Semaine 1 Flashcards
Définition métabolisme
Processus global qui assure aux organismes vivants l’apport et l’utilisation de l’énergie libre pour assurer leurs différentes fonctions
Définir réaction exergonique
Libère énergie
Réaction exergonique provient de quoi
Oxydation des nutriments
Définir réaction endergonique
Nécessite de l’énergie
Définition voie métabolique
Série de réactions enzymatiques successives qui forment des produits spécifiques
Que sont les métabolites
Substrats intermédiaires et produits
Définir catabolisme
Assure dégradation exergonique des nutriments et des constituants cellulaires pour récupérer unités de base et/ou produire de l’énergie libre qui est captée en synthétisant l’ATP ou en réduisant le coenzyme NADP+
Définir anabolisme
Assure synthèse de biomolécules à partir constituants plus simples (générer de nouvelles molécules)
Nommer principales sources énergie libre pour voies analogiques
ATP et NADPH
Voies métaboliques sont
a) réversible
b) irréversible
b) Irréversible
Particularité anabolisme et catabolisme
Emprunter voies différentes
Chaque voie métabolique comprend une réaction d’engagement
Définir et de quel côté c’est favorable
Pas de retour en arrière
Favorable gauche à droite
Où se déroulent les voies métaboliques
Sites intracellulaires spécifiques
Nommer réactions organiques enzymatiques (4)
- Réactions de transfert de groupes
- Oxydoréductions
- Éliminations, isomérisations et réarrangements
- Réactions de formation et de rupture de liaisons carbone-carbone
Définir réactions de transfert de groupe
Substitution nucléophile: transfert d’un groupe électrophile d’un nucléophile à l’autre
Nommer groupe fréquemment transféré lors substitution nucléophile
Acyle, phosphoryle et glycosyle
Définir réactions oxydoréductions
Perte ou gain d’électrons
Réaction oxydoréduction rupture quel liaison et quels sont les conséquences
Rupture liaison C-H
Perte 2 électrons par l’atome C
Électrons sont transférés à un accepteur d’électron
Nommer exemple accepteur d’électrons
NAD+
Nommer accepteur terminal pour organismes aérobies
Accepteur terminal des paires d’électrons provenant des métabolites oxydés est l’oxygène moléculaire (O2)
Particularité O2
Ne peut accepter le transfert d’électrons qu’un à la fois
Possible grâce à l’intervention de coenzymes dont FAD
Réactions d’élimination mènent à formation de quoi
Doubles liaisons carbone-carbone
Quelle substance est la plus souvent éliminée
Nommer en quelques autres
H2O
NH3, ROH, RNH2
Définition isomères
Molécules avec même formule brute, mais possédant des propriétés chimiques et biologiques différentes
Définir énantiomères
Molécules isomères images l’une de l’autre dans un miroir, mais non-superposables
Différence entre L et D, + et - ainsi que R et S
L et D désigne conformation molécule 3D
- et + indique propriétés optiques
R et S basé sur priorités (numéro atomique) des molécules attachées C*
Réactions d’isomérisation impliquent quoi
Déplacement intramoléculaire d’un atome pour déplacer position double liaison
Conséquence réaction isomérisation
Proton est enlevé d’un atome de carbone et ajouté à un autre
Nommer réaction isomérisation la plus importante dans métabolisme
Interconversion aldose-cétose
Définir interconversion aldose-cétose
Réaction à catalyse acido-basique au cours de laquelle se forment des intermédiaires anion ènediolate
Exemple d’interconversion aldose-cétose
Phosphoglucose isomérase
Enzyme de la glycolyse
Définir racémisation
Réaction d’isomérisation dans laquelle un atome d’hydrogène d’un centre chiral modifie sa localisation stéréochimque
Donner exemple de racémisation
Conversion - vers +
Définir épimérisation
Réaction d’isomérisation autour d’un seul carbone asymétrique d’une molécule ayant plusieurs centres chiraux
Définir réactions de réarrangements
Modifient squelettes carbonés
Rompent et reforment des liaisons C-C
Nommer exemple de réaction de réarrangement
Conversion L-méthylmalonyl-CoA en succinyl-CoA par enzyme méthylmalonyl-CoA mutase
Réactions de formation et rupture de liaisons carbone-carbone sont la base de…
Métabolisme de dégradation et de biosynthèse
Réactions de synthèse impliquent quoi
Addition d’un carbanion nucléophile sur atome de carbone électrophile
Processus endergoniques qui assurent le maintien de la vie des organismes sont possibles par…
Réactions exergoniques de oxydation des nutriments
Couplage réaction endergoniques et exergoniques dépend de…
Synthèse d’intermédiaires “riches en énergie”
Servent aux processus endergoniques (qui demande énergie)
Nommer un exemple de réactions de transfert de groupements phosphoryle
Hydrolyse ATP
Régénération ATP est assurée par quoi
Couplage avec processus métabolique plus exergonique que hydrolyse
Définir énergie libre de Gibbs ou enthalpie libre
Potentiel thermodynamique qui représente le maximum d’énergie utilisable pour effectuer un travail mécanique
Définir liaisons à haut potentiel énergétique ou liaisons “riches en énergie”
Liaisons dont l’hydrolyse s’accompagne delta G très négatif ( < -25 kJ-mol-1)
2 raisons qui expliquent que les réactions de transfert de groupement phosphoryle de l’ATP sont exergoniques
- Répétition électrons à proximité (répulsion des charges négatives)
- Résonance électrons
Nommer 3 exemples d’utilisation de l’ATP
- Amorçage de dégradation de substrats
- Activation des acides aminés lors synthèse protéique
- Plusieurs processus biologiques nécessitant un apport énergétique
Nommer quelques processus biologiques nécessitant un apport énergétique
- Contraction musculaire
- Transport membranaire
- Réplication ADN
- Mouvement flagellaire spermatozoïdes
Nommer quelle sorte de réaction d’oxydo-réduction ont une importance biochimique considérable
Celle qui se traduisent par transferts électrons
Demi-réactions
Lieu au cours métabolisme oxydatif lors transfert vital d’électrons qui se déroule dans mitochondries sous dépendance cytochrome c oxydase
Nommer exemple de réactions de transfert d’électrons
Chaine de transfert d’électrons mitochondrial (source primaire ATP eucaryote)
Où l’acide gras est métabolisé
Mitochondries
V ou F? La régénération de l’ATP est assurée par couplage avec un processus métabolique encore plus endergonique que son hydrolyse
FAUX. EXERGONIQUE, pas endergonique
Pourquoi les réactions de transfert de groupement phosphoryle de l’ATP sont elles si exergoniques?
L’ATP est une molécule énergétique, car elle nest pas stable . La réaction est donc exergonique, car on passe du pas stable –> stable.
Agent réducteur
Donneur d’électrons dans une réaction oxydo-red
Agent oxydant
Accepteur d’électrons dans une réaction d’oxydo-red
