M13 Flashcards
M13 est virulent mais______ et infecte E. coli
n’est pas nécessairement lytique
La famille ____ comprend 7 genres et 31 éspeces. Cette famille n’est pas encore classée dans un ordre
Inoviridae
Le phage M13 est l’espèce-type des phages classés dans le genre ____
Inovirus
Les virus de la famille Inoviridae sont souvent désignés sous le terme ____
phages Ff («F-specific filamentous phages»)
Tous les virus de la famille Inoviridae (appelés les inovirids) ont un génome ___ et une capside ____
d’ADNsb
filamenteuse avec une structure hélicoïdale
Les capsides des phages Ff sont____ ; elles ont une longueur de ___ et un diamètre de seulement __
longues et flexibles
~900 nm
~7 nm
La particule M13 est constituée d’une molécule ___ de ____ bases
d’ADNsb
6 407
Le génome est revêtu de____ copies de la protéine d’enveloppe majeure___ de manière hélicoïdale
~ 2 800
pVIII
_____ Cela stabilise la particule du phage.
La séquence C-terminale de pVIII est chargée positivement et interagit avec le squelette phosphate de l’ADN.
L’extrémité du phage présente ___ exemplaires de chacune des protéines ____
Si l’une de ces protéines est absente, la production de particules de phage ne se déroule pas
cinq
d’enveloppe mineures pVII et pIX
voir image 10 et tout
ok
L’autre extrémité du phage est constituée de cinq copies de ___ et ___ . Ces protéines sont impliquées dans ____ .
Ces protéines permettent aussi ___
pIII
pVI
l’adsorption au récepteur de l’hôte
au virion nouvellement formé de se détacher de la membrane cellulaire lors de sa sortie de la cellule
Le génome des phages Ff contient __ gènes et ____
Le signal d’encapsidation («the packaging signal (PS)»), situé dans la région ___ , est nécessaire à l’encapsidation efficace du génome
Contrairement à T4 et à T7 où la régulation temporelle de l’expression génique est la règle, les protéines des phages Ff sont ____
9
une région non codante
(«IG»)
non codante
toutes synthétisées simultanément
Parmi les ___ protéines codées par le phage:
3 (pII, pX et pV) sont nécessaires pour ____
3 (pI, pXI et pIV) sont nécessaires pour ____ du phage
5 (pIII, pVI, pVII, pVIII et pIX) sont____
11
générer l’ADNsb
la morphogenèse
des composants de la particule de phage
Parmi les 11 protéines codées par le phage:
3 (______ ) sont nécessaires pour générer l’ADNsb
3 (_______ ) sont nécessaires pour la morphogenèse du phage
5 (_______) sont des composants de la particule de phage
pII, pX et pV
pI, pXI et pIV
pIII, pVI, pVII, pVIII et pIX
La réplication de M13 peut être divisée en ___ phases:
- 3.
3
- l’adsorption à la cellule hôte et la décapsidation
- la réplication et la transcription -l’assemblage et la sécrétion des virions
L’adsorption de M13 est spécifique à quoi : _____
aux pilus des bactéries F+ d’E. coli
Le pilus est codé par
un plasmide (facteur F)
Les phages Ff peuvent infecter des cellules auxquelles il manque un pilus, mais le processus est extrêmement inefficace
ok
ADSORPTION : À l’aide de la protéine ___ , le virus va se fixer au pilus
Comme lors de la conjugaison bactérienne, _____
Ensuite, la protéine pIII interagit avec la protéine hôte ___ située dans ___
pIII
le pilus se contracte et attire le phage vers la membrane
TolA
la paroi cellulaire
17
ok
16
ok
réplication : L’ADN sb est converti en ____ d’ADN db superenroulé par l’action de ___ , ____ et ____
Une ARN polymérase ___
Le site d’initiation de la polymérisation est une structure _____ située dans____ .
L’amorce d’ARN est allongée par ____ , le brin nouvellement répliqué est ___ et le produit double brin est ensuite ____
une forme réplicative («RF- Replicative Form»)
l’ARN polymérase de l’hôte, l’ADN polymérase et une gyrase
génère l’amorce utilisée pour initier la synthèse du brin d’ADN négatif
en forme de boucle («hairpin»)
la région non codante du brin positif
l’ADN polymérase III
ligaturé
superenroulé par la gyrase
quest-ce qui fait que ladn senroule
la gyrase
quelle prot démarre le processus de réplication en cercle roulant
pII
La synthèse de l’enzyme plI, une enzyme de ___(«site-specific nicking-closing enzyme»), est nécessaire pour la poursuite de la réplication du génome
réparation reconnaissant un site spécifique de coupe monocaténaire
La forme réplicative («RF») superenroulée est ___ , ce qui génère une molécule simple brin
un gabarit pour l’expression des
gènes de phage et la réplication en cercle roulant
20
ok
pII crée un bris monocaténaire du brin positif de la forme réplicative sur le site ori dans la région non codante du génome
L’extrémité ___ est allongée par une ____ , en utilisant le brin négatif comme gabarit
3’
ADN polymérase III de l’hôte
Le brin positif d’origine est déplacé par _____ pendant que le nouveau brin positif est synthétisé
Quand un tour de la réplication est terminé, le brin positif déplacé est
recircularisé par ___ et encore ____
l’hélicase «Rep»
plI
converti en «RF»
Au début de l’infection lorsque la concentration de ___ est faible, de
l’ADN sb nouvellement synthétisé est converti en «RF» augmentant ainsi à la fois le nombre de «RF» et les protéines de phage de façon exponentielle
pV
La protéine pV est une protéine ___
fixant l’ADN simple brin
23
ok
Quand un nombre suffisant de pV s’est accumulé dans le cytoplasme, des dimères de pV couvrent l’ADN sb, empêchant_____. La formation de «RF» et la traduction des gènes viraux sont donc bloquées
Le recouvrement par la protéine pV le long de l’ADN lui donne____
l’accès à l’ADN-polymérase
une structure en forme de tige («rod-like»)
L’assemblage des phages Ff est un processus ___
sécrétoire
L’assemblage se produit dans____ et les phages
naissants sont ____
la membrane cytoplasmique
sécrétés par la cellule en même temps qu’ils sont assemblés
desssin24
ok
Les 8 protéines directement impliquées dans l’assemblage sont d’abord _____ («integral cytoplasmic proteins») avant leur incorporation dans la particule de phage
des protéines intégrales de la membrane cytoplasmique
L’assemblage des phages se produit sur des sites d’assemblage distincts où
la membrane cytoplasmique et la membrane externe sont en contact étroit
26- 27
ok
Les phages naissants passent à travers un canal formé par la protéine ___ dans la paroi de la cellule
pIV
L’allongement du phage
comprend le remplacement successif des pV par les protéines de capside
pVII, pVIII et pIX
Une fois que pIII et pVI sont incorporées à l’extrémité terminale du phage, elles
subissent un changement de conformation qui stabilise le virus et le détache de la paroi cellulaire
Une fois que ___ et ___ sont incorporées à l’extrémité terminale du phage, elles subissent un changement de conformation qui stabilise le virus et le détache de la paroi cellulaire
pIII et pVI
Les descendants des particules de phage apparaissent dans le surnageant de culture dès ___ (!) lors d’une infection à 37 ° C
Dans ces conditions, ~____ sont produites dans la première heure
Dans des conditions optimales, les cellules infectées peuvent ___
Cependant, une petite perturbation dans le cycle de vie du phage se traduira par ____
~ 10 min
1000 particules
continuer à croître et à se diviser tout en produisant des phages
la lyse de la cellule
Par exemple, les phages Ff ont été utilisés dans une méthode nommée le
«phage display»
La protéine P3 du phage m13 semblent _____ qui se forment au cours de la maladie d’Alzheimer
dissoudre les plaques amyloïdes
voir phage display à fin
ok
