Section 1.2 Flashcards
Par quoi est accomplie la traduction de l’information génétique (codons) en acides aminés?
Par des molécules d’ARN de transfert, qui agissent comme adapteurs entre les codons et l’acide aminé qu’ils spécifient.
ARN de transfert
Combien de ribonucléotides contiennent les molécules d’ARNt?
Entre 75 et 95.
ARN de transfert
Quels sont les points communs des ARNt?
- Tous les ARNt terminent par la séquence : 5’-CCA-3’
- Présence de bases inhabituelles dans leur structure primaire
ARN de transfert
Nommez des exemples de bases inhabituelles des ARNt
Pseudouridine (ΨU), dihydrouridine (D), Hypoxanthine, thymine, methylguanine, …
ARN de transfert
Les bases modifiées des ARNt sont-elles nécessaires à leur fonction?
Non, mais les ARNt qui ne les ont pas montrent des taux de croissance réduits.
ARNt : structure secondaire
À quoi ressemble la structure secondaire des ARNt?
À un trèfle
ARNt : structure secondaire
Quels sont les 5 sections de la structure secondaires des ARNt? Pourquoi sont-elles nommées ainsi?
- Le bras accepteur : site d’attachement de l’acide aminé, formé par liaisons.
- Boucle ΨU : présence charactéristique de la base inhabituelle ΨU
- Boucle D : présence charactéristique de la base inhabituelle dihydrouridine
- Boucle anticodon : présence de l’anticodon (section de 3 nucléotides qui reconnait le codon par liaison entre leurs bases avec l’ARNm).
- Boucle variable (entre ΨU et anticodon) qui varie de 3 à 21 bases.
ARNt : structure tridimensionnele
À quoi ressemble la structure trimidensionnelle des ARN de transfert?
À un L
ARNt : structure tridimensionelle
Quelles sont les trois types d’interactions qui stabilisent la structure tridimensionelle de l’ARNt?
- Formation de deux régions étendues de “base pairing” qui permet d’empiler les bases.
- Les liens hydrogènes sont formés entre les bases dans différentes régions hélicales (paires non Watson-Crick)
- Interactions entre les bases et le squelette sucre-phosphate
Amino-acylation de l’ARNt
Quel est le lien permettant à un ARNt d’être chargé d’un acide aminé?
Un lien acyle entre le groupement carboxyle de l’acide aminée et l’hydroxyle 2’ ou 3’ de l’adénosine à l’extrémité 3’ de l’ARNt
Amino-acylation de l’ARNt
Que permet le lien à haute énergie entre l’acide aminé et l’ARNt?
L’énergie du lien libérée quand le lien acyle est brisé est couplé à la formation des liens peptidiques qui lient les acides aminés ensemble dans une chaîne polypeptidique
Amino-acylation de l’ARNt - aaRS
Expliquez les deux étapes enzymatiques effectuées par les aminoacyl-ARNt synthétases (aaRS).
- Activation de l’acide aminé (adénylylation) : réaction entre l’acide aminé et l’ATP pour devenir adénylylé, libération d’un pyrophosphate (PPi) (1)
- Formation d’aminoacyl-ARNt (chargement) : l’acide aminé adénylylé réagit avec l’ARNt, transfert de l’acide aminé à l’extrémité 3’ de l’ARNt (via 2’ ou 3’-OH). Libération d’AMP
(1) Adénylylation réfère au transfert d’AMP, alors qu’adénylation réfère au transfert d’adénine
Amino-acylation de l’ARNt - aaRS
Quelles sont les deux classes d’aaRS et leurs différences?
Classe 1 :
- Attache l’Acide aminé au 2’-OH de l’ARNt
- Généralement monomérique
- Acides aminés pris en charge généralement volumineux et hydrophobes,
- Anticodon doit être reconnu par plusieurs enzymes
- Reconaissent le sillon mineur de la tige acceptrice
Classe 2 :
- Attache l’acide aminé au 3’-OH de l’ARNt
- Généralement dimérique ou tetramérique
- Acides aminés pris en charge généralement petits et non-hydrophobe
Amino-acylation de l’ARNt - aaRS
Vrai ou faux? Chaque aaRS attache un seul acide aminé à un ou plusieurs ARNt?
Vrai, chacun d’est acides aminés est attaché par un seul aaRS.
Un aaRS, cependant, charge souvent plus d’un ARNt
Amino-acylation de l’ARNt - aaRS
Comment les aaRS reconnaissent-ils les bons ARNt pour leur acide aminé?
À partir du bras accepteur et de la boucle anticodon.
Souvent, une seule base (base discriminatoire) dans le bras accepteur est suffisant pour convertir la spécificité d’ARNt d’une synthétase à l’autre
Boucle anticodon aide aussi (ex. glutamine, qui a besoin de plusieurs contacts dans le bras accepteur et la boucle anticodon)
ARNt : concept du flottement (wobble)
La base située à la position de flottement (wobble position) peut-elle se lier avec n’importe quelle base?
Non. L’appariement n’est pas nécessairement Watson-Crick mais la liaison ne peut pas être fait entre n’importe quelle base. Le pairage permis par l’hypothèse du flottement est celui qui donne des distances entre les deux riboses étant le plus proche possible du A:U ou G:C standard.
