M13 Flashcards

1
Q

M13 est virulent mais______ et infecte E. coli

A

n’est pas nécessairement lytique

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2
Q

La famille ____ comprend 7 genres et 31 éspeces. Cette famille n’est pas encore classée dans un ordre

A

Inoviridae

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3
Q

Le phage M13 est l’espèce-type des phages classés dans le genre ____

A

Inovirus

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4
Q

Les virus de la famille Inoviridae sont souvent désignés sous le terme ____

A

phages Ff («F-specific filamentous phages»)

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5
Q

Tous les virus de la famille Inoviridae (appelés les inovirids) ont un génome ___ et une capside ____

A

d’ADNsb

filamenteuse avec une structure hélicoïdale

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6
Q

Les capsides des phages Ff sont____ ; elles ont une longueur de ___ et un diamètre de seulement __

A

longues et flexibles

~900 nm

~7 nm

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7
Q

La particule M13 est constituée d’une molécule ___ de ____ bases

A

d’ADNsb

6 407

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8
Q

Le génome est revêtu de____ copies de la protéine d’enveloppe majeure___ de manière hélicoïdale

A

~ 2 800

pVIII

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9
Q

_____ Cela stabilise la particule du phage.

A

La séquence C-terminale de pVIII est chargée positivement et interagit avec le squelette phosphate de l’ADN.

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10
Q

L’extrémité du phage présente ___ exemplaires de chacune des protéines ____
Si l’une de ces protéines est absente, la production de particules de phage ne se déroule pas

A

cinq

d’enveloppe mineures pVII et pIX

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11
Q

voir image 10 et tout

A

ok

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12
Q

L’autre extrémité du phage est constituée de cinq copies de ___ et ___ . Ces protéines sont impliquées dans ____ .

Ces protéines permettent aussi ___

A

pIII

pVI

l’adsorption au récepteur de l’hôte

au virion nouvellement formé de se détacher de la membrane cellulaire lors de sa sortie de la cellule

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13
Q

Le génome des phages Ff contient __ gènes et ____
Le signal d’encapsidation («the packaging signal (PS)»), situé dans la région ___ , est nécessaire à l’encapsidation efficace du génome
Contrairement à T4 et à T7 où la régulation temporelle de l’expression génique est la règle, les protéines des phages Ff sont ____

A

9

une région non codante
(«IG»)

non codante

toutes synthétisées simultanément

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14
Q

Parmi les ___ protéines codées par le phage:
3 (pII, pX et pV) sont nécessaires pour ____
3 (pI, pXI et pIV) sont nécessaires pour ____ du phage
5 (pIII, pVI, pVII, pVIII et pIX) sont____

A

11

générer l’ADNsb

la morphogenèse

des composants de la particule de phage

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15
Q

Parmi les 11 protéines codées par le phage:
3 (______ ) sont nécessaires pour générer l’ADNsb
3 (_______ ) sont nécessaires pour la morphogenèse du phage
5 (_______) sont des composants de la particule de phage

A

pII, pX et pV

pI, pXI et pIV

pIII, pVI, pVII, pVIII et pIX

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16
Q

La réplication de M13 peut être divisée en ___ phases:

  1. 3.
A

3

  • l’adsorption à la cellule hôte et la décapsidation
  • la réplication et la transcription -l’assemblage et la sécrétion des virions
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17
Q

L’adsorption de M13 est spécifique à quoi : _____

A

aux pilus des bactéries F+ d’E. coli

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18
Q

Le pilus est codé par

A

un plasmide (facteur F)

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19
Q

Les phages Ff peuvent infecter des cellules auxquelles il manque un pilus, mais le processus est extrêmement inefficace

A

ok

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20
Q

ADSORPTION : À l’aide de la protéine ___ , le virus va se fixer au pilus
Comme lors de la conjugaison bactérienne, _____
Ensuite, la protéine pIII interagit avec la protéine hôte ___ située dans ___

A

pIII

le pilus se contracte et attire le phage vers la membrane

TolA

la paroi cellulaire

21
Q

17

A

ok

22
Q

16

A

ok

23
Q

réplication : L’ADN sb est converti en ____ d’ADN db superenroulé par l’action de ___ , ____ et ____
Une ARN polymérase ___

Le site d’initiation de la polymérisation est une structure _____ située dans____ .
L’amorce d’ARN est allongée par ____ , le brin nouvellement répliqué est ___ et le produit double brin est ensuite ____

A

une forme réplicative («RF- Replicative Form»)

l’ARN polymérase de l’hôte, l’ADN polymérase et une gyrase

génère l’amorce utilisée pour initier la synthèse du brin d’ADN négatif

en forme de boucle («hairpin»)

la région non codante du brin positif

l’ADN polymérase III

ligaturé

superenroulé par la gyrase

24
Q

quest-ce qui fait que ladn senroule

A

la gyrase

25
Q

quelle prot démarre le processus de réplication en cercle roulant

A

pII

26
Q

La synthèse de l’enzyme plI, une enzyme de ___(«site-specific nicking-closing enzyme»), est nécessaire pour la poursuite de la réplication du génome

A

réparation reconnaissant un site spécifique de coupe monocaténaire

27
Q

La forme réplicative («RF») superenroulée est ___ , ce qui génère une molécule simple brin

A

un gabarit pour l’expression des

gènes de phage et la réplication en cercle roulant

28
Q

20

A

ok

29
Q

pII crée un bris monocaténaire du brin positif de la forme réplicative sur le site ori dans la région non codante du génome

L’extrémité ___ est allongée par une ____ , en utilisant le brin négatif comme gabarit

A

3’

ADN polymérase III de l’hôte

30
Q

Le brin positif d’origine est déplacé par _____ pendant que le nouveau brin positif est synthétisé
Quand un tour de la réplication est terminé, le brin positif déplacé est
recircularisé par ___ et encore ____

A

l’hélicase «Rep»

plI

converti en «RF»

31
Q

Au début de l’infection lorsque la concentration de ___ est faible, de
l’ADN sb nouvellement synthétisé est converti en «RF» augmentant ainsi à la fois le nombre de «RF» et les protéines de phage de façon exponentielle

A

pV

32
Q

La protéine pV est une protéine ___

A

fixant l’ADN simple brin

33
Q

23

A

ok

34
Q

Quand un nombre suffisant de pV s’est accumulé dans le cytoplasme, des dimères de pV couvrent l’ADN sb, empêchant_____. La formation de «RF» et la traduction des gènes viraux sont donc bloquées
Le recouvrement par la protéine pV le long de l’ADN lui donne____

A

l’accès à l’ADN-polymérase

une structure en forme de tige («rod-like»)

35
Q

L’assemblage des phages Ff est un processus ___

A

sécrétoire

36
Q

L’assemblage se produit dans____ et les phages

naissants sont ____

A

la membrane cytoplasmique

sécrétés par la cellule en même temps qu’ils sont assemblés

37
Q

desssin24

A

ok

38
Q

Les 8 protéines directement impliquées dans l’assemblage sont d’abord _____ («integral cytoplasmic proteins») avant leur incorporation dans la particule de phage

A

des protéines intégrales de la membrane cytoplasmique

39
Q

L’assemblage des phages se produit sur des sites d’assemblage distincts où

A

la membrane cytoplasmique et la membrane externe sont en contact étroit

40
Q

26- 27

A

ok

41
Q

Les phages naissants passent à travers un canal formé par la protéine ___ dans la paroi de la cellule

A

pIV

42
Q

L’allongement du phage

comprend le remplacement successif des pV par les protéines de capside

A

pVII, pVIII et pIX

43
Q

Une fois que pIII et pVI sont incorporées à l’extrémité terminale du phage, elles

A

subissent un changement de conformation qui stabilise le virus et le détache de la paroi cellulaire

44
Q

Une fois que ___ et ___ sont incorporées à l’extrémité terminale du phage, elles subissent un changement de conformation qui stabilise le virus et le détache de la paroi cellulaire

A

pIII et pVI

45
Q

Les descendants des particules de phage apparaissent dans le surnageant de culture dès ___ (!) lors d’une infection à 37 ° C
Dans ces conditions, ~____ sont produites dans la première heure
Dans des conditions optimales, les cellules infectées peuvent ___
Cependant, une petite perturbation dans le cycle de vie du phage se traduira par ____

A

~ 10 min

1000 particules

continuer à croître et à se diviser tout en produisant des phages

la lyse de la cellule

46
Q

Par exemple, les phages Ff ont été utilisés dans une méthode nommée le

A

«phage display»

47
Q

La protéine P3 du phage m13 semblent _____ qui se forment au cours de la maladie d’Alzheimer

A

dissoudre les plaques amyloïdes

48
Q

voir phage display à fin

A

ok