Semaine 5 Flashcards
CoA est formé de quoi (3)
- Groupe B-mercaptoéthylamine
- Vitamine B5
- 3’5’- adénosine diphosphate
Seul rôle du CoA
Assure transport du groupement acétyle (qui s’accroche au groupement thiol)
Groupement thiol est sur quel composants du CoA
- B-mercaptoéthylamine
- Vitamine B5
- 3’5’- adénosine diphosphate
- B-mercaptoéthylamine
L’hydrolyse de liaison thioester de l’acétyl-CoA est endergonique ou exergonique
Delta G°’ négatif ou positif
Exergonique
-31,5kj/mol
Nommer 3 enzymes de PDH
E1: pyruvate déshydrogénase
E2: dihydrolipoyl transacétylase
E3: dihydrolipoyl déshydrogénase
Nommer 5 coenzymes de PDH
Thiamine pyrophosphate TPP Lipoamide/dihydrolipoamide CoA Flavine adénine dinucléotide (FAD) Nicotinamide adénine dinucléotide (NAD+)
Nommer coenzymes de PDH qui sont des groupements prosthétiques
Lipoamide/dihydrolipoamide
Flavine adénine dinucléotide FAD
Nommer 3 composants que le PDH contient chez les mammifères
- Protéine de liaison E3 (E3BP)
- Pyruvate déshydrogénase kinase (ajout P)
- Pyruvate déshydrogénase phosphatase (enlève P)
Rôle E3BP dans PDH
Faciliter la liaison E3 au coeur E2
Rôle enzymes pyruvate déshydrogénase kinase et pyruvate déshydrogénase phosphatase dans PDH
Régulation de l’activité catalytique de PDH
Comment l’arsenic joue un rôle dans synthèse du CoA
Capacité à se lier par convalence aux composés à groupement sulfhydryle comme ceux E2
Décarboxylation du pyruvate par E1 est
a) réversible
b) irréversible
b) irréversible
Nommer les 2 systèmes de régulation de synthèse acétyl-CoA
- Inhibition par produits: NADH et acétyl-CoA
- Modification covalente par phosphorylation/déphosphorylation de E1
Nommer 3 façons de réguler le cycle de Krebs
- Disponibilité en substrat
- Inhibition par le(s) produit(s)
- Inhibition compétitive par rétrocontrôle exercé par d’autres intermédiaires du cycle
Nommer régulateurs les plus stratégiques du cycle Krebs
Substrats: Acétyl-coA et oxaloacétate
Produit: NADH
Quand tissu passe d’une faible activité à une activité et respiration intense, la [NADH] mitochondriale augmente/diminue et s’ensuit de augmentation/diminution de [oxaloacétate] et [citrate] diminue/augmente
Diminue
Augmentation
Diminue
Vitesse d’utilisation du citrate est sous dépendance de…
Isocitrate déshydrogénase NAD+-dépendante
Isocitrate déshydrogénase NAD+-dépendante est fortement inhibée par…
NADH
Citrate synthase est inhibé par…
NADH
Réoxydation de 1 NADH permet synthèse de… ATP
3
Réoxydation de 1 FADH2 permet synthèse de … ATP
2
Grand total d’ATP pour 1 molécule de glucose complètement oxydée en CO2 et H2O
38 ATP
Conséquence de la membrane interne mitochondrie qui est sélectivement perméable
Formation d’un gradient de protons qui fournit énergie essentielle à respiration cellulaire
Définir chimiosmose
Mouvement des ions en fonction de leur gradient électrochimique à travers membrane sélectivement perméable
Où retrouve t’on la navette malate-aspartate dans le corps (organes)
Coeur, foie, rein
Dans quels organismes retrouvent t’on le cytochrome c
Tous les organismes sauf quelques anaérobies obligatoires
Combien de protons sont nécessaires (entrer dans ATP synthase) pour faire 1 ATP
3 protons
Gluconéogenèse produit …% du glucose dans les 22 premières heures du jeune
64
Gluconéogenèse produit …% du glucose après 48 heures de jeûne
100
Pyruvate carboxylase est
a) monomère
b) dimère
c) tétramère
d) homomère
e) hétéromère
c) tétramère
d) homomère
Rôle de l’avidine (dans le blanc d’oeuf)
Se lie fortement à biotine et empêche son absorption intestinale
Déficience en biotine chez l’homme est due à…
Consommation excessive de blancs d’oeufs crus
PEP carboxykinase est
a) monomère
b) dimère
c) tétramère
a) monomère
Où est localisée la PEP carboxykinase
Chez tous espèces
Chez l’homme
Varie selon espèces
Cytosol et mitochondries
Nommer quelques réactions qui ont besoin du système NADP+/NADPH
Biosynthèse des acides gras, cholestérol
Métabolisme des stéroïdes et médicaments
Prévention du stress oxydatif
Différence entre rôle NADPH et NADH
NADPH: réactions de biosynthèse réductrice
NADH: transport électrons et production ATP
Distinction entre les réactions qui utilisent NADPH ou NADH est due à…
Grande spécificité des enzymes
PDH est actif ou inactif quand il est phosphorylé
Inactive
Nom de l’enzyme qui catalyse réaction GTP + ADP = Gdp + ATP
Nucléoside diphosphate kinase
Rôle FAD
Oxydation … (double ou simple liaison) en … (double ou simple liaison)
Alcane (simple)
Alcène (double)
Rôle NAD+
Oxyde les alcools en … ou …
Cétone ou aldéhyde
Vitesse d’utilisation du citrate est sous dépendance de quelle enzyme
Isocitrate déshydrogénase NAD+-dépendante
Glycérol -> G3P -> DHAP -> glucose
Nommer les 2 premières enzymes
Glycérol kinase
G3P déshydrogénase
Chez mammifères où la voie des pentoses phosphate a t’elle lieu
Organes
Cytoplasme
Voie active dans foie, mais pas muscle
Flux à travers voie pentose dépend de la vitesse de formation de…
NADPH qui est contrôlée par vitesse de réactions catalysée par G6PDH
Vitesse G6PDH (voie pentose) est contrôlée par Inhibiteur ou activateur
[NADPH]
Inhibiteur
Biotine est lié à quelle enzyme
Nommer lien qui les unit
Pyruvate carboxylase
Liaison amide entre groupe carboxylique de chaine latérale valérate et groupement amine d’un résidu Lys
Nommer les 4 groupes prosthétiques qui participent au transfert d’électrons dans complexe 3
- 2 cytochromes type B ( b l et b h)
- 1 centre Fer-S
- 1 cytochrome de type c
Décrire membrane externe de mitochondrie
Poreuse/perméable à plupart ions et petites molécules (ADP, ATP, pyruvate et H+)
Décrire membrane interne de mitochondrie
Imperméable aux ions (surtout H+)
Sélectivement perméable
Expliquer acidose lactique et dans quelle condition pourrait-elle se produire
Si hypoxie (apport O2 insuffisant) Mitochondries incapables de continuer synthèse ATP à rythme suffisant = accumulation pyruvate -> lactate = baisse pH
Vrai ou faux
Énergie requise pour synthèse ATP est fixe
Faux, dépend [ADP, ATP, Pi] et pH
3 avantages de former un complexe (comme le PDH)
- Augmente vitesse, car distance minime
- Guide les intermédiaires: organisation
- Régulation coordonnée
Synthèse de l’acétyl-CoA est réversible ou irréversible
Irréversible
Cofacteur donc isocitrate déshydrogénase a besoin (étape 3 cycle Krebs)
Mn+ ou Mg+
Fumarase catalyse hydratation de fumarate en…
a) D-malate
b) L-malate
c) D-malate ou L-malate
b) L-malate
Nommer l’enzyme de Krebs qui n’est JAMAIS saturée (qui explique pour c’est cycle et pas réaction linéaire)
Citrate synthase
Nommer l’intermédiaire de Krebs qui est nécéssaire pour: synthèse glucose avec gluconéogenèse
Oxaloacétate
Nommer l’intermédiaire de Krebs qui est nécéssaire pour: synthèse lipides
Acétyl-CoA
Nommer l’intermédiaire de Krebs qui est nécéssaire pour: synthèse certains a.a.
Alpha-cétoglutarate et oxaloacétate
Nommer l’intermédiaire de Krebs qui est nécéssaire pour: synthèse porphyrines
Succinyl-CoA
Nommer l’intermédiaire de Krebs qui est nécéssaire pour: oxydation complète a.a
Alpha-cétoglutarate
L’oxydation d’acides gras avec nombre impair de C donne quel intermédiaire de Krebs
Succinyl-CoA
La dégradation de certains a.a forme quel intermédiaire de Krebs
Succinyl-CoA
La transamination/désamination de certains a.a forme quels intermédiaires de Krebs
Alpha-cétoglutarate et oxaloacétate
Comment s’appelle le système antiport qui permet transport ATP et ADP dans mitochondries
a) monomère
b) homodimère
c) hétérodimère
d) homotétramère
e) hétérotétramère
Translocase des nucléotides adényliques
b) homodimère
Comment s'appelle le système qui permet de transporter le Pi dans mitochondries a) antiport b) symport c) passif Est sous dépendance de quoi
b) symport
Transporteur de phosphate
Gradient pH
Potentiel d’oxydoréduction (E°’) de NAD+ est
a) positif
b) négatif
b) négatif
Potentiel d’oxydoréduction (E°’) de O2 est
a) positif
b) négatif
a) positif
Nommer l’étape nécessitant énergie dans ATPsynthase
Libération ATP
Composantes du rotor
Dodécamère c12 associé à lambda et espilon
Composantes du stator
Hexamère alpha3 beta3, sous-unité a,b et delta
Pourquoi transporter ATP hors matrice après sa synthèse est couteux pour la cellule
Car on perd un proton
Rôle thermogénine
Crée canal p+ passif par lequel s’écoulent p+ de l’espace intermembranaire vers matrice
Nommer les sous-unités de F0
a, b, c
Où entrent les protons dans l’ATP synthase (précis)
Canaux de la sous-unité a de F0
Nommer les 5 polypeptides que F1
alpha, beta, lambda, delta et epsilon
Nommer les polypeptides de F1 qui forment la tige centrale
lambda et epsilon
Quelle sous-unité ou polypeptide de l’ATPsynthase possède une activité catalytique
Beta
F0 et F1 sont connecté par …
Tige centrale epsilon et lambda
La réaction pyruvate -> oxaloacétate se produit où
(par pyruvate carboxylase)
Et comment on l’exporte
Seulement mitochondries
Transformé en aspartate ou malate
Où se forme le lactate
Où transfère t’on le lactate
Muscles
Foie
