STS CM 5 Flashcards
Une omique ne permet pas d’avoir beaucoup de données ?
C’est faux elle permet justement d’avoir beaucoup de données
Qu’est-ce que c’est une omique ?
C’est une analyse quantitative de quelque chose (dépend de laquelle) d’un système biologique (un organe, un tissu, un organisme….)
Est-ce que la métabolomique est une approche interdisciplinaire ?
Oui
Qu’est-ce que la métabolomique ?
C’est l’analyse globale quantitative du métabolome d’un système biologique
Qu’est-ce qu’un métabolome ?
C’est le contenu total en métabolites d’un échantillon biologique
Qu’est-ce qu’on cherche à faire avec une analyse à haut débit ?
On cherche à caractériser le plus précisément possible l’échantillon
Qu’est-ce que cherche à faire la métabolomique ?
Elle cherche à décrire au plus près du phénotype
Les omiques peuvent permettre de faire quoi au niveau pathologique ?
Elles peuvent permettre de recomprendre certaines pathologies
Quelles sont les différentes omiques ?
- Génomique : ADN
- Transcriptomique : ARN
- Protéomique : Protéines
- Métabolomique : métabolome
Qu’est-ce que sont les métabolites endogènes ?
Ce sont tout les métabolites produit par/dans notre corps ?
- Ca peut être des lipides, des petits AN, des cétones
- Des molécules de signalisation
En gros un large éventail d’études
Avant d’utiliser une omique, il faut quoi ?
Il faut d’abord une question biologique
Qu’est-ce qui rentre dans la métabolomique ?
- Les métabolites endogènes
- Les métabolites provenant de sources exogènes
Quels sont les différences des molécules qu’on possède dans le HMDB (?) ?
- Grand gamme de concentration (10 à 10^9)
- Différents paramètres physico-chimiques
Combien de molécules décrites sur Human Metabolom Data Base (HMDB) ?
218 000 (c’est la plus complète aujourd’hui)
Quels techniques peut-on utiliser pour étudier la métabolomique ?
- IRM
- Spectrophotométrie de masse
- Chromatographie
Qu’est-ce qu’un exposome ?
- Ce sont les métabolites de sources exogènes
Par exemple : métabolites issues de l’alimentation, des toxiques, des polluants
Qu’est-ce que cause l’étude de beaucoup de molécules différentes ?
Il faut beaucoup plus de techniques pour les analyser
A quoi peut-on coupler la chromatographie ?
A la spectrophotométrie de masse
Est-ce qu’on retrouve peu de maladies venant des polluants ?
Faux, on en retrouve beaucoup
Quels types de signaux on obtient après analyse ?
Des signaux complexes
Quels sont les étapes du workflow ?
- Question biologique
- Choix du protocole
- Préparation de l’échantillon
- Analyse de/des échantillons
- Acquisition et stockage des données
- Prétraitement des données
- Analyse statistique
- Identification des métabolites d’intérêt
- Interprétation
- Conclusion
Quand on a un signal, on en fait quoi ?
On l’attribue à un métabolite grâce à une base de données
Que permet le choix du protocole ?
Il permet d’analyser un type de mol par la meilleure technique
Que permet la préparation des échantillons ?
De faciliter l’analyse
