait été copié en ADNc
- crée l’amorce pour la synthèse de l’ADN brin + de l’ARN génomique
- et supprime cette amorce et aussi l’amorce d’ARNt des extrémités 5’ de l’ADN viral naissant
RT commence à un site proche de l’extrémité___ du gabarit d’ARN (pbs) et synthétise un produit d’une longueur de ~100 nt de brin d’ADN -, qui comprend l’amorce d’ARNt, appelée ____
5’
l’ADN «strong- stop»-
L’extrémité 5’ du génome d’ARN viral est dégradé par ____ , une sous-unité de la transcriptase inverse, tandis que l’ADN «strong-stop»- est synthétisé
l’activité de RNase H
Dans l’étape suivante, ____ du génome d’ARN est engagée en tant que gabarit par liaison entre la séquence de ___ dans l’ADN «strong-stop»- et la séquence complémentaire de ___ en amont de la queue du poly . Cette réaction est appelée ____ , et aboutit à la substitution d’une extrémité (région 5’) de l’ARN à l’autre (région 3’)
l’extrémité 3’
R
r
«le premier échange de gabarit»
Initiation de la synthèse de l’ADN à brin +:
L’un des produits de la digestion de l’ARN génomique par la RNase H est un fragment comprenant une ____ . La ppt sert d’amorce pour la synthèse de l’ADN à brin +
polypurine (ppt)
En commençant à l’emplacement de l’amorce ppt, la synthèse de l’ADN à brin + se produit à la section terminale du gabarit d’ADN à brin - et se termine après avoir copié le premier18 nt de l’amorce d’ARNt. Ce produit est appelé de ______
l’ADN «strong-stop»+
Après l’élimination de l’amorce d’ARNt par ____ , l’extrémité 3’ simple brin de l’ADN «strong-stop»+ se lie _____ à l’extrémité 3’ de l’ADN génomique de polarité négative
la RNase H
aux séquences simples brins complémentaires (PBS)
Dans l’étape suivante,____ fournit un gabarit à l’ADN circulaire pour la polymérisation continue par la RT
l’hybridation des séquences complémentaires de pbs
Le produit final est une copie linéaire de l’ADN duplex du génome viral qui possède des sequences ______ . Le LTR contient des signaux (____ ) importants aux deux extrémités
«long terminal repeats» (LTR)
U3, R et U5
La transcription inverse rétrovirale est appelée une «_____ », car il n’y a pas de gain net de génomes, mais plutôt _____
réplication destructrice
une substitution de 2 molécules d’ARNsb+ pour une seule molécule d’ADNdb
On estime que _____ sont la source d’au moins la moitié de la recombinaison génétique qui se produit chez les rétrovirus
les échanges internes au cours de la synthèse de l’ADN
La transcription inverse favorise ____
la recombinaison
2 modèles de recombinaison aucours de la transcription inverse :
- 1 modele de recombinaison au cours de la synthese du brin - de l’ADN appelé ( copy choice)
- mécanisme de recombinaison lors de la synthese du brin + appelé (strand displacement model)
quel modele de recombinaison ? Le brin assimilé dans l’ADN du deuxième génome produit un double brin avec des régions hétéroduplex
mécanisme de recombinaison lors de la synthese du brin + appelé (strand displacement model )
Au cours de l’intégration, _____ sont perdues à partir des deux extrémités du provirus et un site cible de 6 pb dans l’ADN de l’hôte est ____ . Enfin, les extrémités de tous les provirus ont le même dinucléotide ____
2 pb (AA et TT)
dupliqué de chaque côté de l’ADN viral (en rose)
(5 ‘TG et CA-3’)
L’insertion du provirus active les protéines cellulaires impliquées dans la détection de dommages à l’ADN. Ces protéines rejoignent les extrémités libres du provirus à l’ADN de l’hôte
ok
presqun virus complet mais pas cap de srépliquer :
rétroéléments
Près de ___ du génome humain comprend des éléments génétiques mobiles, y compris des provirus endogènes et d’autres rétroéléments
50%
-les gènes dérivés des rétroéléments codent pour des protéines responsables de ____ entre la mère et le fœtus
la couche dans le placenta
