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virologie > retroviridae > Flashcards

retroviridae Flashcards

1
Q

virus trouvés chez

A

tous les vertébrés

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2
Q

famille des retroviridae divisés en 2 groupes :

A
  1. rétrovirus simples

2. rétrovirus complexes

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Q

rétrovirus simples :

A

alpha
beta
gamma
codent pour les protéines Gag, Pro, Pol, Env

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4
Q

rétrovirus coplexes :

A 
delta
epsilon
lenti
spuma
codent pour les protéines Gag, pro, Pol, Env et un ensemble de protéines régulatrices
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5
Q

autres éléments génétiques capables de transcription inverse :

A

rétroéléments

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6
Q

exemples de rétroéléments :

A

d’autre familles de virus
rétrotransposons
introns

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7
Q

particules :

A

sphériques ( forme complexe )

sensible à chaleur, détergents et formaldéhyde ( enveloppé donc )

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8
Q

SU :

A

protéine de surface

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9
Q

TM :

A

protéine transmembranaire

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10
Q

elles fonctionnent ensemble :

A

SU et TM

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11
Q

PR :

A

protéase

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12
Q

protéines MA :

A

matrice

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13
Q

protéine NC :

A

nucléocapside

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14
Q

protéine CA :

A

capside

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15
Q

prtéine IN

A

intégrase

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16
Q

protéine RT :

A

transciptase inverse

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17
Q

genome dans le virion :

A

deux copies linéaires d’ARN simple brin + où chaque monomere possède 13,7 kb

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18
Q

enveloppe comment ?

A

membrane bicouche lipidique

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19
Q

intégrée dans le génome de l’hôte en ordre :

A

U5 : site requis pour intégration provirale
GAG : antigene specifique de groupe
pol
env
U3 : expression du gene viral et intégration de l’Adn

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20
Q

Le ____ est libéré dans le cytoplasme suite à____

A

«core» viral

la fusion des enveloppes du virion et de la cellule

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21
Q

transcription inverse dans cytoplasme ou noyau

A

cytoplasme

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22
Q

amenéé par virus dans cellule

A

intégrase

RT

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23
Q

la recombinaison intégrative, catalysée par l’IN, se traduit par l’insertion de l’ADN viral, qui peut avoir lieu où

A

à n’importe quel endroit dans le génome des hôtes

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24
Q

La transcription de l’ADN viral intégré (appelé ____ ) par ____ de l’hôte produit des transcrits de longueur complète

A

provirus

l’ARN polymérase II

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25
Q

Certaines molécules d’ARN pleine longueur sont exportées à partir du noyau et servent comme des ARNm, Ces transcrits sont traduits par ____ pour former les ____

A

des ribosomes cytoplasmiques

polyprotéines précurseures Gag et Gag-Pol

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26
Q

3 objectifs de transcrits d’adn

A
  1. polyprotéine
  2. genome
  3. prot de surface
27
Q

D’autres molécules d’ARN pleine longueur sont ___ dans le noyau pour former les ARNm, codant pour les protéines précurseures de la polyprotéine Env

A

épissées

28
Q

L’ARNm d’Env est traduit par les ribosomes liés ___

A

au RE

29
Q

Les protéines Env sont transportées à travers ____ où elles sont glycosylées et clivées par des enzymes cellulaires pour former ____

A

l’appareil de Golgi

le complexe SU-TM mature

30
Q

Les composants du virion (ARN viral, les précurseurs de Gag et Gag-Pol et SU-TM), se réunissent ____ via la machinerie de ____

A

au site de bourgeonnement

trafic vésiculaire intracellulaire

31
Q

Le virus s’assemble sur ____ et les virions naissants bourgeonnent à la surface de la cellule

A

la face interne de la membrane plasmique

32
Q

Le virus devient infectieux quand _______ pour produire les protéines de virions matures

A

la protéase PR clive les précurseurs Gag et Gag-Pol

33
Q

meme apres bourgeonnement , virus pas encore mature..
faut que protéase clive la polyprotéine pour finalement former particule mature
important pcq virus ne veut pas infecter cellule en train de mourir… donne un peu
de distane entre virus descendant et cellule utilisée pour les produire

A

ok

34
Q

L’attachement a lieu entre

A

un récepteur cellulaire et la protéine Env (SU + TM) du virus

35
Q

La sous-unité ___ de l’Env fait le premier contact avec le récepteur, et la sous-unité __ est le principal acteur dans la fusion membranaire

A

SU

TM

36
Q

L’entrée du virus exige des régions membranaires cellulaires qui possèdent

A

une composition lipidique spéciale appelée les “radeaux” lipidiques

37
Q

Le signal qui déclenche le début de la synthèse de l’ADN semble être

A

l’exposition de la nucléocapside virale à des niveaux élevés de dNTP présents dans le cytoplasme

38
Q

Les composants essentiels de la réaction de RT sont 3 choses

A

l’ARN génomique viral, une amorce et la transcriptase inverse

39
Q

La NC facilite le «template switching», (changement de gabarit) et améliore l’efficacité de l’allongement (processivité)

A

ok

40
Q

____ sert d’amorce pour l’initiation de la RT

A

molécules d’ARNt cellulaire

41
Q

virus vol adn T lors de

A

encapsidation ( coquin )

42
Q

L’amorce d’ARNt est acquise à partir de la cellule pendant l’assemblage du virus, et elle se lie à une région du génome appelée ____ à proximité de l’extrémité 5’

A

le site principal de liaison (PBS)

43
Q

La synthèse de l’ADN a lieu principalement dans le cytoplasme d’une
structure sous-virale appelée la ___

A

«RT complex»

44
Q

La RT est capable des activités catalytiques suivantes:

A
  • la polymérisation dépendante de l’ARN ou de l’ADN («RNA-dependent and DNA-dependent polymerisation»)
  • le déroulement de l’ADN
  • et l’hydrolyse de l’ARN dans l’hybride ARN-ADN par la RNase H
45
Q

Le domaine de RNase H de la RT:

A
  • dégrade l’ARN génomique après qu’il ait été copié en ADNc
  • crée l’amorce pour la synthèse de l’ADN brin + de l’ARN génomique
  • et supprime cette amorce et aussi l’amorce d’ARNt des extrémités 5’ de l’ADN viral naissant
46
Q

RT commence à un site proche de l’extrémité___ du gabarit d’ARN (pbs) et synthétise un produit d’une longueur de ~100 nt de brin d’ADN -, qui comprend l’amorce d’ARNt, appelée ____

A

5’

l’ADN «strong- stop»-

47
Q

L’extrémité 5’ du génome d’ARN viral est dégradé par ____ , une sous-unité de la transcriptase inverse, tandis que l’ADN «strong-stop»- est synthétisé

A

l’activité de RNase H

48
Q

Dans l’étape suivante, ____ du génome d’ARN est engagée en tant que gabarit par liaison entre la séquence de ___ dans l’ADN «strong-stop»- et la séquence complémentaire de ___ en amont de la queue du poly . Cette réaction est appelée ____ , et aboutit à la substitution d’une extrémité (région 5’) de l’ARN à l’autre (région 3’)

A

l’extrémité 3’

R

r

«le premier échange de gabarit»

49
Q

Initiation de la synthèse de l’ADN à brin +:
L’un des produits de la digestion de l’ARN génomique par la RNase H est un fragment comprenant une ____ . La ppt sert d’amorce pour la synthèse de l’ADN à brin +

A

polypurine (ppt)

50
Q

En commençant à l’emplacement de l’amorce ppt, la synthèse de l’ADN à brin + se produit à la section terminale du gabarit d’ADN à brin - et se termine après avoir copié le premier18 nt de l’amorce d’ARNt. Ce produit est appelé de ______

A

l’ADN «strong-stop»+

51
Q

Après l’élimination de l’amorce d’ARNt par ____ , l’extrémité 3’ simple brin de l’ADN «strong-stop»+ se lie _____ à l’extrémité 3’ de l’ADN génomique de polarité négative

A

la RNase H

aux séquences simples brins complémentaires (PBS)

52
Q

Dans l’étape suivante,____ fournit un gabarit à l’ADN circulaire pour la polymérisation continue par la RT

A

l’hybridation des séquences complémentaires de pbs

53
Q

Le produit final est une copie linéaire de l’ADN duplex du génome viral qui possède des sequences ______ . Le LTR contient des signaux (____ ) importants aux deux extrémités

A

«long terminal repeats» (LTR)

U3, R et U5

54
Q

La transcription inverse rétrovirale est appelée une «_____ », car il n’y a pas de gain net de génomes, mais plutôt _____

A

réplication destructrice

une substitution de 2 molécules d’ARNsb+ pour une seule molécule d’ADNdb

55
Q

On estime que _____ sont la source d’au moins la moitié de la recombinaison génétique qui se produit chez les rétrovirus

A

les échanges internes au cours de la synthèse de l’ADN

56
Q

La transcription inverse favorise ____

A

la recombinaison

57
Q

2 modèles de recombinaison aucours de la transcription inverse :

A
  1. 1 modele de recombinaison au cours de la synthese du brin - de l’ADN appelé ( copy choice)
  2. mécanisme de recombinaison lors de la synthese du brin + appelé (strand displacement model)
58
Q

quel modele de recombinaison ? Le brin assimilé dans l’ADN du deuxième génome produit un double brin avec des régions hétéroduplex

A

mécanisme de recombinaison lors de la synthese du brin + appelé (strand displacement model )

59
Q

Au cours de l’intégration, _____ sont perdues à partir des deux extrémités du provirus et un site cible de 6 pb dans l’ADN de l’hôte est ____ . Enfin, les extrémités de tous les provirus ont le même dinucléotide ____

A

2 pb (AA et TT)

dupliqué de chaque côté de l’ADN viral (en rose)

(5 ‘TG et CA-3’)

60
Q

L’insertion du provirus active les protéines cellulaires impliquées dans la détection de dommages à l’ADN. Ces protéines rejoignent les extrémités libres du provirus à l’ADN de l’hôte

A

ok

61
Q

presqun virus complet mais pas cap de srépliquer :

A

rétroéléments

62
Q

Près de ___ du génome humain comprend des éléments génétiques mobiles, y compris des provirus endogènes et d’autres rétroéléments

A

50%

63
Q

-les gènes dérivés des rétroéléments codent pour des protéines responsables de ____ entre la mère et le fœtus

A

la couche dans le placenta

virologie (15 decks)

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