LAMBDA Flashcards
Lambda est le phage _____ le plus étudié à ce jour et a servi comme modèle pour étudier des processus de ____ .
tempéré
régulation complexes.
La famille ____ est classifiée dans l’ordre Caudovirales
Siphoviridae
caudovirales : ( _____ ( contractile ) , ____ (extensible) , _____ )
myoviridae
podoviridae
siphoviridae
Les caractéristiques partagées par les virus de la famille Siphoviridae comprennent:
- des virions aux queues _____
- l’assemblage ____ de la tête et la queue du virion
- la différenciation entre les genres dans la famille par l’organisation du génome, les mécanismes d’empaquetage de l’ADN et par ____
minces, longues, flexibles et non-
contractiles
séparé
la présence ou l’absence d’une ADN polymérase virale
Le virion de λ est constitué d’une tête icosaédrique isométrique d’environ ___ de diamètre et d’une longue queue flexible et non contractile d’environ ___ de long, possédant des ___ à son extrémité.
55 nm
150 nm
fibres ( PAS AUSSI COMPLEX QUE CHEZ MYOVIRIDAE )
Le génome de λ a ~ ____ pb d’_____
48 000
ADNdb linéaire
Le génome a de petites extrémités cohésives sb (12 nt de long)
Ces extrémités sont_____ , ce qui permet à la molécule linéaire de _______
complémentaires en séquence
se circulariser par appariement de bases
Le génome de λ code pour plus de ___ gènes
70
Il existe des groupes distincts impliqués dans
la synthèse de la tête et celle de la queue,
dans la lysogénie
la réplication de l’ADN
la lyse des cellules
La régulation des gènes est facilitée par _____ et par la ____
leur regroupement
coordination de la transcription à partir des mêmes promoteurs
λ infecte E. coli dans un processus en deux parties:
- _____ se lient à la protéine de la membrane externe ____
- la protéine ___ , située à l’extrémité de la queue, se lie à la protéine membranaire externe ___
- il n’y a que cette seconde interaction qui soit essentielle pour qu’il y ait infection
- la capside reste attachée à l’extérieur de la cellule après l’infection
les fibres latérales de la queue
OmpC
gpJ
LamB
DÉTAIL DE LENTRÉE DE LADN PAS BIEN COMPRIS
Néanmoins, il semblerait que ____ se
réorganisent pour faciliter le passage de l’ADN dans la cellule et que la protéine ____ («tape measure protein») ___ est injectée dans la cellule et est essentielle pour le succès de l’injection de l’ADN
les protéines à l’extrémité de la queue
étalon de la queue
gpH
Immédiatement après l’injection, ____
Les deux extrémités sont ensuite liées de façon covalente par l’enzyme ____ DE ____
les
extrémités cohésives (cos) se lient pour circulariser le génome
ADN ligase de l’hôte
La transcription du génome de λ est catalysée par ____
l’ARN polymérase
dépendante de l’ADN de la cellule hôte
17-18
OK
La transcription est initiée par l’ARN polymérase aux promoteurs
____ qui aboutit à la transcription des gènes ___ ET ___
précoces immédiats PL et PR
N et cro
La protéine N est un facteur ____ qui modifie l’ARN polymérase de façon à ce qu’elle ____
d’anti-terminaison de la transcription
se lie à travers les terminateurs et dans les gènes précoces plus loin sur les opérons contrôlés par les promoteurs PL et PR
______ joue un rôle clé pour déterminer si le virus déclenchera le cycle lytique ou lysogénique
La protéine cII
La protéine cII joue un rôle clé pour____
déterminer si le virus déclenchera le cycle lytique ou lysogénique
La protéine cII joue un rôle clé pour déterminer si le virus déclenchera le cycle lytique ou lysogénique
Si la concentration de cII est suffisamment élevée, la transcription du gène _____
int qui code pour l’enzyme intégrase sera augmentée
___ catalyse l’intégration du génome du phage dans le chromosome de la cellule hôte, établissant ainsi la lysogénie
L’intégrase
Le gène cII augmente également la transcription du gène ___ codant pour ____ qui ____
cI
la protéine répresseur λ
réprime la transcription de tous les gènes à l’exception du sien
La protéine répresseur λ permet la transcription de ___ , car elle active ___ , tout en inhibant ___
son propre promoteur PRMcI
PL et PR
Rappel: une forte concentration de cIl est nécessaire pour ___
permettre à la lysogénie de continuer
Cependant, cII est dégradée par ____ , à moins qu’elle ne soit protégée par la protéine de phage ___ , qui est produite en même temps que cII
l’enzyme hôte HflB
cIII
L’intégration du génome du phage dans le chromosome de l’hôte se fait en un site appelé ____
«site de fixation» att
Un prophage est formé par ____ ENTRE SITE ___
une recombinaison site-spécifique entre le site d’attachement du phage (attP) et le site bactérien (attB)
23 imag
ok
La recombinaison est catalysée par
l’intégrase, mais nécessite également
le facteur d’intégration de l’hôte («Integration Host Factor (IHF)»)
À la suite de l’intégration, le génome λ circulaire devient linéaire
ok
Si cII n’est pas suffisamment protégée par cIII contre la dégradation, la concentration d’une autre protéine virale appelée ___ va augmenter
Cro inhibe la transcription de ___ , diminuant _____
Cro
cIII et cI
diminuant encore la quantité de cIl et du répresseur λ
Note: cI code pour
répresseur λ
En plus de la répression de cI et cIII, Cro ____ ainsi que ____
augmente sa propre synthèse
celle des protéines Q
Lorsque la protéine Q est à une concentration suffisamment élevée, elle _____
active les gènes requis pour le cycle lytique
Lorsque l’ADN de l’hôte est endommagé, l’enzyme de réparation d’ADN («DNA repair enzyme») ___ est produite
Rec A incite ____ , en ____ et, finalement, en réduisant la concentration de répresseur λ dans la cellule
Rec A
le répresseur λ à se cliver
réduisant la transcription de cI
La faible concentration de répresseur
λ conduit à la transcription de____
Le gène xis code pour la protéine ___
l’excisionase redirige l’intégrase, pour _____ , libérant le prophage du chromosome de l’hôte
xis, int et cro
excisionase
recréer les sites attP et attB
la _____ est synthétisé et active la trnscription des genes quon a besoin pour cycle lytique
protéine Q
La transcription des gènes tardifs débute___ après le début de l’infection du promoteur PR ‘
10 minutes
Les gènes tardifs réglementés par Q comprennent des gènes ___ et ____ qui ____
O et P
régulent la réplication de l’ADN du phage
La réplication de l’ADN du phage est mise en oeuvre par la _____ et est dirigée vers l’origine de réplication du phage par ___ et ___
La réplication est ___
Le résultat de la réplication est la production de ____
machinerie de réplication de l’hôte
O et P
bidirectionnelle
initialement mais est convertie ensuite en un mode de cercle roulant unidirectionnellement
concatémères multi-
génomiques
image 31
ok
Au cours de l’emballage, l’ADN est injecté dans la procapside et clivé par une nucléase aux sites cos, libérant l’ADN du concatémère
ok
Lorsque les concentrations de la protéine ____ sont suffisamment élevées, la protéine perfore la membrane cellulaire
La protéine__, une ____ , est maintenant en mesure d’accéder à ____ et de la dégrader
Enfin, les protéines ___ et ____ forment____ qui ____ , permettant aux phages de se libérer de la cellule
S105 holine
R
endolysine
la couche de peptidoglycane
Rz et Rz1
un complexe spannin («spannin complex»)
perturbe la membrane externe
